Entry information : BstrPrx47Bostr.13129s0430
Entry ID 14974
Creation 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: BstrPrx47Bostr.13129s0430
Name BstrPrx47Bostr.13129s0430
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx007]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Boechera
Organism Boechera stricta    [TaxId: 72658 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value BstrPrx47
start..stop
S start..stop
AruPrx52 620 0 1..324 1..324
AtPrx52 605 0 1..324 1..324
AlyPrx52 604 0 1..324 1..324
AhalPrx44 603 0 1..324 1..324
Literature and cross-references BstrPrx47Bostr.13129s0430
Protein sequence: BstrPrx47Bostr.13129s0430
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   324 (296)
PWM (Da):   %s   34403.03 (31245.3)  
PI (pH):   %s   8.4 (8.58) Peptide Signal:   %s   cut: 29 range:29-324
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MASNQFLSIL VIVVTLLLQG YNNNVVEAQL TTNFYSTSCP NLLSTVQTAV KSAVNSQPRM GASILRLFFH DCFVNGCDGS ILLDDTSSFT GEQNANPNRN SARGFNVIDN IKSAVEKACP  GVVSCADILA IAARDSVVVL GGPNWNVKLG RRDARTASQA AANSNIPAPT SSLSQLISSF SAVGLSTRDM VALSGAHTIG QARCTTFRTR IYNETNINAA FATTRQRTCP RTSGSGDGNL 
APLDVTTAAS FDNNYFKNLM TQRGLLHSDQ ELFNGGSTDS IVRGYSNSPS SFNSDFTAAM IKMGDISPLT GSSGEIRKMC GRTN* 

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Remarks
DNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CTCTAAGTCT ATTCAAGTCT TTGCTTCACC TAACCATGGC TTCAAATCAA TTTCTTTCCA TTCTAGTTAT CGTGGTTACA CTTTTACTCC AAGGTTATAA CAATAACGTC GTCGAAGCCC  AACTCACGAC TAATTTCTAC TCAACTTCTT GCCCTAACCT CCTCTCCACT GTCCAAACCG CCGTTAAATC TGCCGTTAAC AGCCAGCCTC GAATGGGTGC ATCTATCCTC CGTCTCTTCT  TCCACGATTG CTTCGTCAAC GTAACTCTTT CTTTTATACT TTTTTTTTTC TGTATTCCTT GCATCCCAAG AAACTTAGCA TAATAGTTAT TTTGGTTATG TCCTTCTAAT CATAGTCATA  ACTTACATAT ATAGGGATGT GACGGTTCAA TTCTACTAGA TGACACGTCG AGCTTCACGG GAGAACAAAA CGCGAACCCG AACCGCAATT CCGCTCGCGG GTTTAATGTG ATCGACAACA  TCAAATCAGC GGTTGAGAAA GCATGTCCCG GGGTTGTGTC TTGTGCTGAT ATCTTAGCCA TTGCAGCTAG AGACTCCGTC GTAGTCGTAC GCTCCCTATT TCATCTCTTA GTCCGGTTTT  GCAAATTTTA AAGATTAAAC CGGTCTAACA TATTCGTCTT TGTTGTTGAA GCTTGGAGGG CCGAATTGGA ATGTGAAATT AGGAAGAAGA GATGCAAGAA CGGCGAGCCA AGCGGCAGCG  AATAGTAACA TTCCTGCGCC GACTTCGAGT CTGAGCCAAC TCATTAGTAG TTTCAGTGCC GTTGGACTCT CCACCAGAGA TATGGTTGCT CTCTCTGGTC CGTTTCATTT CTCTTCTTAA  CCCAATTCCT TTTTCGTTTA TGCAACTATT TGTTTCATAT ACTAACGTTT ATTGCAATTT TTAGAATATC GATTACTAAT ACATTGCTTA ATATTGGTGA CAAGAAAATT GTTTTCCTAA  TATGTGTTTG TTTTTAATTT AATAATATTG CTTAAAGTTT TGCCTGTCAC CAATTTGTTC TACAAAAAGG AAAAAATAAT AACCGATAAA AATATATATT TCAAAGGACT ATAAGAGTCA  ACATAAAGTA AAATATAATT TGATTGTGTT GTTTGATTTG TCGACTTTTT TTTTTGTTTC TTTGTGTTTG TTTTTTCAAC ACATTTTTTA ACGCACCACC GACTTTTTCC CGTTTCTTTG  CCAACCTACG TAATCATACA AATTACTGTT ACGAAACACT GACAAAGTAA TTCAAATAAT ACTTAATTGT AATATCCTGC ACTACACCGT GGCGGGATAA TATACTTTTA AAAATAATAT  TAAATAATTT TTCAAAAAGT TATGGTTGTA ATGTTATAAC AAATATTAAA ATGTGTATAC TTTATTATTT TCAAATATAA AAATAGGTAG ACTATTATTT AATGTATAGT AGTATATTGA  TAATTGCCAA ATTGATAATT TTATTGATAT AATAATATTA TTATTAGTAT AAATTTGATT TAGTTTATAT TATTAAAATT TTAAGTGTAA ATAATATAGA TGGTCATTAT TGTTAGCTTA  TTATTGTTAT CTACCTTCGA GTAAATAAAA AAAAACAGTT ACCGTTGTAC ATAATATTCT AAAAGAAATA TTCTAGTTAG CTTATTATTG TTAGATAGAA TGTTTTAATT CATTTGTATT  AGGGTTAATT TCTAAAACGT GTTAATAGTA TAGGATTAAC CGATTAAGTC AACTATTAAA CTAATCATTC AATTTTTGTT TTTGTTTTCA GGCGCACACA CGATTGGACA AGCCCGTTGC  ACGACCTTCC GAACGAGAAT CTACAACGAG ACAAACATCA ACGCAGCCTT CGCCACCACA CGTCAACGAA CTTGCCCTAG AACCTCCGGC TCCGGCGACG GAAACCTAGC TCCACTCGAC  GTCACCACGG CGGCTTCTTT CGACAACAAC TACTTCAAGA ATCTCATGAC TCAAAGAGGT CTCCTTCATT CCGACCAAGA GCTCTTCAAC GGCGGCTCCA CTGACTCCAT AGTCCGTGGT  TACAGCAATA GTCCGTCGAG CTTTAACTCC GACTTCACGG CGGCGATGAT AAAAATGGGT GATATTAGCC CCTTGACTGG TAGTAGCGGT GAGATCCGGA AAATGTGCGG AAGGACCAAC  TGATACAAAT CCATTAAACG TGTCATTTTC CTATTGGATT TTACATTCTG TTATTTGAGT TGGTGAGAAT AAGATTGATC TTCCCCAAAA AAATATCGAA GATCCCTATT AATGGTTTTT 
TTTTCTTTTC CCTTACATGT T 

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CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTCAA ATCAATTTCT TTCCATTCTA GTTATCGTGG TTACACTTTT ACTCCAAGGT TATAACAATA ACGTCGTCGA AGCCCAACTC ACGACTAATT TCTACTCAAC TTCTTGCCCT  AACCTCCTCT CCACTGTCCA AACCGCCGTT AAATCTGCCG TTAACAGCCA GCCTCGAATG GGTGCATCTA TCCTCCGTCT CTTCTTCCAC GATTGCTTCG TCAACGGATG TGACGGTTCA  ATTCTACTAG ATGACACGTC GAGCTTCACG GGAGAACAAA ACGCGAACCC GAACCGCAAT TCCGCTCGCG GGTTTAATGT GATCGACAAC ATCAAATCAG CGGTTGAGAA AGCATGTCCC  GGGGTTGTGT CTTGTGCTGA TATCTTAGCC ATTGCAGCTA GAGACTCCGT CGTAGTCCTT GGAGGGCCGA ATTGGAATGT GAAATTAGGA AGAAGAGATG CAAGAACGGC GAGCCAAGCG  GCAGCGAATA GTAACATTCC TGCGCCGACT TCGAGTCTGA GCCAACTCAT TAGTAGTTTC AGTGCCGTTG GACTCTCCAC CAGAGATATG GTTGCTCTCT CTGGCGCACA CACGATTGGA  CAAGCCCGTT GCACGACCTT CCGAACGAGA ATCTACAACG AGACAAACAT CAACGCAGCC TTCGCCACCA CACGTCAACG AACTTGCCCT AGAACCTCCG GCTCCGGCGA CGGAAACCTA  GCTCCACTCG ACGTCACCAC GGCGGCTTCT TTCGACAACA ACTACTTCAA GAATCTCATG ACTCAAAGAG GTCTCCTTCA TTCCGACCAA GAGCTCTTCA ACGGCGGCTC CACTGACTCC  ATAGTCCGTG GTTACAGCAA TAGTCCGTCG AGCTTTAACT CCGACTTCAC GGCGGCGATG ATAAAAATGG GTGATATTAG CCCCTTGACT GGTAGTAGCG GTGAGATCCG GAAAATGTGC 
GGAAGGACCA ACTGA 

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cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CTCTAAGTCT ATTCAAGTCT TTGCTTCACC TAACCATGGC TTCAAATCAA TTTCTTTCCA TTCTAGTTAT CGTGGTTACA CTTTTACTCC AAGGTTATAA CAATAACGTC GTCGAAGCCC  AACTCACGAC TAATTTCTAC TCAACTTCTT GCCCTAACCT CCTCTCCACT GTCCAAACCG CCGTTAAATC TGCCGTTAAC AGCCAGCCTC GAATGGGTGC ATCTATCCTC CGTCTCTTCT  TCCACGATTG CTTCGTCAAC GGATGTGACG GTTCAATTCT ACTAGATGAC ACGTCGAGCT TCACGGGAGA ACAAAACGCG AACCCGAACC GCAATTCCGC TCGCGGGTTT AATGTGATCG  ACAACATCAA ATCAGCGGTT GAGAAAGCAT GTCCCGGGGT TGTGTCTTGT GCTGATATCT TAGCCATTGC AGCTAGAGAC TCCGTCGTAG TCCTTGGAGG GCCGAATTGG AATGTGAAAT  TAGGAAGAAG AGATGCAAGA ACGGCGAGCC AAGCGGCAGC GAATAGTAAC ATTCCTGCGC CGACTTCGAG TCTGAGCCAA CTCATTAGTA GTTTCAGTGC CGTTGGACTC TCCACCAGAG  ATATGGTTGC TCTCTCTGGC GCACACACGA TTGGACAAGC CCGTTGCACG ACCTTCCGAA CGAGAATCTA CAACGAGACA AACATCAACG CAGCCTTCGC CACCACACGT CAACGAACTT  GCCCTAGAAC CTCCGGCTCC GGCGACGGAA ACCTAGCTCC ACTCGACGTC ACCACGGCGG CTTCTTTCGA CAACAACTAC TTCAAGAATC TCATGACTCA AAGAGGTCTC CTTCATTCCG  ACCAAGAGCT CTTCAACGGC GGCTCCACTG ACTCCATAGT CCGTGGTTAC AGCAATAGTC CGTCGAGCTT TAACTCCGAC TTCACGGCGG CGATGATAAA AATGGGTGAT ATTAGCCCCT  TGACTGGTAG TAGCGGTGAG ATCCGGAAAA TGTGCGGAAG GACCAACTGA TACAAATCCA TTAAACGTGT CATTTTCCTA TTGGATTTTA CATTCTGTTA TTTGAGTTGG TGAGAATAAG 
ATTGATCTTC CCCAAAAAAA TATCGAAGAT CCCTATTAAT GGTTTTTTTT TCTTTTCCCT TACATGTT 

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