Entry information : CrubPrx46Carubv10003841m.g
Entry ID 15047
Creation 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CrubPrx46Carubv10003841m.g
Name CrubPrx46Carubv10003841m.g
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx044]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella rubella    [TaxId: 81985 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CrubPrx46
start..stop
S start..stop
BstrPrx35 632 0 1..330 1..329
AlyPrx56-1 625 0 1..330 1..329
AtPrx56 622 0 1..330 1..329
AhalPrx41 620 0 1..330 1..327
Literature and cross-references CrubPrx46Carubv10003841m.g
Protein sequence: CrubPrx46Carubv10003841m.g
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   330 (299)
PWM (Da):   %s   36187.51 (32746.8)  
PI (pH):   %s   8.54 (8.55) Peptide Signal:   %s   cut: 32 range:32-330
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAALRMTISC VMFLQLLSCL LSSFAPTNVQ GLKVGFYDKA CPKAELIVKK VVFEAMKKDP TLGAPLLRMF FHDCFVRGCE GSVLLELKNK QDEKNSIPNL TLRGFEIIDN AKAALEKECP  GIVSCSDVLA IVARDAMVAL NGPSWEVETG RRDGIVTNIS EALLNLPSPF ANISSLITQF QSKGLDKKDL VVLSGGHTIG NGHCPQITNR LYNFTGKGDS DPNLDTKYAA ALRKKCKPTD 
TTTALEMDPG SFKTFDGSYF KLVSQRRGLF QSDAALLDNQ ETKSYLLKQM NSDGYSTFFE DFGVSMVKMG RIGVLTGEVG QVRKKCRMVN * 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGGCTT TGAGGATGAC TATCTCTTGT GTCATGTTCC TTCAATTACT ATCGTGCTTG CTCTCTTCAT TTGCTCCAAC CAATGTGCAA GGATTGAAAG TTGGGTTCTA CGACAAGGCA  TGCCCAAAAG CTGAGCTTAT TGTCAAGAAG GTTGTCTTCG AGGCAATGAA GAAGGACCCG ACACTTGGAG CTCCTTTGCT AAGAATGTTT TTCCATGATT GCTTCGTTCG GGTAATGTCC  TCAATATCCA TTTCGTCTTT TTGGGGCACT TAATCGATCT AATTATTGAA TCATGATGTA TTAGGGATGT GAAGGGTCAG TCTTGCTAGA GCTAAAGAAC AAACAAGATG AGAAAAACTC  AATCCCTAAC CTCACCCTTA GAGGGTTTGA GATCATAGAC AATGCAAAGG CAGCTCTAGA AAAGGAGTGT CCGGGCATTG TTTCTTGCTC TGATGTGTTG GCTATTGTCG CTAGGGATGC  AATGGTTGCG GTAAGTATAA AGCTTTTTAG TATCAAGCGT TACTGATCTA ATATTTGGTC GAACTCACGG TATCTTTAGT ACACACCCTC CTTTACATGG TGATTATAAA CTCCATAAAT  TAGGTTGGAC GCACTCTTTT TTTTTTTTTC TTTTAATGCT ACAAAATGCA CTTGACGTAA ACTCCGAGAG ACTACTAGTT CAGGTTTACG TTTGAGATTT TCTGAATGGT CATAAAGAAA  ATCCATAGAA TCTGTTATAT GTGATATGTT GGATTTTTAA GACTTGTGAT ATACCAATTA ATATATATTC AGCTCAATGG ACCGTCATGG GAGGTTGAAA CAGGAAGAAG AGACGGTATA  GTTACAAACA TCAGTGAGGC CCTATTAAAC CTACCATCAC CATTTGCTAA TATCAGTAGC CTTATCACTC AATTCCAATC CAAAGGCCTG GACAAGAAAG ACCTCGTTGT GCTTTCAGGT  ATATGTGTTA TAGAATCAGA AAACTCATTA GTTATGCTTG ACCTGAAAGT TAGAAAAGCA GTCTCCAATC AATTTTTTTT AGATTAAAAA ATCCCATATA TACCTTATTC AGATTTTGAA  ACGTAGAAAG AACAACTCAT TCACTTTTTC GATATTTCAC AAGCTTTTAT ATTTCATTCT CAGTTTCCTC CTTTTTCCCA AGCATTGTTT GTTATTTTAG ACTTTTAAAA TAGCAACTAG  CAAGAATACT CTGGTCTTCT ATGATATAAT CTTAGGTTTG GCTTGGGATA TCCACTTATA ATATAATAAA AATAAATTCA TTCTCAACTT ATTTTTATAT ATTTTATTTA CATTTTGATA  GGTGGACACA CAATAGGTAA CGGACACTGC CCTCAAATCA CAAACCGGCT CTACAATTTC ACCGGGAAAG GAGATAGTGA TCCAAACTTA GACACGAAAT ACGCAGCCGC CCTTAGAAAA  AAATGCAAGC CAACTGATAC CACGACGGCT TTAGAAATGG ATCCAGGAAG CTTTAAAACG TTTGACGGGA GCTACTTCAA GCTTGTGTCT CAAAGAAGAG GGTTGTTTCA ATCTGATGCA  GCTCTTTTAG ACAATCAAGA AACTAAGTCT TATCTTCTCA AGCAAATGAA TAGTGACGGG TACTCTACTT TCTTTGAAGA CTTTGGTGTT TCTATGGTAA AGATGGGTCG GATTGGGGTC 
TTAACAGGTG AAGTTGGACA AGTTCGCAAG AAATGCAGAA TGGTTAACTA A 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGGCTT TGAGGATGAC TATCTCTTGT GTCATGTTCC TTCAATTACT ATCGTGCTTG CTCTCTTCAT TTGCTCCAAC CAATGTGCAA GGATTGAAAG TTGGGTTCTA CGACAAGGCA  TGCCCAAAAG CTGAGCTTAT TGTCAAGAAG GTTGTCTTCG AGGCAATGAA GAAGGACCCG ACACTTGGAG CTCCTTTGCT AAGAATGTTT TTCCATGATT GCTTCGTTCG GGGATGTGAA  GGGTCAGTCT TGCTAGAGCT AAAGAACAAA CAAGATGAGA AAAACTCAAT CCCTAACCTC ACCCTTAGAG GGTTTGAGAT CATAGACAAT GCAAAGGCAG CTCTAGAAAA GGAGTGTCCG  GGCATTGTTT CTTGCTCTGA TGTGTTGGCT ATTGTCGCTA GGGATGCAAT GGTTGCGCTC AATGGACCGT CATGGGAGGT TGAAACAGGA AGAAGAGACG GTATAGTTAC AAACATCAGT  GAGGCCCTAT TAAACCTACC ATCACCATTT GCTAATATCA GTAGCCTTAT CACTCAATTC CAATCCAAAG GCCTGGACAA GAAAGACCTC GTTGTGCTTT CAGGTGGACA CACAATAGGT  AACGGACACT GCCCTCAAAT CACAAACCGG CTCTACAATT TCACCGGGAA AGGAGATAGT GATCCAAACT TAGACACGAA ATACGCAGCC GCCCTTAGAA AAAAATGCAA GCCAACTGAT  ACCACGACGG CTTTAGAAAT GGATCCAGGA AGCTTTAAAA CGTTTGACGG GAGCTACTTC AAGCTTGTGT CTCAAAGAAG AGGGTTGTTT CAATCTGATG CAGCTCTTTT AGACAATCAA  GAAACTAAGT CTTATCTTCT CAAGCAAATG AATAGTGACG GGTACTCTAC TTTCTTTGAA GACTTTGGTG TTTCTATGGT AAAGATGGGT CGGATTGGGG TCTTAACAGG TGAAGTTGGA 
CAAGTTCGCA AGAAATGCAG AATGGTTAAC TAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGGCTT TGAGGATGAC TATCTCTTGT GTCATGTTCC TTCAATTACT ATCGTGCTTG CTCTCTTCAT TTGCTCCAAC CAATGTGCAA GGATTGAAAG TTGGGTTCTA CGACAAGGCA  TGCCCAAAAG CTGAGCTTAT TGTCAAGAAG GTTGTCTTCG AGGCAATGAA GAAGGACCCG ACACTTGGAG CTCCTTTGCT AAGAATGTTT TTCCATGATT GCTTCGTTCG GGGATGTGAA  GGGTCAGTCT TGCTAGAGCT AAAGAACAAA CAAGATGAGA AAAACTCAAT CCCTAACCTC ACCCTTAGAG GGTTTGAGAT CATAGACAAT GCAAAGGCAG CTCTAGAAAA GGAGTGTCCG  GGCATTGTTT CTTGCTCTGA TGTGTTGGCT ATTGTCGCTA GGGATGCAAT GGTTGCGCTC AATGGACCGT CATGGGAGGT TGAAACAGGA AGAAGAGACG GTATAGTTAC AAACATCAGT  GAGGCCCTAT TAAACCTACC ATCACCATTT GCTAATATCA GTAGCCTTAT CACTCAATTC CAATCCAAAG GCCTGGACAA GAAAGACCTC GTTGTGCTTT CAGGTGGACA CACAATAGGT  AACGGACACT GCCCTCAAAT CACAAACCGG CTCTACAATT TCACCGGGAA AGGAGATAGT GATCCAAACT TAGACACGAA ATACGCAGCC GCCCTTAGAA AAAAATGCAA GCCAACTGAT  ACCACGACGG CTTTAGAAAT GGATCCAGGA AGCTTTAAAA CGTTTGACGG GAGCTACTTC AAGCTTGTGT CTCAAAGAAG AGGGTTGTTT CAATCTGATG CAGCTCTTTT AGACAATCAA  GAAACTAAGT CTTATCTTCT CAAGCAAATG AATAGTGACG GGTACTCTAC TTTCTTTGAA GACTTTGGTG TTTCTATGGT AAAGATGGGT CGGATTGGGG TCTTAACAGG TGAAGTTGGA 
CAAGTTCGCA AGAAATGCAG AATGGTTAAC TAA 

Retrieve as FASTA