Entry information : CrubPrx107Carubv10017534m.g
Entry ID 15021
Creation 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CrubPrx107Carubv10017534m.g
Name CrubPrx107Carubv10017534m.g
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx035]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella rubella    [TaxId: 81985 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CrubPrx107
start..stop
S start..stop
AlyPrx33 681 0 8..353 4..349
AhalPrx39 674 0 12..353 14..355
AtPrx33 667 0 12..353 13..354
BrPrx34-1Ab_other 652 0 7..353 3..349
Literature and cross-references CrubPrx107Carubv10017534m.g
Protein sequence: CrubPrx107Carubv10017534m.g
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   353 (323)
PWM (Da):   %s   38842.68 (35477.0)  
PI (pH):   %s   8.14 (7.99) Peptide Signal:   %s   cut: 31 range:31-353
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MKFFSSSSST TWTILVTLGC LMLRASLSDA QLTPTFYDTS CPSVTRIVRD TIVNELRSDP RIAGSILRLH FHDCFVNGCD ASILLDNTTA FQTEKDALGN ANSARGFPVI DRMKAAIERA  CPRTVSCADM LTIAAQQSVT LAGGPSWRVP LGRRDSLQAF LQLANANLPA PFFTLPQLKA NFKNVGLDRP SDLVALSGGH TFGKNQCRFI MDRLYNFSAT GLPDPTLNTT YLQTLRGQCP 
RNGNQSVLVD FDLRTPLVFD NKYYVNLKEQ KGLLQSDQEL FSSPNATDTI PLVRSFADGT QKFFDAFVVA MNRMGNITPL TGTQGQIRLN CRVVNSNSLL HDVVEIVDFV SSM* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATAACACCTC TTCATCTTAT ATATCGTTGA AAAAAAAAAA AATGAGAGCC TTCTTTTGTG TTCGCAAGAA GAGCCTTTAA TTGAGAAAGG AAAAAAGAGA AGCCTCCAGG TCTGACCCAT  TTTTTACCTA TAAAAGGATT GTTAAGAGTT CAAGACCTTA CTCATCTTCT CCCCAACCAT ATAGTTTTAT ATTTCTTTCT AAAAACAACA ATGAAGTTCT TCTCTTCATC ATCTTCTACT  ACTTGGACAA TCTTAGTCAC ATTGGGATGC CTTATGCTTC GTGCGTCTTT GTCTGATGCT CAACTTACTC CTACCTTTTA CGACACGTCA TGTCCTAGCG TTACCAGGAT CGTAAGAGAT  ACCATTGTCA ACGAGCTAAG ATCGGACCCT CGTATCGCCG GGAGCATCCT TCGTCTTCAC TTCCACGACT GCTTTGTTAA CGTAAGATTT CACTTTTCAT ATATTTGTAG TGTTTTCACT  TGACATACTC TGTTTCTCAT GCTCTGTCTT TTTGGCCTAC ACTTCATACA TATATTTTCT GTTGTAATTT TTTCATTTGT TGATCAATAA ATATATTTTC GGTTTTTTGT TAGGAATCAA  TAAATTTAAA TTTATTAACA AATTTTTATA ACAAATTAAT ACTCTTATTT TCTTTAAATT TAATCTCACT ATAGGTTGCA TTGCTTTTAT GTTTAGGAAT TTCTATATTT TCAACGTAAA  TTTATTTAAG TCTCTGTATA TATCACTAAT TACTTGTTTC AGAGGAACAA ATGGTAGTAG TGGATTAAAA GAAGTTCAAT GTTAAAAATT GTTACCTTTG GTAAAGATTT TGTAACTGTG  GATGTTATAC ATTGACTAAT AATTTCTTTT TATTTGGGCA AAAGACTAAT AATTTCTTAA ATAACGTTTT GGACTTTTAA AAGGGTTGTG ATGCATCGAT CTTGTTGGAC AACACAACAG  CATTCCAAAC AGAGAAAGAT GCGCTTGGAA ACGCAAATTC GGCTAGGGGT TTCCCCGTGA TTGATAGAAT GAAAGCCGCA ATAGAGAGGG CTTGCCCGAG AACCGTTTCA TGCGCAGACA  TGCTCACCAT TGCAGCTCAA CAATCTGTCA CTTTGGTACA TATGCTTCAC TTATCATCCT TTTATTCATT ACTGTCTACA ATAATGATCT GTTTATAATC ATGATACTAT TTATGCCCGA  CAACGTACCC GAGTTAAAAA ATTTAAAAAC TTTTGTTGTT GTTTGAGAAG GTCGCACTCA ATATTTACTA TCAACCTTTC AACCATATGA CCAAGAATTC AAATTTATTA GGTTTGCTAT  TATTGAAACC AACCGTAAAT AAATTTTTAT AGGTTTACTA TTATTGAAAA ATAATATCAT TGGTAAAAAT ACGTTTCAAG TTAACCAAAA AGATTTTTTT TTTTTTCAAG AAAATATTGG  AAACTAAAAA GAAAACAAAA ATCCTTCGTT TGATTATTTC ATCTATGAAT ATAATTATAT AAAATGATTT TCTAATTACG AATTGAAATT TCTGAATGAT ATTATAATAG GCAGGAGGTC  CTTCTTGGAG AGTTCCATTG GGGAGAAGAG ACAGCTTACA AGCATTTTTG CAACTCGCTA ATGCAAATCT TCCAGCTCCA TTCTTCACAC TTCCACAACT TAAGGCCAAC TTTAAAAATG  TTGGCCTCGA TCGTCCTTCT GATCTTGTTG CTCTCTCCGG TAATAAACAA CACAAAAACT AAACACCATT CGACATACAT TAGTTGTAAT AAACGAGTTA AATGTTGATC TAACTATGAT  CTTTCTTTTT GTCAGGGGGT CATACATTTG GTAAAAATCA ATGTCGATTT ATTATGGACA GATTATACAA CTTCAGCGCG ACCGGGTTAC CTGACCCTAC CCTTAACACT ACTTACCTAC  AAACTCTTCG TGGACAATGT CCGCGTAATG GCAATCAAAG CGTCTTGGTG GATTTCGATC TGCGTACGCC TTTGGTTTTC GACAACAAAT ACTACGTGAA TCTGAAAGAG CAAAAAGGGC  TTCTCCAGAG TGACCAAGAG TTGTTCTCTA GCCCCAATGC CACAGACACA ATCCCCTTGG TGAGATCTTT TGCTGATGGA ACACAAAAGT TCTTTGATGC GTTCGTGGTG GCAATGAACA  GGATGGGAAA CATTACACCT CTTACTGGAA CTCAAGGACA AATCAGGTTG AATTGTAGGG TGGTTAACTC CAACTCTCTA CTCCATGATG TGGTGGAGAT CGTTGACTTT GTTAGCTCTA  TGTGAGAATA GTTGACTCCA TATCTGGCTA CCAGACTATG TTAAGATTAA TAAGCGCTCT CAAGTTGTTA CTTGAGCAGG AGAAGATCTT TATCGGTATG TAAAGTATCT ACGTAATTCT  GTCTTTTTAT TCCTAATGTT TGATATTGGC CTTTGAAAAT GTTACGTGAA TCGTTCTATA AGTTTTTTAT AGTTTTGAAC TCGTTTCTAT ACTAATAAAG ATGACATAAT AAAGATATAT 
ATGTTAGTTG AGAATTTTTT TTTACATTTT CTAGATTTTC CTTGTGAACT CCTAGTGAT 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGTTCT TCTCTTCATC ATCTTCTACT ACTTGGACAA TCTTAGTCAC ATTGGGATGC CTTATGCTTC GTGCGTCTTT GTCTGATGCT CAACTTACTC CTACCTTTTA CGACACGTCA  TGTCCTAGCG TTACCAGGAT CGTAAGAGAT ACCATTGTCA ACGAGCTAAG ATCGGACCCT CGTATCGCCG GGAGCATCCT TCGTCTTCAC TTCCACGACT GCTTTGTTAA CGGTTGTGAT  GCATCGATCT TGTTGGACAA CACAACAGCA TTCCAAACAG AGAAAGATGC GCTTGGAAAC GCAAATTCGG CTAGGGGTTT CCCCGTGATT GATAGAATGA AAGCCGCAAT AGAGAGGGCT  TGCCCGAGAA CCGTTTCATG CGCAGACATG CTCACCATTG CAGCTCAACA ATCTGTCACT TTGGCAGGAG GTCCTTCTTG GAGAGTTCCA TTGGGGAGAA GAGACAGCTT ACAAGCATTT  TTGCAACTCG CTAATGCAAA TCTTCCAGCT CCATTCTTCA CACTTCCACA ACTTAAGGCC AACTTTAAAA ATGTTGGCCT CGATCGTCCT TCTGATCTTG TTGCTCTCTC CGGGGGTCAT  ACATTTGGTA AAAATCAATG TCGATTTATT ATGGACAGAT TATACAACTT CAGCGCGACC GGGTTACCTG ACCCTACCCT TAACACTACT TACCTACAAA CTCTTCGTGG ACAATGTCCG  CGTAATGGCA ATCAAAGCGT CTTGGTGGAT TTCGATCTGC GTACGCCTTT GGTTTTCGAC AACAAATACT ACGTGAATCT GAAAGAGCAA AAAGGGCTTC TCCAGAGTGA CCAAGAGTTG  TTCTCTAGCC CCAATGCCAC AGACACAATC CCCTTGGTGA GATCTTTTGC TGATGGAACA CAAAAGTTCT TTGATGCGTT CGTGGTGGCA ATGAACAGGA TGGGAAACAT TACACCTCTT 
ACTGGAACTC AAGGACAAAT CAGGTTGAAT TGTAGGGTGG TTAACTCCAA CTCTCTACTC CATGATGTGG TGGAGATCGT TGACTTTGTT AGCTCTATGT GA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATAACACCTC TTCATCTTAT ATATCGTTGA AAAAAAAAAA AATGAGAGCC TTCTTTTGTG TTCGCAAGAA GAGCCTTTAA TTGAGAAAGG AAAAAAGAGA AGCCTCCAGG TCTGACCCAT  TTTTTACCTA TAAAAGGATT GTTAAGAGTT CAAGACCTTA CTCATCTTCT CCCCAACCAT ATAGTTTTAT ATTTCTTTCT AAAAACAACA ATGAAGTTCT TCTCTTCATC ATCTTCTACT  ACTTGGACAA TCTTAGTCAC ATTGGGATGC CTTATGCTTC GTGCGTCTTT GTCTGATGCT CAACTTACTC CTACCTTTTA CGACACGTCA TGTCCTAGCG TTACCAGGAT CGTAAGAGAT  ACCATTGTCA ACGAGCTAAG ATCGGACCCT CGTATCGCCG GGAGCATCCT TCGTCTTCAC TTCCACGACT GCTTTGTTAA CGGTTGTGAT GCATCGATCT TGTTGGACAA CACAACAGCA  TTCCAAACAG AGAAAGATGC GCTTGGAAAC GCAAATTCGG CTAGGGGTTT CCCCGTGATT GATAGAATGA AAGCCGCAAT AGAGAGGGCT TGCCCGAGAA CCGTTTCATG CGCAGACATG  CTCACCATTG CAGCTCAACA ATCTGTCACT TTGGCAGGAG GTCCTTCTTG GAGAGTTCCA TTGGGGAGAA GAGACAGCTT ACAAGCATTT TTGCAACTCG CTAATGCAAA TCTTCCAGCT  CCATTCTTCA CACTTCCACA ACTTAAGGCC AACTTTAAAA ATGTTGGCCT CGATCGTCCT TCTGATCTTG TTGCTCTCTC CGGGGGTCAT ACATTTGGTA AAAATCAATG TCGATTTATT  ATGGACAGAT TATACAACTT CAGCGCGACC GGGTTACCTG ACCCTACCCT TAACACTACT TACCTACAAA CTCTTCGTGG ACAATGTCCG CGTAATGGCA ATCAAAGCGT CTTGGTGGAT  TTCGATCTGC GTACGCCTTT GGTTTTCGAC AACAAATACT ACGTGAATCT GAAAGAGCAA AAAGGGCTTC TCCAGAGTGA CCAAGAGTTG TTCTCTAGCC CCAATGCCAC AGACACAATC  CCCTTGGTGA GATCTTTTGC TGATGGAACA CAAAAGTTCT TTGATGCGTT CGTGGTGGCA ATGAACAGGA TGGGAAACAT TACACCTCTT ACTGGAACTC AAGGACAAAT CAGGTTGAAT  TGTAGGGTGG TTAACTCCAA CTCTCTACTC CATGATGTGG TGGAGATCGT TGACTTTGTT AGCTCTATGT GAGAATAGTT GACTCCATAT CTGGCTACCA GACTATGTTA AGATTAATAA  GCGCTCTCAA GTTGTTACTT GAGCAGGAGA AGATCTTTAT CGGTATGTAA AGTATCTACG TAATTCTGTC TTTTTATTCC TAATGTTTGA TATTGGCCTT TGAAAATGTT ACGTGAATCG  TTCTATAAGT TTTTTATAGT TTTGAACTCG TTTCTATACT AATAAAGATG ACATAATAAA GATATATATG TTAGTTGAGA ATTTTTTTTT ACATTTTCTA GATTTTCCTT GTGAACTCCT 
AGTGAT 

Retrieve as FASTA