Entry information : BstrPrx30Bostr.7867s0416
Entry ID 14957
Creation 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: BstrPrx30Bostr.7867s0416
Name BstrPrx30Bostr.7867s0416
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx016]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Boechera
Organism Boechera stricta    [TaxId: 72658 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value BstrPrx30
start..stop
S start..stop
CagraPrx52 646 0 1..326 1..326
AtPrx43 635 0 1..326 1..326
TsPrx43 623 0 1..326 1..326
AlyPrx43 615 0 1..326 1..326
Literature and cross-references BstrPrx30Bostr.7867s0416
Protein sequence: BstrPrx30Bostr.7867s0416
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   326 (302)
PWM (Da):   %s   35317.13 (32684.7)  
PI (pH):   %s   6.99 (6.36) Peptide Signal:   %s   cut: 25 range:25-326
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAWTKAKMSL ALSLVTVFLG VSLADLKVGF YSNTCPQAES IVRRVVSGAA LSDPNLPAIL LRLHFHDCFV EGCDGSILVN NGAISEKNAF GHEGVRGFEI LEAAKAELEA ACPGVVSCSD  IVVLAARDAI SLANGPAYEV PTGRRDGRVS NMSLAKDMPE VSDSIQILKA KFMQKGLNAK ELVLLSAAHT IGTTACFFMT KRLYDFLPGG QPDPTINPVF LPELTTQCPQ NGDINVRLPM 
DRFSERVFDK QILHNIKDGF AVLQTDAGLY EDVTTRRVVD SYLGMLNPFF GPTFESDFVK AIVKMGRIGV KTGSKGEIRR VCSAFN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGTGGA CAAAGGCTAA GATGAGTCTA GCTTTGTCTC TGGTTACGGT TTTCCTCGGC GTCTCTCTTG CTGATCTCAA AGTCGGATTT TACTCCAATA CATGTCCTCA AGCCGAGTCA  ATCGTTAGGA GAGTCGTCTC AGGAGCTGCT CTTTCTGACC CTAACCTCCC AGCCATACTT CTACGGCTCC ATTTCCATGA CTGCTTTGTT GAGGTACAAT GCACTTTCCT CCTCTTTGTG  CTTTCTACTA TTGTTGCTAT GCTGATAGAT TTAACCACAC GTTCAGGGAT GTGATGGCTC AATCCTCGTG AATAACGGAG CAATCTCTGA AAAGAATGCC TTTGGGCATG AAGGCGTTAG  AGGATTTGAG ATATTAGAAG CCGCCAAAGC CGAGCTTGAA GCTGCATGCC CCGGTGTTGT CTCTTGCTCT GACATTGTTG TCTTGGCTGC ACGTGATGCC ATATCTTTGG TAAAAAAATC  AATTAGAGAA AGAAAAAAAA AAACTTTTGA TCTTCATATT TCTTCTTCTC CGTTGTGATC AATTCATGAT ACAGGCGAAT GGACCGGCGT ATGAGGTGCC AACTGGGCGG AGAGATGGTC  GGGTTTCGAA TATGTCGCTG GCTAAGGACA TGCCTGAGGT GAGTGACTCG ATTCAGATAC TAAAGGCCAA GTTCATGCAG AAGGGACTCA ACGCCAAAGA GCTCGTGCTT CTCAGTGGTA  TGTATCTCTT CTTCTTCTTT CTCTCTCCTT CATGTTTGTT TGTTGGTTTC GAATCTCTCG AGGTTTTGGG TTCGAAGTTC AAGTTATATG ATTTTCATTT CCCGAATCCG TGATGTGTTT  CGCATGTTTC GTCCGTTTCC TCTTCTCTTC GTGTGTTGGT GTCACGTGCT TCCGTGCGTT ACGAAGTTCT AGTTGACCAA TAAAAAAAAA AACATTTTTG GCTTTGTTTC CAGCCTAAGC  CAACAGTGTT TTCTTCCTCA GAAAAAAAGT TCTCTTGTAA ATTTGGATGA TAAATTCGAG AAATATAATT ATAACAAATA TCCAATTTTA CCTATGTTTT TGCTAATTTT AATGCGAAAA  AAATATTTAG GCTTTTTGCA ACTTACTTTA GGCACTTTTG CATGAATTTG TATTTTATTA CTACAAAATA TTTAGGAAGA TGTGTTTTGA ATTTCTGTCA TCTAATCCAC TAAATCGGGC  CTGGCCCAGA AATGTCATCA TTCACACGAA AATAGGCCTG TTATAGGATC GGCGGTTAAT CGGACAAAAC GTCATATAAA TATCTATCGG ACCATTCTTG TTTTTGACAT CTATCAGGTC  ATTCCTTAGA GTACATTTTA TAGGGTTAAA TCATCAACGT GCACGTGTGA CCAAAAAACA GAAGAAACTA TCAACATGCA TGAGTCTAAT ACTGTAGTGA CTAGTGATCA TGCCTTTCAA  ACCTGGTCTC AGTTTGTGTC ATTTTAATAT CTTAACATGA AATAAAAAAC TTTAACAAAA AAAAAACGAA AGTGTTTCTA GCTTTAAGAA ATCAAAAGAT CTAATAAAAT TGAGTGGTCC  ACTTTTCGTT CGTTCTAATA ATTTCTCTCA ACCGTATCAG CTGCTCACAC TATCGGAACA ACGGCCTGCT TCTTCATGAC CAAACGCCTC TACGATTTCT TACCCGGTGG CCAACCTGAC  CCTACCATCA ATCCGGTATT CCTACCCGAA TTAACCACTC AGTGCCCACA AAATGGTGAC ATAAACGTCC GGTTACCAAT GGACCGGTTC AGTGAACGAG TATTCGACAA GCAGATTCTG  CACAACATAA AGGATGGTTT CGCTGTGCTT CAGACCGATG CAGGTCTTTA CGAGGATGTA ACGACCCGAC GGGTTGTGGA TTCCTATCTT GGGATGCTAA ATCCGTTCTT TGGGCCAACG  TTCGAGTCTG ATTTCGTAAA GGCAATAGTG AAGATGGGGA GGATTGGTGT GAAGACTGGT TCTAAAGGGG AGATTCGACG GGTTTGCTCG GCCTTTAATT GAGAGAGCAT GCAATGAAAT  TGAAACTGTT GAATATCTTA TACTCAAAAA AATGTTTTGA TCTTTGACTC CAGAATATGT ATAGGCAAAA ATGCCTAAAA CAAAGAAAAT ATTACTGCAT GGTACATTAT ATTAAATGCG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGTGGA CAAAGGCTAA GATGAGTCTA GCTTTGTCTC TGGTTACGGT TTTCCTCGGC GTCTCTCTTG CTGATCTCAA AGTCGGATTT TACTCCAATA CATGTCCTCA AGCCGAGTCA  ATCGTTAGGA GAGTCGTCTC AGGAGCTGCT CTTTCTGACC CTAACCTCCC AGCCATACTT CTACGGCTCC ATTTCCATGA CTGCTTTGTT GAGGGATGTG ATGGCTCAAT CCTCGTGAAT  AACGGAGCAA TCTCTGAAAA GAATGCCTTT GGGCATGAAG GCGTTAGAGG ATTTGAGATA TTAGAAGCCG CCAAAGCCGA GCTTGAAGCT GCATGCCCCG GTGTTGTCTC TTGCTCTGAC  ATTGTTGTCT TGGCTGCACG TGATGCCATA TCTTTGGCGA ATGGACCGGC GTATGAGGTG CCAACTGGGC GGAGAGATGG TCGGGTTTCG AATATGTCGC TGGCTAAGGA CATGCCTGAG  GTGAGTGACT CGATTCAGAT ACTAAAGGCC AAGTTCATGC AGAAGGGACT CAACGCCAAA GAGCTCGTGC TTCTCAGTGC TGCTCACACT ATCGGAACAA CGGCCTGCTT CTTCATGACC  AAACGCCTCT ACGATTTCTT ACCCGGTGGC CAACCTGACC CTACCATCAA TCCGGTATTC CTACCCGAAT TAACCACTCA GTGCCCACAA AATGGTGACA TAAACGTCCG GTTACCAATG  GACCGGTTCA GTGAACGAGT ATTCGACAAG CAGATTCTGC ACAACATAAA GGATGGTTTC GCTGTGCTTC AGACCGATGC AGGTCTTTAC GAGGATGTAA CGACCCGACG GGTTGTGGAT  TCCTATCTTG GGATGCTAAA TCCGTTCTTT GGGCCAACGT TCGAGTCTGA TTTCGTAAAG GCAATAGTGA AGATGGGGAG GATTGGTGTG AAGACTGGTT CTAAAGGGGA GATTCGACGG 
GTTTGCTCGG CCTTTAATTG A 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGTGGA CAAAGGCTAA GATGAGTCTA GCTTTGTCTC TGGTTACGGT TTTCCTCGGC GTCTCTCTTG CTGATCTCAA AGTCGGATTT TACTCCAATA CATGTCCTCA AGCCGAGTCA  ATCGTTAGGA GAGTCGTCTC AGGAGCTGCT CTTTCTGACC CTAACCTCCC AGCCATACTT CTACGGCTCC ATTTCCATGA CTGCTTTGTT GAGGGATGTG ATGGCTCAAT CCTCGTGAAT  AACGGAGCAA TCTCTGAAAA GAATGCCTTT GGGCATGAAG GCGTTAGAGG ATTTGAGATA TTAGAAGCCG CCAAAGCCGA GCTTGAAGCT GCATGCCCCG GTGTTGTCTC TTGCTCTGAC  ATTGTTGTCT TGGCTGCACG TGATGCCATA TCTTTGGCGA ATGGACCGGC GTATGAGGTG CCAACTGGGC GGAGAGATGG TCGGGTTTCG AATATGTCGC TGGCTAAGGA CATGCCTGAG  GTGAGTGACT CGATTCAGAT ACTAAAGGCC AAGTTCATGC AGAAGGGACT CAACGCCAAA GAGCTCGTGC TTCTCAGTGC TGCTCACACT ATCGGAACAA CGGCCTGCTT CTTCATGACC  AAACGCCTCT ACGATTTCTT ACCCGGTGGC CAACCTGACC CTACCATCAA TCCGGTATTC CTACCCGAAT TAACCACTCA GTGCCCACAA AATGGTGACA TAAACGTCCG GTTACCAATG  GACCGGTTCA GTGAACGAGT ATTCGACAAG CAGATTCTGC ACAACATAAA GGATGGTTTC GCTGTGCTTC AGACCGATGC AGGTCTTTAC GAGGATGTAA CGACCCGACG GGTTGTGGAT  TCCTATCTTG GGATGCTAAA TCCGTTCTTT GGGCCAACGT TCGAGTCTGA TTTCGTAAAG GCAATAGTGA AGATGGGGAG GATTGGTGTG AAGACTGGTT CTAAAGGGGA GATTCGACGG  GTTTGCTCGG CCTTTAATTG AGAGAGCATG CAATGAAATT GAAACTGTTG AATATCTTAT ACTCAAAAAA ATGTTTTGAT CTTTGACTCC AGAATATGTA TAGGCAAAAA TGCCTAAAAC 
AAAGAAAATA TTACTGCATG GTACATTATA TTAAATGCG 

Retrieve as FASTA