Entry information : BstrPrx25Bostr.12302s0103
Entry ID 14952
Creation 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: BstrPrx25Bostr.12302s0103
Name BstrPrx25Bostr.12302s0103
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx037]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Boechera
Organism Boechera stricta    [TaxId: 72658 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value BstrPrx25
start..stop
S start..stop
CrubPrx52 663 0 21..366 1..346
09 654 0 21..366 1..346
AlyPrx09 652 0 21..366 1..346
AhalPrx34 649 0 21..366 1..346
Literature and cross-references BstrPrx25Bostr.12302s0103
Protein sequence: BstrPrx25Bostr.12302s0103
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   366
PWM (Da):   %s   39995.38 Transmb domain:   %s   i21-43o
PI (pH):   %s   7.99
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MYKTPTTLLL SHLKNSQVTK MAISMLIRGL VLFALFSFDI VVGHPGLGFG WRSNGPIGGS FTSSLYPQFY QFSCPQADEI VMTVLEKAIA KEPRMAASLL RLHFHDCFVQ GCDASILLDD  SATIRSEKNA GPNKNSIRGF QVIDEIKAKL EQVCPQVVSC ADILALAARG STILSGGPSW ELPLGRRDSR TASLNGANTN IPAPNSTIQN LLTMFRRQGL NEEDLVSLSG GHTIGVARCT  TFKQRLYNQN GNNQPDETLE RSYYYGLRSI CPPTGGDNNI SPLDLASPAR FDNTYFKLLL WGKGLLTSDE VLLTGNVGKT VALVKAYAED ESLFFQQFAV SMVNMGNIQP LTGFNGEIRK 
SCHVIN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CATTTTCAAT GTTCGACTCT CATACAACAC AAGGATGTTA GACAGTGCAG ATGCTTATGG TTGAAAGCCT TACCTAATAG TGGTACAATG CGTTTTTGTT GGGATCACGT GTGAAGTTAG  GCACATGGAT TCGTTCTTGG AGTTGGTAGA AGACCTCAAA AAGACAAATA GGAGGTATAA TAAGAACAAG TTGACTATGT CTCTCTCTTA ACCTTACATT CTAAACTAGG ATTTGGTAAA  CTAGGAGCAG TTAGCTTTTT GAATCTCTTC ATGTATAAAA CGCCCACCAC TCTACTACTA TCTCATCTTA AAAACTCTCA AGTTACGAAA ATGGCTATCT CAATGCTTAT TCGTGGTCTT  GTGCTCTTTG CTTTGTTCTC TTTTGATATT GTTGTTGGTC ATCCAGGTCT AGGATTTGGA TGGAGAAGTA ATGGCCCCAT TGGAGGATCT TTTACCTCAA GTCTTTACCC ACAATTCTAC  CAGTTCTCTT GCCCACAAGC TGATGAGATT GTCATGACAG TGCTGGAAAA AGCCATAGCT AAAGAGCCAA GAATGGCAGC ATCTTTACTC AGGCTTCACT TCCACGATTG CTTCGTCCAG  GTAAAGCCAT GACCTATTTT TTTTTTCCTT TTATTTGTCT AATAAGCTTA ACATTTATTA CTCTATGTAT AAACAGGGCT GTGATGCATC AATCTTGTTG GATGATAGTG CTACCATAAG  AAGTGAAAAG AATGCGGGAC CAAACAAGAA CTCCATTAGA GGGTTTCAAG TAATCGATGA GATCAAAGCC AAACTGGAGC AAGTTTGCCC TCAAGTCGTT TCCTGTGCCG ACATTCTAGC  TCTTGCTGCT CGTGGCTCAA CTATACTGGT AAAAAAAAGA GACCTTCAAG AGAAACTATT GGCGCACTTA CATGTATATA GCTTATATTT TCTGAATGTG GTTCAATACA GAGCGGTGGA  CCATCATGGG AGCTTCCACT AGGAAGGAGA GACTCGAGGA CAGCGAGCCT CAATGGAGCA AACACGAACA TTCCTGCACC AAACTCCACT ATTCAGAATC TTTTAACCAT GTTCCGACGC  CAAGGTTTGA ACGAAGAAGA CCTTGTTTCC CTATCAGGTG AGCTTAATAA CATGTATTAT TGTTTTGTTA TAGGGGTTCG CATGGAAACC AAACCGAAAC AGATTTTTAA AACCGAATGA  TAATAACATT TCTGCGCTGA ATAAAACCGA ACCGAACCCT AATTTAGTGC AAACAAACCT GAACTGAATA AACCAAAATT TTGCAGGAGG GCATACGATT GGAGTAGCGA GATGCACAAC  GTTCAAACAA AGGCTATACA ATCAAAACGG TAATAACCAA CCAGACGAGA CACTAGAGAG GTCTTACTAC TATGGTCTCA GATCGATTTG TCCACCAACG GGCGGTGACA ACAACATTTC  ACCTCTAGAC TTAGCCTCTC CTGCTCGATT CGACAACACA TACTTCAAGC TCCTCCTATG GGGCAAAGGC TTATTGACAT CAGATGAAGT GCTTCTCACT GGTAACGTAG GCAAGACTGT  TGCATTGGTG AAAGCTTACG CTGAAGACGA GAGCCTTTTC TTCCAACAAT TCGCAGTGTC GATGGTAAAC ATGGGGAACA TTCAGCCTCT TACTGGTTTT AATGGTGAGA TCAGGAAGAG  TTGTCATGTG ATTAATTAAA CCAAGCTGTG TTTCAGCATA TTATTGTATT AAGGGATGAT GAATAATAAG TCGTGCTATG GTTTTCTATA TATTAGTGAT CTAATTAACG TCTTTGAATG 
AAATTGGACG GTTGTTTCAA GGG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACAGTGC TGGAAAAAGC CATAGCTAAA GAGCCAAGAA TGGCAGCATC TTTACTCAGG CTTCACTTCC ACGATTGCTT CGTCCAGGGC TGTGATGCAT CAATCTTGTT GGATGATAGT  GCTACCATAA GAAGTGAAAA GAATGCGGGA CCAAACAAGA ACTCCATTAG AGGGTTTCAA GTAATCGATG AGATCAAAGC CAAACTGGAG CAAGTTTGCC CTCAAGTCGT TTCCTGTGCC  GACATTCTAG CTCTTGCTGC TCGTGGCTCA ACTATACTGA GCGGTGGACC ATCATGGGAG CTTCCACTAG GAAGGAGAGA CTCGAGGACA GCGAGCCTCA ATGGAGCAAA CACGAACATT  CCTGCACCAA ACTCCACTAT TCAGAATCTT TTAACCATGT TCCGACGCCA AGGTTTGAAC GAAGAAGACC TTGTTTCCCT ATCAGGAGGG CATACGATTG GAGTAGCGAG ATGCACAACG  TTCAAACAAA GGCTATACAA TCAAAACGGT AATAACCAAC CAGACGAGAC ACTAGAGAGG TCTTACTACT ATGGTCTCAG ATCGATTTGT CCACCAACGG GCGGTGACAA CAACATTTCA  CCTCTAGACT TAGCCTCTCC TGCTCGATTC GACAACACAT ACTTCAAGCT CCTCCTATGG GGCAAAGGCT TATTGACATC AGATGAAGTG CTTCTCACTG GTAACGTAGG CAAGACTGTT  GCATTGGTGA AAGCTTACGC TGAAGACGAG AGCCTTTTCT TCCAACAATT CGCAGTGTCG ATGGTAAACA TGGGGAACAT TCAGCCTCTT ACTGGTTTTA ATGGTGAGAT CAGGAAGAGT 
TGTCATGTGA TTAATTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CATTTTCAAT GTTCGACTCT CATACAACAC AAGGATGTTA GACAGTGCAG ATGCTTATGG TTGAAAGCCT TACCTAATAG TGGTACAATG CGTTTTTGTT GGGATCACGT GTGAAGTTAG  GCACATGGAT TCGTTCTTGG AGTTGGTAGA AGACCTCAAA AAGACAAATA GGAGGTCTAG GATTTGGATG GAGAAGTAAT GGCCCCATTG GAGGATCTTT TACCTCAAGT CTTTACCCAC  AATTCTACCA GTTCTCTTGC CCACAAGCTG ATGAGATTGT CATGACAGTG CTGGAAAAAG CCATAGCTAA AGAGCCAAGA ATGGCAGCAT CTTTACTCAG GCTTCACTTC CACGATTGCT  TCGTCCAGGG CTGTGATGCA TCAATCTTGT TGGATGATAG TGCTACCATA AGAAGTGAAA AGAATGCGGG ACCAAACAAG AACTCCATTA GAGGGTTTCA AGTAATCGAT GAGATCAAAG  CCAAACTGGA GCAAGTTTGC CCTCAAGTCG TTTCCTGTGC CGACATTCTA GCTCTTGCTG CTCGTGGCTC AACTATACTG AGCGGTGGAC CATCATGGGA GCTTCCACTA GGAAGGAGAG  ACTCGAGGAC AGCGAGCCTC AATGGAGCAA ACACGAACAT TCCTGCACCA AACTCCACTA TTCAGAATCT TTTAACCATG TTCCGACGCC AAGGTTTGAA CGAAGAAGAC CTTGTTTCCC  TATCAGGAGG GCATACGATT GGAGTAGCGA GATGCACAAC GTTCAAACAA AGGCTATACA ATCAAAACGG TAATAACCAA CCAGACGAGA CACTAGAGAG GTCTTACTAC TATGGTCTCA  GATCGATTTG TCCACCAACG GGCGGTGACA ACAACATTTC ACCTCTAGAC TTAGCCTCTC CTGCTCGATT CGACAACACA TACTTCAAGC TCCTCCTATG GGGCAAAGGC TTATTGACAT  CAGATGAAGT GCTTCTCACT GGTAACGTAG GCAAGACTGT TGCATTGGTG AAAGCTTACG CTGAAGACGA GAGCCTTTTC TTCCAACAAT TCGCAGTGTC GATGGTAAAC ATGGGGAACA  TTCAGCCTCT TACTGGTTTT AATGGTGAGA TCAGGAAGAG TTGTCATGTG ATTAATTAAA CCAAGCTGTG TTTCAGCATA TTATTGTATT AAGGGATGAT GAATAATAAG TCGTGCTATG 
GTTTTCTATA TATTAGTGAT CTAATTAACG TCTTTGAATG AAATTGGACG GTTGTTTCAA GGG 

Retrieve as FASTA