Entry information : BstrPrx18Bostr.9686s0004
Entry ID 14945
Creation 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: BstrPrx18Bostr.9686s0004
Name BstrPrx18Bostr.9686s0004
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx035]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Boechera
Organism Boechera stricta    [TaxId: 72658 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value BstrPrx18
start..stop
S start..stop
BstrPrx36 661 0 1..345 1..344
CrubPrx47 649 0 1..345 1..345
AhalPrx37 634 0 1..345 1..346
AtPrx37 632 0 1..345 1..346
Literature and cross-references BstrPrx18Bostr.9686s0004
Protein sequence: BstrPrx18Bostr.9686s0004
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   345 (323)
PWM (Da):   %s   38152.3 (35577.8)  
PI (pH):   %s   6.36 (5.46) Peptide Signal:   %s   cut: 23 range:23-345
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MHFSLIKLGF LLLLLQVSLS HAQLSPSFYD KTCPQVFDIA TKTIVNALRS DPRIAASILR LHFHDCFVNG CDASILLDNT TSFRTEKDAF GNANSARGFD VIDKMKADVE KACPKTVSCA  DLLAIAAQES VVLAGGPSWK VPGGRRDSLR GFMDLANDNL PAPFLTLKEL KDKFENVGLD RPSDLVALSG GHTFGKNQCQ FIMDRLYNFN DSGLPDPTLD KSYLSTLRKQ CPRDGNQSVL 
VDFDLRTPTL FDNKYYVNLK ENKGLIQTDQ ELFSSPDASD TIPLVRTYAD SQGKFFDAFV EAMIRMGNLS PLTGKQGEIR LNCRVVNSKS KMMDVVDAFD FASSI* 

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Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AATTCTCTTA GAGAGCAAAG AAAATGCATT TCTCGTTGAT AAAATTGGGA TTTCTTCTTC TTCTTCTTCA GGTATCACTG TCACATGCTC AACTAAGCCC TTCCTTTTAC GATAAAACAT  GTCCCCAAGT CTTTGACATT GCAACCAAAA CCATTGTCAA TGCACTGAGA TCAGACCCTC GTATCGCTGC AAGTATCCTT CGTCTTCATT TCCATGACTG CTTTGTTAAT GTAAGATATC  ACCAGATTCC ATATATTCAT GTATATATAT TAAGTCTTTT GGTCCTCTAA TAGTTTATCC TAAAGAGCAT GAATGCTTTA CGGATATTAT AAACTTGAAA TCAGAATATG AAAATGTGAT  GAACATTTCA ATTTGTGGTT CGACTCAAGT TATTCGTTTC ACGTTTTATT CATTTCAAAT CTGTGAATTT CTTTTTGTTA ATTTGGTTAA ATTTTGGCTT TCACAATTTA TTCATTTCTG  TTTGTTTTTG TTCAATTAAT TTGGTGGGGA TATATTATAA ATGGACCAAC CGCTTCTTAA TGAAATGAAT ATGATAATAT TAGTACAACT TTACACAGAT TGCTGTGCTT TCTTATCTCA  AGTTTCAGAG TTTGTCGTCA AAGATGATTA GATAATAATT ATTGGACTCA TATTAGTTTC CTTCAATTCG GCATATATAT TTGACTACAT AGTTCTTTTG GATTTTTATT ACATTTGAAT  ACCATATTTG TTACGGAGAT CAAAATCAGT TTTCTCTCCA CTAATTAATA GATTCCCTAG ATATCGTGAT CCATTAGTGG TAAATGCCTT AATGTCCTAG TGGCCCATAA ATGTTGTTTT  CGAATTCTTT ACCCTAGTGA CAGTGTGATA CTATTTACTT GCAGTAAAAA AAGGAAAAAA AAAATGCCGT GGTTGCGGGT AGAATTTGTT TATATATATT TGTTTTGACA ACATATAATT  TGTTTATATA AAATAAATGG GGAACACAAA GTATTGCACT GTTTACGGCT ATGAAAATGT TGCGAATTAA CTATGAATGT GGTACTTGAC TAAAAAGCTG AAGAAAATAT GTTGTTTTGA  AAAAGGGATG TGATGCATCG ATATTGTTAG ACAACACAAC ATCGTTTAGG ACGGAGAAAG ACGCGTTTGG GAACGCTAAT TCTGCTCGAG GTTTCGATGT GATCGACAAA ATGAAGGCTG  ACGTTGAGAA AGCATGTCCT AAAACAGTTT CATGTGCTGA TTTGCTCGCC ATCGCAGCAC AAGAATCGGT CGTTTTGGTA TGCATTTTTT ACAATACATA CTAAGCAAAT ACACATCTTT  TATATTTTAA TTCCATTTGA AACGTTTTCT AGATAATGTT GTTGATTTTT AAGCAGAAGA AAATATTTAA GACCAAATAT AATTGTGTTG TCCATAGGCG GGAGGTCCTT CATGGAAGGT  TCCAGGTGGA AGAAGAGACA GCTTAAGAGG GTTTATGGAT CTTGCTAACG ATAACCTTCC AGCTCCATTC CTTACCCTTA AAGAACTTAA GGATAAATTC GAAAATGTTG GACTCGACCG  TCCTTCTGAT CTCGTTGCTC TTTCCGGTAC GTTATCAATG GAAACATTTT CATCCGTAGT TGTAATCACT AATAACTCTA TATGGCTATT GGTTTAGTTA ACTTATTCTT TTGATATTTT  TCTTTGGTTA GGTGGTCACA CCTTTGGCAA AAACCAATGT CAGTTCATAA TGGATCGGCT TTACAACTTC AATGACTCCG GTTTACCCGA CCCAACCCTT GATAAATCTT ACCTCAGCAC  GCTTAGAAAA CAATGTCCGC GTGATGGAAA CCAGAGTGTC TTGGTAGATT TTGATTTACG TACGCCAACA CTCTTTGACA ACAAATACTA TGTGAATCTC AAAGAGAACA AAGGACTTAT  CCAGACCGAC CAAGAGTTAT TCTCTAGTCC TGATGCTTCA GACACTATCC CTTTAGTCCG GACATACGCT GATAGTCAAG GGAAATTTTT CGACGCGTTT GTGGAGGCAA TGATAAGGAT  GGGAAACCTT TCACCTTTAA CAGGGAAACA AGGAGAAATT AGATTGAACT GTAGAGTGGT GAATTCGAAA TCGAAAATGA TGGATGTGGT AGATGCTTTT GACTTTGCAA GCTCAATATG 
AGGAAATGAC TTTCTTCTAA TAATAAATAA AATATCAATG TTATCAAGAT GTTATCTTTT TC 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCATTTCT CGTTGATAAA ATTGGGATTT CTTCTTCTTC TTCTTCAGGT ATCACTGTCA CATGCTCAAC TAAGCCCTTC CTTTTACGAT AAAACATGTC CCCAAGTCTT TGACATTGCA  ACCAAAACCA TTGTCAATGC ACTGAGATCA GACCCTCGTA TCGCTGCAAG TATCCTTCGT CTTCATTTCC ATGACTGCTT TGTTAATGGA TGTGATGCAT CGATATTGTT AGACAACACA  ACATCGTTTA GGACGGAGAA AGACGCGTTT GGGAACGCTA ATTCTGCTCG AGGTTTCGAT GTGATCGACA AAATGAAGGC TGACGTTGAG AAAGCATGTC CTAAAACAGT TTCATGTGCT  GATTTGCTCG CCATCGCAGC ACAAGAATCG GTCGTTTTGG CGGGAGGTCC TTCATGGAAG GTTCCAGGTG GAAGAAGAGA CAGCTTAAGA GGGTTTATGG ATCTTGCTAA CGATAACCTT  CCAGCTCCAT TCCTTACCCT TAAAGAACTT AAGGATAAAT TCGAAAATGT TGGACTCGAC CGTCCTTCTG ATCTCGTTGC TCTTTCCGGT GGTCACACCT TTGGCAAAAA CCAATGTCAG  TTCATAATGG ATCGGCTTTA CAACTTCAAT GACTCCGGTT TACCCGACCC AACCCTTGAT AAATCTTACC TCAGCACGCT TAGAAAACAA TGTCCGCGTG ATGGAAACCA GAGTGTCTTG  GTAGATTTTG ATTTACGTAC GCCAACACTC TTTGACAACA AATACTATGT GAATCTCAAA GAGAACAAAG GACTTATCCA GACCGACCAA GAGTTATTCT CTAGTCCTGA TGCTTCAGAC  ACTATCCCTT TAGTCCGGAC ATACGCTGAT AGTCAAGGGA AATTTTTCGA CGCGTTTGTG GAGGCAATGA TAAGGATGGG AAACCTTTCA CCTTTAACAG GGAAACAAGG AGAAATTAGA 
TTGAACTGTA GAGTGGTGAA TTCGAAATCG AAAATGATGG ATGTGGTAGA TGCTTTTGAC TTTGCAAGCT CAATATGA 

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cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AATTCTCTTA GAGAGCAAAG AAAATGCATT TCTCGTTGAT AAAATTGGGA TTTCTTCTTC TTCTTCTTCA GGTATCACTG TCACATGCTC AACTAAGCCC TTCCTTTTAC GATAAAACAT  GTCCCCAAGT CTTTGACATT GCAACCAAAA CCATTGTCAA TGCACTGAGA TCAGACCCTC GTATCGCTGC AAGTATCCTT CGTCTTCATT TCCATGACTG CTTTGTTAAT GGATGTGATG  CATCGATATT GTTAGACAAC ACAACATCGT TTAGGACGGA GAAAGACGCG TTTGGGAACG CTAATTCTGC TCGAGGTTTC GATGTGATCG ACAAAATGAA GGCTGACGTT GAGAAAGCAT  GTCCTAAAAC AGTTTCATGT GCTGATTTGC TCGCCATCGC AGCACAAGAA TCGGTCGTTT TGGCGGGAGG TCCTTCATGG AAGGTTCCAG GTGGAAGAAG AGACAGCTTA AGAGGGTTTA  TGGATCTTGC TAACGATAAC CTTCCAGCTC CATTCCTTAC CCTTAAAGAA CTTAAGGATA AATTCGAAAA TGTTGGACTC GACCGTCCTT CTGATCTCGT TGCTCTTTCC GGTGGTCACA  CCTTTGGCAA AAACCAATGT CAGTTCATAA TGGATCGGCT TTACAACTTC AATGACTCCG GTTTACCCGA CCCAACCCTT GATAAATCTT ACCTCAGCAC GCTTAGAAAA CAATGTCCGC  GTGATGGAAA CCAGAGTGTC TTGGTAGATT TTGATTTACG TACGCCAACA CTCTTTGACA ACAAATACTA TGTGAATCTC AAAGAGAACA AAGGACTTAT CCAGACCGAC CAAGAGTTAT  TCTCTAGTCC TGATGCTTCA GACACTATCC CTTTAGTCCG GACATACGCT GATAGTCAAG GGAAATTTTT CGACGCGTTT GTGGAGGCAA TGATAAGGAT GGGAAACCTT TCACCTTTAA  CAGGGAAACA AGGAGAAATT AGATTGAACT GTAGAGTGGT GAATTCGAAA TCGAAAATGA TGGATGTGGT AGATGCTTTT GACTTTGCAA GCTCAATATG AGGAAATGAC TTTCTTCTAA 
TAATAAATAA AATATCAATG TTATCAAGAT GTTATCTTTT TC 

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