Entry information : CrubAPx03-1 (Carubv10005417m.g)
Entry ID 15025
Creation 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CrubAPx03-1 (Carubv10005417m.g)
Name (synonym) CrubAPx03-1 (Carubv10005417m.g)
Class Ascorbate peroxidase     [Orthogroup: APx003]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella rubella    [TaxId: 81985 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CrubAPx03-1
start..stop
S start..stop
CagraAPx03-1 589 0 1..287 1..287
BstrAPx03 564 0 1..287 1..287
BnAPx03-1Aa_other 543 0 1..287 1..287
AtAPx03 533 0 1..287 1..287
Literature and cross-references CrubAPx03-1 (Carubv10005417m.g)
Protein sequence: CrubAPx03-1 (Carubv10005417m.g)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   287
PWM (Da):   %s   31639.17 Transmb domain:   %s   o258-280i
PI (pH):   %s   6.64
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MATPIVDAEY LKEITKARRD LRSLISNKNC APIMLRLAWH DAGTYDAQSK TGGPNGSIRN EEEYTHGANS GLKIALDLCE GVKAKHPKIT YADLFQLAGV VAVEVTGGPD ISFVPGRKDS  KVSTREGRLP DAKQGFQHLR DVFYRMGLSD KDIVALSGAH TLGRAHPERS GFDGPWTEEP LKFDNSYFVE LLKGESEGLL KLPTDKTLLE DPEFRRYVEL YAKDEDAFFR DYAESHKKLS 
ELGFSPSSSA GKAVADSTVL AQSAFGVAVA AAVVAFSYFY EIRKRMK* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TGTGGCTGAG GGAAACAGCA GATAACTGAC ACCGCCCATT CAAATCCCGT TTCTCATTGG GTGGTTTATC TCTTCGGCCC AAACTTCAGT GTAACCAAAA AAGAAAGAAA AAAATCTTCA  CATCACACAC CTTGACCATA TTCTTCTTCA TCGCTCTCTC ACCAATCCCA GACGAGTAGG AGCTATGGCG ACGCCGATTG TTGACGCGGA GTACTTGAAA GAGATCACCA AGGCTCGCCG  TGACCTCCGC TCTCTCATCT CGAACAAGAA CTGCGCTCCG ATCATGCTCC GATTGGCGTA AGTTTCGATT TCTTTGGTTT TTCTTCGATT CGGTTATGTT GACTGCTCCA TATTTCGTTT  TCTGCTCCTG TGAAAATCGT TGGATTGATA GTTTGGGTGT AGAAATCGCT CGATATTGTT CAGTTTTTAA TTTGTGAAAT GTTGTCTCAT ATGGTTTTTG TGAAGATGGC ACGATGCTGG  AACCTATGAT GCTCAATCGA AGACCGGTGG ACCTAATGGT TCTATCAGGA ACGAAGAGGA GTACACTCAT GGTGCCAACA GTGGTTTGAA GATCGCTCTC GATCTCTGTG GTAGGATTTT  CATTTAGTTA TTGTAGATTC GTTTGCTGGA TAGTTTCTCT TTTTGTTGGT GACGAGATTA CTATTTGCGC ATAATCCGTG GGTTATTCTT GAAATTTGGA TAGCCAATAC TGTTCGAAAT  GATTCCATTC TGTTTTTTTT GGAATGGACT TTGAATTGTT TAGTTTTGAA ATCCTATCTT TTATGTTTCA GAGGGCGTGA AAGCTAAGCA TCCCAAAATC ACATATGCAG ACCTATTTCA  GGTGATTATG AGATTTTTCT TAGAAGTATT ATGATTACAG TGAAGTTCTA ACAATTTGAT GACTGATATA TATCCATAAC TGATGCAATT TTATTAGTTT TGCTACCATA GAGTTAGTAT  AGCGCATCAG ATTTGAGCCT TGTTGTTTTC TGTGCTCCTT TGTCAACAGT CTATAGAAAC TAGTACCCCA CGTGTCTCAT AGACCCATCC CATGTTTGGT AGACTTAGAT GAGTTGTGTA  ATTATTGTCG CAGGATAGTG AAAGTGTGCA ACAATGAAAT AAGAATTTTC TTTTTCTACG AACTGTTGCA GATTATGTTT TGATATGTTG ACTATATCAA TTCGTTCCAA GAAAGACAGA  TTGACTATGT TATTCAAGTA GAAACTAGAT TCTAGTAAAA TGTACTCTAC TCTCAAGGAG ATTGTCACAA AACCTCAAGC TATTTCCACG CTAGAGGATT TGTTTCATAA TTGACCAGAA  TAAATCTGCC TATGTTGTCC TTCCGGTAAA TCTTGTCATT TAATTCCTGA ATTAGTCATG ACCAGGAAGG TTTGTTAAAC TCATTTAATA GTTTTGTTAT ATTGACATAC TGTTCACCCA  TCTGTGATTC TGTGTTATTG ACTTAAGGAC TTGGACTGAG TAGTATTCAA AAGTCCATCG CTTGCACCTA TTTTACATTG TGCATTACTG TTTGTATTGT TGTTTGTCCA GCTTTGTTGG  TCAATAATGT GGAGGCTTTA TATATGAATG CCCAGCAGAA GTTTCCAATT GGAGCAATAG TTTAATAGCA ATCAAAAATT TGAATCTGAA TAATTTATCT CATTCTCGTG TTTCAGCTTG  CTGGTGTGGT AGCAGTGGAG GTTACTGGTG GACCTGACAT CAGCTTCGTT CCTGGGAGAA AAGTATAGTT TCTCATTCTT CTAGACATTA CAACAGTTGG CCGGTTTTAG CGCTGAAGAA  AATAACCATA AATACTGTAT GTTTCTTTTT GATAGGATTC AAAGGTCTCC ACCAGGGAAG GAAGACTTCC TGATGCCAAA CAAGGTACAA TAATACTTCT ATCGTTTATA GTATACTTTG  CTTTTCTCTA TTGAAATTCT TTTCATGGAA CTGGAAGATC TTTTCTATGA ATTTACCTTG TTTATTTGAT TGTAGGTTTT CAACATCTAA GAGATGTATT CTACCGCATG GGACTATCTG  ATAAGGATAT TGTGGCACTC TCAGGTGCTC ATACTCTGGT AAATTCATTG GCCACTTACT TAATTCCCGC TGTTTTTTTC TTTTGGGACA AATAAAAGGT ATTTGTGCTG ATGATCACTT  TTTGGTGTTT AGGGAAGGGC TCATCCAGAG AGGTCAGGCT TCGATGGGCC ATGGACTGAA GAGCCTCTGA AGTTTGATAA CTCCTACTTC GTGTAATTTT TATTTCCTTA TCCTCATAGA  TTCTTTGTCT TTTTGAAATT TTTCTTCCAA GAAGAACAAG CAGCAAACAG CTACTTTACT ACAGGATCTG TTTAATCCAC GAACTAATTA CTGTGTTGGT ACCAGGGAAC TGCTGAAAGG  AGAATCAGAG GGCTTGTTGA AACTCCCAAC TGACAAGACT TTATTGGAAG ACCCGGAATT CCGTCGTTAT GTTGAGCTCT ATGCAAAGGT AAATTCGAGT ATTGAGCAGC TGCTTGCATG  TATATATCTC ATTTGCCCTG TTTTTGTGCT GTTAGATGTT ATTTTGACAA GTTGTACCGG TGTTAACAGG ATGAAGATGC GTTCTTCAGA GACTACGCTG AATCTCACAA GAAACTCTCT  GAGCTTGGTT TCAGCCCGAG CTCCTCAGCA GGGAAGGCGG TTGCAGACAG CACAGTTCTC GCACAGAGCG CGTTCGGGGT TGCGGTTGCT GCTGCGGTTG TGGCGTTTAG TTACTTTTAC  GAGATTAGGA AGAGGATGAA ATAAATGGGA GTACAAGGAA AACTATTCAG ATAAAACCCT ATTTTACTGC CACAATATGC TAAACTCTTT TAATCCACCA CGATCATACT GTTTTGTTAG  TAAAAAGTCA AAAAGTCAAA AAAATAATAT TTTGGGGTAA ATTTCATGGT TGGTTGGTTG CGTAACCGTT CATAACAAGG ATTGGTTACT ACCATTAAAT GATTGAGTAT TGCTTACAAG 
ATTTGTG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGACGC CGATTGTTGA CGCGGAGTAC TTGAAAGAGA TCACCAAGGC TCGCCGTGAC CTCCGCTCTC TCATCTCGAA CAAGAACTGC GCTCCGATCA TGCTCCGATT GGCATGGCAC  GATGCTGGAA CCTATGATGC TCAATCGAAG ACCGGTGGAC CTAATGGTTC TATCAGGAAC GAAGAGGAGT ACACTCATGG TGCCAACAGT GGTTTGAAGA TCGCTCTCGA TCTCTGTGAG  GGCGTGAAAG CTAAGCATCC CAAAATCACA TATGCAGACC TATTTCAGCT TGCTGGTGTG GTAGCAGTGG AGGTTACTGG TGGACCTGAC ATCAGCTTCG TTCCTGGGAG AAAAGATTCA  AAGGTCTCCA CCAGGGAAGG AAGACTTCCT GATGCCAAAC AAGGTTTTCA ACATCTAAGA GATGTATTCT ACCGCATGGG ACTATCTGAT AAGGATATTG TGGCACTCTC AGGTGCTCAT  ACTCTGGGAA GGGCTCATCC AGAGAGGTCA GGCTTCGATG GGCCATGGAC TGAAGAGCCT CTGAAGTTTG ATAACTCCTA CTTCGTGGAA CTGCTGAAAG GAGAATCAGA GGGCTTGTTG  AAACTCCCAA CTGACAAGAC TTTATTGGAA GACCCGGAAT TCCGTCGTTA TGTTGAGCTC TATGCAAAGG ATGAAGATGC GTTCTTCAGA GACTACGCTG AATCTCACAA GAAACTCTCT  GAGCTTGGTT TCAGCCCGAG CTCCTCAGCA GGGAAGGCGG TTGCAGACAG CACAGTTCTC GCACAGAGCG CGTTCGGGGT TGCGGTTGCT GCTGCGGTTG TGGCGTTTAG TTACTTTTAC 
GAGATTAGGA AGAGGATGAA ATAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TGTGGCTGAG GGAAACAGCA GATAACTGAC ACCGCCCATT CAAATCCCGT TTCTCATTGG GTGGTTTATC TCTTCGGCCC AAACTTCAGT GTAACCAAAA AAGAAAGAAA AAAATCTTCA  CATCACACAC CTTGACCATA TTCTTCTTCA TCGCTCTCTC ACCAATCCCA GACGAGTAGG AGCTATGGCG ACGCCGATTG TTGACGCGGA GTACTTGAAA GAGATCACCA AGGCTCGCCG  TGACCTCCGC TCTCTCATCT CGAACAAGAA CTGCGCTCCG ATCATGCTCC GATTGGCATG GCACGATGCT GGAACCTATG ATGCTCAATC GAAGACCGGT GGACCTAATG GTTCTATCAG  GAACGAAGAG GAGTACACTC ATGGTGCCAA CAGTGGTTTG AAGATCGCTC TCGATCTCTG TGAGGGCGTG AAAGCTAAGC ATCCCAAAAT CACATATGCA GACCTATTTC AGCTTGCTGG  TGTGGTAGCA GTGGAGGTTA CTGGTGGACC TGACATCAGC TTCGTTCCTG GGAGAAAAGA TTCAAAGGTC TCCACCAGGG AAGGAAGACT TCCTGATGCC AAACAAGGTT TTCAACATCT  AAGAGATGTA TTCTACCGCA TGGGACTATC TGATAAGGAT ATTGTGGCAC TCTCAGGTGC TCATACTCTG GGAAGGGCTC ATCCAGAGAG GTCAGGCTTC GATGGGCCAT GGACTGAAGA  GCCTCTGAAG TTTGATAACT CCTACTTCGT GGAACTGCTG AAAGGAGAAT CAGAGGGCTT GTTGAAACTC CCAACTGACA AGACTTTATT GGAAGACCCG GAATTCCGTC GTTATGTTGA  GCTCTATGCA AAGGATGAAG ATGCGTTCTT CAGAGACTAC GCTGAATCTC ACAAGAAACT CTCTGAGCTT GGTTTCAGCC CGAGCTCCTC AGCAGGGAAG GCGGTTGCAG ACAGCACAGT  TCTCGCACAG AGCGCGTTCG GGGTTGCGGT TGCTGCTGCG GTTGTGGCGT TTAGTTACTT TTACGAGATT AGGAAGAGGA TGAAATAAAT GGGAGTACAA GGAAAACTAT TCAGATAAAA  CCCTATTTTA CTGCCACAAT ATGCTAAACT CTTTTAATCC ACCACGATCA TACTGTTTTG TTAGTAAAAA GTCAAAAAGT CAAAAAAATA ATATTTTGGG GTAAATTTCA TGGTTGGTTG 
GTTGCGTAAC CGTTCATAAC AAGGATTGGT TACTACCATT AAATGATTGA GTATTGCTTA CAAGATTTGT G 

Retrieve as FASTA