Entry information : CrubPrx106Carubv10007253m.g
Entry ID 15020
Creation 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CrubPrx106Carubv10007253m.g
Name CrubPrx106Carubv10007253m.g
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx027]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella rubella    [TaxId: 81985 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CrubPrx106
start..stop
S start..stop
CagraPrx20 701 0 1..350 1..349
BstrPrx61 665 0 1..350 15..362
AlyPrx40 661 0 3..350 16..362
AhalPrx40 654 0 3..350 16..362
Literature and cross-references CrubPrx106Carubv10007253m.g
Protein sequence: CrubPrx106Carubv10007253m.g
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   350 (326)
PWM (Da):   %s   37440.42 (34633.9)  
PI (pH):   %s   4.31 (4.24) Peptide Signal:   %s   cut: 25 range:25-350
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MKKLLINMFL VLSSVMPLLS FSEANPTNFS ETCEDGSGET GSSFGIGFGL VLDFGLYRNS CPEAESIVYS WVETAVSQDP RMAASLLRLH FHDCFVNGCD ASVLLDDTEG LVGEKTAPPN  LNSLRGFEVI DSIKSDLESV CPETVSCADI LAMAARDSVV VSGGPSWEVE VGRKDSRTAS KQAATTGLPS PNSTVPTLIS NFQKLGLSQT DMVALSGGHT LGKARCTSFT ARLLPLQTGE 
PANHGDNLDF LESLQQLCST VDRSVAITQL DLVTPSTFDN QYYVNLLSGE GLLPSDQALA VQDPGTRAIV ETYAADQSVF FEDFKTAMVK MGGITGGSNS EIRRNCRMIN * 

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Remarks
DNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGAAGC TCTTGATCAA CATGTTCCTT GTGCTTTCCT CTGTTATGCC ACTTCTCTCA TTCTCGGAGG CTAATCCAAC CAACTTCAGC GAGACTTGCG AAGACGGAAG TGGAGAAACC  GGTTCCAGTT TTGGTATAGG GTTTGGTTTG GTTCTTGATT TCGGTTTGTA CCGTAACAGC TGCCCGGAAG CAGAGTCTAT CGTCTACTCG TGGGTCGAAA CAGCCGTCTC ACAGGATCCA  AGAATGGCTG CTTCTCTTCT CCGTCTTCAT TTCCACGACT GTTTTGTCAA TGCAAGTCTC TATCTCATCT TAATTTCTTT TTAATGGTAT TTTACATACC ACTGAACCAG GAAAGTATGA  ATTCTAGTGT GAGTGTGTAT TTTTGACTTA CATCATGCAT TGCAGGGATG TGATGCTTCG GTGTTGTTGG ATGACACGGA AGGGCTAGTT GGTGAAAAAA CCGCGCCTCC TAATCTAAAT  TCTCTCCGAG GATTCGAAGT GATCGATTCG ATAAAGTCTG ATCTTGAATC AGTATGTCCA GAGACCGTCT CATGCGCAGA CATTCTTGCC ATGGCCGCTA GAGATTCAGT TGTTGTGGTA  CATATTTTCA GCCTTACTAA TCAATGAACT CCATTTAAAA CGTTTTTGGT TAATTACTTA TAAATTGGGT TCTTGAAGTC GGGCGGACCA AGCTGGGAGG TGGAAGTAGG AAGAAAAGAT  AGTAGAACAG CGAGCAAACA GGCAGCAACA ACTGGATTGC CCTCACCAAA CTCAACTGTA CCAACTCTCA TCTCTAATTT CCAAAAGCTC GGTCTTTCGC AAACCGACAT GGTTGCTCTT  TCTGGTATAC ATTCTTCTTT TTCTTTATAA CCTAGACTAA CCGTTTTGGA AGAAACACAA GATAATGAAA CTTAACCATG ATGCAAATCA GGTGGACATA CATTGGGAAA GGCACGTTGC  ACTTCCTTTA CAGCTCGATT GCTGCCGCTA CAAACTGGAG AACCGGCTAA CCATGGAGAT AACCTTGACT TCCTCGAGTC ACTACAGCAG CTGTGCTCAA CTGTGGACCG CTCTGTAGCT  ATCACTCAGC TTGACTTGGT GACGCCATCA ACATTTGACA ACCAGTACTA TGTTAACCTC CTCTCAGGGG AGGGATTGCT TCCATCAGAC CAAGCTTTGG CAGTTCAGGA CCCAGGAACG  AGGGCAATTG TTGAAACTTA CGCAGCGGAT CAGTCGGTTT TCTTTGAGGA TTTTAAGACT GCTATGGTAA AAATGGGAGG GATAACTGGT GGTAGTAATA GCGAGATTAG GAGGAATTGT 
AGAATGATTA ACTAA 

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CDS
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGAAGC TCTTGATCAA CATGTTCCTT GTGCTTTCCT CTGTTATGCC ACTTCTCTCA TTCTCGGAGG CTAATCCAAC CAACTTCAGC GAGACTTGCG AAGACGGAAG TGGAGAAACC  GGTTCCAGTT TTGGTATAGG GTTTGGTTTG GTTCTTGATT TCGGTTTGTA CCGTAACAGC TGCCCGGAAG CAGAGTCTAT CGTCTACTCG TGGGTCGAAA CAGCCGTCTC ACAGGATCCA  AGAATGGCTG CTTCTCTTCT CCGTCTTCAT TTCCACGACT GTTTTGTCAA TGGATGTGAT GCTTCGGTGT TGTTGGATGA CACGGAAGGG CTAGTTGGTG AAAAAACCGC GCCTCCTAAT  CTAAATTCTC TCCGAGGATT CGAAGTGATC GATTCGATAA AGTCTGATCT TGAATCAGTA TGTCCAGAGA CCGTCTCATG CGCAGACATT CTTGCCATGG CCGCTAGAGA TTCAGTTGTT  GTGTCGGGCG GACCAAGCTG GGAGGTGGAA GTAGGAAGAA AAGATAGTAG AACAGCGAGC AAACAGGCAG CAACAACTGG ATTGCCCTCA CCAAACTCAA CTGTACCAAC TCTCATCTCT  AATTTCCAAA AGCTCGGTCT TTCGCAAACC GACATGGTTG CTCTTTCTGG TGGACATACA TTGGGAAAGG CACGTTGCAC TTCCTTTACA GCTCGATTGC TGCCGCTACA AACTGGAGAA  CCGGCTAACC ATGGAGATAA CCTTGACTTC CTCGAGTCAC TACAGCAGCT GTGCTCAACT GTGGACCGCT CTGTAGCTAT CACTCAGCTT GACTTGGTGA CGCCATCAAC ATTTGACAAC  CAGTACTATG TTAACCTCCT CTCAGGGGAG GGATTGCTTC CATCAGACCA AGCTTTGGCA GTTCAGGACC CAGGAACGAG GGCAATTGTT GAAACTTACG CAGCGGATCA GTCGGTTTTC 
TTTGAGGATT TTAAGACTGC TATGGTAAAA ATGGGAGGGA TAACTGGTGG TAGTAATAGC GAGATTAGGA GGAATTGTAG AATGATTAAC TAA 

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cDNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGAAGC TCTTGATCAA CATGTTCCTT GTGCTTTCCT CTGTTATGCC ACTTCTCTCA TTCTCGGAGG CTAATCCAAC CAACTTCAGC GAGACTTGCG AAGACGGAAG TGGAGAAACC  GGTTCCAGTT TTGGTATAGG GTTTGGTTTG GTTCTTGATT TCGGTTTGTA CCGTAACAGC TGCCCGGAAG CAGAGTCTAT CGTCTACTCG TGGGTCGAAA CAGCCGTCTC ACAGGATCCA  AGAATGGCTG CTTCTCTTCT CCGTCTTCAT TTCCACGACT GTTTTGTCAA TGGATGTGAT GCTTCGGTGT TGTTGGATGA CACGGAAGGG CTAGTTGGTG AAAAAACCGC GCCTCCTAAT  CTAAATTCTC TCCGAGGATT CGAAGTGATC GATTCGATAA AGTCTGATCT TGAATCAGTA TGTCCAGAGA CCGTCTCATG CGCAGACATT CTTGCCATGG CCGCTAGAGA TTCAGTTGTT  GTGTCGGGCG GACCAAGCTG GGAGGTGGAA GTAGGAAGAA AAGATAGTAG AACAGCGAGC AAACAGGCAG CAACAACTGG ATTGCCCTCA CCAAACTCAA CTGTACCAAC TCTCATCTCT  AATTTCCAAA AGCTCGGTCT TTCGCAAACC GACATGGTTG CTCTTTCTGG TGGACATACA TTGGGAAAGG CACGTTGCAC TTCCTTTACA GCTCGATTGC TGCCGCTACA AACTGGAGAA  CCGGCTAACC ATGGAGATAA CCTTGACTTC CTCGAGTCAC TACAGCAGCT GTGCTCAACT GTGGACCGCT CTGTAGCTAT CACTCAGCTT GACTTGGTGA CGCCATCAAC ATTTGACAAC  CAGTACTATG TTAACCTCCT CTCAGGGGAG GGATTGCTTC CATCAGACCA AGCTTTGGCA GTTCAGGACC CAGGAACGAG GGCAATTGTT GAAACTTACG CAGCGGATCA GTCGGTTTTC 
TTTGAGGATT TTAAGACTGC TATGGTAAAA ATGGGAGGGA TAACTGGTGG TAGTAATAGC GAGATTAGGA GGAATTGTAG AATGATTAAC TAA 

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