Entry information : CrubPrx43Carubv10028504m.g
Entry ID 15045
Creation 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CrubPrx43Carubv10028504m.g
Name CrubPrx43Carubv10028504m.g
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx015]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella rubella    [TaxId: 81985 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CrubPrx43
start..stop
S start..stop
CagraPrx56 658 0 1..317 1..317
BstrPrx12 649 0 1..317 1..317
AlyPrx64 638 0 1..317 1..317
AhalPrx17 637 0 1..317 1..317
Literature and cross-references CrubPrx43Carubv10028504m.g
Protein sequence: CrubPrx43Carubv10028504m.g
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   317 (295)
PWM (Da):   %s   34588.51 (31962.1)  
PI (pH):   %s   8.74 (8.91) Peptide Signal:   %s   cut: 23 range:23-317
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MNAHFFNVLL IVILVVSFDV QALSPHYYDH SCPQADHIVT NAVKKAMSND KTVPAALLRM HFHDCFVRGC DGSVLLDSKG KNKAEKDGPP NISLHAFYVI DNAKKALEEQ CPGIVSCADI  LSLAARDAVA LSGGPTWAVP KGRKDGRISK AIETRQLPAP TFNISQLRQN FGQRGLSMHD LVVLSGGHTL GFAHCSSFQN RLHNFNTQKE VDPTLNPSFA ASLEGVCPAH NTVKNAGSTL 
DGTVSSFDNI YYRMLMQGKS LFSSDEALLA VPSTKKLVAK YASSNEEFER AFVKSMIKMS SISGNGNEVR LNCRRVR* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAATGCAC ATTTTTTCAA TGTCCTTCTC ATTGTCATCT TAGTGGTTTC TTTTGACGTC CAAGCACTTA GTCCTCACTA CTACGACCAT TCATGTCCAC AAGCTGACCA CATTGTCACC  AATGCAGTCA AGAAGGCCAT GTCAAACGAC AAAACAGTCC CAGCCGCGCT CTTAAGGATG CATTTCCACG ACTGCTTCGT CAGAGTACTA ACTACTTTAC ACACAACATT CTCTTGCCAT  CTTTCAATGT CATATGTGTT TATACTCTTA ATAACTTGAA TATATATGTT TGATCTTTAA AGGGATGTGA TGGGTCAGTT CTATTAGACT CAAAGGGTAA GAACAAAGCA GAGAAAGATG  GACCTCCTAA CATCTCACTC CATGCGTTTT ATGTGATTGA CAATGCAAAA AAGGCATTAG AAGAGCAATG CCCCGGTATT GTCTCTTGCG CCGACATTCT TTCACTCGCT GCAAGAGATG  CGGTCGCTCT CGTGAGTGAT CTCTCTATCT CATATTCCAA ATACTACCTC TTCTTTGATG ATTTGATGAT TGATCCACTC AAAACATTCA TTGTGGGTGT TGTTATAGTC AGGAGGGCCG  ACATGGGCTG TGCCTAAAGG GAGAAAAGAT GGAAGAATAT CAAAGGCAAT AGAAACAAGA CAACTACCAG CTCCTACTTT CAACATCTCT CAACTACGTC AAAACTTTGG CCAAAGAGGC  CTCTCTATGC ATGATCTTGT TGTTCTCTCT GGTATTCTAC ATTTCTCCCC TTAACCTAAA ATACATATAC AAAGCTATAT TGAAAAATCT TGTTAGTATC CTTAGAGATG TGACATAAAT  ATATGAAACA AAAATTTCTT AAACTAAGTG GATATGTACA CAATCTAGAA ACTAGGTGGA TTTTTACAGT TTCGATGATC TTACTTATTT ATGTGAAGTA ATATAAATTG TGAATGTTGA  ATGAAATGAC AGGGGGACAT ACACTAGGAT TTGCCCACTG CTCATCGTTC CAGAATAGGC TCCACAACTT CAACACCCAA AAGGAGGTTG ACCCAACACT AAACCCGTCG TTTGCAGCCA  GCTTGGAGGG AGTGTGCCCA GCCCATAACA CGGTGAAGAA CGCTGGATCG ACCTTGGATG GAACCGTGTC ATCATTCGAC AATATCTACT ACAGGATGCT TATGCAAGGC AAGTCACTGT  TCTCATCTGA CGAAGCGCTT CTCGCAGTGC CCTCTACTAA GAAACTTGTG GCCAAGTACG CAAGTTCCAA CGAAGAGTTC GAGAGGGCTT TTGTAAAATC CATGATCAAG ATGAGTAGTA 
TCAGTGGGAA TGGTAATGAG GTCAGACTTA ACTGCAGAAG GGTTCGCTAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAATGCAC ATTTTTTCAA TGTCCTTCTC ATTGTCATCT TAGTGGTTTC TTTTGACGTC CAAGCACTTA GTCCTCACTA CTACGACCAT TCATGTCCAC AAGCTGACCA CATTGTCACC  AATGCAGTCA AGAAGGCCAT GTCAAACGAC AAAACAGTCC CAGCCGCGCT CTTAAGGATG CATTTCCACG ACTGCTTCGT CAGAGGATGT GATGGGTCAG TTCTATTAGA CTCAAAGGGT  AAGAACAAAG CAGAGAAAGA TGGACCTCCT AACATCTCAC TCCATGCGTT TTATGTGATT GACAATGCAA AAAAGGCATT AGAAGAGCAA TGCCCCGGTA TTGTCTCTTG CGCCGACATT  CTTTCACTCG CTGCAAGAGA TGCGGTCGCT CTCTCAGGAG GGCCGACATG GGCTGTGCCT AAAGGGAGAA AAGATGGAAG AATATCAAAG GCAATAGAAA CAAGACAACT ACCAGCTCCT  ACTTTCAACA TCTCTCAACT ACGTCAAAAC TTTGGCCAAA GAGGCCTCTC TATGCATGAT CTTGTTGTTC TCTCTGGGGG ACATACACTA GGATTTGCCC ACTGCTCATC GTTCCAGAAT  AGGCTCCACA ACTTCAACAC CCAAAAGGAG GTTGACCCAA CACTAAACCC GTCGTTTGCA GCCAGCTTGG AGGGAGTGTG CCCAGCCCAT AACACGGTGA AGAACGCTGG ATCGACCTTG  GATGGAACCG TGTCATCATT CGACAATATC TACTACAGGA TGCTTATGCA AGGCAAGTCA CTGTTCTCAT CTGACGAAGC GCTTCTCGCA GTGCCCTCTA CTAAGAAACT TGTGGCCAAG 
TACGCAAGTT CCAACGAAGA GTTCGAGAGG GCTTTTGTAA AATCCATGAT CAAGATGAGT AGTATCAGTG GGAATGGTAA TGAGGTCAGA CTTAACTGCA GAAGGGTTCG CTAG 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAATGCAC ATTTTTTCAA TGTCCTTCTC ATTGTCATCT TAGTGGTTTC TTTTGACGTC CAAGCACTTA GTCCTCACTA CTACGACCAT TCATGTCCAC AAGCTGACCA CATTGTCACC  AATGCAGTCA AGAAGGCCAT GTCAAACGAC AAAACAGTCC CAGCCGCGCT CTTAAGGATG CATTTCCACG ACTGCTTCGT CAGAGGATGT GATGGGTCAG TTCTATTAGA CTCAAAGGGT  AAGAACAAAG CAGAGAAAGA TGGACCTCCT AACATCTCAC TCCATGCGTT TTATGTGATT GACAATGCAA AAAAGGCATT AGAAGAGCAA TGCCCCGGTA TTGTCTCTTG CGCCGACATT  CTTTCACTCG CTGCAAGAGA TGCGGTCGCT CTCTCAGGAG GGCCGACATG GGCTGTGCCT AAAGGGAGAA AAGATGGAAG AATATCAAAG GCAATAGAAA CAAGACAACT ACCAGCTCCT  ACTTTCAACA TCTCTCAACT ACGTCAAAAC TTTGGCCAAA GAGGCCTCTC TATGCATGAT CTTGTTGTTC TCTCTGGGGG ACATACACTA GGATTTGCCC ACTGCTCATC GTTCCAGAAT  AGGCTCCACA ACTTCAACAC CCAAAAGGAG GTTGACCCAA CACTAAACCC GTCGTTTGCA GCCAGCTTGG AGGGAGTGTG CCCAGCCCAT AACACGGTGA AGAACGCTGG ATCGACCTTG  GATGGAACCG TGTCATCATT CGACAATATC TACTACAGGA TGCTTATGCA AGGCAAGTCA CTGTTCTCAT CTGACGAAGC GCTTCTCGCA GTGCCCTCTA CTAAGAAACT TGTGGCCAAG 
TACGCAAGTT CCAACGAAGA GTTCGAGAGG GCTTTTGTAA AATCCATGAT CAAGATGAGT AGTATCAGTG GGAATGGTAA TGAGGTCAGA CTTAACTGCA GAAGGGTTCG CTAG 

Retrieve as FASTA