Entry information : BstrPrx66Bostr.26675s0215
Entry ID 14993
Creation 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: BstrPrx66Bostr.26675s0215
Name BstrPrx66Bostr.26675s0215
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx021]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Boechera
Organism Boechera stricta    [TaxId: 72658 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value BstrPrx66
start..stop
S start..stop
AtPrx10 675 0 1..350 1..350
AhalPrx15 672 0 1..350 1..350
AlyPrx10 671 0 1..350 1..350
CagraPrx12 654 0 1..350 1..356
Literature and cross-references BstrPrx66Bostr.26675s0215
Protein sequence: BstrPrx66Bostr.26675s0215
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   350
PWM (Da):   %s   37998.78  
PI (pH):   %s   5.39
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MDCKNISYSF ISYLAILTLF FNDFVSSFPS GYNHGYNNGQ GYGLTSNLDY RFYDRSCPRL QMIVKSGVWR AFKDDSRIAA SLLRLHFHDC FVNGCDGSIL LNDSEDFKGE KNAGPNRNSV  RGFEVIEDIK SDIESSCPLT VSCADIVALA AREAVVLTGG PFWSVPLGRR DSLTASEQAA NTNLPSPFEP LENITAKFVT LGLDLKDVVV LSGAHTIGFA QCFVFKHRLF NFKGSGQPDP 
NLAASSALLS KLKDTCPNVD SSDSKLAALD AATSVKFDNA YYVNLMNNIG LLDSDQTLMT DPTAAALVKS YSENPYLFSR DFAVSMVKMG NIGVMTGSDG VIRGKCGFPG * 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CGATCAATCC ATCTTTTATT TCATCATTAT GGACTGCAAA AATATTTCGT ATTCGTTTAT ATCTTACCTC GCAATCTTAA CTCTTTTCTT CAATGACTTC GTCTCCTCGT TTCCTTCGGG  ATATAACCAT GGTTATAATA ATGGTCAAGG ATACGGACTA ACTAGCAATC TCGACTATCG ATTCTATGAT CGGTCTTGTC CTCGTCTTCA GATGATTGTT AAGTCCGGAG TTTGGAGAGC  TTTTAAAGAT GATTCTAGAA TCGCTGCGTC TCTTCTCCGA CTCCATTTCC ATGATTGTTT TGTCAATGTA AGTTTTTGTT GTTTAATTGT CAGTGTAAGT TACGTGACAT TTCTTTTTTT  TTTTTTTTAT GTTTACGCAT GCATATATAA ATAGTGGATT ATATATCACA CATACTCTAT ATATATTTAA GCCGTGTATA TATTATAAAA ACTAATCAAG CCAATTTAGT GAAAACATTT  CTACTCAAGT ACTAATATTT TACAACAATT CTACTTGAAA AAAAAAAACA CTCTCTAGAC ACATACGCAT CAAAAAAATT ATGTTTCTGT TTTAGTATAT AAAAGATCCA TATTAGAGTA  GAAGCCACTA GCTAGACTAA AGGCTCTATA TATGTGTATC AAAAATAATT ATTTCTATAT AACTACGAAA ATGAAGTAAT TAAATTGTAT GTTGTAGGGA TGTGATGGAT CTATACTTCT  GAATGATTCC GAGGATTTCA AAGGAGAGAA GAACGCTGGG CCAAACCGAA ACTCAGTCCG TGGCTTCGAA GTCATTGAAG ACATTAAATC TGACATCGAA AGTTCTTGTC CCTTAACTGT  TTCATGCGCG GACATAGTTG CCCTTGCAGC TAGAGAAGCC GTCGTCCTCG TACGTGTGAT CTTGAAACCC CTAATTATTA ATCTGAAATA TGACAATATT ATAATGAAAT AACAAAAACA  TTATCTATTG GTTCATTACT TATGACTTCT TATGCCATGC AGACCGGAGG GCCGTTTTGG TCGGTGCCTT TGGGGCGAAG GGACTCGTTA ACGGCAAGTG AGCAAGCGGC AAATACAAAC  CTGCCGTCTC CGTTTGAGCC GTTGGAGAAT ATAACAGCCA AGTTTGTGAC CCTTGGGCTC GACCTCAAGG ATGTTGTTGT CCTCTCAGGT TTGGTTAATT CAAAATTCGA TTCAACTCGA  TACATTATAG AGACTTTAAG AAAATCAAAA TCGATTGACT TTTGTATTAA TTAAGTAAAA TATTACTTAT GTTAAAACAA ATATTAAATG GTAGCAAATC GATTATTATA AACCAAATAG  AGTAAAGTAC ATCATCAGGC ATATACATGG TTATTTTGAA CTTATACTAC TATATGACTT AATTTAATGA TACGTGGATG TAGGAGCACA TACTATAGGA TTTGCTCAAT GTTTCGTTTT  CAAGCACAGG CTCTTCAACT TCAAGGGCTC TGGACAGCCT GACCCAAACC TAGCTGCTTC CTCGGCTCTT CTCTCTAAGC TAAAGGACAC ATGTCCTAAT GTGGACTCAT CGGACTCTAA  GCTCGCTGCT CTTGACGCAG CTACCTCAGT CAAGTTTGAC AATGCTTACT ACGTGAACTT AATGAATAAC ATAGGACTGT TGGATTCCGA CCAAACCCTA ATGACGGATC CTACAGCCGC  CGCCTTGGTG AAGTCGTACA GCGAGAATCC GTACTTGTTC TCGAGGGATT TTGCAGTTTC AATGGTTAAA ATGGGGAATA TCGGCGTTAT GACCGGAAGT GATGGAGTAA TTAGAGGAAA  ATGTGGATTT CCAGGTTAAG TTACATAGAC TCGTTTGAAC CTAAAACACT CAGTCATCAA TCTAGAACAT ATCTAGAAAT AATCTAGCTT TTAAATATGA ATCATATAGA CAAAAGTCTA  TGAATAAAAT ATGTTTATAT ATGGTGTAAA ATCAACCTTA TGTATCTACA TATGGATCAC AGAGACAAAA ATACTTGGAA TTGTATGTGT GTTTGTGTGT AATGGAATAT GTGTCTTTGT 
ATTTTTCTAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGACTGCA AAAATATTTC GTATTCGTTT ATATCTTACC TCGCAATCTT AACTCTTTTC TTCAATGACT TCGTCTCCTC GTTTCCTTCG GGATATAACC ATGGTTATAA TAATGGTCAA  GGATACGGAC TAACTAGCAA TCTCGACTAT CGATTCTATG ATCGGTCTTG TCCTCGTCTT CAGATGATTG TTAAGTCCGG AGTTTGGAGA GCTTTTAAAG ATGATTCTAG AATCGCTGCG  TCTCTTCTCC GACTCCATTT CCATGATTGT TTTGTCAATG GATGTGATGG ATCTATACTT CTGAATGATT CCGAGGATTT CAAAGGAGAG AAGAACGCTG GGCCAAACCG AAACTCAGTC  CGTGGCTTCG AAGTCATTGA AGACATTAAA TCTGACATCG AAAGTTCTTG TCCCTTAACT GTTTCATGCG CGGACATAGT TGCCCTTGCA GCTAGAGAAG CCGTCGTCCT CACCGGAGGG  CCGTTTTGGT CGGTGCCTTT GGGGCGAAGG GACTCGTTAA CGGCAAGTGA GCAAGCGGCA AATACAAACC TGCCGTCTCC GTTTGAGCCG TTGGAGAATA TAACAGCCAA GTTTGTGACC  CTTGGGCTCG ACCTCAAGGA TGTTGTTGTC CTCTCAGGAG CACATACTAT AGGATTTGCT CAATGTTTCG TTTTCAAGCA CAGGCTCTTC AACTTCAAGG GCTCTGGACA GCCTGACCCA  AACCTAGCTG CTTCCTCGGC TCTTCTCTCT AAGCTAAAGG ACACATGTCC TAATGTGGAC TCATCGGACT CTAAGCTCGC TGCTCTTGAC GCAGCTACCT CAGTCAAGTT TGACAATGCT  TACTACGTGA ACTTAATGAA TAACATAGGA CTGTTGGATT CCGACCAAAC CCTAATGACG GATCCTACAG CCGCCGCCTT GGTGAAGTCG TACAGCGAGA ATCCGTACTT GTTCTCGAGG 
GATTTTGCAG TTTCAATGGT TAAAATGGGG AATATCGGCG TTATGACCGG AAGTGATGGA GTAATTAGAG GAAAATGTGG ATTTCCAGGT TAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CGATCAATCC ATCTTTTATT TCATCATTAT GGACTGCAAA AATATTTCGT ATTCGTTTAT ATCTTACCTC GCAATCTTAA CTCTTTTCTT CAATGACTTC GTCTCCTCGT TTCCTTCGGG  ATATAACCAT GGTTATAATA ATGGTCAAGG ATACGGACTA ACTAGCAATC TCGACTATCG ATTCTATGAT CGGTCTTGTC CTCGTCTTCA GATGATTGTT AAGTCCGGAG TTTGGAGAGC  TTTTAAAGAT GATTCTAGAA TCGCTGCGTC TCTTCTCCGA CTCCATTTCC ATGATTGTTT TGTCAATGGA TGTGATGGAT CTATACTTCT GAATGATTCC GAGGATTTCA AAGGAGAGAA  GAACGCTGGG CCAAACCGAA ACTCAGTCCG TGGCTTCGAA GTCATTGAAG ACATTAAATC TGACATCGAA AGTTCTTGTC CCTTAACTGT TTCATGCGCG GACATAGTTG CCCTTGCAGC  TAGAGAAGCC GTCGTCCTCA CCGGAGGGCC GTTTTGGTCG GTGCCTTTGG GGCGAAGGGA CTCGTTAACG GCAAGTGAGC AAGCGGCAAA TACAAACCTG CCGTCTCCGT TTGAGCCGTT  GGAGAATATA ACAGCCAAGT TTGTGACCCT TGGGCTCGAC CTCAAGGATG TTGTTGTCCT CTCAGGAGCA CATACTATAG GATTTGCTCA ATGTTTCGTT TTCAAGCACA GGCTCTTCAA  CTTCAAGGGC TCTGGACAGC CTGACCCAAA CCTAGCTGCT TCCTCGGCTC TTCTCTCTAA GCTAAAGGAC ACATGTCCTA ATGTGGACTC ATCGGACTCT AAGCTCGCTG CTCTTGACGC  AGCTACCTCA GTCAAGTTTG ACAATGCTTA CTACGTGAAC TTAATGAATA ACATAGGACT GTTGGATTCC GACCAAACCC TAATGACGGA TCCTACAGCC GCCGCCTTGG TGAAGTCGTA  CAGCGAGAAT CCGTACTTGT TCTCGAGGGA TTTTGCAGTT TCAATGGTTA AAATGGGGAA TATCGGCGTT ATGACCGGAA GTGATGGAGT AATTAGAGGA AAATGTGGAT TTCCAGGTTA  AGTTACATAG ACTCGTTTGA ACCTAAAACA CTCAGTCATC AATCTAGAAC ATATCTAGAA ATAATCTAGC TTTTAAATAT GAATCATATA GACAAAAGTC TATGAATAAA ATATGTTTAT 
ATATGGTGTA AAATCAACCT TATGTATCTA CATATGGATC ACAGAGACAA AAATACTTGG AATTGTATGT GTGTTTGTGT GTAATGGAAT ATGTGTCTTT GTATTTTTCT AG 

Retrieve as FASTA