Entry information : CrubAPx05 (Carubv10003730m.g)
Entry ID 15028
Creation 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CrubAPx05 (Carubv10003730m.g)
Name (synonym) CrubAPx05 (Carubv10003730m.g)
Class Ascorbate peroxidase     [Orthogroup: APx002]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella rubella    [TaxId: 81985 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CrubAPx05
start..stop
S start..stop
CagraAPx05 665 0 1..372 1..373
AlyAPx05 616 0 1..372 1..370
BstrAPx05 611 0 1..372 1..367
BnAPx04-1Aa_other 602 0 1..372 1..354
Literature and cross-references CrubAPx05 (Carubv10003730m.g)
Protein sequence: CrubAPx05 (Carubv10003730m.g)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   372
PWM (Da):   %s   40678.54  
PI (pH):   %s   8.07
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAERVSLTLN STSFFLLSPP PPKTTTTMSS SLRTTTAASH LLRRSSSSSR STLTLSSSIS FTRSLVSSPL LSSSSLSQKS YRNRVASVNR SFNSTAATKC SSDPDQLKNA REDIKELLNT  KFCHPILVRL GWHDAGTYNK NINEWPQRGG ANGSLRFDIE LKHAANAGLV NALNLIKDIK EKYSGITYAD LFQLASATAI EEAGGPKIPM KYGRVDASGP EDCPEEGRLP DAGPPSPANH  LREVFYRMGL DDKDIVALSG AHTLGRSRPE RSGWGKPETK YTKEGPGAPG GQSWTPEWLK FDNSYFTEIK EKRDEDLLVL PTDAAIFEDS SFKVYAENYA ADQNAFFKDY AVAHAKLSNL 
GAEFNPPEGI VI* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCAGAGC GTGTGTCTCT CACACTCAAC AGCACCAGCT TCTTCCTCCT TTCTCCTCCT CCTCCCAAAA CCACCACAAC CATGTCTTCT TCTCTCCGCA CAACCACCGC TGCTTCTCAT  CTCCTCCGCC GCTCCTCCTC CTCCTCCAGA TCTACACTCA CTCTCTCTTC TTCTATCTCA TTCACTAGAT CTCTCGTCTC TTCTCCTCTT CTCTCTTCTT CATCCCTCTC TCAGGTACGC  TTCACTCTCT CTCTCAGATT TTGTTATACT CTATAGTTTT CACGACCTGA TTTGATTTCA GAAGAGTTAT CGTAACCGAG TCGCGTCGGT GAATCGGAGT TTTAACTCAA CCGCCGCTAC  GAAATGTTCA TCAGATCCTG ATCAGTTGAA GAACGCTAGA GAAGACATCA AAGAGCTTCT CAATACCAAA TTCTGCCATC CAATTTTGGT TCGTATTGCT AAAACCTTCC TTCTCTAAAT  CCGAAGTAAT CAATCGCTAC GTTTGTATTG ATTTTGTTTG CGTTGTGTTT TGAATCAATA GGTTCGATTA GGGTGGCATG ATGCTGGAAC GTACAACAAG AACATCAATG AATGGCCACA  GAGAGGTGGA GCTAATGGTA GTCTTAGATT CGATATTGAG CTTAAGCATG CTGCTAATGC TGGTACTATT ATATCACTTT GTTACCATAT GTGTGTTAGC TTCTCTTTTT ACACTTGCTT  GTTTTGCTTA TAAGCTTTGT TTGATGTTTT TGTAAGGTCT TGTGAATGCT TTGAATTTGA TTAAGGATAT CAAAGAGAAG TACTCTGGGA TTACTTATGC TGACTTGTTC CAATTGGCTA  GTGCTACTGC TATTGAGGTG AGGTGTGATG ATTTATAAAC CTTTGTTGTT AACATTTACT TGAAAGGTTT TGGAATGTTT TAGGAAGCTG GAGGACCTAA GATACCTATG AAGTATGGAA  GAGTTGATGC CTCTGGTCCT GAGGATTGTC CTGAAGAAGG AAGACTCCCT GGTAATTAAA GTGTCTCGTT GCCTCTTCTT TGGGTACATT AATTGTATCA CAACTTTAGT AATAACGGAT  ATCTTATGTT TCTATAGATG CTGGTCCTCC TTCACCTGCT AATCATCTTA GAGAAGTTTT TTACAGGATG GGACTAGATG ATAAGGTGAT GATTGCTGTT GAATATTGAT AGTTATGGAA  GATAAGTAGG TTTAGACTTT TAGTGGTCTA TATTGAAAGA GTTTTTGTAT GTGCAGGACA TTGTTGCGTT ATCTGGTGCT CATACCTTAG GAAGATCTAG GCCAGAACGT AGTGGTTGGG  GGAAGCCAGA GACGAAATAC ACGGTAATGT ATTATCCAGT TCTATAATGT ATTGTTGTAT AATATGTCGT AAAGTTAGAT TTTTATTATA TTTTTTTTTT GTTTCACATT ATAGAAAGAG  GGGCCTGGCG CACCAGGAGG ACAATCATGG ACACCCGAGT GGCTGAAGTT TGACAATTCT TACTTCACGG TTGCGTCTCA GAACTTAACT CTTTCTTCAC ACTTTGTTAT GAATCTCTTC  TTCTTTCCGT TTTTACTGTC TTATTAATAT AACTAATATA ACAGGAAATT AAGGAAAAGA GAGATGAAGA TCTCCTTGTC CTACCTACTG ATGCAGCCAT CTTTGAAGAC TCTTCTTTCA  AGGTATAAAA AAAATGAGGT TAAACATACA TATCCATACT AACTAACTTA CCAAGTCTTT ACCTTTAAAA CTGAAAATTG AATGCAATTG CAGGTATATG CTGAGAACTA CGCTGCAGAT  CAGAATGCAT TCTTCAAGGA TTACGCTGTC GCCCATGCGA AGCTCAGCAA TCTTGGAGCA GAATTCAACC CTCCTGAGGT TTGTTGTCAT AATACTTCCA TCATTACACT AACATAATAA  TGAAAATGAT TTTAAAAGAC ACACATGAGC ATACATAAAA ATTGTGCAAA TCTGACCGAG CATGAGCAAT AGGAAGATGT ATAGAATTCC TACCTTTCGT AAGTCATTGA TAATCGTGTT  AGAACCATGT TACTTGAAGA GATAGACATC ATCTTTTTTT TGCCATCAGA GTACGTAGAA TCTCCATTGA TGAATGAGTT TGCAGGGGCG TCATATGAAC TGATTATTGT GAATCCTTTT 
TGTAGGGAAT CGTAATCTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCAGAGC GTGTGTCTCT CACACTCAAC AGCACCAGCT TCTTCCTCCT TTCTCCTCCT CCTCCCAAAA CCACCACAAC CATGTCTTCT TCTCTCCGCA CAACCACCGC TGCTTCTCAT  CTCCTCCGCC GCTCCTCCTC CTCCTCCAGA TCTACACTCA CTCTCTCTTC TTCTATCTCA TTCACTAGAT CTCTCGTCTC TTCTCCTCTT CTCTCTTCTT CATCCCTCTC TCAGAAGAGT  TATCGTAACC GAGTCGCGTC GGTGAATCGG AGTTTTAACT CAACCGCCGC TACGAAATGT TCATCAGATC CTGATCAGTT GAAGAACGCT AGAGAAGACA TCAAAGAGCT TCTCAATACC  AAATTCTGCC ATCCAATTTT GGTTCGATTA GGGTGGCATG ATGCTGGAAC GTACAACAAG AACATCAATG AATGGCCACA GAGAGGTGGA GCTAATGGTA GTCTTAGATT CGATATTGAG  CTTAAGCATG CTGCTAATGC TGGTCTTGTG AATGCTTTGA ATTTGATTAA GGATATCAAA GAGAAGTACT CTGGGATTAC TTATGCTGAC TTGTTCCAAT TGGCTAGTGC TACTGCTATT  GAGGAAGCTG GAGGACCTAA GATACCTATG AAGTATGGAA GAGTTGATGC CTCTGGTCCT GAGGATTGTC CTGAAGAAGG AAGACTCCCT GATGCTGGTC CTCCTTCACC TGCTAATCAT  CTTAGAGAAG TTTTTTACAG GATGGGACTA GATGATAAGG ACATTGTTGC GTTATCTGGT GCTCATACCT TAGGAAGATC TAGGCCAGAA CGTAGTGGTT GGGGGAAGCC AGAGACGAAA  TACACGAAAG AGGGGCCTGG CGCACCAGGA GGACAATCAT GGACACCCGA GTGGCTGAAG TTTGACAATT CTTACTTCAC GGAAATTAAG GAAAAGAGAG ATGAAGATCT CCTTGTCCTA  CCTACTGATG CAGCCATCTT TGAAGACTCT TCTTTCAAGG TATATGCTGA GAACTACGCT GCAGATCAGA ATGCATTCTT CAAGGATTAC GCTGTCGCCC ATGCGAAGCT CAGCAATCTT 
GGAGCAGAAT TCAACCCTCC TGAGGGAATC GTAATCTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCAGAGC GTGTGTCTCT CACACTCAAC AGCACCAGCT TCTTCCTCCT TTCTCCTCCT CCTCCCAAAA CCACCACAAC CATGTCTTCT TCTCTCCGCA CAACCACCGC TGCTTCTCAT  CTCCTCCGCC GCTCCTCCTC CTCCTCCAGA TCTACACTCA CTCTCTCTTC TTCTATCTCA TTCACTAGAT CTCTCGTCTC TTCTCCTCTT CTCTCTTCTT CATCCCTCTC TCAGAAGAGT  TATCGTAACC GAGTCGCGTC GGTGAATCGG AGTTTTAACT CAACCGCCGC TACGAAATGT TCATCAGATC CTGATCAGTT GAAGAACGCT AGAGAAGACA TCAAAGAGCT TCTCAATACC  AAATTCTGCC ATCCAATTTT GGTTCGATTA GGGTGGCATG ATGCTGGAAC GTACAACAAG AACATCAATG AATGGCCACA GAGAGGTGGA GCTAATGGTA GTCTTAGATT CGATATTGAG  CTTAAGCATG CTGCTAATGC TGGTCTTGTG AATGCTTTGA ATTTGATTAA GGATATCAAA GAGAAGTACT CTGGGATTAC TTATGCTGAC TTGTTCCAAT TGGCTAGTGC TACTGCTATT  GAGGAAGCTG GAGGACCTAA GATACCTATG AAGTATGGAA GAGTTGATGC CTCTGGTCCT GAGGATTGTC CTGAAGAAGG AAGACTCCCT GATGCTGGTC CTCCTTCACC TGCTAATCAT  CTTAGAGAAG TTTTTTACAG GATGGGACTA GATGATAAGG ACATTGTTGC GTTATCTGGT GCTCATACCT TAGGAAGATC TAGGCCAGAA CGTAGTGGTT GGGGGAAGCC AGAGACGAAA  TACACGAAAG AGGGGCCTGG CGCACCAGGA GGACAATCAT GGACACCCGA GTGGCTGAAG TTTGACAATT CTTACTTCAC GGAAATTAAG GAAAAGAGAG ATGAAGATCT CCTTGTCCTA  CCTACTGATG CAGCCATCTT TGAAGACTCT TCTTTCAAGG TATATGCTGA GAACTACGCT GCAGATCAGA ATGCATTCTT CAAGGATTAC GCTGTCGCCC ATGCGAAGCT CAGCAATCTT 
GGAGCAGAAT TCAACCCTCC TGAGGGAATC GTAATCTAA 

Retrieve as FASTA