Entry information : BstrPrx68Bostr.10199s0027
Entry ID 14995
Creation 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: BstrPrx68Bostr.10199s0027
Name BstrPrx68Bostr.10199s0027
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx029]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Boechera
Organism Boechera stricta    [TaxId: 72658 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value BstrPrx68
start..stop
S start..stop
AlyPrx61 681 0 1..341 1..341
AtPrx61 672 0 2..341 1..340
BrPrx61-1Aa_other 659 0 1..341 1..341
TsPrx61 659 0 1..341 1..341
Literature and cross-references BstrPrx68Bostr.10199s0027
Protein sequence: BstrPrx68Bostr.10199s0027
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   341 (315)
PWM (Da):   %s   37331.65 (34451.1) Transmb domain:   %s   i7-29o
PI (pH):   %s   7.06 (7.06) Peptide Signal:   %s   cut: 27 range:27-341
Sequence
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Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MMQFMKFFPL LALVVISLAG TATVEAATGL NPPVKLVWHY YKVTNTCDDA ETYIRYQVEK FYKDDSSIAP KLLRLLYSDC MVNGCDASVL LQGPNSERTA PQNRGLGGFV IIDKIKQVLE  SRCPGVVSCA DILNLATRDA VHMAGAPSYP VFTGRRDGGI LNADAVDLPS PSISVDESLA YFKSKGLDVL DMTTLLGAHS MGKTHCSHIV NRLYNFKSTG KPDPSMNTTL VSQLRYLCPP 
RTQKGQTDPL VYLNPESGSS NRFSNSYYSR VLSHNAVLGV DQELLNNDDS KEITQEFASG FEDFRKSFAL AMSRMGSINV LTGTAGEIRQ DCRVTNANYG A* 

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Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TTTCTTTTCT CGTATACACA AACAATAAGA ATCTAGCTAC TTTGATCTTT TAATCAAAAA CGAAAAAGAA AACTAGGGTT TTTTGTGGTG GAAGTTTTTT TCGTTTTTTA TTAAAATGAT  GCAGTTTATG AAATTTTTCC CACTATTGGC CCTCGTAGTC ATAAGCTTAG CCGGAACGGC GACAGTAGAG GCTGCGACGG GATTGAACCC TCCGGTGAAG CTGGTTTGGC ATTACTACAA  AGTTACTAAC ACTTGTGATG ATGCAGAGAC TTATATTAGA TACCAAGTCG AAAAGTTTTA TAAGGATGAT AGTAGTATTG CCCCAAAGCT GCTACGTCTC CTATACTCCG ATTGCATGGT  TAATGTAAGT AAAAACCGTC GTTCAATAAC TATAAGATTT ACATTTCCTT CATTTAATTT CTTTTATACC CATTGGTAGT GTTGTTCTAT GTAAAATGTG TATGTAGGGA TGTGATGCTT  CGGTTCTCTT GCAAGGACCA AACTCAGAAA GGACAGCTCC ACAGAATCGA GGGCTTGGAG GTTTTGTGAT AATCGATAAG ATAAAACAAG TTCTTGAATC ACGTTGTCCT GGTGTTGTTT  CTTGCGCTGA TATCCTCAAC CTTGCCACTA GAGATGCTGT TCACATGGTA CATATATACA TGTACTTGCA TGTTCTTATT AAAGAGGAAG TATTGATTGA TTATTGTGTG AATTTTACTG  ATTGGTGTTT TTTTGACAAA TTCGATATTA GGCCGGAGCA CCGTCTTACC CTGTGTTTAC CGGGCGAAGG GACGGTGGGA TATTAAATGC AGACGCCGTG GATCTGCCGT CACCGTCCAT  CTCAGTCGAC GAGTCATTGG CATACTTCAA ATCCAAAGGT CTTGACGTTT TGGATATGAC TACTCTTCTA GGTATTTCAT TCGTCTTCTT TTTATCTTTC CCTTTAAACA CAAGCATCTT  TTATCATTTC TTCTAGCTAG GGAAACGTAC TCGCAATGCA CTACAAATTC GATTGTTTGC TTACGTTTGC GTTTATATTT ACATATAGTG TTTACTTTTC CAAATGATTC CACAACCAAA  AGCATTTTAA TCAAAATCAT TTGTTAATTA TAAACGAAGA CATCAACTGA ATAGCTTTGG GTTTGACATT TTTTTAATTT GTAATTTGCA AAAATATTTT CTGAAAATCT TAAAAAATGT  TTGATATTTT AAAAATATGA CATTTGAAAC AATGAAGACC TAATTATATT AACGTTGAAA AAAACTAAGA TTGTAATTCA ATGCTCTAGT TATGTTTGGC AGAGAGGAAG ATCTTACCAC  TACTATATAA AGATTACAAA TATTTGAATT AATTCTCATA GCATACAACA CTTAACTACT ATAAAGTTTA CAAGGCGGTT TCACATCCTA GAATTTAAGA ATATCCAAAT AATAAACTGG  TAATCAAGAA ATAAAAATAT AATATACAAT CAAAGTGGAG TTAAATAACT TTATCTTGGG TGAATTCTAA CAACCTCTAA TATATTGCGT AATGGAATAG GAGCACACTC AATGGGGAAG  ACACATTGCA GTCACATAGT GAACAGACTA TATAACTTCA AGAGCACCGG GAAACCAGAT CCGAGCATGA ACACGACATT GGTTTCACAA CTTCGATATC TTTGTCCTCC AAGAACACAA  AAGGGCCAAA CCGATCCACT CGTTTACCTA AACCCAGAGT CAGGCTCGAG CAACAGATTC AGCAACTCTT ACTATTCTCG TGTTCTGTCT CATAACGCTG TTTTGGGGGT GGACCAAGAG  TTGCTAAACA ACGATGACTC GAAGGAGATC ACGCAAGAGT TCGCTTCAGG TTTTGAAGAT TTCAGAAAGT CTTTTGCTTT AGCAATGTCG AGGATGGGAT CTATCAATGT GTTGACCGGA  ACAGCTGGAG AGATTCGTCA AGACTGCAGA GTTACCAACG CTAATTACGG GGCTTAAACT ATATTTATAT CTTATTTAAT TTATGTGTGT GTGTTTGTTA TAAAATATAA ATATAAATTA 
TTTTGATAAA ATTATTATCA ATAAGGATGG AAGATAAATA AGGGAAATTG CATTCTATGA CAATGACAGA TTTAAAAATT TATGGAGTAA CACATACACT A 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGATGCAGT TTATGAAATT TTTCCCACTA TTGGCCCTCG TAGTCATAAG CTTAGCCGGA ACGGCGACAG TAGAGGCTGC GACGGGATTG AACCCTCCGG TGAAGCTGGT TTGGCATTAC  TACAAAGTTA CTAACACTTG TGATGATGCA GAGACTTATA TTAGATACCA AGTCGAAAAG TTTTATAAGG ATGATAGTAG TATTGCCCCA AAGCTGCTAC GTCTCCTATA CTCCGATTGC  ATGGTTAATG GATGTGATGC TTCGGTTCTC TTGCAAGGAC CAAACTCAGA AAGGACAGCT CCACAGAATC GAGGGCTTGG AGGTTTTGTG ATAATCGATA AGATAAAACA AGTTCTTGAA  TCACGTTGTC CTGGTGTTGT TTCTTGCGCT GATATCCTCA ACCTTGCCAC TAGAGATGCT GTTCACATGG CCGGAGCACC GTCTTACCCT GTGTTTACCG GGCGAAGGGA CGGTGGGATA  TTAAATGCAG ACGCCGTGGA TCTGCCGTCA CCGTCCATCT CAGTCGACGA GTCATTGGCA TACTTCAAAT CCAAAGGTCT TGACGTTTTG GATATGACTA CTCTTCTAGG AGCACACTCA  ATGGGGAAGA CACATTGCAG TCACATAGTG AACAGACTAT ATAACTTCAA GAGCACCGGG AAACCAGATC CGAGCATGAA CACGACATTG GTTTCACAAC TTCGATATCT TTGTCCTCCA  AGAACACAAA AGGGCCAAAC CGATCCACTC GTTTACCTAA ACCCAGAGTC AGGCTCGAGC AACAGATTCA GCAACTCTTA CTATTCTCGT GTTCTGTCTC ATAACGCTGT TTTGGGGGTG  GACCAAGAGT TGCTAAACAA CGATGACTCG AAGGAGATCA CGCAAGAGTT CGCTTCAGGT TTTGAAGATT TCAGAAAGTC TTTTGCTTTA GCAATGTCGA GGATGGGATC TATCAATGTG 
TTGACCGGAA CAGCTGGAGA GATTCGTCAA GACTGCAGAG TTACCAACGC TAATTACGGG GCTTAA 

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cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TTTCTTTTCT CGTATACACA AACAATAAGA ATCTAGCTAC TTTGATCTTT TAATCAAAAA CGAAAAAGAA AACTAGGGTT TTTTGTGGTG GAAGTTTTTT TCGTTTTTTA TTAAAATGAT  GCAGTTTATG AAATTTTTCC CACTATTGGC CCTCGTAGTC ATAAGCTTAG CCGGAACGGC GACAGTAGAG GCTGCGACGG GATTGAACCC TCCGGTGAAG CTGGTTTGGC ATTACTACAA  AGTTACTAAC ACTTGTGATG ATGCAGAGAC TTATATTAGA TACCAAGTCG AAAAGTTTTA TAAGGATGAT AGTAGTATTG CCCCAAAGCT GCTACGTCTC CTATACTCCG ATTGCATGGT  TAATGGATGT GATGCTTCGG TTCTCTTGCA AGGACCAAAC TCAGAAAGGA CAGCTCCACA GAATCGAGGG CTTGGAGGTT TTGTGATAAT CGATAAGATA AAACAAGTTC TTGAATCACG  TTGTCCTGGT GTTGTTTCTT GCGCTGATAT CCTCAACCTT GCCACTAGAG ATGCTGTTCA CATGGCCGGA GCACCGTCTT ACCCTGTGTT TACCGGGCGA AGGGACGGTG GGATATTAAA  TGCAGACGCC GTGGATCTGC CGTCACCGTC CATCTCAGTC GACGAGTCAT TGGCATACTT CAAATCCAAA GGTCTTGACG TTTTGGATAT GACTACTCTT CTAGGAGCAC ACTCAATGGG  GAAGACACAT TGCAGTCACA TAGTGAACAG ACTATATAAC TTCAAGAGCA CCGGGAAACC AGATCCGAGC ATGAACACGA CATTGGTTTC ACAACTTCGA TATCTTTGTC CTCCAAGAAC  ACAAAAGGGC CAAACCGATC CACTCGTTTA CCTAAACCCA GAGTCAGGCT CGAGCAACAG ATTCAGCAAC TCTTACTATT CTCGTGTTCT GTCTCATAAC GCTGTTTTGG GGGTGGACCA  AGAGTTGCTA AACAACGATG ACTCGAAGGA GATCACGCAA GAGTTCGCTT CAGGTTTTGA AGATTTCAGA AAGTCTTTTG CTTTAGCAAT GTCGAGGATG GGATCTATCA ATGTGTTGAC  CGGAACAGCT GGAGAGATTC GTCAAGACTG CAGAGTTACC AACGCTAATT ACGGGGCTTA AACTATATTT ATATCTTATT TAATTTATGT GTGTGTGTTT GTTATAAAAT ATAAATATAA 
ATTATTTTGA TAAAATTATT ATCAATAAGG ATGGAAGATA AATAAGGGAA ATTGCATTCT ATGACAATGA CAGATTTAAA AATTTATGGA GTAACACATA CACTA 

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