Entry information : CrubPrx101Carubv10016503m.g
Entry ID 15015
Creation 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CrubPrx101Carubv10016503m.g
Name CrubPrx101Carubv10016503m.g
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx035]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella rubella    [TaxId: 81985 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CrubPrx101
start..stop
S start..stop
BstrPrx67 691 0 21..372 1..352
AtPrx32 687 0 21..372 1..352
AhalPrx29 679 0 21..372 1..352
TsPrx32 660 0 20..372 4..357
Literature and cross-references CrubPrx101Carubv10016503m.g
Protein sequence: CrubPrx101Carubv10016503m.g
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   372
PWM (Da):   %s   41123.68  
PI (pH):   %s   7.42
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MKVPHHLNLN QSNRLIFLPK MHFSYSSLSA WTTLITLGCL IFQSSTSDAQ LNTTFYDSTC PSVFTIVRDT IVNELRSDPR IAASILRLHF HDCFVNGCDA SILLDNTTSF RTEKEAAPNA  NSARGFPVID RMKAAIEAAC PRTVSCADML TIAAQQSVNL AGGPSWRVPL GRRDSLQAFF DLANANLPAP FFTLPQLKAS FSNVGLDRPS DLVALSGGHT FGKNQCQFIM DRLYNFSNTG  LPDPTLNTTY LQTLRGQCPR NGNQTVLVDF DLRTPTVFDN KYYVNLKELK GLIQTDQELF SSPNATDTVP LVRAYADGTQ KFFNAFVEAM NRMGNITPLT GTQGQIRQNC RVVNSNSLLH 
DVVEIVDFVS SI* 

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Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CACATTTCGC CTATAAAAGG ATCCTTAAGA TATGAAGGTT CCTCATCATC TCAACTTAAA CCAATCAAAT AGGTTAATCT TCTTACCAAA AATGCATTTC TCTTATTCTT CCTTGTCGGC  TTGGACAACC CTAATAACAT TGGGTTGTCT TATATTTCAA TCATCTACGT CCGATGCTCA ACTCAACACT ACCTTCTACG ACAGTACATG CCCTAGCGTC TTTACCATCG TACGGGACAC  CATCGTAAAC GAGCTAAGAT CAGATCCTCG TATCGCTGCA AGCATCCTTC GTCTTCACTT CCATGACTGC TTTGTTAATG TAAGATATTA TTTTTTCACT TTATAAGTAT ATATATATAT  ATATATATAT ATATACGTAT TATATTTCTT ATAATTACGC CAACAATATA GAGAATTAGG TCACTGGGCT AAGATCTGGT TTACAAAAAT GTCAATATAA AATTTCAACG AAGTTAGATG  TGATATTTTT GGTTTTTATG GTCTAGTATC TTAGTTCTTG TCGTCAAGGA TGACTATAAA AAAGTAATTC GACAACATTG TAGTAAGATT TGTTCACCCA TGCATTATTC AATGAACGTG  AACTATTTAT AAATTAATTT AAGAAAAGCA TGTGGACTCT CGTACGGTCG TACCAAATAC GTTATTAATA TATTAAAAAA TCATTAACTG AAGGATAAAA AAATGTCACA GAAATCATTC  AAAAGTCTCA AGTTTATCAT CAACACTGAA CACCCCACAT AATATTTGGA AATATAAATA GAAATGTACG TGAAAACCTT ATCTATCATT TAATTTTTTA TTTCCTGGAA ATTTTTAGCT  TTTGAATCAG ATGTATTTGT TAACCTAATA TAGAATGTAA ACTAAAATCA ATAATAGCTA ACTTGTATGT ATAAACTATG TATATTATAG TGGATTAGAA GAACAAATAC TTTTAGTGAA  TGAAAATGAA ATCTTACACT CTTTTATAGC TAGTAAATTA TTTGTAAACT AAGTACAAAC ATATAAACTG ATTATGATTT CAATGTATTG ACTAACGAGT GATAAAACTT ATATTCGTTT  GCAAAGGGAT GCGATGCATC GATTTTGTTA GACAATACAA CATCCTTTCG AACAGAGAAA GAGGCAGCTC CAAACGCAAA CTCGGCTCGA GGATTTCCAG TGATTGATAG GATGAAAGCA  GCAATTGAGG CAGCATGTCC AAGGACTGTA TCATGCGCAG ATATGCTTAC CATCGCAGCT CAACAATCAG TAAATTTGGT ATGCATTTTC TCTCTCCCTT TTTTTCATTT ATAAGAAATA  TTGTGTCCAA CATAAGGAGT AGTTCTTGTT GGTTTGTTTC AATTTTTAAA AAAATATGGA GTAGCTCGAT GCAAAATAAA ACTCATAACC AAGTGCTAAT ATATCAATTG GTAAAGATCT  CTGGCAAAAG CTTAGAGGTC GCCGGTTCGA GTATTGCTTG GGACGAAACC ATATAATATG CTTTGGTTTC GGGTCTGAGG GGATGTATGG GTTTCGGTCC AGAACCTCTT TGATTATTCA  AAAAAAAAGA AAAAAAAAAA AACTCATAAA AAAAATGGAT ATTCTTGATG AATTTGAAAC AAGAATTTAA CTAGTAAACA AAATTCCTAT AGCCACTTGA ATATTCGTGA CCGTGCCTTA  ATATTCGTGG CTATAGCATC GTAGCTTAAC TAATTCGTGG TTTTTTTAAA CAAATCACCT ATAGCAACGA AATTTCGCGA CTGTCAAGTG GTTAGCTATA GAGTATTCTT TTTACTAGTA  TAATTTGGAC GCACCAAATG CTGCAACTCG CAAGTTGTAC AATCTAGCTA GATTTGATAT TATGGCATAC TACGCGGTAC TAGAAAGACT TCAATATTCA TTAGGGAAAT GTTTTAAAAT  TCTAGTCTTA TTCCAATAGT AAACTCGATT CGTTAAGACT AGTGTTTTTG GTTACTGGAA ATAATATAAG AAAAATTTCC AAACAAACTG AAAAAAATAG TCATAAAGTT GAGAACCAAT  TTGTTGAATT TTTGTGATGT ATAACTTGTC TTTTGTCTTT TGAATCGTAA CACTTTTGTG TGGTAAGAAT TATTTTCGTA AACTGATTAT TATGTTTTAA ATATCGGTAT TTTAGGCAGG  AGGTCCTTCG TGGAGGGTTC CTTTAGGGAG AAGAGACAGC TTACAAGCAT TTTTTGATCT CGCTAATGCA AATCTTCCCG CACCATTCTT CACGCTTCCA CAACTCAAGG CTAGCTTTAG  TAATGTTGGA CTTGACCGTC CTTCGGATCT TGTTGCACTC TCTGGTAATT CTCATATATA TTTCAATTCC ATCTAACAAG TTCATAAACT TTATTGTTAA TTTATCTCTT CTTTTGGTTA  GGTGGTCACA CATTTGGTAA AAACCAATGC CAATTTATTA TGGATAGGCT ATACAACTTT AGCAACACTG GTTTACCCGA CCCTACTCTC AATACAACTT ACCTCCAGAC ACTTCGTGGA  CAATGTCCCC GTAATGGTAA CCAGACGGTC TTGGTCGATT TCGATTTACG TACACCGACG GTTTTTGACA ACAAATACTA TGTGAATCTG AAAGAGCTAA AGGGACTTAT CCAGACCGAT  CAAGAATTGT TTTCTAGCCC TAATGCCACT GACACTGTCC CATTGGTGAG AGCATATGCT GATGGTACTC AAAAGTTCTT TAATGCTTTT GTGGAAGCCA TGAATAGGAT GGGAAACATT  ACACCTCTCA CTGGAACTCA AGGACAGATA AGACAGAATT GTAGGGTGGT CAACTCCAAC TCGCTGCTTC ATGATGTGGT TGAAATCGTT GACTTTGTCA GCTCTATATA ATATAACAGT 
TGTTGTTTCA ATATATGTGG C 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGGTTC CTCATCATCT CAACTTAAAC CAATCAAATA GGTTAATCTT CTTACCAAAA ATGCATTTCT CTTATTCTTC CTTGTCGGCT TGGACAACCC TAATAACATT GGGTTGTCTT  ATATTTCAAT CATCTACGTC CGATGCTCAA CTCAACACTA CCTTCTACGA CAGTACATGC CCTAGCGTCT TTACCATCGT ACGGGACACC ATCGTAAACG AGCTAAGATC AGATCCTCGT  ATCGCTGCAA GCATCCTTCG TCTTCACTTC CATGACTGCT TTGTTAATGG ATGCGATGCA TCGATTTTGT TAGACAATAC AACATCCTTT CGAACAGAGA AAGAGGCAGC TCCAAACGCA  AACTCGGCTC GAGGATTTCC AGTGATTGAT AGGATGAAAG CAGCAATTGA GGCAGCATGT CCAAGGACTG TATCATGCGC AGATATGCTT ACCATCGCAG CTCAACAATC AGTAAATTTG  GCAGGAGGTC CTTCGTGGAG GGTTCCTTTA GGGAGAAGAG ACAGCTTACA AGCATTTTTT GATCTCGCTA ATGCAAATCT TCCCGCACCA TTCTTCACGC TTCCACAACT CAAGGCTAGC  TTTAGTAATG TTGGACTTGA CCGTCCTTCG GATCTTGTTG CACTCTCTGG TGGTCACACA TTTGGTAAAA ACCAATGCCA ATTTATTATG GATAGGCTAT ACAACTTTAG CAACACTGGT  TTACCCGACC CTACTCTCAA TACAACTTAC CTCCAGACAC TTCGTGGACA ATGTCCCCGT AATGGTAACC AGACGGTCTT GGTCGATTTC GATTTACGTA CACCGACGGT TTTTGACAAC  AAATACTATG TGAATCTGAA AGAGCTAAAG GGACTTATCC AGACCGATCA AGAATTGTTT TCTAGCCCTA ATGCCACTGA CACTGTCCCA TTGGTGAGAG CATATGCTGA TGGTACTCAA  AAGTTCTTTA ATGCTTTTGT GGAAGCCATG AATAGGATGG GAAACATTAC ACCTCTCACT GGAACTCAAG GACAGATAAG ACAGAATTGT AGGGTGGTCA ACTCCAACTC GCTGCTTCAT 
GATGTGGTTG AAATCGTTGA CTTTGTCAGC TCTATATAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CACATTTCGC CTATAAAAGG ATCCTTAAGA TATGAAGGTT CCTCATCATC TCAACTTAAA CCAATCAAAT AGGTTAATCT TCTTACCAAA AATGCATTTC TCTTATTCTT CCTTGTCGGC  TTGGACAACC CTAATAACAT TGGGTTGTCT TATATTTCAA TCATCTACGT CCGATGCTCA ACTCAACACT ACCTTCTACG ACAGTACATG CCCTAGCGTC TTTACCATCG TACGGGACAC  CATCGTAAAC GAGCTAAGAT CAGATCCTCG TATCGCTGCA AGCATCCTTC GTCTTCACTT CCATGACTGC TTTGTTAATG GATGCGATGC ATCGATTTTG TTAGACAATA CAACATCCTT  TCGAACAGAG AAAGAGGCAG CTCCAAACGC AAACTCGGCT CGAGGATTTC CAGTGATTGA TAGGATGAAA GCAGCAATTG AGGCAGCATG TCCAAGGACT GTATCATGCG CAGATATGCT  TACCATCGCA GCTCAACAAT CAGTAAATTT GGCAGGAGGT CCTTCGTGGA GGGTTCCTTT AGGGAGAAGA GACAGCTTAC AAGCATTTTT TGATCTCGCT AATGCAAATC TTCCCGCACC  ATTCTTCACG CTTCCACAAC TCAAGGCTAG CTTTAGTAAT GTTGGACTTG ACCGTCCTTC GGATCTTGTT GCACTCTCTG GTGGTCACAC ATTTGGTAAA AACCAATGCC AATTTATTAT  GGATAGGCTA TACAACTTTA GCAACACTGG TTTACCCGAC CCTACTCTCA ATACAACTTA CCTCCAGACA CTTCGTGGAC AATGTCCCCG TAATGGTAAC CAGACGGTCT TGGTCGATTT  CGATTTACGT ACACCGACGG TTTTTGACAA CAAATACTAT GTGAATCTGA AAGAGCTAAA GGGACTTATC CAGACCGATC AAGAATTGTT TTCTAGCCCT AATGCCACTG ACACTGTCCC  ATTGGTGAGA GCATATGCTG ATGGTACTCA AAAGTTCTTT AATGCTTTTG TGGAAGCCAT GAATAGGATG GGAAACATTA CACCTCTCAC TGGAACTCAA GGACAGATAA GACAGAATTG 
TAGGGTGGTC AACTCCAACT CGCTGCTTCA TGATGTGGTT GAAATCGTTG ACTTTGTCAG CTCTATATAA TATAACAGTT GTTGTTTCAA TATATGTGGC 

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