Entry information : CrubPrx48Carubv10017532m.g
Entry ID 15049
Creation 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CrubPrx48Carubv10017532m.g
Name CrubPrx48Carubv10017532m.g
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx035]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella rubella    [TaxId: 81985 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CrubPrx48
start..stop
S start..stop
AlyPrx33 664 0 1..354 1..349
AtPrx33 662 0 1..354 1..354
AhalPrx39 657 0 13..354 14..355
CrubPrx107 657 0 13..354 12..353
Literature and cross-references CrubPrx48Carubv10017532m.g
Protein sequence: CrubPrx48Carubv10017532m.g
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   354 (323)
PWM (Da):   %s   38930.4 (35514.8) Transmb domain:   %s   i13-35o
PI (pH):   %s   5.15 (4.98) Peptide Signal:   %s   cut: 32 range:32-354
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MKFSSSSTTS YTWTTLITLG CLMLCASLSV AQLTPTFYDN SCPNVTNIVR DTIVDELRSD PRIAGSILRL HFHDCFVNGC DASILLDNTT SFQTEKDAFG NANSARGFPV IDRMKAAIES  ACPRTVSCAD MLTIAAQQSV TLAGGPSWKV PLGRRDSLQA FLELANKNLP APTLTLPELK ENFKNVGLDR PSDLVALSGG HTFGKNQCRF IMDRLYNFSN TGLPDPTLNT TYLQTLRGQC 
PQDGNQSVLV DFDLRTPLVF DNKYYVNLKE QKGLIQTDQE LFSSPNATDT IPLVRSYADG TQTFFDAFVE AMNRMGNITP LTGTQGQIRL NCRVVNSNSL LHDVVEIVDF VSSM* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGTTCT CTTCATCTTC TACTACTTCC TACACTTGGA CAACCTTAAT CACATTGGGA TGTCTTATGC TTTGTGCCTC TTTGTCCGTT GCTCAACTTA CCCCTACCTT TTACGACAAT  TCGTGTCCTA ACGTCACTAA CATTGTTAGA GATACTATTG TAGACGAGCT AAGATCGGAC CCTCGTATCG CCGGGAGCAT CCTTCGTCTT CACTTCCACG ACTGCTTTGT TAACGTAAGA  TATCATTATC ATTATTTTCA TATATGTTTT AGTCTTTTGA ATTACTGTAG TTCATCTCTA TATCTTTTAA TGAGTCAAGA GTGTGATAAC AGAAATGCAT TCAAAATCAC ATTTTATCTA  TTTTTCGCAA AATTACATTG TTACATTTGG TACATATGGA TGTGATACAT TGACTGATAA TTTCTTAAAT GTCGTTTTGA ATTCTTAAAA GGGTTGTGAT GCATCGATCT TGTTAGACAA  CACAACATCA TTTCAAACAG AGAAAGATGC GTTTGGAAAC GCAAATTCGG CTCGGGGATT TCCAGTTATT GATAGAATGA AAGCCGCAAT AGAGAGTGCT TGCCCGAGAA CCGTTTCATG  CGCAGACATG CTTACCATTG CAGCTCAACA ATCTGTTACT TTGGTACGCT CCATTGTTCC ATCTTCTTTC CTTGGTTACA AACATTTTTT TCCATCAAAT TTTAATATTT CAAGTAGTCA  CTTTACATAT CAAACATATA TGAGTTAAAT TTGGGATATA GTTGTTTGAG AATGTCACAA TGATCATATT TAGTACAAAC CAAACGTTTT TAATATTTCT CCAATAATTT TGAACGCTTT  AATTTTGAAA AGTGCTCAGA ATTATTCGAG AAATATTCAA AACGTGTGGT CCGGTCAAGA AAATTTGTCA AGCTTAATAT CAAACTAGGA TATATTTTTA TTTGGTTACG CAAGACTAAC  TTTTTTTTCG AAGAAGCAGT GGAGATTCTA AAAACTTCCT TTTGAGTATT TAACGAATTC TAGTACATGT TTCTGAGTGA TAAAACTTTC TTATAAAGTA ATTATAATTT TGAGAGTATA  ATGGTAATTG TACTATATAG GCAGGAGGTC CTTCTTGGAA GGTTCCTTTG GGAAGAAGAG ACAGCTTACA AGCATTTTTG GAACTCGCTA ATAAAAATCT TCCAGCTCCA ACCTTAACAC  TTCCAGAACT TAAGGAAAAC TTTAAAAATG TTGGCCTTGA TCGTCCTTCT GATCTTGTTG CTCTCTCAGG TACGTAATTA ACACAAACAA ATTAAACCCT AGCTATTGAC ATAGTTGTAT  TATTTTATCT AATTATGGTC TTTCTTTTGT TTAGGGGGTC ACACATTTGG TAAAAATCAA TGTCGATTTA TTATGGACAG ATTATACAAC TTCAGCAACA CCGGGTTACC TGACCCTACC  CTCAACACTA CTTACCTACA AACTCTTCGT GGACAATGCC CTCAAGATGG TAACCAAAGC GTCTTGGTGG ATTTCGATTT GCGTACGCCT TTGGTGTTCG ACAACAAATA CTACGTGAAT  CTGAAAGAAC AAAAAGGTCT TATCCAAACC GATCAAGAGT TGTTCTCTAG TCCTAATGCC ACAGACACGA TCCCCTTGGT GAGATCTTAT GCTGATGGCA CACAAACATT CTTTGATGCG  TTCGTGGAGG CGATGAATAG GATGGGAAAC ATTACACCGC TTACAGGAAC TCAAGGACAA ATCAGGTTGA ACTGTAGGGT GGTGAACTCC AACTCTCTAC TCCATGATGT GGTGGAGATT 
GTTGACTTTG TTAGCTCTAT GTGAGAATCG TTGAC 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGTTCT CTTCATCTTC TACTACTTCC TACACTTGGA CAACCTTAAT CACATTGGGA TGTCTTATGC TTTGTGCCTC TTTGTCCGTT GCTCAACTTA CCCCTACCTT TTACGACAAT  TCGTGTCCTA ACGTCACTAA CATTGTTAGA GATACTATTG TAGACGAGCT AAGATCGGAC CCTCGTATCG CCGGGAGCAT CCTTCGTCTT CACTTCCACG ACTGCTTTGT TAACGGTTGT  GATGCATCGA TCTTGTTAGA CAACACAACA TCATTTCAAA CAGAGAAAGA TGCGTTTGGA AACGCAAATT CGGCTCGGGG ATTTCCAGTT ATTGATAGAA TGAAAGCCGC AATAGAGAGT  GCTTGCCCGA GAACCGTTTC ATGCGCAGAC ATGCTTACCA TTGCAGCTCA ACAATCTGTT ACTTTGGCAG GAGGTCCTTC TTGGAAGGTT CCTTTGGGAA GAAGAGACAG CTTACAAGCA  TTTTTGGAAC TCGCTAATAA AAATCTTCCA GCTCCAACCT TAACACTTCC AGAACTTAAG GAAAACTTTA AAAATGTTGG CCTTGATCGT CCTTCTGATC TTGTTGCTCT CTCAGGGGGT  CACACATTTG GTAAAAATCA ATGTCGATTT ATTATGGACA GATTATACAA CTTCAGCAAC ACCGGGTTAC CTGACCCTAC CCTCAACACT ACTTACCTAC AAACTCTTCG TGGACAATGC  CCTCAAGATG GTAACCAAAG CGTCTTGGTG GATTTCGATT TGCGTACGCC TTTGGTGTTC GACAACAAAT ACTACGTGAA TCTGAAAGAA CAAAAAGGTC TTATCCAAAC CGATCAAGAG  TTGTTCTCTA GTCCTAATGC CACAGACACG ATCCCCTTGG TGAGATCTTA TGCTGATGGC ACACAAACAT TCTTTGATGC GTTCGTGGAG GCGATGAATA GGATGGGAAA CATTACACCG 
CTTACAGGAA CTCAAGGACA AATCAGGTTG AACTGTAGGG TGGTGAACTC CAACTCTCTA CTCCATGATG TGGTGGAGAT TGTTGACTTT GTTAGCTCTA TGTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGTTCT CTTCATCTTC TACTACTTCC TACACTTGGA CAACCTTAAT CACATTGGGA TGTCTTATGC TTTGTGCCTC TTTGTCCGTT GCTCAACTTA CCCCTACCTT TTACGACAAT  TCGTGTCCTA ACGTCACTAA CATTGTTAGA GATACTATTG TAGACGAGCT AAGATCGGAC CCTCGTATCG CCGGGAGCAT CCTTCGTCTT CACTTCCACG ACTGCTTTGT TAACGGTTGT  GATGCATCGA TCTTGTTAGA CAACACAACA TCATTTCAAA CAGAGAAAGA TGCGTTTGGA AACGCAAATT CGGCTCGGGG ATTTCCAGTT ATTGATAGAA TGAAAGCCGC AATAGAGAGT  GCTTGCCCGA GAACCGTTTC ATGCGCAGAC ATGCTTACCA TTGCAGCTCA ACAATCTGTT ACTTTGGCAG GAGGTCCTTC TTGGAAGGTT CCTTTGGGAA GAAGAGACAG CTTACAAGCA  TTTTTGGAAC TCGCTAATAA AAATCTTCCA GCTCCAACCT TAACACTTCC AGAACTTAAG GAAAACTTTA AAAATGTTGG CCTTGATCGT CCTTCTGATC TTGTTGCTCT CTCAGGGGGT  CACACATTTG GTAAAAATCA ATGTCGATTT ATTATGGACA GATTATACAA CTTCAGCAAC ACCGGGTTAC CTGACCCTAC CCTCAACACT ACTTACCTAC AAACTCTTCG TGGACAATGC  CCTCAAGATG GTAACCAAAG CGTCTTGGTG GATTTCGATT TGCGTACGCC TTTGGTGTTC GACAACAAAT ACTACGTGAA TCTGAAAGAA CAAAAAGGTC TTATCCAAAC CGATCAAGAG  TTGTTCTCTA GTCCTAATGC CACAGACACG ATCCCCTTGG TGAGATCTTA TGCTGATGGC ACACAAACAT TCTTTGATGC GTTCGTGGAG GCGATGAATA GGATGGGAAA CATTACACCG 
CTTACAGGAA CTCAAGGACA AATCAGGTTG AACTGTAGGG TGGTGAACTC CAACTCTCTA CTCCATGATG TGGTGGAGAT TGTTGACTTT GTTAGCTCTA TGTGAGAATC GTTGAC 

Retrieve as FASTA