Entry information : CrubPrx42Carubv10010885m.g
Entry ID 15044
Creation 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CrubPrx42Carubv10010885m.g
Name CrubPrx42Carubv10010885m.g
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx038]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella rubella    [TaxId: 81985 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CrubPrx42
start..stop
S start..stop
CagraPrx71 726 0 1..352 1..352
BstrPrx10 617 0 16..352 17..351
AlyPrx07 612 0 17..352 18..349
AhalPrx54 602 0 46..352 1..307
Literature and cross-references CrubPrx42Carubv10010885m.g
Protein sequence: CrubPrx42Carubv10010885m.g
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   352 (331)
PWM (Da):   %s   38688.52 (36319.2) Transmb domain:   %s   i5-22o
PI (pH):   %s   5.78 (5.46) Peptide Signal:   %s   cut: 22 range:22-352
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MKLAVVSVVL LMVLVAWPVS AGRKDLPGAG GYGGDHDDDD GDDTTSWFPL DNLLSLNYYD KICPNFEKIV DNKVRQWTKT DASLGPALLR LIFHDCGVTG CDASVLLDYE GTERRSPASK  TLRGFELIDD IKSELEKSCP GLVSCADILT AASRAATVQL GGPYWPNAYG RRDSKHSYAR DVEKVPSGRR DVTALLETFQ SYGLNILDLV VLSGAHTIGQ AYCGTIQSRL YNFNGTSGTD 
PSIDPKYADY LRRKCRWATE TVSLDAITPA VFDNQYYINL QKNMGVLTTD QELVKDPRTA PLVKAFAEQP PQMFRQQFAV SMAKLVNVGV LTGEDRIGEI RKVCSKSNSG TY* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGTTGG CCGTGGTCTC AGTCGTCTTG CTCATGGTTC TCGTGGCTTG GCCGGTATCA GCTGGCCGGA AAGACTTACC GGGAGCTGGA GGATACGGAG GTGATCATGA TGATGACGAT  GGTGACGACA CAACGTCATG GTTTCCTTTG GACAATCTGT TATCGTTGAA TTACTATGAC AAGATTTGTC CAAATTTTGA GAAAATCGTT GATAACAAAG TGAGGCAATG GACTAAGACT  GACGCTTCCC TTGGCCCTGC CCTCCTCCGC CTTATCTTCC ACGACTGTGG CGTCACGGTA TTGCAATTAT ATCTTCTTTC TTAAATATTT ATTCAACATT AGTCGTTCAA TTGCGTAGTA  TTTATATATA CATTACTCCA GGCTACATAA CCGATTAATA TTTTGATTCA TATATGTAAT GTATGGTTTA CGATGTTTTC ATTTCTTGAT ATTGAAAACG TAGTAAAGCA ATTTATTCTA  TGCACAAACG CACCTTACCT TAATGTTTTG CGCATATCTT ATAGTATAGA TAAGCATTTC AGAAGATAAC AATTTGACTC TCTTGTAAAA TGAATTAACG ACTTTCAGGG ATGTGATGCG  TCGGTTCTTC TAGACTACGA AGGGACAGAG AGGAGATCTC CCGCGAGCAA AACCCTTAGA GGCTTCGAGC TGATCGACGA TATCAAGTCA GAGCTCGAGA AATCTTGCCC CGGCTTAGTC  TCCTGCGCTG ACATCCTAAC CGCAGCTAGC CGTGCCGCTA CCGTCCAACT CGGTGGTCCT TACTGGCCAA ACGCCTACGG TCGTCGTGAC TCCAAACACT CTTACGCTAG AGACGTTGAG  AAAGTTCCTT CAGGCCGTCG TGATGTCACC GCCCTTCTCG AGACGTTTCA ATCTTATGGT CTAAACATCC TCGACCTAGT TGTCCTCTCC GGGGCACACA CCATCGGACA AGCGTACTGT  GGCACCATCC AGTCAAGGCT TTACAACTTC AACGGTACCA GTGGTACTGA TCCGTCGATT GACCCTAAAT ACGCAGATTA CTTGAGACGC AAGTGTCGCT GGGCCACTGA GACTGTTTCT  CTCGACGCCA TAACTCCAGC AGTGTTCGAT AACCAGTATT ACATTAATCT TCAGAAGAAT ATGGGAGTCT TGACGACTGA TCAGGAGCTT GTTAAGGACC CGAGGACCGC TCCACTTGTA  AAGGCTTTCG CTGAACAGCC GCCTCAGATG TTCAGGCAGC AGTTTGCTGT CTCTATGGCC AAGCTGGTCA ATGTTGGTGT TCTCACTGGT GAAGATCGTA TCGGAGAGAT CAGGAAGGTC 
TGCAGCAAAT CTAACTCCGG AACTTACTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGTTGG CCGTGGTCTC AGTCGTCTTG CTCATGGTTC TCGTGGCTTG GCCGGTATCA GCTGGCCGGA AAGACTTACC GGGAGCTGGA GGATACGGAG GTGATCATGA TGATGACGAT  GGTGACGACA CAACGTCATG GTTTCCTTTG GACAATCTGT TATCGTTGAA TTACTATGAC AAGATTTGTC CAAATTTTGA GAAAATCGTT GATAACAAAG TGAGGCAATG GACTAAGACT  GACGCTTCCC TTGGCCCTGC CCTCCTCCGC CTTATCTTCC ACGACTGTGG CGTCACGGGA TGTGATGCGT CGGTTCTTCT AGACTACGAA GGGACAGAGA GGAGATCTCC CGCGAGCAAA  ACCCTTAGAG GCTTCGAGCT GATCGACGAT ATCAAGTCAG AGCTCGAGAA ATCTTGCCCC GGCTTAGTCT CCTGCGCTGA CATCCTAACC GCAGCTAGCC GTGCCGCTAC CGTCCAACTC  GGTGGTCCTT ACTGGCCAAA CGCCTACGGT CGTCGTGACT CCAAACACTC TTACGCTAGA GACGTTGAGA AAGTTCCTTC AGGCCGTCGT GATGTCACCG CCCTTCTCGA GACGTTTCAA  TCTTATGGTC TAAACATCCT CGACCTAGTT GTCCTCTCCG GGGCACACAC CATCGGACAA GCGTACTGTG GCACCATCCA GTCAAGGCTT TACAACTTCA ACGGTACCAG TGGTACTGAT  CCGTCGATTG ACCCTAAATA CGCAGATTAC TTGAGACGCA AGTGTCGCTG GGCCACTGAG ACTGTTTCTC TCGACGCCAT AACTCCAGCA GTGTTCGATA ACCAGTATTA CATTAATCTT  CAGAAGAATA TGGGAGTCTT GACGACTGAT CAGGAGCTTG TTAAGGACCC GAGGACCGCT CCACTTGTAA AGGCTTTCGC TGAACAGCCG CCTCAGATGT TCAGGCAGCA GTTTGCTGTC 
TCTATGGCCA AGCTGGTCAA TGTTGGTGTT CTCACTGGTG AAGATCGTAT CGGAGAGATC AGGAAGGTCT GCAGCAAATC TAACTCCGGA ACTTACTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGTTGG CCGTGGTCTC AGTCGTCTTG CTCATGGTTC TCGTGGCTTG GCCGGTATCA GCTGGCCGGA AAGACTTACC GGGAGCTGGA GGATACGGAG GTGATCATGA TGATGACGAT  GGTGACGACA CAACGTCATG GTTTCCTTTG GACAATCTGT TATCGTTGAA TTACTATGAC AAGATTTGTC CAAATTTTGA GAAAATCGTT GATAACAAAG TGAGGCAATG GACTAAGACT  GACGCTTCCC TTGGCCCTGC CCTCCTCCGC CTTATCTTCC ACGACTGTGG CGTCACGGGA TGTGATGCGT CGGTTCTTCT AGACTACGAA GGGACAGAGA GGAGATCTCC CGCGAGCAAA  ACCCTTAGAG GCTTCGAGCT GATCGACGAT ATCAAGTCAG AGCTCGAGAA ATCTTGCCCC GGCTTAGTCT CCTGCGCTGA CATCCTAACC GCAGCTAGCC GTGCCGCTAC CGTCCAACTC  GGTGGTCCTT ACTGGCCAAA CGCCTACGGT CGTCGTGACT CCAAACACTC TTACGCTAGA GACGTTGAGA AAGTTCCTTC AGGCCGTCGT GATGTCACCG CCCTTCTCGA GACGTTTCAA  TCTTATGGTC TAAACATCCT CGACCTAGTT GTCCTCTCCG GGGCACACAC CATCGGACAA GCGTACTGTG GCACCATCCA GTCAAGGCTT TACAACTTCA ACGGTACCAG TGGTACTGAT  CCGTCGATTG ACCCTAAATA CGCAGATTAC TTGAGACGCA AGTGTCGCTG GGCCACTGAG ACTGTTTCTC TCGACGCCAT AACTCCAGCA GTGTTCGATA ACCAGTATTA CATTAATCTT  CAGAAGAATA TGGGAGTCTT GACGACTGAT CAGGAGCTTG TTAAGGACCC GAGGACCGCT CCACTTGTAA AGGCTTTCGC TGAACAGCCG CCTCAGATGT TCAGGCAGCA GTTTGCTGTC 
TCTATGGCCA AGCTGGTCAA TGTTGGTGTT CTCACTGGTG AAGATCGTAT CGGAGAGATC AGGAAGGTCT GCAGCAAATC TAACTCCGGA ACTTACTAA 

Retrieve as FASTA