Entry information : CrubPrx121Carubv10003382m.g
Entry ID 15035
Creation 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CrubPrx121Carubv10003382m.g
Name CrubPrx121Carubv10003382m.g
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx033]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella rubella    [TaxId: 81985 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CrubPrx121
start..stop
S start..stop
CagraPrx05 654 0 1..333 1..333
BstrPrx69 597 0 1..333 1..333
AlyPrx60 558 0 1..327 1..327
AtPrx60 523 0 1..328 1..329
Literature and cross-references CrubPrx121Carubv10003382m.g
Protein sequence: CrubPrx121Carubv10003382m.g
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   333 (306)
PWM (Da):   %s   36381.24 (33438.7) Transmb domain:   %s   o5-27i
PI (pH):   %s   7.6 (7.32) Peptide Signal:   %s   cut: 28 range:28-333
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAVKIFSTTS VLILSIALLS FGHCCYGQLR VGFYNKDCRN VENIVFRVVR EAFIKDSSLA PAMIRLYFHD CFSNGCDASL LLDGTSSEKK ASPNLSVRGY ELIDDIKTAV DLECHEIVSC  ADIIAIATRD LVNLASGGKT WYAIPTGRFD GVVSLASTVD LPSPRMTVSQ TAQKFADRKL SLTDMVLLLG GHTIGVAHCS FIMDRLYNFQ NTKQPDPSMD SKLVQDLRAK CPQGSSSDGI 
INLDQNLTSS NTMDVSFYKE INSRRGILHI DQQLAIDGMT SKLVSDIANG NDFLSRFGQA MVNLGFVGVK NKGNGEIRKS CRSCNSPFFC ATS* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCCGTGA AGATCTTCTC GACCACTTCA GTATTGATTC TCTCTATTGC TCTGCTCAGC TTCGGCCATT GTTGTTATGG CCAGCTTCGA GTTGGATTCT ACAACAAAGA TTGCCGAAAC  GTAGAAAACA TCGTCTTTAG AGTTGTTCGA GAGGCATTCA TCAAGGATTC ATCCCTTGCA CCCGCAATGA TCCGCCTTTA TTTTCACGAT TGTTTTAGCA ATGTAAGTGT AATTGGTTAA  TACAACAAAT TTCTAGAAGT ATTGTTCTAA TATATAAGTA TTAATCTTTG ATGCATGTAT TGAAAATGTA TATAGGGATG TGATGCATCG CTTCTTCTAG ATGGTACGAG CAGTGAGAAA  AAGGCGTCAC CAAATCTTAG CGTACGAGGA TACGAACTGA TTGATGACAT TAAAACTGCA GTCGACCTAG AATGTCATGA GATCGTTTCT TGTGCTGATA TCATTGCTAT CGCGACTAGA  GATCTTGTTA ATCTTGTAAG CAAATCCACC TCAGTTCTTG TTACTACATA CATCTTGCAT TTTATATATG TTATGTTTTC CTAATCTGGC TGCCAAAAAA ACTCTATATG ATCAGGCAAG  TGGAGGAAAA ACATGGTATG CGATACCAAC AGGACGATTT GACGGTGTGG TCTCTTTGGC TTCGACTGTA GATTTGCCAT CTCCTCGTAT GACCGTCTCT CAAACCGCTC AGAAATTTGC  TGACAGGAAA CTTAGCCTTA CCGATATGGT TCTACTTCTT GGTATGTAGA ATAAACATAT TACAACATTC TTCTTCACAT TGTTACCAAA ATATATATAT ATATATTACA ACATTCAAAG  AATATAAACT ACTACTAGGT TATATGTTCT CTAGTCTTAA ATAGTATAAA TTCATATATG ACATTTTTAA TGGTTTTATT TGAGTATATA ATTATAGGTG GACATACGAT TGGAGTGGCA  CATTGTTCGT TCATTATGGA TCGATTATAC AATTTTCAGA ATACTAAACA ACCTGATCCA TCCATGGACT CTAAATTGGT CCAAGACCTA AGAGCCAAAT GTCCTCAGGG TTCGTCAAGT  GATGGCATCA TTAATCTAGA TCAAAACCTA ACGAGTTCGA ATACTATGGA TGTATCTTTC TACAAAGAGA TAAATTCTCG CCGAGGAATC CTCCACATCG ATCAACAACT TGCCATCGAC  GGAATGACGA GTAAGCTAGT GTCGGATATA GCCAACGGTA ACGATTTCTT GTCAAGGTTT GGTCAGGCAA TGGTGAATTT GGGATTCGTG GGAGTTAAAA ATAAGGGTAA CGGGGAGATA 
AGAAAATCTT GTCGTTCTTG CAATAGTCCA TTTTTTTGCG CAACTAGTTA A 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCCGTGA AGATCTTCTC GACCACTTCA GTATTGATTC TCTCTATTGC TCTGCTCAGC TTCGGCCATT GTTGTTATGG CCAGCTTCGA GTTGGATTCT ACAACAAAGA TTGCCGAAAC  GTAGAAAACA TCGTCTTTAG AGTTGTTCGA GAGGCATTCA TCAAGGATTC ATCCCTTGCA CCCGCAATGA TCCGCCTTTA TTTTCACGAT TGTTTTAGCA ATGGATGTGA TGCATCGCTT  CTTCTAGATG GTACGAGCAG TGAGAAAAAG GCGTCACCAA ATCTTAGCGT ACGAGGATAC GAACTGATTG ATGACATTAA AACTGCAGTC GACCTAGAAT GTCATGAGAT CGTTTCTTGT  GCTGATATCA TTGCTATCGC GACTAGAGAT CTTGTTAATC TTGCAAGTGG AGGAAAAACA TGGTATGCGA TACCAACAGG ACGATTTGAC GGTGTGGTCT CTTTGGCTTC GACTGTAGAT  TTGCCATCTC CTCGTATGAC CGTCTCTCAA ACCGCTCAGA AATTTGCTGA CAGGAAACTT AGCCTTACCG ATATGGTTCT ACTTCTTGGT GGACATACGA TTGGAGTGGC ACATTGTTCG  TTCATTATGG ATCGATTATA CAATTTTCAG AATACTAAAC AACCTGATCC ATCCATGGAC TCTAAATTGG TCCAAGACCT AAGAGCCAAA TGTCCTCAGG GTTCGTCAAG TGATGGCATC  ATTAATCTAG ATCAAAACCT AACGAGTTCG AATACTATGG ATGTATCTTT CTACAAAGAG ATAAATTCTC GCCGAGGAAT CCTCCACATC GATCAACAAC TTGCCATCGA CGGAATGACG  AGTAAGCTAG TGTCGGATAT AGCCAACGGT AACGATTTCT TGTCAAGGTT TGGTCAGGCA ATGGTGAATT TGGGATTCGT GGGAGTTAAA AATAAGGGTA ACGGGGAGAT AAGAAAATCT 
TGTCGTTCTT GCAATAGTCC ATTTTTTTGC GCAACTAGTT AA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCCGTGA AGATCTTCTC GACCACTTCA GTATTGATTC TCTCTATTGC TCTGCTCAGC TTCGGCCATT GTTGTTATGG CCAGCTTCGA GTTGGATTCT ACAACAAAGA TTGCCGAAAC  GTAGAAAACA TCGTCTTTAG AGTTGTTCGA GAGGCATTCA TCAAGGATTC ATCCCTTGCA CCCGCAATGA TCCGCCTTTA TTTTCACGAT TGTTTTAGCA ATGGATGTGA TGCATCGCTT  CTTCTAGATG GTACGAGCAG TGAGAAAAAG GCGTCACCAA ATCTTAGCGT ACGAGGATAC GAACTGATTG ATGACATTAA AACTGCAGTC GACCTAGAAT GTCATGAGAT CGTTTCTTGT  GCTGATATCA TTGCTATCGC GACTAGAGAT CTTGTTAATC TTGCAAGTGG AGGAAAAACA TGGTATGCGA TACCAACAGG ACGATTTGAC GGTGTGGTCT CTTTGGCTTC GACTGTAGAT  TTGCCATCTC CTCGTATGAC CGTCTCTCAA ACCGCTCAGA AATTTGCTGA CAGGAAACTT AGCCTTACCG ATATGGTTCT ACTTCTTGGT GGACATACGA TTGGAGTGGC ACATTGTTCG  TTCATTATGG ATCGATTATA CAATTTTCAG AATACTAAAC AACCTGATCC ATCCATGGAC TCTAAATTGG TCCAAGACCT AAGAGCCAAA TGTCCTCAGG GTTCGTCAAG TGATGGCATC  ATTAATCTAG ATCAAAACCT AACGAGTTCG AATACTATGG ATGTATCTTT CTACAAAGAG ATAAATTCTC GCCGAGGAAT CCTCCACATC GATCAACAAC TTGCCATCGA CGGAATGACG  AGTAAGCTAG TGTCGGATAT AGCCAACGGT AACGATTTCT TGTCAAGGTT TGGTCAGGCA ATGGTGAATT TGGGATTCGT GGGAGTTAAA AATAAGGGTA ACGGGGAGAT AAGAAAATCT 
TGTCGTTCTT GCAATAGTCC ATTTTTTTGC GCAACTAGTT AA 

Retrieve as FASTA