Entry information : BstrPrx35Bostr.2902s0252
Entry ID 14962
Creation 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: BstrPrx35Bostr.2902s0252
Name BstrPrx35Bostr.2902s0252
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx044]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Boechera
Organism Boechera stricta    [TaxId: 72658 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value BstrPrx35
start..stop
S start..stop
AlyPrx56-1 635 0 1..329 1..329
AhalPrx41 630 0 1..329 1..327
AtPrx56 630 0 1..329 1..329
CrubPrx46 611 0 1..329 1..330
Literature and cross-references BstrPrx35Bostr.2902s0252
Protein sequence: BstrPrx35Bostr.2902s0252
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   329 (298)
PWM (Da):   %s   36093.55 (32615.8) Transmb domain:   %s   i7-29o
PI (pH):   %s   8.98 (9.07) Peptide Signal:   %s   cut: 32 range:32-329
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAALRMTVSC FFFLQILSCL LSSFAPTTVQ GLKVGFYDKA CPKAELIVKK SVFEAMKKDP TLGAPLLRMF FHDCFVRGCE GSVLLELKNK KDEKNAVPNL TLRGFEIIDN AKAALEKECP  GIVSCSDVLA LVARDAMVAL NGPSWEVETG RRDGLVTNIN EAILNLPSPF NNISSLISQF HSKGLDKKDL VVLSGGHTIG NGHCPQITNR LYNFTGKGDS DPNLDTGYAA SLRRKCKPTD 
TTTALEMDPG SFKTFDESYF KLVSQRRGLF QSDAALLDNQ ETKSYILKQL KSDGSAFFKD FGVSMVKMGR IGVLTGQVGQ VRKKCRMVN* 

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Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GTCAAAAGAG AAGCTAATAA TAATATGGCT GCTTTGAGGA TGACTGTCTC TTGTTTCTTC TTCCTTCAAA TACTATCGTG CTTGCTCTCT TCATTTGCTC CAACCACTGT GCAAGGATTG  AAAGTTGGGT TCTACGACAA GGCATGCCCG AAAGCCGAGC TTATTGTCAA GAAGTCTGTC TTCGAGGCAA TGAAGAAGGA TCCAACACTT GGAGCTCCTT TGCTAAGAAT GTTCTTCCAC  GATTGCTTCG TTCGGGTACT GTCCTTTCCT GACAACCTGA ATTTCCATTT CGTCTTTTTG GGCACTTTAT CGATCTAATG ATTGAATCAT GATGTTTTAG GGATGCGAAG GGTCGGTCTT  GCTAGAGCTA AAGAACAAAA AAGATGAGAA AAACGCAGTT CCTAACCTCA CCCTTCGAGG GTTTGAGATC ATAGACAATG CCAAGGCAGC TCTAGAAAAG GAGTGTCCGG GCATTGTTTC  TTGCTCTGAT GTATTGGCTC TTGTCGCTAG AGATGCAATG GTTGCGGTAA GTATAAAGTT TTAGTATCAA GTGATAGTGA TCTAATATTT GGTCGAGCTC ACGGTATCTT TATTACACGC  TCCTTTTTTG CTTATTTAAA ATTTCACATG GCGATTATAG ACTCCATAAA TTAGGTTGGA CGCACTCTTC TTTTTTAAAA AAAATGTTAC AAAATGCACT TGACTTCAAA TCTCAAGAGA  CTACTAGTTC AGGTTTAGGT TTGAGATTTT CTGACTGATC TTAAAGAAAA TACAATCCAT ATGTGATATG TTGGATTTTT AACATTATAT ATTTTATGAT ATACCAATCA ATATATATTC  AGCTCAATGG ACCGTCGTGG GAGGTTGAAA CGGGAAGAAG AGACGGTCTG GTTACAAACA TCAATGAGGC CATATTAAAC TTACCATCAC CATTTAATAA TATCAGTAGC CTTATCTCTC  AGTTCCATTC CAAAGGCCTC GACAAGAAAG ACCTCGTTGT GCTCTCAGGT ATGTTATAGA ATCCGAAAAT TCATAAATTA TACTTGAACG ATGCATAAAA TAATTAAAGT GTAGTGTTTT  TGTTCTTTGA ACAAACAAGA AAATCAGATA AAAACTCATT AACAAAGAAC AATATCTTGA TATTGGTTTT GTCCGAGTTC TGATAGAATT GACCTGAAAA AATTAGAAAA GCATTCCCCA  ATCAAATTTT TTTGAGATTG AAAAAGATCA TACTTTTAAT ATCAAGGAAC AGACTAATTC ACTTTTTCGA ATTCACAAGT TTGTTTTTGG TCAAACCACA AGTGTTTTTT TGCAAATATA  AGAACAAAAA AATTGTCCGT TGCAGAGGTA AGAAAACAAA TGTAATATGT CTTGTCCACT GCCACCAACT CTAACTTGCC CTTACTAAAT CTGGATGATC AGCCACCATA TGAATTCTTC  TGATCCGTAC CACATATCAA TTTGAGTTAT ATGATAAGAA TTTGTGATTT CATTCTCATT TTTCTCCTTT TTCCAAGCAT TGTTTGGCTA TTTTAGACTT TTTAAATTGC AACTAGCAAG  AATACTCGGT TCTTCTACAT ACTTCGTAGA TTAATCTTAG TTTTGGCTTG GGATCTCCAG TTATAAAATA ATAAAAATAA AATCATTCTC AACTTATTTG TATATATTTA CATTTTGATA  GGTGGGCATA CAATTGGGAA TGGACATTGT CCTCAAATCA CAAACCGGCT CTACAATTTC ACCGGAAAAG GAGATAGTGA TCCAAACTTA GACACGGGAT ACGCAGCCAG CCTCAGAAGA  AAATGCAAGC CAACTGATAC CACGACGGCT TTAGAAATGG ATCCAGGAAG CTTTAAAACG TTCGATGAAA GCTACTTCAA GCTTGTGTCG CAAAGAAGAG GGTTGTTTCA ATCTGATGCA  GCTCTTTTAG ACAATCAAGA AACTAAGTCT TATATTCTCA AGCAATTGAA AAGTGATGGG TCTGCTTTCT TTAAAGACTT TGGTGTCTCT ATGGTAAAGA TGGGTCGGAT TGGGGTTTTA  ACGGGTCAGG TTGGGCAAGT TCGCAAGAAG TGCAGAATGG TTAATTAAGT ATAGATATGC CTGTGAGGTT GTGCTATGAT TATTATTATG TTTGTGTTTT TTCCTAAAGA ATAATGTGTG  GAATCATGTG TATTATACAA TGGAATGTTA AATTGTAATT AATGTGTGGA ATCATGTGTA TTGTACAAAG GAATGTTAAA TTGTAAAATC CGATTATGTC AAGTTTTATT TATCAAAAAA 
TAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTGCTT TGAGGATGAC TGTCTCTTGT TTCTTCTTCC TTCAAATACT ATCGTGCTTG CTCTCTTCAT TTGCTCCAAC CACTGTGCAA GGATTGAAAG TTGGGTTCTA CGACAAGGCA  TGCCCGAAAG CCGAGCTTAT TGTCAAGAAG TCTGTCTTCG AGGCAATGAA GAAGGATCCA ACACTTGGAG CTCCTTTGCT AAGAATGTTC TTCCACGATT GCTTCGTTCG GGGATGCGAA  GGGTCGGTCT TGCTAGAGCT AAAGAACAAA AAAGATGAGA AAAACGCAGT TCCTAACCTC ACCCTTCGAG GGTTTGAGAT CATAGACAAT GCCAAGGCAG CTCTAGAAAA GGAGTGTCCG  GGCATTGTTT CTTGCTCTGA TGTATTGGCT CTTGTCGCTA GAGATGCAAT GGTTGCGCTC AATGGACCGT CGTGGGAGGT TGAAACGGGA AGAAGAGACG GTCTGGTTAC AAACATCAAT  GAGGCCATAT TAAACTTACC ATCACCATTT AATAATATCA GTAGCCTTAT CTCTCAGTTC CATTCCAAAG GCCTCGACAA GAAAGACCTC GTTGTGCTCT CAGGTGGGCA TACAATTGGG  AATGGACATT GTCCTCAAAT CACAAACCGG CTCTACAATT TCACCGGAAA AGGAGATAGT GATCCAAACT TAGACACGGG ATACGCAGCC AGCCTCAGAA GAAAATGCAA GCCAACTGAT  ACCACGACGG CTTTAGAAAT GGATCCAGGA AGCTTTAAAA CGTTCGATGA AAGCTACTTC AAGCTTGTGT CGCAAAGAAG AGGGTTGTTT CAATCTGATG CAGCTCTTTT AGACAATCAA  GAAACTAAGT CTTATATTCT CAAGCAATTG AAAAGTGATG GGTCTGCTTT CTTTAAAGAC TTTGGTGTCT CTATGGTAAA GATGGGTCGG ATTGGGGTTT TAACGGGTCA GGTTGGGCAA 
GTTCGCAAGA AGTGCAGAAT GGTTAATTAA 

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cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GTCAAAAGAG AAGCTAATAA TAATATGGCT GCTTTGAGGA TGACTGTCTC TTGTTTCTTC TTCCTTCAAA TACTATCGTG CTTGCTCTCT TCATTTGCTC CAACCACTGT GCAAGGATTG  AAAGTTGGGT TCTACGACAA GGCATGCCCG AAAGCCGAGC TTATTGTCAA GAAGTCTGTC TTCGAGGCAA TGAAGAAGGA TCCAACACTT GGAGCTCCTT TGCTAAGAAT GTTCTTCCAC  GATTGCTTCG TTCGGGGATG CGAAGGGTCG GTCTTGCTAG AGCTAAAGAA CAAAAAAGAT GAGAAAAACG CAGTTCCTAA CCTCACCCTT CGAGGGTTTG AGATCATAGA CAATGCCAAG  GCAGCTCTAG AAAAGGAGTG TCCGGGCATT GTTTCTTGCT CTGATGTATT GGCTCTTGTC GCTAGAGATG CAATGGTTGC GCTCAATGGA CCGTCGTGGG AGGTTGAAAC GGGAAGAAGA  GACGGTCTGG TTACAAACAT CAATGAGGCC ATATTAAACT TACCATCACC ATTTAATAAT ATCAGTAGCC TTATCTCTCA GTTCCATTCC AAAGGCCTCG ACAAGAAAGA CCTCGTTGTG  CTCTCAGGTG GGCATACAAT TGGGAATGGA CATTGTCCTC AAATCACAAA CCGGCTCTAC AATTTCACCG GAAAAGGAGA TAGTGATCCA AACTTAGACA CGGGATACGC AGCCAGCCTC  AGAAGAAAAT GCAAGCCAAC TGATACCACG ACGGCTTTAG AAATGGATCC AGGAAGCTTT AAAACGTTCG ATGAAAGCTA CTTCAAGCTT GTGTCGCAAA GAAGAGGGTT GTTTCAATCT  GATGCAGCTC TTTTAGACAA TCAAGAAACT AAGTCTTATA TTCTCAAGCA ATTGAAAAGT GATGGGTCTG CTTTCTTTAA AGACTTTGGT GTCTCTATGG TAAAGATGGG TCGGATTGGG  GTTTTAACGG GTCAGGTTGG GCAAGTTCGC AAGAAGTGCA GAATGGTTAA TTAAGTATAG ATATGCCTGT GAGGTTGTGC TATGATTATT ATTATGTTTG TGTTTTTTCC TAAAGAATAA  TGTGTGGAAT CATGTGTATT ATACAATGGA ATGTTAAATT GTAATTAATG TGTGGAATCA TGTGTATTGT ACAAAGGAAT GTTAAATTGT AAAATCCGAT TATGTCAAGT TTTATTTATC 
AAAAAATAA 

Retrieve as FASTA