Entry information : CrubAPx03-3 (Carubv10014296m.g)
Entry ID 15038
Creation 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CrubAPx03-3 (Carubv10014296m.g)
Name (synonym) CrubAPx03-3 (Carubv10014296m.g)
Class Ascorbate peroxidase     [Orthogroup: APx018]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella rubella    [TaxId: 81985 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CrubAPx03-3
start..stop
S start..stop
AlyAPx23 532 0 1..292 1..292
AlyAPx23-2 489 4e-177 2..292 4..292
CrubAPx03-2 481 7e-174 2..292 3..290
TsAPx23-2 475 1e-171 1..292 1..288
Literature and cross-references CrubAPx03-3 (Carubv10014296m.g)
Protein sequence: CrubAPx03-3 (Carubv10014296m.g)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   292
PWM (Da):   %s   32439.48 Transmb domain:   %s   o266-285i
PI (pH):   %s   5.46
Sequence
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Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAELVGDAVY LKEIDKARRE LRALIANKNC APIMLRLAWH DAGTYDAESK TGGPNGSIRN EEEYSHGANS GLKIAIDLCE EVKTKHPKIT YADLYQLAGV VAVEVTGGPD ISFVPGRKDS  NACTEEGRLP DANQGFKHLK DVFYRMGLSD KDIVALSGAH TLGRAHLERS GFDGPWTRDP LKFDNSYFVE LLKGEGSEGL LKLSTDETLL DVPEFRRYVE LYAKDEDAFF RDYAESHKKL 
SELGFTPTAS VTNKETQWMI TFELKLSQLG VVVVAATVVA FGCFNEVRKR MK* 

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Remarks
DNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AAATTTTTTC CGTCTTCCCT TGAAAACCCC TCTCTCAGAC TCCAGAGTAA CAACAATGGC GGAACTCGTG GGTGACGCGG TTTACCTTAA GGAGATCGAC AAAGCTCGCC GTGAGCTCCG  TGCTCTCATC GCTAACAAGA ATTGTGCTCC GATCATGCTC CGATTGGCGT AAGTTTCCAT TTTCCGTGTT CGATTTCTCT GATATTTGAG TGCTACGAAC TTGAAAAATC TCGCGATGTT  GTGCGATTTT CATGTTGTGT TCTCTCTGGT TTTGTGAGAA GGTGGCATGA CGCTGGAACC TATGATGCTG AATCGAAGAC TGGTGGACCT AATGGCTCGA TTAGGAACGA AGAAGAGTAT  AGTCATGGTG CTAATAGTGG TTTGAAGATC GCTATTGATC TCTGTGGTGC GTTATTCTCG TTTTTCCTTT TCCGTGGATT AGGGTTTGGA GTTTAGATTC TGTGATTGAG TACTTCGTTT  TGGGGATTCT GTTTCTTAGC TTGTCTTTAC ACTCAATTTG TTCATGGGTG ACGACGAGAT CTATCACATT TTGAAATCTT TCCAAGTATA AACTTAATCG CTTTATACAT AGACCTAGAG  CTGATGATTA TGTGTTGGCT ATATTTTTGC TGGAATATAC TGATTTACTT GTGACAGATC GTTCTACTAG TGGTTCTGAG GATTTATGAG AAGCTTCACA TGTTAAATTT GCTACTGTGT  GTTGAATCAA TTTGTCTAGT GACCTGAGGA ACTTTTTGAG AACAATCTTA CTTCTTGTTT TGAATATCAT TGTTGAATCA TTGTTATTTC AGAGGAAGTG AAGACTAAAC ATCCCAAAAT  CACTTATGCG GATCTTTACC AGGTAACTAA CTTGAACTTT AGCAGTTTTT CTACTGGAAT GAAGAGTGTA AAAATGATCA GTGTGATATC CCTTTTGTTC AGTTGTGTTG GCAGTATAAT  TTCTCACGGA CCTTGTTTTT ACCTCTTCAT TCAGATTTTT CAAGGATTTT TTAGTAGTTG TGTTGTGTCT CAGAAATTCA TCAGTGGTGT TGGCTAGTTG AGCGATTGCG GTCCTCAGGG  TATAGAAATT AGGGAATTGA CAATTTGCAG CGCTTCAGGG TTGATATATT TGGCTGATTC ACAGTGTGAA GATTCTTTTA CACAGATTAG TACTTATGGT CTCTTTTGTG TTCTCTGGCT  TTAACAAATC TAATGTAAAG GCTTGGGTTG TTGAGAATGA CCAGAACAAA TTCCCAATAC GGCTGCTATT ATCTTATAGC TAAGTTTTGG ATCTCTCATT CATTTTCACA TGAAATTCAT  TCTGTCATTT TTCAGCTTGC GGGTGTGGTA GCGGTTGAAG TTACTGGTGG ACCTGACATC AGTTTTGTGC CTGGCAGAAA AGTAATAATC TCTAAACCAT TAAGATGGTA TAAAAGCTTA  CCACCAAATG CAATTACTGA TTAATTGTAT GTTTCTCTCT TATAGGATTC AAATGCCTGC ACCGAGGAAG GAAGGCTCCC TGATGCTAAT CAAGGTTGGA TGGAAATCTT TTTCCATTAA  CCAGAAACTC CAATGTGTTT TACATAAAAC AAAATACCTA ATTTATTGAA TATGAGTATA GCAAATAATC ACTGTACAGT ATAATCTTCT GTTCGAATGT GTTCTTTGAC CTCAATGAGA  GTTTGAAGTT ATGTCTTCTG ATTTACATGT AGGTTTCAAA CATCTTAAAG ATGTCTTCTA CCGGATGGGA CTGTCTGATA AAGATATTGT GGCACTCTCA GGGGCTCATA CTCTGGTACA  TTCTTTGTTC CACAATTCAT ACTTGTCGTT TGGTATTTTA ACAAATAAGT TGTGTATAGT TTTTCTAATT AGATTTCAAT TAATGTTTAG GGAAGGGCTC ATTTAGAGAG ATCAGGTTTT  GATGGACCAT GGACTCGAGA TCCTCTGAAG TTTGATAACT CATACTTTGT GTAAGATCCT CTAATGTCAT TGACAATATT TTTTGTTGGA GACAACAAAT AGTTCCTCTG ACTGATCACT  GAATTGTTTA TTTATATGAT ATATGTTTGT CATAGGGAAT TGCTGAAAGG AGAAGGATCA GAAGGTTTGC TGAAACTTTC CACGGATGAG ACTTTGTTGG ATGTCCCAGA GTTCCGTCGT  TATGTTGAGC TTTACGCAAA GGTATTATTC TGATCCAAGA AACCGATTTG AGCAATTAAC CAGAGCTGCA AATCGAGTTT CATAAAAGAC AAGCCTAAGA TTATTGTATT GCAACAAGTA  TAAGTTTTTT GTTTCAACAA GCATAAGTTT CTAATATTTG TTCCAACAGG ACGAAGATGC ATTCTTTAGA GACTATGCAG AGTCACACAA GAAACTCTCA GAGCTCGGGT TCACACCAAC  GGCTTCAGTC ACTAATAAGG AAACTCAGTG GATGATAACT TTCGAATTAA AACTCTCACA GCTCGGAGTC GTAGTCGTTG CTGCTACTGT TGTGGCCTTT GGCTGCTTCA ATGAAGTCCG  CAAAAGGATG AAGTAAATAA ATGAGAGTAA GAAACGATTC CTCTAATCTT GGGTTTTGTT GCAAAACGAA ACATTGTAAA AAACACGAAT CTACTATGGA TCGGTTCGTT CATCGGTATG  TAGATGATTC GGATCTTAAC CGGACATATA ATTGGAATTG GTACGAATTG GTTCAGTTCT TATTGAATCG GTTTGGTCCA GTACTAGAAA TCATGTCTTC TACTTTGGTT TATTACAGTC 
ACGATTAGGA TTGGTTTAGA A 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGGAAC TCGTGGGTGA CGCGGTTTAC CTTAAGGAGA TCGACAAAGC TCGCCGTGAG CTCCGTGCTC TCATCGCTAA CAAGAATTGT GCTCCGATCA TGCTCCGATT GGCGTGGCAT  GACGCTGGAA CCTATGATGC TGAATCGAAG ACTGGTGGAC CTAATGGCTC GATTAGGAAC GAAGAAGAGT ATAGTCATGG TGCTAATAGT GGTTTGAAGA TCGCTATTGA TCTCTGTGAG  GAAGTGAAGA CTAAACATCC CAAAATCACT TATGCGGATC TTTACCAGCT TGCGGGTGTG GTAGCGGTTG AAGTTACTGG TGGACCTGAC ATCAGTTTTG TGCCTGGCAG AAAAGATTCA  AATGCCTGCA CCGAGGAAGG AAGGCTCCCT GATGCTAATC AAGGTTTCAA ACATCTTAAA GATGTCTTCT ACCGGATGGG ACTGTCTGAT AAAGATATTG TGGCACTCTC AGGGGCTCAT  ACTCTGGGAA GGGCTCATTT AGAGAGATCA GGTTTTGATG GACCATGGAC TCGAGATCCT CTGAAGTTTG ATAACTCATA CTTTGTGGAA TTGCTGAAAG GAGAAGGATC AGAAGGTTTG  CTGAAACTTT CCACGGATGA GACTTTGTTG GATGTCCCAG AGTTCCGTCG TTATGTTGAG CTTTACGCAA AGGACGAAGA TGCATTCTTT AGAGACTATG CAGAGTCACA CAAGAAACTC  TCAGAGCTCG GGTTCACACC AACGGCTTCA GTCACTAATA AGGAAACTCA GTGGATGATA ACTTTCGAAT TAAAACTCTC ACAGCTCGGA GTCGTAGTCG TTGCTGCTAC TGTTGTGGCC 
TTTGGCTGCT TCAATGAAGT CCGCAAAAGG ATGAAGTAA 

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cDNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AAATTTTTTC CGTCTTCCCT TGAAAACCCC TCTCTCAGAC TCCAGAGTAA CAACAATGGC GGAACTCGTG GGTGACGCGG TTTACCTTAA GGAGATCGAC AAAGCTCGCC GTGAGCTCCG  TGCTCTCATC GCTAACAAGA ATTGTGCTCC GATCATGCTC CGATTGGCGT GGCATGACGC TGGAACCTAT GATGCTGAAT CGAAGACTGG TGGACCTAAT GGCTCGATTA GGAACGAAGA  AGAGTATAGT CATGGTGCTA ATAGTGGTTT GAAGATCGCT ATTGATCTCT GTGAGGAAGT GAAGACTAAA CATCCCAAAA TCACTTATGC GGATCTTTAC CAGCTTGCGG GTGTGGTAGC  GGTTGAAGTT ACTGGTGGAC CTGACATCAG TTTTGTGCCT GGCAGAAAAG ATTCAAATGC CTGCACCGAG GAAGGAAGGC TCCCTGATGC TAATCAAGGT TTCAAACATC TTAAAGATGT  CTTCTACCGG ATGGGACTGT CTGATAAAGA TATTGTGGCA CTCTCAGGGG CTCATACTCT GGGAAGGGCT CATTTAGAGA GATCAGGTTT TGATGGACCA TGGACTCGAG ATCCTCTGAA  GTTTGATAAC TCATACTTTG TGGAATTGCT GAAAGGAGAA GGATCAGAAG GTTTGCTGAA ACTTTCCACG GATGAGACTT TGTTGGATGT CCCAGAGTTC CGTCGTTATG TTGAGCTTTA  CGCAAAGGAC GAAGATGCAT TCTTTAGAGA CTATGCAGAG TCACACAAGA AACTCTCAGA GCTCGGGTTC ACACCAACGG CTTCAGTCAC TAATAAGGAA ACTCAGTGGA TGATAACTTT  CGAATTAAAA CTCTCACAGC TCGGAGTCGT AGTCGTTGCT GCTACTGTTG TGGCCTTTGG CTGCTTCAAT GAAGTCCGCA AAAGGATGAA GTAAATAAAT GAGAGTAAGA AACGATTCCT  CTAATCTTGG GTTTTGTTGC AAAACGAAAC ATTGTAAAAA ACACGAATCT ACTATGGATC GGTTCGTTCA TCGGTATGTA GATGATTCGG ATCTTAACCG GACATATAAT TGGAATTGGT 
ACGAATTGGT TCAGTTCTTA TTGAATCGGT TTGGTCCAGT ACTAGAAATC ATGTCTTCTA CTTTGGTTTA TTACAGTCAC GATTAGGATT GGTTTAGAA 

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