Entry information : BstrPrx43Bostr.13129s0300
Entry ID 14970
Creation 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: BstrPrx43Bostr.13129s0300
Name BstrPrx43Bostr.13129s0300
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx005]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Boechera
Organism Boechera stricta    [TaxId: 72658 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value BstrPrx43
start..stop
S start..stop
AlyPrx54 657 0 1..358 1..357
AtPrx54 655 0 1..358 1..358
AruPrx54 651 0 1..358 1..358
CagraPrx23 630 0 1..351 1..351
Literature and cross-references BstrPrx43Bostr.13129s0300
Protein sequence: BstrPrx43Bostr.13129s0300
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   358 (327)
PWM (Da):   %s   37397.34 (34124.7) Transmb domain:   %s   i13-35o
PI (pH):   %s   4.29 (4.27) Peptide Signal:   %s   cut: 32 range:32-358
Sequence
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Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAVTRSSSTC DGFSIISLLV IVSLLFGTSC AQLNATFYSD TCSNASAIVR STIQQALQSD PRIGASLIRL HFHDCFVNGC DGSLLLDATG SIQSEKNAPA NANSTRGFNV VDNIKTALEN  ACPGIVSCSD ILALASEASV SLAGGPSWTV LLGRRDGLTA NQSGANSSLP SPFEGLNNIT SKFVAVGLNT TDVVALSGAH TFGRGQCVTF NNRLFNFNGT GNPDPTLNST LLSSLQQICP 
QNGSGSGITN LDLTTPDAFD NNYFTNLLSN NGLLQSDQEL FSNTGSATVA IVNSYASNQT LFFEAFVQSM IKMGNINPLT GSSGEIRQDC KVVNGQSSAT EAEEIQLQSD GPVNLANI* 

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Remarks
DNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AATCAATCAG TTAGCCTAAA AACTAATCGA AAATCTGCCA TTATTTGCAA AAACTGATTA ATGGCTGTAA CAAGATCTTC TTCTACTTGT GATGGTTTCT CAATCATCAG CCTTCTTGTT  ATCGTTTCTT TATTGTTTGG GACATCATGT GCGCAGTTAA ACGCAACGTT TTACTCCGAC ACGTGCTCTA ACGCCTCTGC CATCGTCCGC AGCACTATTC AGCAAGCTCT TCAATCCGAC  CCGAGAATCG GAGCAAGCCT CATTCGCCTT CATTTTCACG ACTGCTTTGT TAATGTATAA GAAGCTCTTT AAATAAGCTT CTTGATTTTT AATCTTTTTA TCATTAAGCC TTCTACTTTT  TGTTACACTA AACCGCTACT TTGCTTCTTT ACTTTTGAAA AGGGTTGCGA CGGGTCGCTC TTGCTTGACG CTACTGGAAG CATCCAGAGC GAGAAGAACG CTCCTGCCAA CGCAAACTCA  ACTAGAGGAT TTAATGTTGT CGATAATATC AAGACTGCCC TCGAGAATGC TTGTCCCGGC ATTGTCTCTT GCTCTGACAT TTTAGCTCTT GCCTCAGAGG CCTCCGTGTC TTTGGTAATA  ATTAATACTT TCATTACAAA CATATCAAAC AAAACACACA TACACATACA TACATAATTT ATATAAATTG TGTCTTTGGC GGGCGTTTCT GACAGGCCGG GTTACACCAG ATGAAAAAGC  CCGTTTAACT TTCGTTATAT TACATTTATG TTCACATTCA TCTATATAAA TATATACATG TTTGATCATC TTCAGGCAGG AGGGCCTTCA TGGACTGTGT TATTAGGAAG AAGAGATGGT  CTCACCGCAA ACCAGTCCGG GGCCAATTCG TCACTTCCCT CTCCCTTCGA AGGCCTTAAC AACATCACAT CTAAATTTGT AGCTGTCGGG CTAAATACCA CCGATGTAGT AGCCTTGTCT  GGTAAGTCAT CTGACACGTT TAATTATTTT CGGCTCAATT CAAACAAAAC CCTAATTAAT GCCATCTCTC TTGTGATTCA ATGTGCGTAA ATAGGGGCGC ATACGTTTGG GCGTGGTCAA  TGCGTAACAT TCAACAATAG ACTATTCAAC TTCAACGGGA CAGGAAATCC CGACCCGACT TTGAACTCAA CACTTCTCAG CAGTCTTCAA CAGATATGTC CTCAAAACGG CAGCGGATCA  GGGATCACAA ATCTCGATCT GACCACACCT GATGCGTTCG ATAACAACTA CTTCACAAAC CTTCTGAGTA ACAATGGGCT TCTTCAGTCA GACCAGGAAC TGTTCTCCAA CACCGGTTCA  GCAACCGTCG CGATTGTAAA TTCCTATGCA AGTAACCAAA CCCTGTTTTT TGAGGCGTTT GTTCAGTCTA TGATCAAGAT GGGGAACATT AATCCCTTGA CTGGGAGTAG TGGAGAGATT  AGACAAGACT GTAAGGTGGT TAATGGACAG TCATCAGCCA CTGAAGCAGA GGAAATTCAG TTACAATCTG ACGGACCAGT GAATTTAGCA AATATATGAA CAATGATAGG ATCAGTTTCA  CCGTTTGTTT ACCATATATG AATAATTACT CCTAAGCTGA ATCATTTTTG TAAAAAAATA AAAATTTTGC TGGGGATGAA AAAACCTGAG TGGTATGGTT GTGTTTTACA CTTGTGGTTA 
TTTCAATATT TTAAAATTTT TATTATGCCT AAATACATGC ATAGTATCAT GTCTTGTTTC AGTAACGAAA TTAGTAAAAT ACAT 

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CDS
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTGTAA CAAGATCTTC TTCTACTTGT GATGGTTTCT CAATCATCAG CCTTCTTGTT ATCGTTTCTT TATTGTTTGG GACATCATGT GCGCAGTTAA ACGCAACGTT TTACTCCGAC  ACGTGCTCTA ACGCCTCTGC CATCGTCCGC AGCACTATTC AGCAAGCTCT TCAATCCGAC CCGAGAATCG GAGCAAGCCT CATTCGCCTT CATTTTCACG ACTGCTTTGT TAATGGTTGC  GACGGGTCGC TCTTGCTTGA CGCTACTGGA AGCATCCAGA GCGAGAAGAA CGCTCCTGCC AACGCAAACT CAACTAGAGG ATTTAATGTT GTCGATAATA TCAAGACTGC CCTCGAGAAT  GCTTGTCCCG GCATTGTCTC TTGCTCTGAC ATTTTAGCTC TTGCCTCAGA GGCCTCCGTG TCTTTGGCAG GAGGGCCTTC ATGGACTGTG TTATTAGGAA GAAGAGATGG TCTCACCGCA  AACCAGTCCG GGGCCAATTC GTCACTTCCC TCTCCCTTCG AAGGCCTTAA CAACATCACA TCTAAATTTG TAGCTGTCGG GCTAAATACC ACCGATGTAG TAGCCTTGTC TGGGGCGCAT  ACGTTTGGGC GTGGTCAATG CGTAACATTC AACAATAGAC TATTCAACTT CAACGGGACA GGAAATCCCG ACCCGACTTT GAACTCAACA CTTCTCAGCA GTCTTCAACA GATATGTCCT  CAAAACGGCA GCGGATCAGG GATCACAAAT CTCGATCTGA CCACACCTGA TGCGTTCGAT AACAACTACT TCACAAACCT TCTGAGTAAC AATGGGCTTC TTCAGTCAGA CCAGGAACTG  TTCTCCAACA CCGGTTCAGC AACCGTCGCG ATTGTAAATT CCTATGCAAG TAACCAAACC CTGTTTTTTG AGGCGTTTGT TCAGTCTATG ATCAAGATGG GGAACATTAA TCCCTTGACT 
GGGAGTAGTG GAGAGATTAG ACAAGACTGT AAGGTGGTTA ATGGACAGTC ATCAGCCACT GAAGCAGAGG AAATTCAGTT ACAATCTGAC GGACCAGTGA ATTTAGCAAA TATATGA 

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cDNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AATCAATCAG TTAGCCTAAA AACTAATCGA AAATCTGCCA TTATTTGCAA AAACTGATTA ATGGCTGTAA CAAGATCTTC TTCTACTTGT GATGGTTTCT CAATCATCAG CCTTCTTGTT  ATCGTTTCTT TATTGTTTGG GACATCATGT GCGCAGTTAA ACGCAACGTT TTACTCCGAC ACGTGCTCTA ACGCCTCTGC CATCGTCCGC AGCACTATTC AGCAAGCTCT TCAATCCGAC  CCGAGAATCG GAGCAAGCCT CATTCGCCTT CATTTTCACG ACTGCTTTGT TAATGGTTGC GACGGGTCGC TCTTGCTTGA CGCTACTGGA AGCATCCAGA GCGAGAAGAA CGCTCCTGCC  AACGCAAACT CAACTAGAGG ATTTAATGTT GTCGATAATA TCAAGACTGC CCTCGAGAAT GCTTGTCCCG GCATTGTCTC TTGCTCTGAC ATTTTAGCTC TTGCCTCAGA GGCCTCCGTG  TCTTTGGCAG GAGGGCCTTC ATGGACTGTG TTATTAGGAA GAAGAGATGG TCTCACCGCA AACCAGTCCG GGGCCAATTC GTCACTTCCC TCTCCCTTCG AAGGCCTTAA CAACATCACA  TCTAAATTTG TAGCTGTCGG GCTAAATACC ACCGATGTAG TAGCCTTGTC TGGGGCGCAT ACGTTTGGGC GTGGTCAATG CGTAACATTC AACAATAGAC TATTCAACTT CAACGGGACA  GGAAATCCCG ACCCGACTTT GAACTCAACA CTTCTCAGCA GTCTTCAACA GATATGTCCT CAAAACGGCA GCGGATCAGG GATCACAAAT CTCGATCTGA CCACACCTGA TGCGTTCGAT  AACAACTACT TCACAAACCT TCTGAGTAAC AATGGGCTTC TTCAGTCAGA CCAGGAACTG TTCTCCAACA CCGGTTCAGC AACCGTCGCG ATTGTAAATT CCTATGCAAG TAACCAAACC  CTGTTTTTTG AGGCGTTTGT TCAGTCTATG ATCAAGATGG GGAACATTAA TCCCTTGACT GGGAGTAGTG GAGAGATTAG ACAAGACTGT AAGGTGGTTA ATGGACAGTC ATCAGCCACT  GAAGCAGAGG AAATTCAGTT ACAATCTGAC GGACCAGTGA ATTTAGCAAA TATATGAACA ATGATAGGAT CAGTTTCACC GTTTGTTTAC CATATATGAA TAATTACTCC TAAGCTGAAT  CATTTTTGTA AAAAAATAAA AATTTTGCTG GGGATGAAAA AACCTGAGTG GTATGGTTGT GTTTTACACT TGTGGTTATT TCAATATTTT AAAATTTTTA TTATGCCTAA ATACATGCAT 
AGTATCATGT CTTGTTTCAG TAACGAAATT AGTAAAATAC AT 

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