Entry information : CrubPrx100Carubv10016167m.g
Entry ID 15014
Creation 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CrubPrx100Carubv10016167m.g
Name CrubPrx100Carubv10016167m.g
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx004]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella rubella    [TaxId: 81985 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CrubPrx100
start..stop
S start..stop
CagraPrx37 646 0 1..318 1..318
AhalPrx60 620 0 1..318 1..318
AtPrx27 619 0 1..318 1..318
AlyPrx27 618 0 1..318 1..318
Literature and cross-references CrubPrx100Carubv10016167m.g
Protein sequence: CrubPrx100Carubv10016167m.g
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   318 (295)
PWM (Da):   %s   34509.65 (32074.3) Transmb domain:   %s   i7-24o
PI (pH):   %s   8.91 (8.86) Peptide Signal:   %s   cut: 24 range:24-318
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAASKQLIVS CLFLVLLFAQ ATSQGLRVGF YSKTCPQVEG IVKKVVFDAM KKAPTLGAPL LRMFFHDCFV RGCDGSVLLD KSNNQAEKSA IPNLSLRGFG IIDDSKAALE KVCPGIVSCS  DVLALVARDA MVALEGPSWE VETGRRDGRV SNINEVNLPS PFDNITKLIT DFRSKGLNEK DLVILSGGHT IGMGHCPLLT NRLYNFTGRG DSDPSLDSEY AAHLRKKCKP TDTTTALEMD 
PGSFKTFDVS YFTLVAKRRG LFQSDAALLD NSKTRGYVLQ LARTHGSMFF HDFGVSMVKM GRAGVLTGQS GEIRKMCR 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCCGCTT CTAAGCAACT AATTGTCTCT TGCTTGTTCT TAGTGCTGTT GTTTGCTCAA GCCACTTCGC AAGGCTTGAG AGTAGGTTTC TACAGCAAAA CATGCCCACA AGTCGAGGGT  ATTGTGAAAA AGGTCGTGTT CGATGCAATG AAGAAAGCCC CTACACTTGG TGCTCCTTTG CTTAGGATGT TCTTCCACGA CTGCTTCGTT CGAGTAAGTT TTATGTAAAG CGTGAAGTGA  CTCATGACTT TTATATTTTT TCATCACGTC ACGTTTGCTT AACAATGTGA GATTCCTAGA AAAATGATTA ATTTGTTGTA TCATCTATCG TCGATCTAAT GTGTGGATCT TTATAATTAA  TTAACAGGGA TGTGACGGAT CAGTTTTGTT AGACAAATCG AACAACCAAG CCGAGAAGAG TGCGATTCCT AACCTAAGCC TTCGAGGGTT TGGCATCATA GACGATTCCA AGGCGGCTCT  AGAAAAAGTG TGCCCGGGTA TTGTTTCTTG CTCTGATGTC TTGGCACTTG TCGCCAGAGA CGCAATGGTT GCAGTAAGTA ATCTTCACAT AAATACAAAA TTATTTCTAC ATGTATACAC  GTACAAAAAA GAGCTCTCTA AATTTACTAT GAATATGTAA ATTTGTAGCT TGAAGGACCA TCGTGGGAAG TTGAAACGGG AAGAAGAGAC GGTAGGGTTT CCAATATCAA CGAGGTCAAC  TTGCCATCAC CTTTCGATAA CATCACCAAG CTTATCACGG ATTTCCGCTC AAAGGGCCTC AACGAGAAGG ATCTAGTCAT TCTTTCTGGT ACGTAAAAGT GTTAGTCTAA AAAGTGAATA  ATGAGAAATC TTGTTTTGGT AGTGATATTG ATATATGGAA AATACACATG TTTTTTTTTT CTATAGGTGG ACACACTATT GGAATGGGAC ATTGTCCTCT ATTGACAAAC CGGCTTTACA  ACTTCACCGG AAGAGGAGAC AGTGACCCGA GTTTGGACTC GGAGTACGCC GCTCACCTCA GGAAGAAGTG CAAGCCGACC GATACCACGA CGGCTCTAGA GATGGATCCA GGAAGTTTCA  AGACTTTTGA CGTGAGCTAC TTCACGCTAG TGGCTAAGAG AAGAGGACTT TTCCAATCGG ATGCTGCTCT ATTGGACAAC TCCAAGACAA GGGGTTATGT CTTGCAGCTG GCAAGAACCC 
ATGGGTCGAT GTTCTTTCAT GACTTTGGTG TCTCTATGGT GAAAATGGGT CGGGCCGGAG TTCTTACGGG TCAGTCTGGG GAGATCCGTA AGATGTGTCG G 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCCGCTT CTAAGCAACT AATTGTCTCT TGCTTGTTCT TAGTGCTGTT GTTTGCTCAA GCCACTTCGC AAGGCTTGAG AGTAGGTTTC TACAGCAAAA CATGCCCACA AGTCGAGGGT  ATTGTGAAAA AGGTCGTGTT CGATGCAATG AAGAAAGCCC CTACACTTGG TGCTCCTTTG CTTAGGATGT TCTTCCACGA CTGCTTCGTT CGAGGATGTG ACGGATCAGT TTTGTTAGAC  AAATCGAACA ACCAAGCCGA GAAGAGTGCG ATTCCTAACC TAAGCCTTCG AGGGTTTGGC ATCATAGACG ATTCCAAGGC GGCTCTAGAA AAAGTGTGCC CGGGTATTGT TTCTTGCTCT  GATGTCTTGG CACTTGTCGC CAGAGACGCA ATGGTTGCAC TTGAAGGACC ATCGTGGGAA GTTGAAACGG GAAGAAGAGA CGGTAGGGTT TCCAATATCA ACGAGGTCAA CTTGCCATCA  CCTTTCGATA ACATCACCAA GCTTATCACG GATTTCCGCT CAAAGGGCCT CAACGAGAAG GATCTAGTCA TTCTTTCTGG TGGACACACT ATTGGAATGG GACATTGTCC TCTATTGACA  AACCGGCTTT ACAACTTCAC CGGAAGAGGA GACAGTGACC CGAGTTTGGA CTCGGAGTAC GCCGCTCACC TCAGGAAGAA GTGCAAGCCG ACCGATACCA CGACGGCTCT AGAGATGGAT  CCAGGAAGTT TCAAGACTTT TGACGTGAGC TACTTCACGC TAGTGGCTAA GAGAAGAGGA CTTTTCCAAT CGGATGCTGC TCTATTGGAC AACTCCAAGA CAAGGGGTTA TGTCTTGCAG 
CTGGCAAGAA CCCATGGGTC GATGTTCTTT CATGACTTTG GTGTCTCTAT GGTGAAAATG GGTCGGGCCG GAGTTCTTAC GGGTCAGTCT GGGGAGATCC GTAAGATGTG TCGG 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCCGCTT CTAAGCAACT AATTGTCTCT TGCTTGTTCT TAGTGCTGTT GTTTGCTCAA GCCACTTCGC AAGGCTTGAG AGTAGGTTTC TACAGCAAAA CATGCCCACA AGTCGAGGGT  ATTGTGAAAA AGGTCGTGTT CGATGCAATG AAGAAAGCCC CTACACTTGG TGCTCCTTTG CTTAGGATGT TCTTCCACGA CTGCTTCGTT CGAGGATGTG ACGGATCAGT TTTGTTAGAC  AAATCGAACA ACCAAGCCGA GAAGAGTGCG ATTCCTAACC TAAGCCTTCG AGGGTTTGGC ATCATAGACG ATTCCAAGGC GGCTCTAGAA AAAGTGTGCC CGGGTATTGT TTCTTGCTCT  GATGTCTTGG CACTTGTCGC CAGAGACGCA ATGGTTGCAC TTGAAGGACC ATCGTGGGAA GTTGAAACGG GAAGAAGAGA CGGTAGGGTT TCCAATATCA ACGAGGTCAA CTTGCCATCA  CCTTTCGATA ACATCACCAA GCTTATCACG GATTTCCGCT CAAAGGGCCT CAACGAGAAG GATCTAGTCA TTCTTTCTGG TGGACACACT ATTGGAATGG GACATTGTCC TCTATTGACA  AACCGGCTTT ACAACTTCAC CGGAAGAGGA GACAGTGACC CGAGTTTGGA CTCGGAGTAC GCCGCTCACC TCAGGAAGAA GTGCAAGCCG ACCGATACCA CGACGGCTCT AGAGATGGAT  CCAGGAAGTT TCAAGACTTT TGACGTGAGC TACTTCACGC TAGTGGCTAA GAGAAGAGGA CTTTTCCAAT CGGATGCTGC TCTATTGGAC AACTCCAAGA CAAGGGGTTA TGTCTTGCAG 
CTGGCAAGAA CCCATGGGTC GATGTTCTTT CATGACTTTG GTGTCTCTAT GGTGAAAATG GGTCGGGCCG GAGTTCTTAC GGGTCAGTCT GGGGAGATCC GTAAGATGTG TCGG 

Retrieve as FASTA