Entry information : CrubPrx47Carubv10001326m.g
Entry ID 15048
Creation 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CrubPrx47Carubv10001326m.g
Name CrubPrx47Carubv10001326m.g
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx035]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella rubella    [TaxId: 81985 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CrubPrx47
start..stop
S start..stop
BstrPrx36 643 0 1..345 1..344
CrubPrx96 637 0 1..345 1..345
AhalPrx37 636 0 1..345 1..346
AlyPrx38-1 634 0 1..345 1..346
Literature and cross-references CrubPrx47Carubv10001326m.g
Protein sequence: CrubPrx47Carubv10001326m.g
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   345 (323)
PWM (Da):   %s   37937.31 (35484.9)  
PI (pH):   %s   7.98 (7.68) Peptide Signal:   %s   cut: 23 range:23-345
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MSSSLIKLGF VLVLLQLALS HAQLSPSFYD KTCPQVFDIA TKTIVNALRS DPRIAASILR LHFHDCFVNG CDASILLDNT TSFRTEKDAF GNAKSARGFE VIDQMKAAVE KACPKTVSCA  DLLAIAAQKS VVLAGGPSWT VPNGRRDSLK GFMDLANDNL PAPFFTLKQL KDSFKKVGLE RPSDLVALSG AHTFGKNQCQ FIMDRLYNFN ESGLPDPTLD KSYLTTLRKQ CPQNGNQSVL 
VDFDLRTPTL FDNKYYVNLR ENKGLIQSDQ ELFSSPDASD TIPLVRAYAD GQGKFFDAFV EAMIRMGSLS PLTGKQGEIR LNCRVVNTKS KIMDVVDAND FASSM* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TGAATACTTC TCTTAGAGTG CAAAGAAAAT GAGTTCCTCT TTGATAAAAT TGGGTTTTGT TCTTGTTCTT CTTCAGCTAG CATTGTCTCA TGCACAACTA AGTCCTTCCT TTTACGATAA  AACATGTCCA CAAGTCTTTG ACATTGCTAC CAAAACCATT GTCAATGCTC TGAGATCAGA CCCTCGCATC GCTGCGAGCA TCCTTCGTCT TCATTTCCAC GACTGCTTTG TTAATGTAAG  ATATAAATTG GTTCAATAAA TTTGTGTCGT ATATATTAAT TATCTAATAG TTTATCCTAA AGAGCGGGAA TTTTATAAAT TTAAAATCAG GATGTGATAA TTTTAAGCTA TTTACTTGCT  GTAAAAAAAA ATTACAGCTA TGAAAATGTT GCGAATGACC TATGAATGTG GGTGACACTT GACTAAAAAT CTGATGAAAA AGTGTTTTTC CTAAAATAGG GATGTGATGC ATCGATATTG  TTAGACAACA CAACATCGTT TAGAACGGAG AAAGACGCCT TTGGGAACGC CAAATCCGCA CGAGGTTTCG AGGTGATCGA CCAAATGAAG GCTGCTGTGG AGAAAGCATG TCCTAAAACA  GTTTCATGTG CTGATTTACT CGCAATCGCG GCTCAAAAAT CTGTCGTTTT GGTATGCATT TTTTACAATA CAATTCTTTT TTTCAATTCA AAATATGTTT CTAGATCATG TTTTCTGATT  CTTAAGTAGA AGAAAATACT TAATACCAAA TATAATTGTT TTGTCCATAG GCGGGAGGTC CTTCATGGAC GGTTCCAAAT GGAAGAAGAG ACAGTTTAAA GGGGTTTATG GATCTTGCTA  ACGATAACCT TCCAGCTCCA TTCTTTACTC TTAAACAACT TAAGGATAGC TTCAAAAAAG TCGGACTCGA ACGTCCTTCT GATCTCGTTG CTCTTTCCGG TATGTTATCA TTTTAAACAT  TTTCATCTAT AGTATTAATC AGTCACAACT ATATGTATGA TTATTCGCAA TTAGTTTATT TGTTCTCTAT ACATTTTTCT TTTGATTAGG TGCTCACACC TTTGGTAAAA ACCAATGTCA  GTTCATAATG GACCGTCTTT ACAACTTCAA TGAATCCGGT TTACCCGATC CAACCCTTGA TAAATCTTAC CTTACCACAC TTAGAAAACA ATGTCCACAA AATGGAAACC AAAGTGTCTT  GGTAGATTTT GATTTACGTA CACCAACGCT ATTCGACAAC AAATACTATG TGAATCTAAG AGAAAACAAG GGTCTTATCC AAAGCGACCA AGAGCTATTC TCTAGCCCTG ATGCTTCAGA  CACTATCCCT TTAGTCCGGG CTTACGCGGA TGGTCAAGGG AAATTTTTCG ATGCGTTCGT GGAAGCAATG ATAAGGATGG GAAGCCTTTC ACCTTTAACA GGGAAGCAAG GAGAGATTAG  ATTGAATTGT AGAGTTGTTA ATACGAAATC CAAAATCATG GATGTGGTAG ATGCTAATGA CTTTGCTAGC TCAATGTGAT GAGCATATGA ATGTTCTTCT AATAATTAAT AAATTATCAA 
TGTTATGTTT TCTTCTACTT TCTTGTTTCG TTTGCCTTAC CTATGTATAA TCGATAAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGTTCCT CTTTGATAAA ATTGGGTTTT GTTCTTGTTC TTCTTCAGCT AGCATTGTCT CATGCACAAC TAAGTCCTTC CTTTTACGAT AAAACATGTC CACAAGTCTT TGACATTGCT  ACCAAAACCA TTGTCAATGC TCTGAGATCA GACCCTCGCA TCGCTGCGAG CATCCTTCGT CTTCATTTCC ACGACTGCTT TGTTAATGGA TGTGATGCAT CGATATTGTT AGACAACACA  ACATCGTTTA GAACGGAGAA AGACGCCTTT GGGAACGCCA AATCCGCACG AGGTTTCGAG GTGATCGACC AAATGAAGGC TGCTGTGGAG AAAGCATGTC CTAAAACAGT TTCATGTGCT  GATTTACTCG CAATCGCGGC TCAAAAATCT GTCGTTTTGG CGGGAGGTCC TTCATGGACG GTTCCAAATG GAAGAAGAGA CAGTTTAAAG GGGTTTATGG ATCTTGCTAA CGATAACCTT  CCAGCTCCAT TCTTTACTCT TAAACAACTT AAGGATAGCT TCAAAAAAGT CGGACTCGAA CGTCCTTCTG ATCTCGTTGC TCTTTCCGGT GCTCACACCT TTGGTAAAAA CCAATGTCAG  TTCATAATGG ACCGTCTTTA CAACTTCAAT GAATCCGGTT TACCCGATCC AACCCTTGAT AAATCTTACC TTACCACACT TAGAAAACAA TGTCCACAAA ATGGAAACCA AAGTGTCTTG  GTAGATTTTG ATTTACGTAC ACCAACGCTA TTCGACAACA AATACTATGT GAATCTAAGA GAAAACAAGG GTCTTATCCA AAGCGACCAA GAGCTATTCT CTAGCCCTGA TGCTTCAGAC  ACTATCCCTT TAGTCCGGGC TTACGCGGAT GGTCAAGGGA AATTTTTCGA TGCGTTCGTG GAAGCAATGA TAAGGATGGG AAGCCTTTCA CCTTTAACAG GGAAGCAAGG AGAGATTAGA 
TTGAATTGTA GAGTTGTTAA TACGAAATCC AAAATCATGG ATGTGGTAGA TGCTAATGAC TTTGCTAGCT CAATGTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TGAATACTTC TCTTAGAGTG CAAAGAAAAT GAGTTCCTCT TTGATAAAAT TGGGTTTTGT TCTTGTTCTT CTTCAGCTAG CATTGTCTCA TGCACAACTA AGTCCTTCCT TTTACGATAA  AACATGTCCA CAAGTCTTTG ACATTGCTAC CAAAACCATT GTCAATGCTC TGAGATCAGA CCCTCGCATC GCTGCGAGCA TCCTTCGTCT TCATTTCCAC GACTGCTTTG TTAATGGATG  TGATGCATCG ATATTGTTAG ACAACACAAC ATCGTTTAGA ACGGAGAAAG ACGCCTTTGG GAACGCCAAA TCCGCACGAG GTTTCGAGGT GATCGACCAA ATGAAGGCTG CTGTGGAGAA  AGCATGTCCT AAAACAGTTT CATGTGCTGA TTTACTCGCA ATCGCGGCTC AAAAATCTGT CGTTTTGGCG GGAGGTCCTT CATGGACGGT TCCAAATGGA AGAAGAGACA GTTTAAAGGG  GTTTATGGAT CTTGCTAACG ATAACCTTCC AGCTCCATTC TTTACTCTTA AACAACTTAA GGATAGCTTC AAAAAAGTCG GACTCGAACG TCCTTCTGAT CTCGTTGCTC TTTCCGGTGC  TCACACCTTT GGTAAAAACC AATGTCAGTT CATAATGGAC CGTCTTTACA ACTTCAATGA ATCCGGTTTA CCCGATCCAA CCCTTGATAA ATCTTACCTT ACCACACTTA GAAAACAATG  TCCACAAAAT GGAAACCAAA GTGTCTTGGT AGATTTTGAT TTACGTACAC CAACGCTATT CGACAACAAA TACTATGTGA ATCTAAGAGA AAACAAGGGT CTTATCCAAA GCGACCAAGA  GCTATTCTCT AGCCCTGATG CTTCAGACAC TATCCCTTTA GTCCGGGCTT ACGCGGATGG TCAAGGGAAA TTTTTCGATG CGTTCGTGGA AGCAATGATA AGGATGGGAA GCCTTTCACC  TTTAACAGGG AAGCAAGGAG AGATTAGATT GAATTGTAGA GTTGTTAATA CGAAATCCAA AATCATGGAT GTGGTAGATG CTAATGACTT TGCTAGCTCA ATGTGATGAG CATATGAATG 
TTCTTCTAAT AATTAATAAA TTATCAATGT TATGTTTTCT TCTACTTTCT TGTTTCGTTT GCCTTACCTA TGTATAATCG ATAAG 

Retrieve as FASTA