Entry information : CrubPrx38Carubv10019421m.g
Entry ID 15040
Creation 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CrubPrx38Carubv10019421m.g
Name CrubPrx38Carubv10019421m.g
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx035]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella rubella    [TaxId: 81985 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CrubPrx38
start..stop
S start..stop
CagraPrx69 721 0 1..357 1..357
BstrPrx03 659 0 8..357 4..353
AlyPrx34-2 652 0 19..357 17..355
AhalPrx51 650 0 19..357 17..355
Literature and cross-references CrubPrx38Carubv10019421m.g
Protein sequence: CrubPrx38Carubv10019421m.g
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   357
PWM (Da):   %s   39151.81 Transmb domain:   %s   i12-31o
PI (pH):   %s   8.32
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MKFSVSSSST TTFFTWTILI ALGCLTLRAS MSDAQLTPTF YDTSCPNVTN IVRDTIVNEL RSDPRIAASI LRLHFHDCFV NGCDASILLD NTTSFRTEKD AGGNANSARG FPVIDRMKAA  IERACPRTVS CADTLTIAAQ QSVTLAGGPS WRVPLGRRDS LQAFLQLANA NLPGPSSTLL RLKDRFRNVG LDRPSDLVAL SGAHTFGKNQ CRFIINRLYN FNSTGLPDPT LNTTYLQTLR 
GLCPQNGNLS ALVDFDLRTP TVFDNKYYVN LGERKGLIQS DQELFSSPNA TDTIPLVRSY ASSTQTFFNA FVEAMNRMGN ITPLTGTQGQ IRLNCRVVNS NSLLQDVVEI VDFVSSM* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGTTCT CTGTTTCTTC TTCTTCTACT ACTACTTTTT TCACTTGGAC AATCTTAATA GCATTGGGAT GTCTTACGCT TCGTGCGTCT ATGTCCGATG CTCAACTTAC TCCTACCTTT  TATGACACTT CATGTCCTAA CGTCACCAAC ATCGTAAGAG ATACCATTGT CAACGAGTTA AGGTCAGACC CTCGTATCGC CGCGAGCATC CTTCGTCTTC ACTTCCACGA CTGCTTTGTT  AACGTACGAT ACTATACTTT TTTAAGTTTT TTCACATATC TATCGCGTTA CTAAACTACT GTATGTATCA TACTACTGAT TTTTTCATGT TTATTTATTC ATATTATTTT AACGCATTTA  TTTATTTGAT TTGATTATAT AACAATTTTA ATAATACTAT ATATAAGATT CAACTATATA TTTATGGAAA TTTTATCTTT ATTCCGTAAA ATATGGTTTT TATGAATTAC AAAAGATTCA  ACTATATATT TATGGATCCA CGTGATACAA TGACTAACAA TTTGTGAAAT TTAAATTTTG GACTTTTTGA AAGGGTTGTG ACGCATCGAT CTTGTTAGAC AACACAACAT CCTTCCGAAC  AGAGAAAGAT GCGGGTGGAA ATGCAAATTC GGCTAGAGGA TTTCCAGTGA TCGATAGAAT GAAAGCCGCA ATAGAGAGGG CTTGCCCGAG AACTGTTTCA TGCGCTGATA CGCTAACCAT  CGCTGCTCAA CAATCTGTCA CTTTGGTATC TATATTTTGG CACTTATCAT TAATTATTAT ATTCATTACT GCTTAAGAGT CACTTAATTA ACAAATTAAA CACGACTATT TAAGATTGAA  AATATGATAT ACAGTATATA TCTTGTTTGT TTGAGAAAGT CACGCACTCA ATATTTAGTA TCAACTTTCC AACCATTTGA CAAATAATTC AAAATTATTA GGGAAAATAT TCAAAACGCG  TGGTCCCGTA ATTGAATTTT GATGGCTTTT ACTACTATTG TTGAATGAAA GAAAAGGAAA ATAGATCACA TATCACAATA GTGTAATTGG TAACCAAAAA GAATTACTTA TATTTTTCAT  ATTTTGTTAA AGAAAATATT GGAGATTAAA AACCTTCATA TCAAGTAGTC TATGAAATAA TATAACATGT TTTTTTTCTT TGAACACATT GAAATTTAAT GATGATATCA TCGTATAGGC  AGGAGGTCCT TCATGGAGAG TTCCATTGGG GAGAAGAGAC AGCTTACAAG CATTTTTGCA ACTCGCTAAT GCGAATCTTC CTGGTCCATC CTCCACACTT CTACGACTTA AAGATAGATT  TAGAAACGTT GGTCTCGACC GTCCTTCTGA TCTCGTTGCT CTATCCGGTA ATTAACAAAA AGATATTAAA CACCATTTCA TGTACTTAGT TGTAATCAGC TAAGTTTGTT ATTTATCGAT  CTTATGGCCT TTCTTTTGCT AGGTGCCCAC ACATTTGGTA AAAACCAATG CCGGTTTATT ATAAACAGAC TATACAACTT TAACAGTACT GGTTTACCCG ACCCTACTCT CAACACTACT  TACCTCCAAA CCCTTCGTGG ACTATGTCCC CAAAATGGTA ATCTAAGTGC CTTGGTGGAT TTTGACCTGC GCACGCCCAC GGTTTTCGAC AACAAATACT ACGTAAATCT TGGTGAGAGA  AAAGGTCTTA TCCAGAGCGA CCAAGAGCTG TTCTCTAGCC CAAATGCCAC GGACACAATC CCTTTGGTGA GATCATATGC TAGTAGCACA CAAACCTTCT TCAATGCGTT TGTGGAGGCC  ATGAATAGGA TGGGAAATAT CACACCTCTT ACTGGAACTC AAGGACAAAT CAGGTTGAAT TGTAGGGTGG TGAATTCCAA CTCTCTACTC CAAGATGTTG TGGAAATTGT TGACTTTGTT 
AGCTCCATGT GA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGTTCT CTGTTTCTTC TTCTTCTACT ACTACTTTTT TCACTTGGAC AATCTTAATA GCATTGGGAT GTCTTACGCT TCGTGCGTCT ATGTCCGATG CTCAACTTAC TCCTACCTTT  TATGACACTT CATGTCCTAA CGTCACCAAC ATCGTAAGAG ATACCATTGT CAACGAGTTA AGGTCAGACC CTCGTATCGC CGCGAGCATC CTTCGTCTTC ACTTCCACGA CTGCTTTGTT  AACGGTTGTG ACGCATCGAT CTTGTTAGAC AACACAACAT CCTTCCGAAC AGAGAAAGAT GCGGGTGGAA ATGCAAATTC GGCTAGAGGA TTTCCAGTGA TCGATAGAAT GAAAGCCGCA  ATAGAGAGGG CTTGCCCGAG AACTGTTTCA TGCGCTGATA CGCTAACCAT CGCTGCTCAA CAATCTGTCA CTTTGGCAGG AGGTCCTTCA TGGAGAGTTC CATTGGGGAG AAGAGACAGC  TTACAAGCAT TTTTGCAACT CGCTAATGCG AATCTTCCTG GTCCATCCTC CACACTTCTA CGACTTAAAG ATAGATTTAG AAACGTTGGT CTCGACCGTC CTTCTGATCT CGTTGCTCTA  TCCGGTGCCC ACACATTTGG TAAAAACCAA TGCCGGTTTA TTATAAACAG ACTATACAAC TTTAACAGTA CTGGTTTACC CGACCCTACT CTCAACACTA CTTACCTCCA AACCCTTCGT  GGACTATGTC CCCAAAATGG TAATCTAAGT GCCTTGGTGG ATTTTGACCT GCGCACGCCC ACGGTTTTCG ACAACAAATA CTACGTAAAT CTTGGTGAGA GAAAAGGTCT TATCCAGAGC  GACCAAGAGC TGTTCTCTAG CCCAAATGCC ACGGACACAA TCCCTTTGGT GAGATCATAT GCTAGTAGCA CACAAACCTT CTTCAATGCG TTTGTGGAGG CCATGAATAG GATGGGAAAT 
ATCACACCTC TTACTGGAAC TCAAGGACAA ATCAGGTTGA ATTGTAGGGT GGTGAATTCC AACTCTCTAC TCCAAGATGT TGTGGAAATT GTTGACTTTG TTAGCTCCAT GTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGTTCT CTGTTTCTTC TTCTTCTACT ACTACTTTTT TCACTTGGAC AATCTTAATA GCATTGGGAT GTCTTACGCT TCGTGCGTCT ATGTCCGATG CTCAACTTAC TCCTACCTTT  TATGACACTT CATGTCCTAA CGTCACCAAC ATCGTAAGAG ATACCATTGT CAACGAGTTA AGGTCAGACC CTCGTATCGC CGCGAGCATC CTTCGTCTTC ACTTCCACGA CTGCTTTGTT  AACGGTTGTG ACGCATCGAT CTTGTTAGAC AACACAACAT CCTTCCGAAC AGAGAAAGAT GCGGGTGGAA ATGCAAATTC GGCTAGAGGA TTTCCAGTGA TCGATAGAAT GAAAGCCGCA  ATAGAGAGGG CTTGCCCGAG AACTGTTTCA TGCGCTGATA CGCTAACCAT CGCTGCTCAA CAATCTGTCA CTTTGGCAGG AGGTCCTTCA TGGAGAGTTC CATTGGGGAG AAGAGACAGC  TTACAAGCAT TTTTGCAACT CGCTAATGCG AATCTTCCTG GTCCATCCTC CACACTTCTA CGACTTAAAG ATAGATTTAG AAACGTTGGT CTCGACCGTC CTTCTGATCT CGTTGCTCTA  TCCGGTGCCC ACACATTTGG TAAAAACCAA TGCCGGTTTA TTATAAACAG ACTATACAAC TTTAACAGTA CTGGTTTACC CGACCCTACT CTCAACACTA CTTACCTCCA AACCCTTCGT  GGACTATGTC CCCAAAATGG TAATCTAAGT GCCTTGGTGG ATTTTGACCT GCGCACGCCC ACGGTTTTCG ACAACAAATA CTACGTAAAT CTTGGTGAGA GAAAAGGTCT TATCCAGAGC  GACCAAGAGC TGTTCTCTAG CCCAAATGCC ACGGACACAA TCCCTTTGGT GAGATCATAT GCTAGTAGCA CACAAACCTT CTTCAATGCG TTTGTGGAGG CCATGAATAG GATGGGAAAT 
ATCACACCTC TTACTGGAAC TCAAGGACAA ATCAGGTTGA ATTGTAGGGT GGTGAATTCC AACTCTCTAC TCCAAGATGT TGTGGAAATT GTTGACTTTG TTAGCTCCAT GTGA 

Retrieve as FASTA