Entry information : BstrPrx17Bostr.19424s0962
Entry ID 14944
Creation 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: BstrPrx17Bostr.19424s0962
Name BstrPrx17Bostr.19424s0962
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx039]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Boechera
Organism Boechera stricta    [TaxId: 72658 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value BstrPrx17
start..stop
S start..stop
AhalPrx23 655 0 1..339 1..339
AlyPrx29 653 0 1..339 1..339
AtPrx29 652 0 1..339 1..339
CagraPrx54 635 0 1..339 1..341
Literature and cross-references BstrPrx17Bostr.19424s0962
Protein sequence: BstrPrx17Bostr.19424s0962
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   339 (311)
PWM (Da):   %s   36671.02 (33660.5)  
PI (pH):   %s   4.85 (4.67) Peptide Signal:   %s   cut: 29 range:29-339
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MKPKSKVAES AAASCFLVMS LLCICINGDQ METNYGGLSY SYYEKTCPRV EEIVRSSLSS MFILDPTSPA ALLRLMFHDC QVQGCDASIL LEPSGDQQFT ELDSAKNFGI RKRDLVGFIK  TSLETECPKQ VSCSDVIILA AREAVALTGG PLIAVPLGRK DSLSTHSKHV ADSELPPSTA DVDTTLSLFA GKGMTVEESV AIMGSHTIGV THCNNVLSRF DNANVTSENM DPRFQTFLRV 
ACPEFSPTSQ AAEATFVPND HTSVIFDTAY YDNAIAGRGN LRIDSEVGAD PRTRPFAEAF AADQDRFFNA FSSAFVKLSS YKVLTGNEGV VRSVCDKVD* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CTACTGATAT TAATTACCTC CAATTCCAAA CAAAAAAGAA AGTGATGAAA CCAAAGAGCA AAGTTGCAGA ATCTGCAGCT GCGTCATGTT TTCTTGTCAT GAGCTTGTTA TGTATCTGTA  TTAACGGTGA CCAAATGGAG ACTAATTATG GAGGCTTATC TTACAGTTAC TACGAGAAAA CTTGTCCCAG AGTCGAAGAG ATCGTGAGAT CTTCACTTTC ATCAATGTTT ATACTTGATC  CTACTTCTCC TGCAGCCTTG CTAAGGCTTA TGTTTCATGA CTGCCAAGTT CAGGTTCTCT ATCTCTAGCT AAATCCATCT CTCTATCTCG CTCTAAGAAA ATTCTCAATA TATGTTTTCA  ACTCAATAAG GTTTGCTTTA ACAAAAAAGA AAAAAAAAAC TTAATAGGAT TTGGGTTGAA AAGTGTTTAT TAATTATGTT AAGGATTCGA ATTTATACAT TTTACGTGAA TAAACATATC  AGCATGTCAT GATTAGGATC ATTAGTTATA TGTATGATCA TTCCGTCTTT AAAAATGCCA AAATTGGACG TTCGTACATG ATATCTGGTT TTAAGTATAT TTTTTCTGCC ATGTATTTGA  GCTTTCGTTT TATTTTTTGT TTAAATTTGT TTATATATAC GAACAAAAGT TTGAGATGTT TCACATACGA TTGTATGTTT TTGCTAACTA TGTAATTTAT AATGCATGTG ATCGATAAAT  TTAGAAGACA ACAGGACACC GAAATTTTGC TAAGACCACT TTAATTGGTT AAACATGTCA CGGTCCACTG TGGACTATAT GTAAAGAGAA TATTGTATTT CTTTCCATAT CAGTGCGCGT  CATGTCACTA CATAGGAAAA TGTCGTGACT AAATTTATAT TTACCAAAAT ATACAAAAAA AGAAAAGAAA ACTATTTTCA TTAATCGGAT TCGGATACAT ACGAAAACAA ATACTTATGG  TCGTGTATTG GAGATCACAT GTCATACTGA TCAGTTAATA GAATTTATGA ATAATTTAAC GTACATGCAC GAGAATTCAA TGTTTTATAT TATATAAACC ACAATCATTG TTTTTTCGAA  AAAAAAAGTC ACAAAATTTC GTATCCATAA TCTTTTAAAG AGATGTAGAA GACCTCGAAT AGATCATTGT TCTTGGTATT TATTGCATCT CATCCGTCAT CATTAATTGT CGGGAACAAA  AATATGTGGC TTATGTAACA GGGCTGTGAC GCATCGATCC TACTCGAGCC AAGCGGGGAC CAGCAGTTCA CAGAGCTTGA TTCAGCCAAG AACTTCGGAA TCAGAAAGAG AGACCTGGTT  GGCTTTATCA AAACCTCACT GGAGACGGAG TGTCCCAAGC AAGTTTCATG CTCTGACGTT ATCATCCTCG CCGCCAGAGA AGCCGTGGCT CTCACGGGAG GCCCACTCAT CGCAGTGCCA  TTAGGAAGAA AAGACTCTCT CTCCACTCAC AGCAAACACG TGGCAGACTC TGAGCTCCCT CCCTCCACTG CTGACGTGGA CACTACCTTA AGCCTCTTTG CCGGCAAAGG CATGACCGTA  GAAGAGTCCG TGGCCATCAT GGGTATACAT ATTTTTACTT CTTATAACAA GACACTCAAT TATGTGCAAA TATAATTCAT ATAATAAGAA TTCTTCTCTT GTAGGTTCAC ATACAATAGG  AGTGACACAC TGCAACAATG TATTATCGCG TTTCGATAAC GCAAATGTGA CAAGCGAGAA CATGGATCCA CGTTTCCAAA CGTTTTTGCG TGTTGCTTGT CCAGAGTTTT CTCCAACCTC  CCAAGCCGCG GAAGCCACAT TTGTTCCCAA CGATCATACT TCGGTGATCT TTGATACAGC TTATTACGAT AATGCCATCG CGGGACGTGG TAATCTCAGA ATTGATTCGG AAGTTGGAGC  TGACCCACGC ACACGTCCGT TTGCTGAAGC CTTTGCGGCT GATCAAGACC GTTTCTTCAA CGCCTTCTCT TCCGCGTTTG TAAAATTGTC GTCTTACAAG GTGTTAACCG GGAATGAAGG 
AGTAGTTAGA AGCGTGTGTG ACAAAGTAGA TTGATGTATA TTATAATTAT CAAATGTTAA ATGACAAAAT ATTATAATCC GT 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAACCAA AGAGCAAAGT TGCAGAATCT GCAGCTGCGT CATGTTTTCT TGTCATGAGC TTGTTATGTA TCTGTATTAA CGGTGACCAA ATGGAGACTA ATTATGGAGG CTTATCTTAC  AGTTACTACG AGAAAACTTG TCCCAGAGTC GAAGAGATCG TGAGATCTTC ACTTTCATCA ATGTTTATAC TTGATCCTAC TTCTCCTGCA GCCTTGCTAA GGCTTATGTT TCATGACTGC  CAAGTTCAGG GCTGTGACGC ATCGATCCTA CTCGAGCCAA GCGGGGACCA GCAGTTCACA GAGCTTGATT CAGCCAAGAA CTTCGGAATC AGAAAGAGAG ACCTGGTTGG CTTTATCAAA  ACCTCACTGG AGACGGAGTG TCCCAAGCAA GTTTCATGCT CTGACGTTAT CATCCTCGCC GCCAGAGAAG CCGTGGCTCT CACGGGAGGC CCACTCATCG CAGTGCCATT AGGAAGAAAA  GACTCTCTCT CCACTCACAG CAAACACGTG GCAGACTCTG AGCTCCCTCC CTCCACTGCT GACGTGGACA CTACCTTAAG CCTCTTTGCC GGCAAAGGCA TGACCGTAGA AGAGTCCGTG  GCCATCATGG GTTCACATAC AATAGGAGTG ACACACTGCA ACAATGTATT ATCGCGTTTC GATAACGCAA ATGTGACAAG CGAGAACATG GATCCACGTT TCCAAACGTT TTTGCGTGTT  GCTTGTCCAG AGTTTTCTCC AACCTCCCAA GCCGCGGAAG CCACATTTGT TCCCAACGAT CATACTTCGG TGATCTTTGA TACAGCTTAT TACGATAATG CCATCGCGGG ACGTGGTAAT  CTCAGAATTG ATTCGGAAGT TGGAGCTGAC CCACGCACAC GTCCGTTTGC TGAAGCCTTT GCGGCTGATC AAGACCGTTT CTTCAACGCC TTCTCTTCCG CGTTTGTAAA ATTGTCGTCT 
TACAAGGTGT TAACCGGGAA TGAAGGAGTA GTTAGAAGCG TGTGTGACAA AGTAGATTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CTACTGATAT TAATTACCTC CAATTCCAAA CAAAAAAGAA AGTGATGAAA CCAAAGAGCA AAGTTGCAGA ATCTGCAGCT GCGTCATGTT TTCTTGTCAT GAGCTTGTTA TGTATCTGTA  TTAACGGTGA CCAAATGGAG ACTAATTATG GAGGCTTATC TTACAGTTAC TACGAGAAAA CTTGTCCCAG AGTCGAAGAG ATCGTGAGAT CTTCACTTTC ATCAATGTTT ATACTTGATC  CTACTTCTCC TGCAGCCTTG CTAAGGCTTA TGTTTCATGA CTGCCAAGTT CAGGGCTGTG ACGCATCGAT CCTACTCGAG CCAAGCGGGG ACCAGCAGTT CACAGAGCTT GATTCAGCCA  AGAACTTCGG AATCAGAAAG AGAGACCTGG TTGGCTTTAT CAAAACCTCA CTGGAGACGG AGTGTCCCAA GCAAGTTTCA TGCTCTGACG TTATCATCCT CGCCGCCAGA GAAGCCGTGG  CTCTCACGGG AGGCCCACTC ATCGCAGTGC CATTAGGAAG AAAAGACTCT CTCTCCACTC ACAGCAAACA CGTGGCAGAC TCTGAGCTCC CTCCCTCCAC TGCTGACGTG GACACTACCT  TAAGCCTCTT TGCCGGCAAA GGCATGACCG TAGAAGAGTC CGTGGCCATC ATGGGTTCAC ATACAATAGG AGTGACACAC TGCAACAATG TATTATCGCG TTTCGATAAC GCAAATGTGA  CAAGCGAGAA CATGGATCCA CGTTTCCAAA CGTTTTTGCG TGTTGCTTGT CCAGAGTTTT CTCCAACCTC CCAAGCCGCG GAAGCCACAT TTGTTCCCAA CGATCATACT TCGGTGATCT  TTGATACAGC TTATTACGAT AATGCCATCG CGGGACGTGG TAATCTCAGA ATTGATTCGG AAGTTGGAGC TGACCCACGC ACACGTCCGT TTGCTGAAGC CTTTGCGGCT GATCAAGACC  GTTTCTTCAA CGCCTTCTCT TCCGCGTTTG TAAAATTGTC GTCTTACAAG GTGTTAACCG GGAATGAAGG AGTAGTTAGA AGCGTGTGTG ACAAAGTAGA TTGATGTATA TTATAATTAT 
CAAATGTTAA ATGACAAAAT ATTATAATCC GT 

Retrieve as FASTA