Entry information : BstrPrx34Bostr.23794s0231
Entry ID 14961
Creation 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: BstrPrx34Bostr.23794s0231
Name BstrPrx34Bostr.23794s0231
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx040]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Boechera
Organism Boechera stricta    [TaxId: 72658 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value BstrPrx34
start..stop
S start..stop
AhalPrx38 634 0 1..349 1..349
AlyPrx22 632 0 1..349 1..349
AtPrx22 620 0 1..349 1..349
AlyPrx23 614 0 1..349 1..349
Literature and cross-references BstrPrx34Bostr.23794s0231
Protein sequence: BstrPrx34Bostr.23794s0231
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   349 (320)
PWM (Da):   %s   38316.41 (35202.9)  
PI (pH):   %s   8.26 (8.20) Peptide Signal:   %s   cut: 30 range:30-349
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MRFSPSFSCS AMGALILGCL LLQTSNSNAQ LRPDFYSRTC PSVFDIIRNT IANELRTDPR IAASLLRLHF HDCFVRGCDA SILLDNSTSF RTEKDAAPNA NSVRGFNVID RMKAAIERAC  PRTVSCADIL TIASQISVLL SGGPFWSVPL GRRDSVEAFF DLANTALPSP FSTLTQLKAA FAAVGLDRTS DLVALSGGHT FGRAQCQFVT PRLYNFNGTN RPDPSLNPIY LFTLRRLCPQ 
NGNGTRLVNF DAVTPDAFDS QYYTNLRIRI GLLQSDQELF STPGADTIPL VNLYSSNMPV FFRAFVDAMI RMGNLRPLTG TQGEIRQNCK VVNSQIRVVE NDDGVVSSI* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CACACAACTC AAATCATCTT TTGTCTTCCT CCTGAAAATA TGAGGTTTTC GCCTTCATTT TCTTGCAGTG CTATGGGAGC CCTAATATTG GGTTGCCTTC TGCTTCAAAC ATCAAACTCT  AATGCTCAGT TGAGGCCTGA CTTCTACTCC AGGACTTGTC CATCTGTTTT CGATATCATT AGGAATACCA TCGCCAATGA ACTTCGGACT GATCCTCGTA TTGCCGCGAG CCTCCTTCGT  CTTCACTTCC ATGACTGTTT TGTTCGTGTA AGGACTTAAA CGTATCGTTT GTGTTAAAAA ACAAATAATC CACGGCGTCT ACTTTTACAT ACTATTTACA TATATATACG TTTTTCTCTT  TAGAATAGAG GCTATTTAGA AAAGCGATTT CTGAATAATA AATCATGTCG TCATCTTATA TATGTAATAT ATGTGGTTTT GTAGGGTTGT GATGCATCCA TCTTGCTTGA CAATTCCACA  TCATTCCGGA CCGAGAAAGA TGCTGCTCCA AACGCAAATT CGGTTCGAGG GTTCAATGTC ATAGATAGAA TGAAAGCAGC CATTGAGAGA GCTTGCCCAA GAACAGTGTC TTGTGCAGAT  ATTCTCACCA TCGCCTCTCA AATATCAGTG CTTTTGGTAT GTACATATAT ATACCTACAT GACTTATATC GGGTGAAGTT AATCCAAAAA TACTAAGAAT TTGACGTCAA TGCTTTATAT  GTTATAGTCT GGAGGTCCAT TTTGGTCGGT TCCGTTGGGG AGGAGAGACA GCGTAGAAGC TTTCTTCGAT TTGGCTAATA CAGCTCTTCC CTCTCCATTT TCTACTCTTA CTCAACTTAA  AGCAGCTTTT GCTGCCGTTG GCCTAGACCG CACCTCAGAT CTAGTTGCTC TTTCTGGTAA AAATTTCATG TATTAATTAT ATATATCATC TTAGATATGT GTTTTTGATC TAGCTAGATA  CAATTCATTT TATATATACA TAGCTAGCTA ATCACAAGTT TGTTCAGAAT TTTATTATTT GTATTTTATC AGAATGATCA ACTTCAGTTA TTTATATTTA GTTTATACTT TCGTAGAAAT  GATTTGGTTG GCTTTGATAA ATTTTTATAT TAATTAAGAT ATTTGTTAAA ATAAACTGAC TCGACTTATA ATGATCAAAT AAAACTAAAA TATTATTTGA AAATTTTTGA TTGCATAGTT  TTTCTCTTAT AACATGTATG TTAAATTTTA ATAGTATATA AAAAATAATT AAAAGATCTA GTTTCTACAA ATATATATAT AATAATATTT TGTTAATTGA AATGGGTTGA CTTATTTTTC  TAAAAGGTTT CAAGTTCGCA TAAATTTAGT ACGAGATATT TAGTATTTAA AAGGTGTTTT AAGGCATATG TGTTAATTAA CATGAGTCAA ATAAGGAAAC CCATTTGCTT GATTTTGAGA  AAAAAGACTT TGTAGAAAAC CATCTCAAAC AAAATATCTT CTACCACATG ATTTTTGAAT TATAAGGCAT ACGTTTTACC AAGTCATCTT TTATTCTTTT TCTTTTGTGG TTGGTAAAAC  GGAAAAAAAC ACAACTCATC TTTAAATAAA ACATACAATG TATCAAACCT TAATTTTTGT AAAAATGTTT TAGGTGGTCA CACATTTGGA AGAGCACAAT GCCAATTCGT GACACCTCGT  CTCTACAACT TCAACGGAAC CAACAGACCA GACCCAAGTC TGAACCCAAT TTACCTCTTC ACACTCCGTC GATTGTGCCC TCAAAACGGA AACGGCACCC GTCTGGTCAA CTTCGATGCC  GTGACTCCAG ATGCTTTCGA TAGTCAATAC TATACCAATC TTCGTATTCG GATAGGTCTG CTTCAGAGTG ACCAAGAGCT TTTCTCGACT CCAGGAGCCG ACACTATTCC ACTAGTAAAC  CTATACAGCA GCAACATGCC CGTGTTCTTT CGAGCATTCG TTGACGCAAT GATCAGGATG GGAAATCTTA GACCTTTGAC TGGAACTCAA GGCGAGATAA GACAGAATTG TAAGGTTGTG  AATTCACAAA TTAGGGTTGT GGAGAACGAC GATGGTGTTG TGAGTTCTAT TTGATTATGC ATGTTGGGGA TATATGGATA ATGTAAACGT GTAAAATGCG TGGGAACATT TCGACTAAAT 
AAAGTTCTCA CAAGTTATGA GATATAAGAA ATTTGGTCTT TTT 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGGTTTT CGCCTTCATT TTCTTGCAGT GCTATGGGAG CCCTAATATT GGGTTGCCTT CTGCTTCAAA CATCAAACTC TAATGCTCAG TTGAGGCCTG ACTTCTACTC CAGGACTTGT  CCATCTGTTT TCGATATCAT TAGGAATACC ATCGCCAATG AACTTCGGAC TGATCCTCGT ATTGCCGCGA GCCTCCTTCG TCTTCACTTC CATGACTGTT TTGTTCGTGG TTGTGATGCA  TCCATCTTGC TTGACAATTC CACATCATTC CGGACCGAGA AAGATGCTGC TCCAAACGCA AATTCGGTTC GAGGGTTCAA TGTCATAGAT AGAATGAAAG CAGCCATTGA GAGAGCTTGC  CCAAGAACAG TGTCTTGTGC AGATATTCTC ACCATCGCCT CTCAAATATC AGTGCTTTTG TCTGGAGGTC CATTTTGGTC GGTTCCGTTG GGGAGGAGAG ACAGCGTAGA AGCTTTCTTC  GATTTGGCTA ATACAGCTCT TCCCTCTCCA TTTTCTACTC TTACTCAACT TAAAGCAGCT TTTGCTGCCG TTGGCCTAGA CCGCACCTCA GATCTAGTTG CTCTTTCTGG TGGTCACACA  TTTGGAAGAG CACAATGCCA ATTCGTGACA CCTCGTCTCT ACAACTTCAA CGGAACCAAC AGACCAGACC CAAGTCTGAA CCCAATTTAC CTCTTCACAC TCCGTCGATT GTGCCCTCAA  AACGGAAACG GCACCCGTCT GGTCAACTTC GATGCCGTGA CTCCAGATGC TTTCGATAGT CAATACTATA CCAATCTTCG TATTCGGATA GGTCTGCTTC AGAGTGACCA AGAGCTTTTC  TCGACTCCAG GAGCCGACAC TATTCCACTA GTAAACCTAT ACAGCAGCAA CATGCCCGTG TTCTTTCGAG CATTCGTTGA CGCAATGATC AGGATGGGAA ATCTTAGACC TTTGACTGGA 
ACTCAAGGCG AGATAAGACA GAATTGTAAG GTTGTGAATT CACAAATTAG GGTTGTGGAG AACGACGATG GTGTTGTGAG TTCTATTTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CACACAACTC AAATCATCTT TTGTCTTCCT CCTGAAAATA TGAGGTTTTC GCCTTCATTT TCTTGCAGTG CTATGGGAGC CCTAATATTG GGTTGCCTTC TGCTTCAAAC ATCAAACTCT  AATGCTCAGT TGAGGCCTGA CTTCTACTCC AGGACTTGTC CATCTGTTTT CGATATCATT AGGAATACCA TCGCCAATGA ACTTCGGACT GATCCTCGTA TTGCCGCGAG CCTCCTTCGT  CTTCACTTCC ATGACTGTTT TGTTCGTGGT TGTGATGCAT CCATCTTGCT TGACAATTCC ACATCATTCC GGACCGAGAA AGATGCTGCT CCAAACGCAA ATTCGGTTCG AGGGTTCAAT  GTCATAGATA GAATGAAAGC AGCCATTGAG AGAGCTTGCC CAAGAACAGT GTCTTGTGCA GATATTCTCA CCATCGCCTC TCAAATATCA GTGCTTTTGT CTGGAGGTCC ATTTTGGTCG  GTTCCGTTGG GGAGGAGAGA CAGCGTAGAA GCTTTCTTCG ATTTGGCTAA TACAGCTCTT CCCTCTCCAT TTTCTACTCT TACTCAACTT AAAGCAGCTT TTGCTGCCGT TGGCCTAGAC  CGCACCTCAG ATCTAGTTGC TCTTTCTGGT GGTCACACAT TTGGAAGAGC ACAATGCCAA TTCGTGACAC CTCGTCTCTA CAACTTCAAC GGAACCAACA GACCAGACCC AAGTCTGAAC  CCAATTTACC TCTTCACACT CCGTCGATTG TGCCCTCAAA ACGGAAACGG CACCCGTCTG GTCAACTTCG ATGCCGTGAC TCCAGATGCT TTCGATAGTC AATACTATAC CAATCTTCGT  ATTCGGATAG GTCTGCTTCA GAGTGACCAA GAGCTTTTCT CGACTCCAGG AGCCGACACT ATTCCACTAG TAAACCTATA CAGCAGCAAC ATGCCCGTGT TCTTTCGAGC ATTCGTTGAC  GCAATGATCA GGATGGGAAA TCTTAGACCT TTGACTGGAA CTCAAGGCGA GATAAGACAG AATTGTAAGG TTGTGAATTC ACAAATTAGG GTTGTGGAGA ACGACGATGG TGTTGTGAGT 
TCTATTTGAT TATGCATGTT GGGGATATAT GGATAATGTA AACGTGTAAA ATGCGTGGGA ACATTTCGAC TAAATAAAGT TCTCACAAGT TATGAGATAT AAGAAATTTG GTCTTTTT 

Retrieve as FASTA