Entry information : BstrAPx06 (Bostr.20129s0184)
Entry ID 14985
Creation 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: BstrAPx06 (Bostr.20129s0184)
Name (synonym) BstrAPx06 (Bostr.20129s0184)
Class Ascorbate peroxidase     [Orthogroup: APx002]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Boechera
Organism Boechera stricta    [TaxId: 72658 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value BstrAPx06
start..stop
S start..stop
AlyAPx06 771 0 1..433 1..429
CagraAPx06 768 0 1..433 1..430
CrubAPx06 766 0 1..433 1..430
AtAPx06 764 0 3..433 1..426
Literature and cross-references BstrAPx06 (Bostr.20129s0184)
Protein sequence: BstrAPx06 (Bostr.20129s0184)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   433
PWM (Da):   %s   46930 Transmb domain:   %s   o404-426i
PI (pH):   %s   8.27
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAVSLSASAA SQLLCSSTRL SLSPAVASSS STSAPLVAVS SSTSTHSLSS LRNVASSSSL FPHSSLVQKK YPIYGRSKEM FSPKCAASDA AQLRSAKEDI KVLLRTKFCH PILVRLGWHD  AGTYNKNIEE WPQRGGANGS LRFEAELKHA ANAGLISALK LIQPIKDKYP NISYADLFQL ASATAIEEAG GPEIPMKYGR VDVVAPEQCP EEGRLPDAGP PSPADHLRDV FYRMGLNDRE  IVALSGAHTL GRARPDRSGW GKPETKYTKT GPGEAGGQSW TVKWLKFDNS YFKDIKEKRD EDLLVLPTDA ALFEDPSFKN YAEKYAEDPA AFFKDYAEAH AKLSNLGAKF DPPEGIIIDN 
APEKFVAAKY STGKKELSDS MKKKIRAEYE AIGGSPDKPL PTNYFLNIII AIGVLVLLST LFGGNNNSDF SGF* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CAACGTATCG CTAAGTTACT GACACCTGTC TTTTTAAACT CACTCTTCCG TCGCTTCTCT CCGCCGTGAC AACAATGGCT GTTTCTCTCT CCGCCTCCGC CGCCTCTCAG TTACTCTGTT  CATCCACCAG ACTCTCTCTT TCCCCCGCCG TCGCCTCCTC TTCGTCCACC TCAGCTCCTC TCGTTGCGGT TTCTTCCTCT ACGTCGACAC ATTCTCTTTC TTCTCTTCGA AACGTCGCAT  CTTCCTCCTC TCTATTTCCT CATTCCTCCC TCGTTCAGGT TAACCATAGT TAAATCGGAA AACTCTGTAC GGAAAATTAT ACTTTCGAAA ATTTCACCTT TGAACATGTT TTTCTATAAT  TTATGTTGAT TTTTAGAAAA AGTATCCGAT TTATGGGAGG AGCAAGGAGA TGTTTTCACC AAAATGTGCC GCTTCTGATG CAGCTCAATT GAGAAGCGCT AAAGAAGACA TCAAAGTGCT  TCTCCGGACT AAGTTTTGCC ATCCCATTTT GGTGAAGTGT CCTTCTCTTC TTGTCTCTTT GATTTGATGA TATGATATCA CGATTTTGCA GCTGGATCAT GATTCTACGG TATTGTTAAG  TGTTTTTTTA TTACTCTGTT ATTGTTTGCT TGTTACTAGA GATATTAGAG AAAGAGAATT GAATTTGTGT GTCACGTTGC ATTGTGTTTG ACAATAGTTG CATGTTTCAC TGCAGGTTAG  ATTGGGGTGG CACGATGCTG GTACATATAA CAAAAACATT GAAGAGTGGC CACAGAGAGG TGGAGCTAAT GGAAGTCTTA GATTTGAGGC TGAGCTTAAA CATGCTGCAA ATGCTGGTGC  TGCTTCCATC ACAATTCACA TGCATTGTGG CTTTAAGACC TTCTTTTTTT TTTTTTTTTT Tnnnnnnnnn nTTTTTTTTT TTTTTTTGTC TTTATATTCT ACTTTTGTCA TATACAGGTC  TCATTAGTGC TTTAAAGCTC ATTCAACCTA TCAAAGACAA GTATCCTAAC ATCTCTTACG CCGACTTATT CCAGTTAGCT AGTGCCACTG CAATAGAGGT CTTCCTTCAC TATTCCTTGG  CTTGGCCTAG CAGGAAACTA TGTTGGCCTT AAAACTTTAT TGATAACTCT AGAATTAACT TCAGGAGGCT GGTGGTCCTG AAATCCCGAT GAAATATGGG AGAGTTGATG TCGTAGCACC  TGAACAGTGT CCAGAAGAAG GAAGACTCCC TGGTTAACTA ATCTTTCCAT TGTCTGTTTC ATGGCTTCGA TGAGTTTGTT TCAGTTTTTT GTTATGGAAT ATTGAACTAA CGAGGTGAAA  TATGCTTATG TTTAGATGCT GGACCTCCTT CACCAGCTGA TCATTTGAGA GATGTATTCT ACAGAATGGG ACTAAATGAC AGGGTGATTT CTGATTTTTT CAATTTTCTG TTATTCATGT  TAACGTGAAT ATTCTCATTT TCTGACTGCA GAGGTTGTCT TGTCAAGCAG GAAATAGTTG CCTTGTCTGG TGCACATACT TTAGGAAGAG CCAGACCAGA CCGTAGCGGT TGGGGAAAAC  CTGAGACAAA GTACACGGTA TAATAGACAA CAAAATGAAA CTTCGTTATA TTGTTGTTGC AATGATAGTG TAGAGATGTT ACGGAAACGT TCAAAATGGC AGAAAACTGG ACCTGGAGAA  GCAGGAGGAC AGTCATGGAC AGTGAAATGG CTTAAGTTTG ACAACTCTTA CTTCAAGGTC TACCTCTCTA TCTGTCTTAG TAACTTTGGA TTGGGACTGA AGAAGAGTTT TCTAGGAAGA  TGAGATATGT GAATACGAAC CTCAGTTTCT TAATAATTGA CTTCTATGAC TAGCAGGATA TCAAAGAAAA GAGGGACGAA GATCTTCTGG TGTTACCCAC TGATGCTGCG CTATTTGAAG  ATCCTTCATT CAAGGTTAAA AAACAGTGAT GAGTAATAAG ATGCCGCAGA ATTAGTAGTT CTTTGTTACT TATGTTAAAA AATAACCTCC TTTTTACAGA ACTATGCAGA GAAGTATGCT  GAAGATCCGG CTGCATTTTT CAAGGATTAC GCTGAAGCTC ATGCCAAGCT CAGCAATCTC GGGGCGAAAT TTGACCCTCC CGAGGTACAT AAAAAAGAGA GAGAAATTTT AATCTCAAGC  CACTTATGTT AACCAACATG AACCATGCCA GTTCAGTGAC TTAACCATAT AGTCTTAAAC TGCTAATCTG TCACTACGAT ACTAATCAGG GCATCATCAT TGACAACGCT CCAGAGAAGT  TTGTAGCTGC TAAGTATTCC ACTGGAAAGG TTTGTCCTTA CTACTTAACA CAAATGTGTT TGTAGCTTAT TGTAATATAA TACATTTTGA GGAAATGATT CTTATTTTAA CTTTTCCGGG  AATATTTGCA GAAGGAGCTT TCAGATTCGA TGAAGAAGAA GATTAGGGCA GAGTATGAAG CAATAGGAGG AAGCCCAGAT AAGCCATTAC CCACTAATTA CTTCCTCAAC ATCATAATTG  CCATTGGCGT TTTGGTCCTT TTGTCCACTC TCTTTGGTGG TAATAACAAC TCCGATTTCT CTGGTTTCTA ATTGGAAAAA TTAGAAATAT ATATTTCTAA TTGGAAAAAT TAGAAAAATA  TATATTTTGA TTTCTCTTAC CTATATACAT AATTACTTGG TGTTCATATA TTCTTTGCAA ACGAACACAT CATTGGTATA GTTTGCTTGG ATAAAGTCAC CTTTAATAAC ATCTTATTTG 
GTGGTTTAAG ATTTGAGATT AGTGTGAGCT TTTCAAATAC TAGATACTA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTGTTT CTCTCTCCGC CTCCGCCGCC TCTCAGTTAC TCTGTTCATC CACCAGACTC TCTCTTTCCC CCGCCGTCGC CTCCTCTTCG TCCACCTCAG CTCCTCTCGT TGCGGTTTCT  TCCTCTACGT CGACACATTC TCTTTCTTCT CTTCGAAACG TCGCATCTTC CTCCTCTCTA TTTCCTCATT CCTCCCTCGT TCAGAAAAAG TATCCGATTT ATGGGAGGAG CAAGGAGATG  TTTTCACCAA AATGTGCCGC TTCTGATGCA GCTCAATTGA GAAGCGCTAA AGAAGACATC AAAGTGCTTC TCCGGACTAA GTTTTGCCAT CCCATTTTGG TTAGATTGGG GTGGCACGAT  GCTGGTACAT ATAACAAAAA CATTGAAGAG TGGCCACAGA GAGGTGGAGC TAATGGAAGT CTTAGATTTG AGGCTGAGCT TAAACATGCT GCAAATGCTG GTCTCATTAG TGCTTTAAAG  CTCATTCAAC CTATCAAAGA CAAGTATCCT AACATCTCTT ACGCCGACTT ATTCCAGTTA GCTAGTGCCA CTGCAATAGA GGAGGCTGGT GGTCCTGAAA TCCCGATGAA ATATGGGAGA  GTTGATGTCG TAGCACCTGA ACAGTGTCCA GAAGAAGGAA GACTCCCTGA TGCTGGACCT CCTTCACCAG CTGATCATTT GAGAGATGTA TTCTACAGAA TGGGACTAAA TGACAGGGAA  ATAGTTGCCT TGTCTGGTGC ACATACTTTA GGAAGAGCCA GACCAGACCG TAGCGGTTGG GGAAAACCTG AGACAAAGTA CACGAAAACT GGACCTGGAG AAGCAGGAGG ACAGTCATGG  ACAGTGAAAT GGCTTAAGTT TGACAACTCT TACTTCAAGG ATATCAAAGA AAAGAGGGAC GAAGATCTTC TGGTGTTACC CACTGATGCT GCGCTATTTG AAGATCCTTC ATTCAAGAAC  TATGCAGAGA AGTATGCTGA AGATCCGGCT GCATTTTTCA AGGATTACGC TGAAGCTCAT GCCAAGCTCA GCAATCTCGG GGCGAAATTT GACCCTCCCG AGGGCATCAT CATTGACAAC  GCTCCAGAGA AGTTTGTAGC TGCTAAGTAT TCCACTGGAA AGAAGGAGCT TTCAGATTCG ATGAAGAAGA AGATTAGGGC AGAGTATGAA GCAATAGGAG GAAGCCCAGA TAAGCCATTA 
CCCACTAATT ACTTCCTCAA CATCATAATT GCCATTGGCG TTTTGGTCCT TTTGTCCACT CTCTTTGGTG GTAATAACAA CTCCGATTTC TCTGGTTTCT AA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CAACGTATCG CTAAGTTACT GACACCTGTC TTTTTAAACT CACTCTTCCG TCGCTTCTCT CCGCCGTGAC AACAATGGCT GTTTCTCTCT CCGCCTCCGC CGCCTCTCAG TTACTCTGTT  CATCCACCAG ACTCTCTCTT TCCCCCGCCG TCGCCTCCTC TTCGTCCACC TCAGCTCCTC TCGTTGCGGT TTCTTCCTCT ACGTCGACAC ATTCTCTTTC TTCTCTTCGA AACGTCGCAT  CTTCCTCCTC TCTATTTCCT CATTCCTCCC TCGTTCAGAA AAAGTATCCG ATTTATGGGA GGAGCAAGGA GATGTTTTCA CCAAAATGTG CCGCTTCTGA TGCAGCTCAA TTGAGAAGCG  CTAAAGAAGA CATCAAAGTG CTTCTCCGGA CTAAGTTTTG CCATCCCATT TTGGTTAGAT TGGGGTGGCA CGATGCTGGT ACATATAACA AAAACATTGA AGAGTGGCCA CAGAGAGGTG  GAGCTAATGG AAGTCTTAGA TTTGAGGCTG AGCTTAAACA TGCTGCAAAT GCTGGTCTCA TTAGTGCTTT AAAGCTCATT CAACCTATCA AAGACAAGTA TCCTAACATC TCTTACGCCG  ACTTATTCCA GTTAGCTAGT GCCACTGCAA TAGAGGAGGC TGGTGGTCCT GAAATCCCGA TGAAATATGG GAGAGTTGAT GTCGTAGCAC CTGAACAGTG TCCAGAAGAA GGAAGACTCC  CTGATGCTGG ACCTCCTTCA CCAGCTGATC ATTTGAGAGA TGTATTCTAC AGAATGGGAC TAAATGACAG GGAAATAGTT GCCTTGTCTG GTGCACATAC TTTAGGAAGA GCCAGACCAG  ACCGTAGCGG TTGGGGAAAA CCTGAGACAA AGTACACGAA AACTGGACCT GGAGAAGCAG GAGGACAGTC ATGGACAGTG AAATGGCTTA AGTTTGACAA CTCTTACTTC AAGGATATCA  AAGAAAAGAG GGACGAAGAT CTTCTGGTGT TACCCACTGA TGCTGCGCTA TTTGAAGATC CTTCATTCAA GAACTATGCA GAGAAGTATG CTGAAGATCC GGCTGCATTT TTCAAGGATT  ACGCTGAAGC TCATGCCAAG CTCAGCAATC TCGGGGCGAA ATTTGACCCT CCCGAGGGCA TCATCATTGA CAACGCTCCA GAGAAGTTTG TAGCTGCTAA GTATTCCACT GGAAAGAAGG  AGCTTTCAGA TTCGATGAAG AAGAAGATTA GGGCAGAGTA TGAAGCAATA GGAGGAAGCC CAGATAAGCC ATTACCCACT AATTACTTCC TCAACATCAT AATTGCCATT GGCGTTTTGG  TCCTTTTGTC CACTCTCTTT GGTGGTAATA ACAACTCCGA TTTCTCTGGT TTCTAATTGG AAAAATTAGA AATATATATT TCTAATTGGA AAAATTAGAA AAATATATAT TTTGATTTCT  CTTACCTATA TACATAATTA CTTGGTGTTC ATATATTCTT TGCAAACGAA CACATCATTG GTATAGTTTG CTTGGATAAA GTCACCTTTA ATAACATCTT ATTTGGTGGT TTAAGATTTG 
AGATTAGTGT GAGCTTTTCA AATACTAGAT ACTA 

Retrieve as FASTA