Entry information : BstrPrx51Bostr.18473s0040
Entry ID 14978
Creation 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: BstrPrx51Bostr.18473s0040
Name BstrPrx51Bostr.18473s0040
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx035]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Boechera
Organism Boechera stricta    [TaxId: 72658 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value BstrPrx51
start..stop
S start..stop
BstrPrx03 672 0 3..354 2..353
AtPrx34 670 0 13..354 12..353
AruPrx01-3 670 0 5..354 3..352
AhalPrx22 666 0 16..354 15..353
Literature and cross-references BstrPrx51Bostr.18473s0040
Protein sequence: BstrPrx51Bostr.18473s0040
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   354 (323)
PWM (Da):   %s   38838.44 (35402.8)  
PI (pH):   %s   7.34 (7.31) Peptide Signal:   %s   cut: 32 range:32-354
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MKFSSSSSTS FTWTTLITLG CLMLHASLSD AQLTPTFYDN SCPNVTNIVR DTIVNELRSD PRIAASILRL HFHDCFVNGC DASILLDNTT SFRTEKDAFG NANSARGFPV IDRMKAAVER  ACPRTVSCAD MLTIAAQQSV TLAGGPSWRV PLGRRDSLQA FLDLANANLP GPNFTLPQLK ASFKKVGLDR PSDLVALSGG HTFGKNQCRF IMDRLYNFGS TGLPDPTLNT TYLQTLRGLC 
PLNGNQSALV DFDLRTPTVF DNKYYVNLKE QKGLIRSDQE LFSSPNATDT IPLVRSYADG TQTFFNAFVE AMNRMGNITP TTGTQGEIRL NCRVVNSNSL LHDVVEIVDF VSSM* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATCTTCTCCG TTAAACCCAA TCATATAGTT TTCTTTTTCC TTGTAAAAGA TGAAGTTCTC TTCTTCTTCT TCTACTTCGT TCACTTGGAC AACCTTAATC ACATTGGGAT GTCTTATGCT  TCATGCGTCT TTGTCCGATG CTCAACTTAC CCCTACATTC TACGACAATT CATGTCCTAA TGTCACTAAC ATCGTACGCG ATACCATAGT CAACGAGTTA AGGTCAGACC CTCGTATCGC  CGCGAGCATC CTTCGTCTTC ACTTCCACGA CTGCTTTGTT AATGTAAGAT ATTACTTTTC ATATATCTAT AGCGTTACGA ATTATTGTGG TTCATCTTTT ATATATTAAG AATCAGTGTA  AAAGGTAGAA AAAAGGTTGC AATTGTTTTA GTTAGTACTT TTTTTTGCTC TAAAGACTAA ATCACGTGGT TAGATGTCAT ATGTTTGCTT TTTTCTATTG ATACTTAACT CTCGTAGACA  ATGATGTTAC TGGTCAGTTA TTAATTTCTT ACAAAATGAT GATGCCAAAA CATTTATGAA ATCGTGTTCA CGAAGATGAA TTATCCGTGT TACAGTATTT AGGAAGAGCA TGGTGGGGTA  CTATATTAAA AATATTTTTT CAAATCAATC AAAAATCCTC TAAAAATAAT TGCATGTCAC CATATCAATC AAAAATAATT GCATCCTAAA CCCGGAAAAA AACACTAAAA AAAAATTAGA  AAAAATAAAT ATTTATATAG AAAAATAGCG TTAAGAATTT TAGGTATCGA GAATAAATAT AATATGAATT ACATTAGTTT ACTAGATGAT AAATGCGTGG GAAAACAAAA CTAAAATTTA  GTTTTGCAAA AAAAATGTTT AAAATAATTA TAAAATAAAT ATTTGATTCG AATGGAAAAC TTTTATTTAA TATACATAAG TAGATTGGAA AAATATTTTT ATGATTTATA ATTTATATTA  TTCGAATCAA TTTATCATTT AATTTTAATT AATTGACATA TTTTAATGTG ATTATATAAA TAGTTCGGTA CAAATATTTT TGTTGAAAAC ATGTTTTATT TTTCTATTGA GTTAAAATGG  ATTTAGGCGT TTTCTCTCTC ATCACTTGGT CTTCATTATA TTGATATATA GATGTATAAT CTTCACTGAT TACTTGCTTC AGAGAAACAA ATGGTTTTAA TGGATGACAA AAAATTGTTT  TAATGTTAAA TTGTTACCTT TGGTAAAGAT TTAGCTATGG ATGTGATACA TTGACTAATA ATTTGTTAAA TAATATTTTG GACTTCTGAA AGGGTTGTGA CGCATCGATC TTGTTGGACA  ACACGACATC ATTTCGAACA GAGAAAGATG CGTTTGGAAA CGCAAATTCA GCTCGGGGAT TTCCCGTGAT TGATAGAATG AAAGCCGCAG TGGAGAGGGC ATGCCCAAGG ACCGTTTCAT  GCGCAGATAT GCTCACCATT GCAGCTCAAC AATCTGTCAC TCTGGTATGC TCCATTGTTC CATCTTCTTT TATTTATTAA AAACATTTTT TTCAGTTTTA ATATGTCAAG TAGTCACTTT  ACATATATCA AACACGACAG CCTAAATTTG AAAAGAAAAA GTGGGATATA TCTTAGTTGT TTGAGAACAT CACGCGCGAT CTATATCATT AAGAAAGTTT TAATACGACA AGTATTCAAA  CTTAATCGAA AAATATTCAA AACGCGTGGT CCCGTTAAGA AGGCTCGATA AGTTTTAATA TCATTTACAA AATTAGGTCT CATCATCACT AGGATTTACC TGGTTACGCA AGACTACCTT  TTTAGTTAAT CAAACAGAAT AATTTTCTTT CTTTTCCAAG AAATAGAGTA GATTAAAAAA AACTTTCTTT TAAGTATATA ATCAATCAAT TAATAATACA TGTTTGTCCT CTTCTCTTTA  CATGTTAAAA CTTCCAAGTG ATAAAAATAA TCTCAAAAGA ATTAATTATT TTGAATATAA TGGTAATTAT ACTATAGGCA GGAGGTCCTT CTTGGAGGGT TCCTTTGGGG AGAAGAGACA  GCTTACAAGC ATTTCTAGAT CTCGCTAATG CAAATCTGCC AGGTCCAAAC TTCACACTTC CCCAACTTAA GGCCAGCTTT AAAAAAGTTG GCCTCGATCG TCCTTCTGAT CTTGTTGCTC  TCTCCGGTAA TTAACAAAAG GAAATTAAAC ACCATTATTT ATAATTGTAA TTAGCGAGTT ATATTTATTA GTTGTTGATC TAATTCTGGT CTTTCTTTTG TTAGGGGGTC ACACATTTGG  TAAAAATCAA TGTCGATTTA TTATGGACAG ATTATACAAC TTCGGCAGTA CCGGTTTACC TGACCCTACC CTCAATACTA CTTACCTCCA AACCCTTCGT GGACTATGTC CCCTTAATGG  CAATCAAAGT GCCTTGGTGG ATTTTGATCT GCGTACGCCT ACGGTTTTCG ACAACAAATA CTATGTGAAT CTCAAAGAGC AAAAAGGTCT TATCCGGAGC GACCAAGAGT TGTTCTCTAG  CCCCAATGCC ACCGACACAA TCCCCTTGGT GAGATCATAT GCTGATGGCA CACAAACATT CTTCAATGCT TTTGTGGAGG CGATGAATAG AATGGGAAAC ATTACACCTA CTACGGGAAC  TCAAGGAGAA ATAAGGTTGA ATTGTAGGGT GGTGAACTCC AACTCTCTGC TCCATGATGT GGTGGAGATC GTTGACTTTG TTAGCTCTAT GTGAGAATTG TTTACTCATT ATGTGGCTAC 
AAGAATACAT ATTAATGAAT AAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGTTCT CTTCTTCTTC TTCTACTTCG TTCACTTGGA CAACCTTAAT CACATTGGGA TGTCTTATGC TTCATGCGTC TTTGTCCGAT GCTCAACTTA CCCCTACATT CTACGACAAT  TCATGTCCTA ATGTCACTAA CATCGTACGC GATACCATAG TCAACGAGTT AAGGTCAGAC CCTCGTATCG CCGCGAGCAT CCTTCGTCTT CACTTCCACG ACTGCTTTGT TAATGGTTGT  GACGCATCGA TCTTGTTGGA CAACACGACA TCATTTCGAA CAGAGAAAGA TGCGTTTGGA AACGCAAATT CAGCTCGGGG ATTTCCCGTG ATTGATAGAA TGAAAGCCGC AGTGGAGAGG  GCATGCCCAA GGACCGTTTC ATGCGCAGAT ATGCTCACCA TTGCAGCTCA ACAATCTGTC ACTCTGGCAG GAGGTCCTTC TTGGAGGGTT CCTTTGGGGA GAAGAGACAG CTTACAAGCA  TTTCTAGATC TCGCTAATGC AAATCTGCCA GGTCCAAACT TCACACTTCC CCAACTTAAG GCCAGCTTTA AAAAAGTTGG CCTCGATCGT CCTTCTGATC TTGTTGCTCT CTCCGGGGGT  CACACATTTG GTAAAAATCA ATGTCGATTT ATTATGGACA GATTATACAA CTTCGGCAGT ACCGGTTTAC CTGACCCTAC CCTCAATACT ACTTACCTCC AAACCCTTCG TGGACTATGT  CCCCTTAATG GCAATCAAAG TGCCTTGGTG GATTTTGATC TGCGTACGCC TACGGTTTTC GACAACAAAT ACTATGTGAA TCTCAAAGAG CAAAAAGGTC TTATCCGGAG CGACCAAGAG  TTGTTCTCTA GCCCCAATGC CACCGACACA ATCCCCTTGG TGAGATCATA TGCTGATGGC ACACAAACAT TCTTCAATGC TTTTGTGGAG GCGATGAATA GAATGGGAAA CATTACACCT 
ACTACGGGAA CTCAAGGAGA AATAAGGTTG AATTGTAGGG TGGTGAACTC CAACTCTCTG CTCCATGATG TGGTGGAGAT CGTTGACTTT GTTAGCTCTA TGTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATCTTCTCCG TTAAACCCAA TCATATAGTT TTCTTTTTCC TTGTAAAAGA TGAAGTTCTC TTCTTCTTCT TCTACTTCGT TCACTTGGAC AACCTTAATC ACATTGGGAT GTCTTATGCT  TCATGCGTCT TTGTCCGATG CTCAACTTAC CCCTACATTC TACGACAATT CATGTCCTAA TGTCACTAAC ATCGTACGCG ATACCATAGT CAACGAGTTA AGGTCAGACC CTCGTATCGC  CGCGAGCATC CTTCGTCTTC ACTTCCACGA CTGCTTTGTT AATGGTTGTG ACGCATCGAT CTTGTTGGAC AACACGACAT CATTTCGAAC AGAGAAAGAT GCGTTTGGAA ACGCAAATTC  AGCTCGGGGA TTTCCCGTGA TTGATAGAAT GAAAGCCGCA GTGGAGAGGG CATGCCCAAG GACCGTTTCA TGCGCAGATA TGCTCACCAT TGCAGCTCAA CAATCTGTCA CTCTGGCAGG  AGGTCCTTCT TGGAGGGTTC CTTTGGGGAG AAGAGACAGC TTACAAGCAT TTCTAGATCT CGCTAATGCA AATCTGCCAG GTCCAAACTT CACACTTCCC CAACTTAAGG CCAGCTTTAA  AAAAGTTGGC CTCGATCGTC CTTCTGATCT TGTTGCTCTC TCCGGGGGTC ACACATTTGG TAAAAATCAA TGTCGATTTA TTATGGACAG ATTATACAAC TTCGGCAGTA CCGGTTTACC  TGACCCTACC CTCAATACTA CTTACCTCCA AACCCTTCGT GGACTATGTC CCCTTAATGG CAATCAAAGT GCCTTGGTGG ATTTTGATCT GCGTACGCCT ACGGTTTTCG ACAACAAATA  CTATGTGAAT CTCAAAGAGC AAAAAGGTCT TATCCGGAGC GACCAAGAGT TGTTCTCTAG CCCCAATGCC ACCGACACAA TCCCCTTGGT GAGATCATAT GCTGATGGCA CACAAACATT  CTTCAATGCT TTTGTGGAGG CGATGAATAG AATGGGAAAC ATTACACCTA CTACGGGAAC TCAAGGAGAA ATAAGGTTGA ATTGTAGGGT GGTGAACTCC AACTCTCTGC TCCATGATGT 
GGTGGAGATC GTTGACTTTG TTAGCTCTAT GTGAGAATTG TTTACTCATT ATGTGGCTAC AAGAATACAT ATTAATGAAT AAA 

Retrieve as FASTA