Entry information : CrubAPx03-2 (Carubv10016423m.g)
Entry ID 15037
Creation 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CrubAPx03-2 (Carubv10016423m.g)
Name (synonym) CrubAPx03-2 (Carubv10016423m.g)
Class Ascorbate peroxidase     [Orthogroup: APx011]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella rubella    [TaxId: 81985 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CrubAPx03-2
start..stop
S start..stop
AlyAPx23-2 540 0 2..290 3..292
TsAPx23-2 521 0 3..290 2..288
BnAPx03-1Aa_other 485 1e-175 3..290 2..287
BstrAPx03-2 484 2e-175 3..290 2..286
Literature and cross-references CrubAPx03-2 (Carubv10016423m.g)
Protein sequence: CrubAPx03-2 (Carubv10016423m.g)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   290
PWM (Da):   %s   32005.29 Transmb domain:   %s   o261-283i
PI (pH):   %s   5.6
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAAALVVDDD YLKEIDKARR ELRALIAKKS CAPIMLRLAW HDAGTYDAES KTGGPNGSIR NEQEYSHGAN SGLKIALDLC EEVKTKHPNI SYADLYQLAG VVAVEVTGGP DISFVPGRKD  SNACTDEGRL PDAHQGFKHL KDVFYRMGLS DKDIVALSGA HTLGRAHPER SGFDGPWTQD PLKFDNSYFV ELLKEEETEG LLKLSTDKTL LEVPEFRHYV ELYAKDEDAF FRDYAESHKK 
LSELGFTPTS SVTKVITDNS TVLAHSAVGV AVAAAVVALG YFYEIRKRIK * 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGGCAG CACTGGTGGT TGACGATGAT TACCTCAAGG AGATAGATAA GGCTCGCCGT GAACTCCGTG CTCTCATCGC TAAGAAGAGT TGCGCTCCGA TCATGCTCCG ATTAGCGTAA  GTTTCCTCTT TAGTACGGAC GAGGGTTTTG ATTGAGAAAA ATCTCGCGAT GTTTTTGTGA ATTTGATTTG TTAAAGATGG TTCGTTGGTT TTGGTTTTTG TGAGAAGGTG GCATGACGCT  GGAACTTATG ATGCTGAATC GAAGACTGGT GGACCTAATG GCTCGATTCG GAACGAACAG GAGTATAGTC ATGGTGCTAA TAGTGGTTTG AAGATTGCTC TTGATCTCTG TGGTGCGTTT  TTTTTTTTCG TTTTTCCAAC TCTGTGGTGG ATTAAGGATT GGAGTTGAGA TTTGAGTATT TGATTGAGTT CTTCGTTTTA GGGATTCTGT TTACTTAGCT CGGAACGTAA TATATCATAT  GGTTTTTGAA ATCTTGCTAA GTATAGACAT AATCGTTGTA TACACTGACC TTGAGATGAC TATGTGGTGT TGATGTATCA ATTTGTCATA AGATGACTGT TTTCTTATGA TTCTGATGTT  GATTTTTTTG CTGTTTCAGA GGAAGTGAAA ACTAAACATC CCAACATCAG TTATGCGGAC CTATACCAGG TAATTAAAAA CGAGTTTTGC TTTTGTTTAT GATTGCATAG TCGTATAAGT  ATGACTTATG GTGTAGAGAC AGGGGAATTG ACTATTGTGT AAACTCATCA AGATGCTAGA TTAAGTTGGT TGAGTTGTGT GATTGCGGTC CTCGGTGTGT AGAAACAGGG GAAATTGACA  GTTGTGCTTC AGGATTGAAA ATATTTGTGT TATTTGCAGT GTGAAAACAT TCCTAAATTT GGCTGTGTCA GTAAAACTGC ATTAACATTT CAATTGGTCT CCTTAAACTA TTCACTCATC  AGTGGTGTTC TATTTAGCCC TGGACTTACT AGGCTTACAT GTTTTTGCTT TTACACCTAT ATCACATTTT CTAAGACTGA ACATCTCATG TATTGTACCA CCTTTTCTTC CTTTGGCATC  ATAATGTTAA GGCTATAGCT GTGAATATCC CAAAACAAGT GTTTACAAGC ATGGTGCTAT ATCTTATGCA AGCAACTTTC GGATCTCAGT CATATTCACA TGAATTTGAT TCGGTCATTT  TCAGCTTGCT GGTGTGGTAG CGGTTGAAGT TACTGGTGGC CCTGACATCA GTTTTGTTCC TGGCCGAAAA GTAATATTGT CATTGCCATT AAGATAAATG GTATTACAAC TTACTATCAT  AAGCAATTAA CTATAAATTA GCTGTATGTT TCTCTCTTAT AGGATTCAAA CGCCTGCACT GACGAAGGAA GACTTCCTGA TGCTCATCAA GGTTGGAGGG TCATGGAGTT TGCACGATGT  TCAACAAACA TTCATTTTGA ATGTTATCTT CCTTAATGAG GGTTTGAAGT TATGTCTGCT ATTTTGCATG TAGGTTTCAA ACATCTCAAA GATGTCTTCT ACCGGATGGG ACTGTCTGAT  AAAGATATTG TGGCACTCTC AGGAGCTCAT ACTCTGGTAA ATACTTGATT TCACGATTCA CATTTTTTGT TTGGTATTTA ATATATAAGT TACATATGCA GATTTTAATT AGATTACAAT  ATGTAGGGAA GGGCTCATCC AGAGAGATCT GGTTTTGATG GACCATGGAC TCAAGATCCT CTAAAGTTTG ATAACTCATA CTTTGTGTAA GATCCTCTGA CAGATTTTGT TTGGTTGGAG  AAAACAACTA GTTGTTTTGT TCACTGATGT TTAAACCATG GTCATTGTTG GTACTACAGG GAATTGCTGA AAGAAGAAGA GACAGAGGGC TTGCTAAAAC TTTCAACGGA CAAGACATTG  TTGGAAGTCC CTGAGTTTCG TCATTACGTC GAGCTTTACG CAAAGGTATA ATTATGGGAG TCTATCTTTA CTCTGATCCA AAAATCCGAT TCAAGTATCA ATTCGCGTGC AAGCTGCATC  GACTACAAGC TAAGATTATG ATGCAGTTGC ATCTTGATTT CTAACTTTTG CCTCTCAACA GGACGAAGAT GCATTCTTCA GAGACTATGC AGAGTCACAC AAGAAACTCT CAGAGCTCGG  GTTCACACCA ACATCTTCAG TCACTAAGGT GATAACAGAC AACAGCACGG TGCTGGCACA TAGTGCAGTC GGGGTTGCAG TCGCTGCTGC TGTGGTGGCC TTAGGCTACT TCTACGAAAT 
TCGCAAAAGG ATCAAGTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGGCAG CACTGGTGGT TGACGATGAT TACCTCAAGG AGATAGATAA GGCTCGCCGT GAACTCCGTG CTCTCATCGC TAAGAAGAGT TGCGCTCCGA TCATGCTCCG ATTAGCGTGG  CATGACGCTG GAACTTATGA TGCTGAATCG AAGACTGGTG GACCTAATGG CTCGATTCGG AACGAACAGG AGTATAGTCA TGGTGCTAAT AGTGGTTTGA AGATTGCTCT TGATCTCTGT  GAGGAAGTGA AAACTAAACA TCCCAACATC AGTTATGCGG ACCTATACCA GCTTGCTGGT GTGGTAGCGG TTGAAGTTAC TGGTGGCCCT GACATCAGTT TTGTTCCTGG CCGAAAAGAT  TCAAACGCCT GCACTGACGA AGGAAGACTT CCTGATGCTC ATCAAGGTTT CAAACATCTC AAAGATGTCT TCTACCGGAT GGGACTGTCT GATAAAGATA TTGTGGCACT CTCAGGAGCT  CATACTCTGG GAAGGGCTCA TCCAGAGAGA TCTGGTTTTG ATGGACCATG GACTCAAGAT CCTCTAAAGT TTGATAACTC ATACTTTGTG GAATTGCTGA AAGAAGAAGA GACAGAGGGC  TTGCTAAAAC TTTCAACGGA CAAGACATTG TTGGAAGTCC CTGAGTTTCG TCATTACGTC GAGCTTTACG CAAAGGACGA AGATGCATTC TTCAGAGACT ATGCAGAGTC ACACAAGAAA  CTCTCAGAGC TCGGGTTCAC ACCAACATCT TCAGTCACTA AGGTGATAAC AGACAACAGC ACGGTGCTGG CACATAGTGC AGTCGGGGTT GCAGTCGCTG CTGCTGTGGT GGCCTTAGGC 
TACTTCTACG AAATTCGCAA AAGGATCAAG TAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGGCAG CACTGGTGGT TGACGATGAT TACCTCAAGG AGATAGATAA GGCTCGCCGT GAACTCCGTG CTCTCATCGC TAAGAAGAGT TGCGCTCCGA TCATGCTCCG ATTAGCGTGG  CATGACGCTG GAACTTATGA TGCTGAATCG AAGACTGGTG GACCTAATGG CTCGATTCGG AACGAACAGG AGTATAGTCA TGGTGCTAAT AGTGGTTTGA AGATTGCTCT TGATCTCTGT  GAGGAAGTGA AAACTAAACA TCCCAACATC AGTTATGCGG ACCTATACCA GCTTGCTGGT GTGGTAGCGG TTGAAGTTAC TGGTGGCCCT GACATCAGTT TTGTTCCTGG CCGAAAAGAT  TCAAACGCCT GCACTGACGA AGGAAGACTT CCTGATGCTC ATCAAGGTTT CAAACATCTC AAAGATGTCT TCTACCGGAT GGGACTGTCT GATAAAGATA TTGTGGCACT CTCAGGAGCT  CATACTCTGG GAAGGGCTCA TCCAGAGAGA TCTGGTTTTG ATGGACCATG GACTCAAGAT CCTCTAAAGT TTGATAACTC ATACTTTGTG GAATTGCTGA AAGAAGAAGA GACAGAGGGC  TTGCTAAAAC TTTCAACGGA CAAGACATTG TTGGAAGTCC CTGAGTTTCG TCATTACGTC GAGCTTTACG CAAAGGACGA AGATGCATTC TTCAGAGACT ATGCAGAGTC ACACAAGAAA  CTCTCAGAGC TCGGGTTCAC ACCAACATCT TCAGTCACTA AGGTGATAAC AGACAACAGC ACGGTGCTGG CACATAGTGC AGTCGGGGTT GCAGTCGCTG CTGCTGTGGT GGCCTTAGGC 
TACTTCTACG AAATTCGCAA AAGGATCAAG TAA 

Retrieve as FASTA