Entry information : CrubPrx110Carubv10023605m.g
Entry ID 15024
Creation 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CrubPrx110Carubv10023605m.g
Name CrubPrx110Carubv10023605m.g
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx005]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella rubella    [TaxId: 81985 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CrubPrx110
start..stop
S start..stop
CagraPrx44 675 0 1..330 1..330
AtPrx25 653 0 1..330 14..341
BstrPrx81 648 0 1..330 1..326
AlyPrx25 635 0 1..330 1..326
Literature and cross-references CrubPrx110Carubv10023605m.g
Protein sequence: CrubPrx110Carubv10023605m.g
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   330 (307)
PWM (Da):   %s   36148.45 (33463.0) Transmb domain:   %s   i5-22o
PI (pH):   %s   7.93 (7.72) Peptide Signal:   %s   cut: 24 range:24-330
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGVYLGKYCY VMIILVLVML VLGKEVRSQL LKNGYYSTSC PKAESIVRST VQSHFDSDPT ISPGLLRLHF HDCFVQGCDG SVLIKGKSAE QAALANLGLR GMEVIDDAKS RLESVCPGVV  SCADILALAA RDSVDLSDGP SWRVPTGRKD GRISLATEAS NLPSPFDSVA VQKQKFQDKG LDTHDLVTLL GAHTIGQTDC LFFRYRLYNF TVTGNSDPTI SPSFLTQLKT LCPPNGDGSK 
RVALDIGSPS KFDESFYKNL RDGNAILESD QRLWSDAETN ALVKKYASRL RGLLGFRFDY EFGKAMIKMS SIDVKTDVDG EVRKVCSKVN * 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GAAAAAAAAA AGAGTAAGTA AGAAAAATGG GAGTGTACTT AGGCAAGTAT TGTTATGTAA TGATAATACT AGTATTAGTC ATGTTGGTGT TGGGAAAAGA AGTTAGAAGC CAATTGTTAA  AAAATGGTTA TTATTCAACT TCATGTCCAA AAGCTGAGTC GATAGTAAGA TCCACTGTTC AATCTCATTT TGATTCTGAT CCCACAATTT CTCCTGGCTT GCTTAGGCTT CATTTCCATG  ACTGTTTTGT TCAGGTTTCA GTTCTTTTTC CTTTCTTTTT TAATCTTGAT CACCTCCTTG ATTGTTTCAA TTATATATAT GCAAGTTAAT TGATTGTTGA ATTTTTAACA TATATATGAC  ATATTATTAG GGTTGTGATG GGTCGGTTTT AATCAAAGGG AAATCTGCGG AGCAAGCTGC TCTAGCGAAC CTCGGTCTAA GAGGGATGGA AGTGATCGAT GATGCAAAAT CCAGGCTCGA  GTCCGTGTGT CCAGGAGTTG TGTCATGCGC AGACATACTT GCACTTGCAG CTCGTGACTC TGTTGACTTG GTACGCAAGT TTACTAACCT TTGGTAGTTT TTCCAATTAC TATATATCAC  CTGAGTATGT CGTATATGTA TGTGAAACAA GAGTGATGGG CCAAGCTGGC GAGTACCAAC GGGGCGTAAG GACGGGAGAA TCTCGTTGGC GACGGAAGCA TCGAATCTAC CTTCTCCATT  CGACTCTGTT GCTGTTCAAA AGCAAAAGTT TCAAGATAAA GGATTGGATA CTCATGATCT CGTTACTCTA CTCGGTATAT TTATCAATCT ATATTTTTCT TTTTATAAAA TGAAAACTTT  AAAATCATTA TTTTTATATT TCTTGTTAAG TTTCTTTATT TAATTTTTTT TTTCATATTT AAACTCTATA CATACGTTCA GAAGAAACAT AAGTAGAGTT CCTTCAAAAA TTTGAAGGTC  AGGTATGTCT GCACTAGACA TCACATGCCA ACACGAAAAA AAGTTAAATC GTGCAAGTGA CTAAAATTAA AGTTGGATTG AACCATATAT GTTTCATTTT ATTGATACTC TTTTGAAAAC  TTGAGCAAAA GCTATTTACG AAAGGTTGTA GTTTATTGAT TGTTGGTGCA AGGAAAGATC GATCAAAATG GAAACAACAG CTTTGCCATC GTCTTACTTT TTTTTTTTTT TTTTGTCATC  TCGTCTTACT GAATATAGAT TAAGAAAACT ACTAAACTGG TAGATTGGTC GTGTATATTA TCTTAAGTAG GCTTATAAGC TTTTGTTCAA TAATAATTTG AAGTTAGAGA AAAATGATGG  TAAGAATAAT TAAGTTTGAA AAAGTTAACA CGTCGATACA AATTACAAAA CTTTTACTGT CAACTAATTT TTTCGAAAAG AATAAATTTA TACGTATATT TGTTATAACC TCATATTTTG  TTATAAAACT GAAGTTTACA AAGATTTGAG ACATCCTTTT TCTATTATTT ATTTTTTGGA AAAGAGAACA TTTGAGAATT ACTTGATATT AGGCCATCTT AAGTTCTTAA AGAGTAGTTA  ACTAAACGTA GTTGCATGTC TATATTGATT ACTGAACATG CCATGATTTG TTTCTCTGAT CCATTATATT TACATTTTCC CCTCCAATTG TAGTTAGTAT CACTATAAAA ATGTCTAAAA  TTGAATGAGA ACAGGTGCAC ATACAATAGG ACAAACGGAC TGTCTCTTCT TCCGTTACCG TCTATACAAC TTTACGGTGA CCGGAAACTC CGACCCAACC ATAAGCCCAT CGTTTCTCAC  ACAGCTCAAG ACTCTTTGTC CTCCCAATGG AGACGGTTCT AAACGTGTTG CTCTTGACAT CGGCAGTCCC TCGAAATTCG ATGAAAGTTT CTACAAGAAC TTACGCGACG GCAACGCTAT  TCTAGAGTCG GACCAACGGC TTTGGTCCGA TGCCGAGACG AATGCCTTGG TAAAAAAGTA TGCGAGTCGT CTTAGAGGTT TGTTAGGGTT TAGGTTTGAT TATGAGTTTG GTAAAGCTAT  GATTAAGATG AGTTCCATTG ATGTAAAGAC AGACGTTGAT GGTGAGGTTA GGAAAGTTTG TTCCAAGGTG AACTAGTAGG TTCAATGAAA ACTTAGTAAA ATGAATAAAG ACACTCTATG 
TTTCAGAATT CAGAGTTTAT ATTATTGAAT ATTCC 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGAGTGT ACTTAGGCAA GTATTGTTAT GTAATGATAA TACTAGTATT AGTCATGTTG GTGTTGGGAA AAGAAGTTAG AAGCCAATTG TTAAAAAATG GTTATTATTC AACTTCATGT  CCAAAAGCTG AGTCGATAGT AAGATCCACT GTTCAATCTC ATTTTGATTC TGATCCCACA ATTTCTCCTG GCTTGCTTAG GCTTCATTTC CATGACTGTT TTGTTCAGGG TTGTGATGGG  TCGGTTTTAA TCAAAGGGAA ATCTGCGGAG CAAGCTGCTC TAGCGAACCT CGGTCTAAGA GGGATGGAAG TGATCGATGA TGCAAAATCC AGGCTCGAGT CCGTGTGTCC AGGAGTTGTG  TCATGCGCAG ACATACTTGC ACTTGCAGCT CGTGACTCTG TTGACTTGAG TGATGGGCCA AGCTGGCGAG TACCAACGGG GCGTAAGGAC GGGAGAATCT CGTTGGCGAC GGAAGCATCG  AATCTACCTT CTCCATTCGA CTCTGTTGCT GTTCAAAAGC AAAAGTTTCA AGATAAAGGA TTGGATACTC ATGATCTCGT TACTCTACTC GGTGCACATA CAATAGGACA AACGGACTGT  CTCTTCTTCC GTTACCGTCT ATACAACTTT ACGGTGACCG GAAACTCCGA CCCAACCATA AGCCCATCGT TTCTCACACA GCTCAAGACT CTTTGTCCTC CCAATGGAGA CGGTTCTAAA  CGTGTTGCTC TTGACATCGG CAGTCCCTCG AAATTCGATG AAAGTTTCTA CAAGAACTTA CGCGACGGCA ACGCTATTCT AGAGTCGGAC CAACGGCTTT GGTCCGATGC CGAGACGAAT  GCCTTGGTAA AAAAGTATGC GAGTCGTCTT AGAGGTTTGT TAGGGTTTAG GTTTGATTAT GAGTTTGGTA AAGCTATGAT TAAGATGAGT TCCATTGATG TAAAGACAGA CGTTGATGGT 
GAGGTTAGGA AAGTTTGTTC CAAGGTGAAC TAG 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GAAAAAAAAA AGAGTAAGTA AGAAAAATGG GAGTGTACTT AGGCAAGTAT TGTTATGTAA TGATAATACT AGTATTAGTC ATGTTGGTGT TGGGAAAAGA AGTTAGAAGC CAATTGTTAA  AAAATGGTTA TTATTCAACT TCATGTCCAA AAGCTGAGTC GATAGTAAGA TCCACTGTTC AATCTCATTT TGATTCTGAT CCCACAATTT CTCCTGGCTT GCTTAGGCTT CATTTCCATG  ACTGTTTTGT TCAGGGTTGT GATGGGTCGG TTTTAATCAA AGGGAAATCT GCGGAGCAAG CTGCTCTAGC GAACCTCGGT CTAAGAGGGA TGGAAGTGAT CGATGATGCA AAATCCAGGC  TCGAGTCCGT GTGTCCAGGA GTTGTGTCAT GCGCAGACAT ACTTGCACTT GCAGCTCGTG ACTCTGTTGA CTTGAGTGAT GGGCCAAGCT GGCGAGTACC AACGGGGCGT AAGGACGGGA  GAATCTCGTT GGCGACGGAA GCATCGAATC TACCTTCTCC ATTCGACTCT GTTGCTGTTC AAAAGCAAAA GTTTCAAGAT AAAGGATTGG ATACTCATGA TCTCGTTACT CTACTCGGTG  CACATACAAT AGGACAAACG GACTGTCTCT TCTTCCGTTA CCGTCTATAC AACTTTACGG TGACCGGAAA CTCCGACCCA ACCATAAGCC CATCGTTTCT CACACAGCTC AAGACTCTTT  GTCCTCCCAA TGGAGACGGT TCTAAACGTG TTGCTCTTGA CATCGGCAGT CCCTCGAAAT TCGATGAAAG TTTCTACAAG AACTTACGCG ACGGCAACGC TATTCTAGAG TCGGACCAAC  GGCTTTGGTC CGATGCCGAG ACGAATGCCT TGGTAAAAAA GTATGCGAGT CGTCTTAGAG GTTTGTTAGG GTTTAGGTTT GATTATGAGT TTGGTAAAGC TATGATTAAG ATGAGTTCCA  TTGATGTAAA GACAGACGTT GATGGTGAGG TTAGGAAAGT TTGTTCCAAG GTGAACTAGT AGGTTCAATG AAAACTTAGT AAAATGAATA AAGACACTCT ATGTTTCAGA ATTCAGAGTT 
TATATTATTG AATATTCC 

Retrieve as FASTA