Entry information : BstrAPx-R01 (Bostr.7867s1084)
Entry ID 14941
Creation 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: BstrAPx-R01 (Bostr.7867s1084)
Name (synonym) BstrAPx-R01 (Bostr.7867s1084)
Class Ascorbate peroxidase related    [Orthogroup: APx-R001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Boechera
Organism Boechera stricta    [TaxId: 72658 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value BstrAPx-R01
start..stop
S start..stop
AlyAPx-R 622 0 1..331 1..329
AtAPx-R 614 0 1..331 1..329
CagraAPx-R01 612 0 1..331 1..327
CrubAPx-R01 609 0 1..331 1..327
Literature and cross-references BstrAPx-R01 (Bostr.7867s1084)
Protein sequence: BstrAPx-R01 (Bostr.7867s1084)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   331
PWM (Da):   %s   36174.81  
PI (pH):   %s   9.16
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MTTATASLLE TSLLRCDSSS SSSFKFKCKF ESPAKTRLLS PATGKHVVRT LRAWRIRCVS DDPGSRPDLV SSRRKMVVLL STVQLLSHLV PPNGKAADIY PVMQNEIRKV VTKGKAAGVL  RLVFHDAGTF ELDDNSGGIN GSIAYELERP ENTGLKKSLK VLAKAKIKVE EIQPVSWADM ISVAGSEAVS ICGGPTIPVL LGRLDSTKPD PEGKLPPETL SASGLKECFK RKGFSTQELV 
ALSGAHTIGS KGFGDPTVFD NAYYKILLEK PWTSNSKMTS MVGLPSDHAL VDDDECLRWV KRYAEDEDKF FEDFTNAYIK LVNSGAKWNK L* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AGAAACTACG TGTAAAATAA AAATCAGCTG GGGCTCGGTG ATTCTCGTCC CACCATTAAA GATGACGACG GCGACTGCGT CACTGTTGGA GACTTCTCTT TTACGGTGCG ACTCGTCTTC  TTCTTCTTCT TTCAAATTCA AATGCAAATT CGAGTCTCCC GCGAAAACGC GACTGCTCTC TCCGGCGACC GGGAAACATG TTGTGAGAAC GTTAAGAGCT TGGCGTATTC GTTGCGTCTC  CGATGATCCT GGTAAGACCG GATTCTAGTA TCTCTAGCCA TTTCTATTAT ATGGTTCCCT TTTCCGTCGA TCTCGGAACA GAACAGCATC GTTTTATAGT TTGAGATGCT TAGTCCGATT  GAAAATTTCA AATGCTTCGA GTCCGATTCG TGCTGAGATT GTTCTGTTTC TGCATAATTT CTAGGTTCGC GTCCTGATTT GGTTTCCAGT AGAAGAAAAA TGGTTGTCCT GTTGTCGACG  GTGCAGCTTC TGTCTCATTT GGTTCCGCCA AATGGGAAGG CAGCTGAGTG AGTTTGAACA AATCCTTAAT TTTGTATAAT TGAAGCTGGA TTTTGGTTTG GTGATTTGGA TTAGTATTCT  TCACGTTATT GTATTCCAAT GTCTTGTGCT AATTTTGCAA ATCGACTGTT GGATTACAGC ATTTATCCAG TGATGCAAAA CGAAATAAGA AAAGTCGTGA CAAAGGGTAA GGCTGCTGGT  GTGCTTCGTT TAGTGTTTCA TGATGCTGGA ACCTTTGAAC TGGACGATAA TTCAGGTAAC AGACATGTTT TCAAATGTAA ACATATGATT GTTAGATTAT ATTTAGAATT GAAACTGTGA  TTTCTGGATG TTTTGTGTAG CTTGTGGTAT TTATTGGCTT AGTTGAACAG AATTTGTAGT AAGAGAGTTC TGGTCTGTTC AGTAGCTCTC TTTGGATGTT CTTATCATTC ACATGTTAAT  ATATCTCAGT TTGTTAACTT GCGTCTTTGC GATTTAGTAC ACTTCTGGAG GGTTATTTTT TCTTTATTTC TTTCTCAGTA AAAGATACTG CAATCCACTA GTTAAGATCA ATTGTGTCTT  AATTCTTCTT GGTTATGAAT TTATTTGCAG GTGGCATCAA CGGGTCTATT GCTTATGAAC TCGAGAGACC TGAAAACACA GGTTTGAAGA AATCCTTAAA GGCACTAAAT CCCTCTCTTT  TTTCTGTTAC CGTGAGCAAA TAAAGATGTA ATTTTCTCAT CTATGTAACT GCCTTTTTAT GTAACTGCCT TTTTATGTGT CTATTTGCTC TTGTATCTCA GATTTGTCAA ATATGTTACA  TTCGGATAAC TAATCTTCTT GGTAGATGAA TTCTTTGTTA GGTTCTAGCA AAAGCAAAGA TTAAGGTTGA GGAGATACAA CCAGGTAGTT ACTAAATGAA CTGTGTAGTA CACCAAAGAC  AATAAGACAT GTGTCCTGTC ATGCACCTTG GTTCTAATGT TCTCAATCTC TGTGATCTCA GTGTCTTGGG CGGATATGAT CTCCGTCGCT GGATCTGAAG CAGTTTCAAT ATGTGGCGGC  CCAACAATTC CAGTACTTTT GGGAAGACTT GATTCAACGT AAGCACACCA TAAATGGTTT TTGTCCTCGT TCGATAGATC TCTGGTCACT GTTTCTATAT TTCCAACAGG GTGATTGTTT  CATGTTCACA GGAAACCTGA TCCAGAAGGC AAGCTACCTC CAGAAACCCT GAGTGCCTCG GGTTTAAAAG AATGCTTCAA AAGAAAAGGA TTTTCGTGAG TCCTTACACA ATGAGAGCTG  TGAATTGTTT TAACATGTTT TTGTATCAAC ATTTTGTAAC TGACGTCAAT GGGTTTGTGT GCCATTGCAG GACCCAGGAG CTTGTTGCTT TATCTGGGGC ACATACGATA GGGAGTAAAG  GTTTTGGGGA TCCGACAGTT TTTGACAATG CATACTACAA AATCCTTCTT GAAAAACCAT GGACATCAAA TTGTAAGTCT CATGAAAAAG TTCTCAAGTT CCTTTACTCA TACAATTTAA  GTTTCCAACC ATTCCTCCCT ATGTTCTGAA GATTGATTGT AAGACTGAGA TTATATATTT ACATAGTTTT CTTCTTATGA TGCAGCCAAA ATGACGAGCA TGGTCGGCCT CCCTTCGGAT  CATGCCTTAG TGGACGATGA TGAGTGCTTA AGGTTTCTCA GTTACTGAAA GTTCTTACCT TATCATTTAA TTGTCTAATT TTCTCTTTAG TACCATTTAA AGTAGAGTAG AGTAATGTGC  TGAACACTTG GACTACAGGC TCATGGATGA AACTGGAATC TGTTGAACAC TTTACTTGTC ATTTGGGCTA AACTATTAAA CTGATATAGA TTCGTGGTTT GGTGATGCAC AGGTGGGTGA  AACGATATGC AGAAGACGAA GACAAGTTCT TCGAAGACTT CACCAATGCT TATATCAAAC TAGTTAATTC TGGGGCCAAA TGGAATAAGT TATGATGTTT AATTTTATCT TTTGTTAGCT  CATAAGTGTT TCAAACATGC CTGAATATTT TGGGTAGTAA TGCTTATTTG CTAGTAAGTA AAAAGTTTCT CTGCTTACTA CTACAAACCT AAACATCAAA TATACCCAAA ATTTACACTT 
ACTTACTCG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACGACGG CGACTGCGTC ACTGTTGGAG ACTTCTCTTT TACGGTGCGA CTCGTCTTCT TCTTCTTCTT TCAAATTCAA ATGCAAATTC GAGTCTCCCG CGAAAACGCG ACTGCTCTCT  CCGGCGACCG GGAAACATGT TGTGAGAACG TTAAGAGCTT GGCGTATTCG TTGCGTCTCC GATGATCCTG GTTCGCGTCC TGATTTGGTT TCCAGTAGAA GAAAAATGGT TGTCCTGTTG  TCGACGGTGC AGCTTCTGTC TCATTTGGTT CCGCCAAATG GGAAGGCAGC TGACATTTAT CCAGTGATGC AAAACGAAAT AAGAAAAGTC GTGACAAAGG GTAAGGCTGC TGGTGTGCTT  CGTTTAGTGT TTCATGATGC TGGAACCTTT GAACTGGACG ATAATTCAGG TGGCATCAAC GGGTCTATTG CTTATGAACT CGAGAGACCT GAAAACACAG GTTTGAAGAA ATCCTTAAAG  GTTCTAGCAA AAGCAAAGAT TAAGGTTGAG GAGATACAAC CAGTGTCTTG GGCGGATATG ATCTCCGTCG CTGGATCTGA AGCAGTTTCA ATATGTGGCG GCCCAACAAT TCCAGTACTT  TTGGGAAGAC TTGATTCAAC GAAACCTGAT CCAGAAGGCA AGCTACCTCC AGAAACCCTG AGTGCCTCGG GTTTAAAAGA ATGCTTCAAA AGAAAAGGAT TTTCGACCCA GGAGCTTGTT  GCTTTATCTG GGGCACATAC GATAGGGAGT AAAGGTTTTG GGGATCCGAC AGTTTTTGAC AATGCATACT ACAAAATCCT TCTTGAAAAA CCATGGACAT CAAATTCCAA AATGACGAGC  ATGGTCGGCC TCCCTTCGGA TCATGCCTTA GTGGACGATG ATGAGTGCTT AAGGTGGGTG AAACGATATG CAGAAGACGA AGACAAGTTC TTCGAAGACT TCACCAATGC TTATATCAAA 
CTAGTTAATT CTGGGGCCAA ATGGAATAAG TTATGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AGAAACTACG TGTAAAATAA AAATCAGCTG GGGCTCGGTG ATTCTCGTCC CACCATTAAA GATGACGACG GCGACTGCGT CACTGTTGGA GACTTCTCTT TTACGGTGCG ACTCGTCTTC  TTCTTCTTCT TTCAAATTCA AATGCAAATT CGAGTCTCCC GCGAAAACGC GACTGCTCTC TCCGGCGACC GGGAAACATG TTGTGAGAAC GTTAAGAGCT TGGCGTATTC GTTGCGTCTC  CGATGATCCT GGTTCGCGTC CTGATTTGGT TTCCAGTAGA AGAAAAATGG TTGTCCTGTT GTCGACGGTG CAGCTTCTGT CTCATTTGGT TCCGCCAAAT GGGAAGGCAG CTGACATTTA  TCCAGTGATG CAAAACGAAA TAAGAAAAGT CGTGACAAAG GGTAAGGCTG CTGGTGTGCT TCGTTTAGTG TTTCATGATG CTGGAACCTT TGAACTGGAC GATAATTCAG GTGGCATCAA  CGGGTCTATT GCTTATGAAC TCGAGAGACC TGAAAACACA GGTTTGAAGA AATCCTTAAA GGTTCTAGCA AAAGCAAAGA TTAAGGTTGA GGAGATACAA CCAGTGTCTT GGGCGGATAT  GATCTCCGTC GCTGGATCTG AAGCAGTTTC AATATGTGGC GGCCCAACAA TTCCAGTACT TTTGGGAAGA CTTGATTCAA CGAAACCTGA TCCAGAAGGC AAGCTACCTC CAGAAACCCT  GAGTGCCTCG GGTTTAAAAG AATGCTTCAA AAGAAAAGGA TTTTCGACCC AGGAGCTTGT TGCTTTATCT GGGGCACATA CGATAGGGAG TAAAGGTTTT GGGGATCCGA CAGTTTTTGA  CAATGCATAC TACAAAATCC TTCTTGAAAA ACCATGGACA TCAAATTCCA AAATGACGAG CATGGTCGGC CTCCCTTCGG ATCATGCCTT AGTGGACGAT GATGAGTGCT TAAGGTGGGT  GAAACGATAT GCAGAAGACG AAGACAAGTT CTTCGAAGAC TTCACCAATG CTTATATCAA ACTAGTTAAT TCTGGGGCCA AATGGAATAA GTTATGATGT TTAATTTTAT CTTTTGTTAG  CTCATAAGTG TTTCAAACAT GCCTGAATAT TTTGGGTAGT AATGCTTATT TGCTAGTAAG TAAAAAGTTT CTCTGCTTAC TACTACAAAC CTAAACATCA AATATACCCA AAATTTACAC 
TTACTTACTC G 

Retrieve as FASTA