Entry information : CrubPrx56Carubv10019462m.g
Entry ID 15056
Creation 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CrubPrx56Carubv10019462m.g
Name CrubPrx56Carubv10019462m.g
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx035]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella rubella    [TaxId: 81985 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CrubPrx56
start..stop
S start..stop
BstrPrx03 631 0 1..353 1..353
AlyPrx34-2 623 0 15..353 17..355
AhalPrx51 622 0 15..353 17..355
AtPrx34 619 0 1..353 1..353
Literature and cross-references CrubPrx56Carubv10019462m.g
Protein sequence: CrubPrx56Carubv10019462m.g
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   353 (323)
PWM (Da):   %s   39060.66 (35590.9)  
PI (pH):   %s   7.34 (6.98) Peptide Signal:   %s   cut: 31 range:31-353
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MKFSASSPLF AWKILITLSC FILYASFSDA QLTHTFYDNS CPNVTNIVRD TIVNELRSDP RIAASILRLH FHDCFVNGCD ASILLDNSTS FRTEKEALPN ANSARGFPVI DRMKAAIERA  CPRTVSCADM LTIAAQQSVS LAGGPSWKVP LGRRDSLQAF FQLANDNLPA PNFTLPLLKD KFRNVGLDRP SDLVALSGGH TFGKNQCQFI TNRLYNFNST GLPDPTLNAT YLQTLRGLCP 
PNGNQSALVD FDLRTPTVFD NKYYMNLGER KGLLQTDQEL FSSPNATDTI PLVRSYANST ETFFSAFVEA MNRMGNITLL TGTQGQIRLN CRVVNPNSLL HDVVEIIDFV SSM* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGTTCT CTGCTTCTTC TCCTTTGTTC GCTTGGAAAA TCTTAATCAC ATTGTCATGT TTTATACTAT ATGCTTCTTT TTCCGATGCT CAGCTTACCC ATACCTTCTA CGACAATTCA  TGTCCTAATG TTACGAACAT CGTACGAGAT ACCATTGTCA ATGAGTTAAG GTCAGATCCT CGTATCGCTG CAAGCATCCT TCGTCTTCAC TTCCACGACT GCTTTGTAAA TGTAAGATAT  TACTTTTTCT CATATGTATC ATATTACTGA TGATGTTTCC ATGTTTATTT ACTCATATTA TATCTTTTGA TTCTTTTCTA TGATCAACAT TTGAATTTTA TATAAAGCCA TTTTAATGTG  ATTATATATA AACATTTCGA TATCATAGTA TTTTGGTTTA TTCAAGATCA TTTATCTTGA TTGAGTAAAA TATGGGTTTT ATATATGAAT TACAAAAAGA AAAAAATCAA CGTACATCGT  TAGTAGAACT GGTGGTAAAG ATTCATTAAC TATTGTACAC TGACTAACAA TATGGCAAAT GCTATTTTGG ACTTTTGAAA GGGTTGTGAT GCATCGATCT TGCTAGACAA CTCAACATCA  TTCCGAACAG AGAAAGAGGC GCTTCCAAAC GCAAATTCTG CTAGGGGATT TCCAGTAATC GATAGAATGA AAGCCGCGAT AGAGAGGGCT TGCCCGAGAA CCGTTTCATG CGCTGATATG  CTCACCATCG CGGCTCAACA ATCTGTTTCT TTGGTATATA CAATGCTCAA CTTATCATTA ATTCTTTTAT TCATTACTGT TTACAATAAT GATATAGTCA CTTAACAAAT TAAGTGAAAT  ATATGAATGA TATCATAGGC GGGAGGTCCT TCTTGGAAAG TTCCATTGGG GAGAAGAGAC AGTTTACAAG CATTTTTTCA ACTCGCTAAT GATAATCTTC CAGCTCCAAA CTTCACACTT  CCACTACTTA AAGATAAATT TAGAAATGTT GGCCTTGACC GTCCTTCTGA TCTCGTTGCT CTCTCCGGTA ATTAATAGAA GGATATTACA CACCATTTGA TATGTAGTTT GTAATCAGCT  GAGTTTTGTT ACTAAATTGA TCTTATGGTT TCTCTTTTTG TTAGGTGGCC ATACATTTGG TAAAAACCAG TGCCAGTTTA TTACGAACAG ACTATACAAC TTTAACAGTA CCGGTCTACC  CGATCCTACT CTCAACGCTA CTTACCTCCA AACTCTTCGT GGATTGTGTC CTCCTAATGG TAACCAAAGT GCCTTGGTGG ATTTTGATCT GCGTACACCT ACGGTTTTCG ACAACAAATA  CTACATGAAT CTTGGTGAGC GAAAAGGTCT TCTCCAAACC GATCAAGAGT TGTTCTCTAG CCCCAATGCC ACGGACACAA TCCCTTTGGT GAGATCATAT GCTAATAGCA CAGAAACCTT  CTTCAGTGCG TTTGTGGAGG CCATGAACAG GATGGGAAAT ATCACACTTC TAACTGGAAC TCAAGGACAA ATCAGGTTGA ATTGTAGGGT GGTGAATCCC AACTCTCTAC TCCATGATGT 
GGTTGAAATT ATTGACTTTG TTAGCTCTAT GTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGTTCT CTGCTTCTTC TCCTTTGTTC GCTTGGAAAA TCTTAATCAC ATTGTCATGT TTTATACTAT ATGCTTCTTT TTCCGATGCT CAGCTTACCC ATACCTTCTA CGACAATTCA  TGTCCTAATG TTACGAACAT CGTACGAGAT ACCATTGTCA ATGAGTTAAG GTCAGATCCT CGTATCGCTG CAAGCATCCT TCGTCTTCAC TTCCACGACT GCTTTGTAAA TGGTTGTGAT  GCATCGATCT TGCTAGACAA CTCAACATCA TTCCGAACAG AGAAAGAGGC GCTTCCAAAC GCAAATTCTG CTAGGGGATT TCCAGTAATC GATAGAATGA AAGCCGCGAT AGAGAGGGCT  TGCCCGAGAA CCGTTTCATG CGCTGATATG CTCACCATCG CGGCTCAACA ATCTGTTTCT TTGGCGGGAG GTCCTTCTTG GAAAGTTCCA TTGGGGAGAA GAGACAGTTT ACAAGCATTT  TTTCAACTCG CTAATGATAA TCTTCCAGCT CCAAACTTCA CACTTCCACT ACTTAAAGAT AAATTTAGAA ATGTTGGCCT TGACCGTCCT TCTGATCTCG TTGCTCTCTC CGGTGGCCAT  ACATTTGGTA AAAACCAGTG CCAGTTTATT ACGAACAGAC TATACAACTT TAACAGTACC GGTCTACCCG ATCCTACTCT CAACGCTACT TACCTCCAAA CTCTTCGTGG ATTGTGTCCT  CCTAATGGTA ACCAAAGTGC CTTGGTGGAT TTTGATCTGC GTACACCTAC GGTTTTCGAC AACAAATACT ACATGAATCT TGGTGAGCGA AAAGGTCTTC TCCAAACCGA TCAAGAGTTG  TTCTCTAGCC CCAATGCCAC GGACACAATC CCTTTGGTGA GATCATATGC TAATAGCACA GAAACCTTCT TCAGTGCGTT TGTGGAGGCC ATGAACAGGA TGGGAAATAT CACACTTCTA 
ACTGGAACTC AAGGACAAAT CAGGTTGAAT TGTAGGGTGG TGAATCCCAA CTCTCTACTC CATGATGTGG TTGAAATTAT TGACTTTGTT AGCTCTATGT GA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGTTCT CTGCTTCTTC TCCTTTGTTC GCTTGGAAAA TCTTAATCAC ATTGTCATGT TTTATACTAT ATGCTTCTTT TTCCGATGCT CAGCTTACCC ATACCTTCTA CGACAATTCA  TGTCCTAATG TTACGAACAT CGTACGAGAT ACCATTGTCA ATGAGTTAAG GTCAGATCCT CGTATCGCTG CAAGCATCCT TCGTCTTCAC TTCCACGACT GCTTTGTAAA TGGTTGTGAT  GCATCGATCT TGCTAGACAA CTCAACATCA TTCCGAACAG AGAAAGAGGC GCTTCCAAAC GCAAATTCTG CTAGGGGATT TCCAGTAATC GATAGAATGA AAGCCGCGAT AGAGAGGGCT  TGCCCGAGAA CCGTTTCATG CGCTGATATG CTCACCATCG CGGCTCAACA ATCTGTTTCT TTGGCGGGAG GTCCTTCTTG GAAAGTTCCA TTGGGGAGAA GAGACAGTTT ACAAGCATTT  TTTCAACTCG CTAATGATAA TCTTCCAGCT CCAAACTTCA CACTTCCACT ACTTAAAGAT AAATTTAGAA ATGTTGGCCT TGACCGTCCT TCTGATCTCG TTGCTCTCTC CGGTGGCCAT  ACATTTGGTA AAAACCAGTG CCAGTTTATT ACGAACAGAC TATACAACTT TAACAGTACC GGTCTACCCG ATCCTACTCT CAACGCTACT TACCTCCAAA CTCTTCGTGG ATTGTGTCCT  CCTAATGGTA ACCAAAGTGC CTTGGTGGAT TTTGATCTGC GTACACCTAC GGTTTTCGAC AACAAATACT ACATGAATCT TGGTGAGCGA AAAGGTCTTC TCCAAACCGA TCAAGAGTTG  TTCTCTAGCC CCAATGCCAC GGACACAATC CCTTTGGTGA GATCATATGC TAATAGCACA GAAACCTTCT TCAGTGCGTT TGTGGAGGCC ATGAACAGGA TGGGAAATAT CACACTTCTA 
ACTGGAACTC AAGGACAAAT CAGGTTGAAT TGTAGGGTGG TGAATCCCAA CTCTCTACTC CATGATGTGG TTGAAATTAT TGACTTTGTT AGCTCTATGT GA 

Retrieve as FASTA