Entry information : CrubPrx54Carubv10005237m.g
Entry ID 15054
Creation 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CrubPrx54Carubv10005237m.g
Name CrubPrx54Carubv10005237m.g
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx026]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella rubella    [TaxId: 81985 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CrubPrx54
start..stop
S start..stop
CagraPrx66 671 0 1..325 1..325
AtPrx47 650 0 1..325 1..325
AlyPrx47 648 0 1..325 1..325
BstrPrx62 645 0 1..325 1..325
Literature and cross-references CrubPrx54Carubv10005237m.g
Protein sequence: CrubPrx54Carubv10005237m.g
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   325
PWM (Da):   %s   36053.96 Transmb domain:   %s   i12-34o
PI (pH):   %s   7.98
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MLTRVKIDNN KMIRANIVSV VLLMHAIVGF PFHARGLSMT YYMMNCPFAE QIVKNSVNNA LRADPTLAAG LIRMLFHDCF IEGCDASILL DSTKDNTAEK DSPANLSLRG YEIIDDAKEK  IEDRCPGVVS CADIIAMAAR DAVFWAGGPY YDIPKGRFDG KRSKIEDTRN LPSPFLNASE LIQTFGQRGF TPQDIVALSG AHTLGVARCS SFKARLTVPD SSMDSTFANT LSKTCSAGDN 
AEQPFDATRN DFDNAYFNAL QRKSGVLFSD QTLFNTPRTR NLVNGYALNQ ARFFFDFQQA MRKMSNLDVK LGSQGEIRQN CRIIN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GCGATATATA CAGAGTGAAG CTGCTTAGTT AATTAAACTG ATTATCATGT TGACAAGAGT TAAGATAGAC AATAATAAGA TGATTAGGGC AAATATAGTG AGCGTGGTTC TGTTGATGCA  TGCCATTGTT GGGTTTCCTT TTCATGCGAG AGGCTTAAGT ATGACTTACT ACATGATGAA CTGTCCTTTC GCCGAACAGA TCGTGAAGAA CAGTGTTAAC AATGCTCTTC GAGCCGATCC  GACTTTAGCC GCAGGTCTTA TCCGTATGTT GTTCCACGAC TGTTTCATTG AGGTAACATT TTCTCTATCA ATATTCTCAT TTCATTAGTC GTGTTGTTTT ACGTAAGAAA ACTCATTACA  GAACTTAAGC TGTTTTTTTT TCCTGTTTAT AAGGGATGTG ACGCGTCTAT CCTGCTAGAT TCAACAAAAG ACAACACCGC TGAAAAGGAT TCGCCTGCGA ACCTGAGTCT ACGTGGCTAC  GAGATCATAG ATGATGCAAA AGAGAAAATC GAGGATAGAT GTCCAGGAGT TGTTTCTTGC GCAGATATTA TTGCCATGGC TGCTAGAGAT GCTGTCTTTT GGGTAACCAG ACTGATCAAT  ATTTTTAACC CTTGAATATA CTAACTATAT GATTAATTTG TGTACTTAAT CTAATGATCA GTAATTGGAA TTGTTAGGCT GGTGGTCCAT ATTATGACAT ACCAAAAGGA AGATTTGATG  GTAAAAGATC GAAGATAGAA GATACAAGAA ACCTACCTTC ACCTTTTCTT AATGCCTCTG AACTCATTCA AACTTTTGGG CAACGTGGCT TCACTCCACA AGACATTGTC GCTCTCTCTG  GTGAGTTCTT TATTGTTTTA TTATTACTTT CAGAGTTATT ATATATTAAA TATATTGTGG AATATATATA GGAGCACATA CCCTAGGAGT TGCAAGATGC TCCTCCTTCA AGGCTAGACT  TACGGTCCCA GACTCTTCAA TGGACTCGAC TTTTGCAAAT ACTCTTTCCA AAACTTGCAG TGCGGGTGAC AACGCAGAGC AACCCTTTGA TGCGACTCGC AACGATTTCG ACAATGCTTA  CTTCAACGCA CTTCAGAGGA AATCAGGAGT CCTGTTTTCA GACCAAACCT TATTTAACAC CCCAAGGACC AGGAATCTCG TTAATGGATA TGCCCTTAAC CAAGCCAGGT TCTTCTTTGA  TTTCCAACAG GCCATGCGCA AAATGAGCAA TCTTGATGTT AAGCTTGGCT CTCAAGGTGA AATCCGTCAA AATTGTCGGA TCATTAACTA GTCTAGCCAT ATCTAGCTAT GATTTATGTA  TTCATGCTAC TTTTAATTAT ATCTACTCTA TCATATATTT GGAATCACGA ATCTCCTGTA TGCTCCCATG TAAAATCCGT GTACCTTAAT ATGCAGTTGT ATACCTATTG ATGAATTGTG 
GGTTTTAGAT ATCCATCAAA ACATAATACG TACTTGGATA TCTTGTATTT AATTTTGGTT CATAAAGCTT TT 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTTGACAA GAGTTAAGAT AGACAATAAT AAGATGATTA GGGCAAATAT AGTGAGCGTG GTTCTGTTGA TGCATGCCAT TGTTGGGTTT CCTTTTCATG CGAGAGGCTT AAGTATGACT  TACTACATGA TGAACTGTCC TTTCGCCGAA CAGATCGTGA AGAACAGTGT TAACAATGCT CTTCGAGCCG ATCCGACTTT AGCCGCAGGT CTTATCCGTA TGTTGTTCCA CGACTGTTTC  ATTGAGGGAT GTGACGCGTC TATCCTGCTA GATTCAACAA AAGACAACAC CGCTGAAAAG GATTCGCCTG CGAACCTGAG TCTACGTGGC TACGAGATCA TAGATGATGC AAAAGAGAAA  ATCGAGGATA GATGTCCAGG AGTTGTTTCT TGCGCAGATA TTATTGCCAT GGCTGCTAGA GATGCTGTCT TTTGGGCTGG TGGTCCATAT TATGACATAC CAAAAGGAAG ATTTGATGGT  AAAAGATCGA AGATAGAAGA TACAAGAAAC CTACCTTCAC CTTTTCTTAA TGCCTCTGAA CTCATTCAAA CTTTTGGGCA ACGTGGCTTC ACTCCACAAG ACATTGTCGC TCTCTCTGGA  GCACATACCC TAGGAGTTGC AAGATGCTCC TCCTTCAAGG CTAGACTTAC GGTCCCAGAC TCTTCAATGG ACTCGACTTT TGCAAATACT CTTTCCAAAA CTTGCAGTGC GGGTGACAAC  GCAGAGCAAC CCTTTGATGC GACTCGCAAC GATTTCGACA ATGCTTACTT CAACGCACTT CAGAGGAAAT CAGGAGTCCT GTTTTCAGAC CAAACCTTAT TTAACACCCC AAGGACCAGG  AATCTCGTTA ATGGATATGC CCTTAACCAA GCCAGGTTCT TCTTTGATTT CCAACAGGCC ATGCGCAAAA TGAGCAATCT TGATGTTAAG CTTGGCTCTC AAGGTGAAAT CCGTCAAAAT 
TGTCGGATCA TTAACTAG 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GCGATATATA CAGAGTGAAG CTGCTTAGTT AATTAAACTG ATTATCATGT TGACAAGAGT TAAGATAGAC AATAATAAGA TGATTAGGGC AAATATAGTG AGCGTGGTTC TGTTGATGCA  TGCCATTGTT GGGTTTCCTT TTCATGCGAG AGGCTTAAGT ATGACTTACT ACATGATGAA CTGTCCTTTC GCCGAACAGA TCGTGAAGAA CAGTGTTAAC AATGCTCTTC GAGCCGATCC  GACTTTAGCC GCAGGTCTTA TCCGTATGTT GTTCCACGAC TGTTTCATTG AGGGATGTGA CGCGTCTATC CTGCTAGATT CAACAAAAGA CAACACCGCT GAAAAGGATT CGCCTGCGAA  CCTGAGTCTA CGTGGCTACG AGATCATAGA TGATGCAAAA GAGAAAATCG AGGATAGATG TCCAGGAGTT GTTTCTTGCG CAGATATTAT TGCCATGGCT GCTAGAGATG CTGTCTTTTG  GGCTGGTGGT CCATATTATG ACATACCAAA AGGAAGATTT GATGGTAAAA GATCGAAGAT AGAAGATACA AGAAACCTAC CTTCACCTTT TCTTAATGCC TCTGAACTCA TTCAAACTTT  TGGGCAACGT GGCTTCACTC CACAAGACAT TGTCGCTCTC TCTGGAGCAC ATACCCTAGG AGTTGCAAGA TGCTCCTCCT TCAAGGCTAG ACTTACGGTC CCAGACTCTT CAATGGACTC  GACTTTTGCA AATACTCTTT CCAAAACTTG CAGTGCGGGT GACAACGCAG AGCAACCCTT TGATGCGACT CGCAACGATT TCGACAATGC TTACTTCAAC GCACTTCAGA GGAAATCAGG  AGTCCTGTTT TCAGACCAAA CCTTATTTAA CACCCCAAGG ACCAGGAATC TCGTTAATGG ATATGCCCTT AACCAAGCCA GGTTCTTCTT TGATTTCCAA CAGGCCATGC GCAAAATGAG  CAATCTTGAT GTTAAGCTTG GCTCTCAAGG TGAAATCCGT CAAAATTGTC GGATCATTAA CTAGTCTAGC CATATCTAGC TATGATTTAT GTATTCATGC TACTTTTAAT TATATCTACT  CTATCATATA TTTGGAATCA CGAATCTCCT GTATGCTCCC ATGTAAAATC CGTGTACCTT AATATGCAGT TGTATACCTA TTGATGAATT GTGGGTTTTA GATATCCATC AAAACATAAT 
ACGTACTTGG ATATCTTGTA TTTAATTTTG GTTCATAAAG CTTTT 

Retrieve as FASTA