Entry information : CrubPrx52Carubv10011083m.g
Entry ID 15052
Creation 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CrubPrx52Carubv10011083m.g
Name CrubPrx52Carubv10011083m.g
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx037]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella rubella    [TaxId: 81985 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CrubPrx52
start..stop
S start..stop
BstrPrx25 662 0 1..346 21..366
BrPrx09-1Aa_other 652 0 1..346 1..347
09 651 0 1..346 1..346
AlyPrx09 649 0 1..346 1..346
Literature and cross-references CrubPrx52Carubv10011083m.g
Protein sequence: CrubPrx52Carubv10011083m.g
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   346 (323)
PWM (Da):   %s   37899.15 (35332.8) Transmb domain:   %s   i7-29o
PI (pH):   %s   7.36 (7.72) Peptide Signal:   %s   cut: 24 range:24-346
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAISMLVPGL VLFAMFSFDI VVAHPGLGFG WRSNRPVGRT FSSSLYPQFY QFSCPQADEI VMTVLEKAIA REPRMAASLL RLHFHDCFVQ GCDASILLDD SATIQSEKNA GPNKNSIRGF  QVIDEIKAKL EQACPQVVSC ADILALAARG STVLSGGPSW ELPLGRRDSR TASLNGANTN IPAPNSTIQN LLTMFQRKGL NEEDLVSLSG GHTIGVARCT TFKQRLYNQN GNNQPDETLE 
RSYYYGLRSI CPPTGGDNNI SPLDLASPAR FDNTYFKLLL WGKGLLTSDE VLITGNVDKT VALVKAYAED ESLFFRQFAK SMVNMGNIQP LTGFNGEIRK SCHVIN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTATCT CAATGCTTGT TCCTGGTCTT GTGCTCTTTG CTATGTTCTC TTTTGATATT GTTGTTGCTC ATCCAGGTCT AGGATTTGGA TGGAGAAGTA ATCGTCCCGT CGGAAGGACT  TTTTCCTCGA GTCTTTACCC ACAGTTTTAC CAGTTCTCTT GCCCACAAGC TGATGAGATT GTTATGACTG TGTTGGAAAA AGCCATAGCT AGAGAGCCAA GAATGGCTGC TTCTTTACTC  AGGCTTCACT TCCACGACTG CTTTGTCCAG GTAAAGTCAT CACTCATCAT CACCTATCTT TGTGTTCCCT TTATGTGTAT CATAAGCTTA ACACTTATTT ACTCAAATGT GTATGTAAAC  AGGGATGTGA TGCATCAATC TTGTTGGATG ATAGTGCTAC CATACAAAGT GAAAAGAACG CAGGACCAAA CAAGAACTCC ATTAGAGGGT TTCAAGTCAT AGATGAGATC AAAGCTAAAC  TGGAACAAGC TTGTCCTCAA GTCGTGTCCT GTGCTGACAT TCTTGCTCTT GCTGCTCGTG GCTCAACTGT ACTGGTAAAA TAGAGACACC TTCAAGAGAT TTGGCTCATG ACTTACAAGT  TATATAAGCT AATATTGCTA ACTTTGTGGT TCAATACAGA GCGGTGGACC ATCATGGGAG CTTCCACTAG GGAGAAGAGA CTCGAGAACA GCTAGCCTCA ACGGCGCAAA CACGAACATT  CCTGCACCAA ACTCAACTAT TCAGAACCTC TTAACCATGT TCCAACGCAA AGGTTTAAAC GAAGAAGACC TTGTTTCCCT ATCAGGTAAG CTTAATAACA TGTATTATTC TTGTTATACA  AGTTATCATG GAAACCTAAC CGTACCGAAC TGAATAAAAC CAAAATTTTT ATAGGAGGGC ATACGATTGG AGTAGCGAGA TGCACAACAT TCAAACAAAG ACTATACAAC CAAAACGGTA  ATAACCAACC AGACGAGACA CTAGAAAGAT CATACTACTA TGGACTAAGA TCAATTTGTC CACCAACGGG AGGGGACAAC AACATATCAC CACTAGACTT AGCCTCTCCT GCTAGATTCG  ACAACACATA CTTCAAACTC CTTCTTTGGG GCAAAGGCTT ATTGACATCA GATGAAGTGC TTATCACTGG TAATGTAGAC AAGACTGTTG CATTGGTGAA AGCTTATGCT GAAGATGAGA 
GCCTTTTCTT CCGACAGTTC GCAAAGTCTA TGGTTAATAT GGGGAATATA CAGCCTCTTA CTGGTTTTAA TGGTGAGATT AGAAAGAGTT GTCATGTGAT TAACTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTATCT CAATGCTTGT TCCTGGTCTT GTGCTCTTTG CTATGTTCTC TTTTGATATT GTTGTTGCTC ATCCAGGTCT AGGATTTGGA TGGAGAAGTA ATCGTCCCGT CGGAAGGACT  TTTTCCTCGA GTCTTTACCC ACAGTTTTAC CAGTTCTCTT GCCCACAAGC TGATGAGATT GTTATGACTG TGTTGGAAAA AGCCATAGCT AGAGAGCCAA GAATGGCTGC TTCTTTACTC  AGGCTTCACT TCCACGACTG CTTTGTCCAG GGATGTGATG CATCAATCTT GTTGGATGAT AGTGCTACCA TACAAAGTGA AAAGAACGCA GGACCAAACA AGAACTCCAT TAGAGGGTTT  CAAGTCATAG ATGAGATCAA AGCTAAACTG GAACAAGCTT GTCCTCAAGT CGTGTCCTGT GCTGACATTC TTGCTCTTGC TGCTCGTGGC TCAACTGTAC TGAGCGGTGG ACCATCATGG  GAGCTTCCAC TAGGGAGAAG AGACTCGAGA ACAGCTAGCC TCAACGGCGC AAACACGAAC ATTCCTGCAC CAAACTCAAC TATTCAGAAC CTCTTAACCA TGTTCCAACG CAAAGGTTTA  AACGAAGAAG ACCTTGTTTC CCTATCAGGA GGGCATACGA TTGGAGTAGC GAGATGCACA ACATTCAAAC AAAGACTATA CAACCAAAAC GGTAATAACC AACCAGACGA GACACTAGAA  AGATCATACT ACTATGGACT AAGATCAATT TGTCCACCAA CGGGAGGGGA CAACAACATA TCACCACTAG ACTTAGCCTC TCCTGCTAGA TTCGACAACA CATACTTCAA ACTCCTTCTT  TGGGGCAAAG GCTTATTGAC ATCAGATGAA GTGCTTATCA CTGGTAATGT AGACAAGACT GTTGCATTGG TGAAAGCTTA TGCTGAAGAT GAGAGCCTTT TCTTCCGACA GTTCGCAAAG 
TCTATGGTTA ATATGGGGAA TATACAGCCT CTTACTGGTT TTAATGGTGA GATTAGAAAG AGTTGTCATG TGATTAACTA A 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTATCT CAATGCTTGT TCCTGGTCTT GTGCTCTTTG CTATGTTCTC TTTTGATATT GTTGTTGCTC ATCCAGGTCT AGGATTTGGA TGGAGAAGTA ATCGTCCCGT CGGAAGGACT  TTTTCCTCGA GTCTTTACCC ACAGTTTTAC CAGTTCTCTT GCCCACAAGC TGATGAGATT GTTATGACTG TGTTGGAAAA AGCCATAGCT AGAGAGCCAA GAATGGCTGC TTCTTTACTC  AGGCTTCACT TCCACGACTG CTTTGTCCAG GGATGTGATG CATCAATCTT GTTGGATGAT AGTGCTACCA TACAAAGTGA AAAGAACGCA GGACCAAACA AGAACTCCAT TAGAGGGTTT  CAAGTCATAG ATGAGATCAA AGCTAAACTG GAACAAGCTT GTCCTCAAGT CGTGTCCTGT GCTGACATTC TTGCTCTTGC TGCTCGTGGC TCAACTGTAC TGAGCGGTGG ACCATCATGG  GAGCTTCCAC TAGGGAGAAG AGACTCGAGA ACAGCTAGCC TCAACGGCGC AAACACGAAC ATTCCTGCAC CAAACTCAAC TATTCAGAAC CTCTTAACCA TGTTCCAACG CAAAGGTTTA  AACGAAGAAG ACCTTGTTTC CCTATCAGGA GGGCATACGA TTGGAGTAGC GAGATGCACA ACATTCAAAC AAAGACTATA CAACCAAAAC GGTAATAACC AACCAGACGA GACACTAGAA  AGATCATACT ACTATGGACT AAGATCAATT TGTCCACCAA CGGGAGGGGA CAACAACATA TCACCACTAG ACTTAGCCTC TCCTGCTAGA TTCGACAACA CATACTTCAA ACTCCTTCTT  TGGGGCAAAG GCTTATTGAC ATCAGATGAA GTGCTTATCA CTGGTAATGT AGACAAGACT GTTGCATTGG TGAAAGCTTA TGCTGAAGAT GAGAGCCTTT TCTTCCGACA GTTCGCAAAG 
TCTATGGTTA ATATGGGGAA TATACAGCCT CTTACTGGTT TTAATGGTGA GATTAGAAAG AGTTGTCATG TGATTAACTA A 

Retrieve as FASTA