Entry information : BstrPrx24Bostr.0568s0392
Entry ID 14951
Creation 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: BstrPrx24Bostr.0568s0392
Name BstrPrx24Bostr.0568s0392
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx006]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Boechera
Organism Boechera stricta    [TaxId: 72658 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value BstrPrx24
start..stop
S start..stop
AhalPrx30 645 0 1..328 1..328
CagraPrx67 645 0 1..328 1..328
CrubPrx67 645 0 1..328 1..328
AlyPrx71 637 0 1..328 1..328
Literature and cross-references BstrPrx24Bostr.0568s0392
Protein sequence: BstrPrx24Bostr.0568s0392
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   328 (305)
PWM (Da):   %s   34820.53 (32229.2)  
PI (pH):   %s   8.43 (8.41) Peptide Signal:   %s   cut: 24 range:24-328
Sequence
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Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGLVRSLCLF ITFLSCLISS VHGQAAARPG PVSGTRIGFY ATTCPNVETI VRNAVNAGFS SDPRIAPGIL RMHFHDCFVQ GCDGSILISG ANTERTAGPN VNLRGFEVID NAKTQLEAAC  PGVVSCADIL ALAARDTVVL SRGTGWQVPT GRRDGRVSLA SNVNNLPGPR DSVAVQQQKF SAFGLNTRDL VVLVGGHTIG TAGCGAFRNR LFNSTGQPAD PTIDPTFLAQ LQTQCPQNGD 
ASVRVDLDTG SGTTWDTSYY NNLSRGRGVL QSDQVLWTDP ATRPIVQQLM APRSTFNVEF ARSMVRMSNI GVVTGANGEI RRVCSAVN* 

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Remarks
DNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CACACTTCAT CTTTTTTTAA ACCCTAAAAT ATAAATACAA GATGGGTTTG GTTAGATCAT TGTGCTTATT CATAACCTTC CTTAGTTGTC TTATCAGCTC GGTCCATGGC CAAGCCGCCG  CAAGGCCGGG TCCTGTTTCT GGCACAAGGA TCGGGTTTTA TGCGACCACG TGTCCTAACG TTGAAACCAT TGTCCGAAAT GCCGTGAATG CTGGTTTCAG TTCCGACCCC AGAATTGCAC  CCGGAATACT GAGAATGCAT TTCCACGACT GTTTTGTCCA AGGTTGTGAC GGTTCGATCC TTATATCGGG AGCTAACACA GAGAGAACCG CGGGTCCGAA CGTCAATCTC CGTGGATTTG  AAGTCATAGA CAACGCCAAA ACGCAGCTCG AAGCCGCGTG TCCAGGAGTT GTCTCTTGTG CTGATATTTT AGCCTTAGCC GCTCGTGACA CTGTCGTCCT CGTAAGCCTT TACTAATTCA  TAAACGCAAA TGCATGAATA TTAATTTTCT TATTTTATAT GTAAATAACG TATACGTGCA TGGGTGATGG GTTAATTTGC ATGCAGTCGA GAGGAACAGG CTGGCAAGTA CCAACGGGAC  GTAGAGATGG TCGAGTTTCT TTGGCGTCGA ATGTTAACAA TCTCCCTGGT CCCCGTGACT CTGTTGCCGT TCAACAACAG AAATTCTCGG CTTTCGGACT CAATACCCGT GATCTCGTCG  TCCTCGTTGG TCAGTAGTTT AAACTTAACA CATTCGAGAA CTATAATTAC CATATTAATT CAAAAAAATA ACGTTAGAAA ACTCTTCATG TGTTCGTTGA ATACTTGGCA ACAGTCAAGC  ACCTAAACTA TCTAAACCTC TTTAGCGCAT GAAGTGTTTC TTAACATTTT TTTTAAAAAA CATTATTTGC AAATCTTTAG GATCAGAACA ATAACAACAT ATACTAAATC AATTTGTACA  TAATTTAACA GGAGGACACA CGATCGGAAC AGCAGGATGT GGTGCATTCA GGAACAGGCT ATTCAATAGC ACCGGACAAC CCGCGGATCC AACCATAGAC CCAACATTTT TGGCGCAGCT  TCAAACACAA TGTCCCCAAA ACGGAGACGC TTCGGTGCGC GTTGATCTTG ACACCGGAAG CGGAACCACT TGGGACACTT CTTACTACAA CAACCTAAGC CGTGGCCGTG GAGTTCTCCA  ATCCGATCAG GTCCTTTGGA CCGATCCAGC CACTAGACCC ATAGTGCAAC AATTGATGGC TCCTAGAAGC ACCTTCAACG TTGAGTTTGC GAGGTCAATG GTCAGAATGA GTAATATTGG  TGTGGTTACG GGGGCTAATG GGGAAATCCG TAGGGTTTGC TCTGCGGTTA ATTAATTAAC CGATTAAAAT CATGACGCTA AGTACTTGTT TCGAGTTTGA TTTTAATTTC AACAATAAAT  AAACCAATAG AAAACGACAT AAGAAAAAAC CCAAAAGTGG GTTGATGAAT ATTGTATCTA TAAGGTGTCG ATATTCGATT TCTTTTGGTT TGGTTTTTAT TAATAAAATG ATATGTCATC 

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CDS
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGTTTGG TTAGATCATT GTGCTTATTC ATAACCTTCC TTAGTTGTCT TATCAGCTCG GTCCATGGCC AAGCCGCCGC AAGGCCGGGT CCTGTTTCTG GCACAAGGAT CGGGTTTTAT  GCGACCACGT GTCCTAACGT TGAAACCATT GTCCGAAATG CCGTGAATGC TGGTTTCAGT TCCGACCCCA GAATTGCACC CGGAATACTG AGAATGCATT TCCACGACTG TTTTGTCCAA  GGTTGTGACG GTTCGATCCT TATATCGGGA GCTAACACAG AGAGAACCGC GGGTCCGAAC GTCAATCTCC GTGGATTTGA AGTCATAGAC AACGCCAAAA CGCAGCTCGA AGCCGCGTGT  CCAGGAGTTG TCTCTTGTGC TGATATTTTA GCCTTAGCCG CTCGTGACAC TGTCGTCCTC TCGAGAGGAA CAGGCTGGCA AGTACCAACG GGACGTAGAG ATGGTCGAGT TTCTTTGGCG  TCGAATGTTA ACAATCTCCC TGGTCCCCGT GACTCTGTTG CCGTTCAACA ACAGAAATTC TCGGCTTTCG GACTCAATAC CCGTGATCTC GTCGTCCTCG TTGGAGGACA CACGATCGGA  ACAGCAGGAT GTGGTGCATT CAGGAACAGG CTATTCAATA GCACCGGACA ACCCGCGGAT CCAACCATAG ACCCAACATT TTTGGCGCAG CTTCAAACAC AATGTCCCCA AAACGGAGAC  GCTTCGGTGC GCGTTGATCT TGACACCGGA AGCGGAACCA CTTGGGACAC TTCTTACTAC AACAACCTAA GCCGTGGCCG TGGAGTTCTC CAATCCGATC AGGTCCTTTG GACCGATCCA  GCCACTAGAC CCATAGTGCA ACAATTGATG GCTCCTAGAA GCACCTTCAA CGTTGAGTTT GCGAGGTCAA TGGTCAGAAT GAGTAATATT GGTGTGGTTA CGGGGGCTAA TGGGGAAATC 
CGTAGGGTTT GCTCTGCGGT TAATTAA 

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cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CACACTTCAT CTTTTTTTAA ACCCTAAAAT ATAAATACAA GATGGGTTTG GTTAGATCAT TGTGCTTATT CATAACCTTC CTTAGTTGTC TTATCAGCTC GGTCCATGGC CAAGCCGCCG  CAAGGCCGGG TCCTGTTTCT GGCACAAGGA TCGGGTTTTA TGCGACCACG TGTCCTAACG TTGAAACCAT TGTCCGAAAT GCCGTGAATG CTGGTTTCAG TTCCGACCCC AGAATTGCAC  CCGGAATACT GAGAATGCAT TTCCACGACT GTTTTGTCCA AGGTTGTGAC GGTTCGATCC TTATATCGGG AGCTAACACA GAGAGAACCG CGGGTCCGAA CGTCAATCTC CGTGGATTTG  AAGTCATAGA CAACGCCAAA ACGCAGCTCG AAGCCGCGTG TCCAGGAGTT GTCTCTTGTG CTGATATTTT AGCCTTAGCC GCTCGTGACA CTGTCGTCCT CTCGAGAGGA ACAGGCTGGC  AAGTACCAAC GGGACGTAGA GATGGTCGAG TTTCTTTGGC GTCGAATGTT AACAATCTCC CTGGTCCCCG TGACTCTGTT GCCGTTCAAC AACAGAAATT CTCGGCTTTC GGACTCAATA  CCCGTGATCT CGTCGTCCTC GTTGGAGGAC ACACGATCGG AACAGCAGGA TGTGGTGCAT TCAGGAACAG GCTATTCAAT AGCACCGGAC AACCCGCGGA TCCAACCATA GACCCAACAT  TTTTGGCGCA GCTTCAAACA CAATGTCCCC AAAACGGAGA CGCTTCGGTG CGCGTTGATC TTGACACCGG AAGCGGAACC ACTTGGGACA CTTCTTACTA CAACAACCTA AGCCGTGGCC  GTGGAGTTCT CCAATCCGAT CAGGTCCTTT GGACCGATCC AGCCACTAGA CCCATAGTGC AACAATTGAT GGCTCCTAGA AGCACCTTCA ACGTTGAGTT TGCGAGGTCA ATGGTCAGAA  TGAGTAATAT TGGTGTGGTT ACGGGGGCTA ATGGGGAAAT CCGTAGGGTT TGCTCTGCGG TTAATTAATT AACCGATTAA AATCATGACG CTAAGTACTT GTTTCGAGTT TGATTTTAAT  TTCAACAATA AATAAACCAA TAGAAAACGA CATAAGAAAA AACCCAAAAG TGGGTTGATG AATATTGTAT CTATAAGGTG TCGATATTCG ATTTCTTTTG GTTTGGTTTT TATTAATAAA 
ATGATATGTC ATC 

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