Entry information : CrubAPx06 (Carubv10020327m.g)
Entry ID 15060
Creation 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CrubAPx06 (Carubv10020327m.g)
Name (synonym) CrubAPx06 (Carubv10020327m.g)
Class Ascorbate peroxidase     [Orthogroup: APx002]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella rubella    [TaxId: 81985 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CrubAPx06
start..stop
S start..stop
CagraAPx06 877 0 1..430 1..430
AtAPx06 759 0 1..430 1..426
AlyAPx06 757 0 1..430 1..429
AhalAPx08 748 0 1..430 1..424
Literature and cross-references CrubAPx06 (Carubv10020327m.g)
Protein sequence: CrubAPx06 (Carubv10020327m.g)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   430
PWM (Da):   %s   46556.73 Transmb domain:   %s   o400-422i
PI (pH):   %s   7.98
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAVSLSAASH LLCSSTRVSL SPAVASSSSS TSAPLVSSTS SPHSLSSLRS VASTSLFPHS SLVQKKYPNY GRSKGMVSPK CAASDAAQLK SAKEDIKVLL RTNFCHPILV RLGWHDAGTY  NKNIEEWPQR GGANGSLRFE PELKHAANAG LISALKLIQP IKDKYPNISY ADLFQLASAT AVEEAGGPDI PMKYGRVDVV APEQCPEEGR LPDAGPPSPA DHLRDVFYRM GLNDKEIVAL  SGAHTLGRAR PDRSGWGKPE TKYTKTGPGE PGGQSWTVKW LKFDNSYFKD IKEKRDEDLL VLPTDAALFE DPSFKNYAEK YAEDPAAFFK DYAEAHAKLS NIGAKFDPPE GIIIDNAPEK 
FVAAKYSNEK KELSDSMKKK IRAEYEAIGG SPDKPLPTNY FLNIIIAIGV LVLLSTLFGG GNNNSDFSGF * 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTGTTT CTCTCTCCGC CGCATCTCAC TTACTCTGTT CATCCACCAG AGTCTCTCTT TCCCCCGCCG TCGCCTCCTC CTCTTCGTCC ACCTCAGCTC CTCTCGTTTC CTCTACGTCG  TCGCCACATT CTCTCTCTTC TCTTCGAAGC GTCGCATCTA CTTCTCTGTT TCCTCATTCC TCCCTCGTTC AGGTACCGTA GTTTGATCGG AAATCATACT TTTTGGAAAT TTTGTTTTGA  ATTTCCTATA ACTTCTGTTT GATTGGTTAG AAAAAGTATC CGAATTATGG GAGGAGCAAG GGGATGGTCT CACCAAAATG TGCCGCTTCT GATGCAGCTC AATTGAAAAG CGCTAAAGAA  GACATCAAAG TTCTCCTCCG GACTAATTTT TGCCATCCCA TTTTGGTGAA GTATCCTTCT CTCTTCTGAT CTTTTTTTAT TTGATGAGTT TTCAGCTGGA TCATGTTTCA AGTGACTTTT  TGTTAGTCTG TTGTTGTTTG CTTTTTACTA GCGAGAGATA TTGGAGAAGA GAAAATTGAA TTTGTGTTTC TAATTTGCAT TGTGCTTGAC AATAGTTGCA TGTTTCATTG CAGGTTAGAC  TGGGGTGGCA CGATGCTGGT ACATACAACA AAAACATTGA GGAGTGGCCA CAGAGAGGTG GAGCTAATGG AAGTCTTAGA TTTGAGCCTG AGCTTAAACA TGCTGCAAAT GCTGGTACTG  CTTCCATCAC AATTCACATG CACTGTGGCT CTAAAACCTT TTTTTTTTGT CTCTTCATAT TCTACTTTTG ACATTTACAG GTCTCATTAG TGCGTTAAAG CTCATTCAAC CTATCAAAGA  CAAGTATCCT AACATCTCTT ACGCCGACTT ATTCCAGTTA GCTAGTGCCA CTGCAGTAGA GGTCTTCCTT CTCTATTCCT TTGATTGGCC AAGCAGGAAG GAAACTATGT TGACCTTCAA  ACTTTTTTGA TAACTCTGGA TTTTAACTTC AGGAGGCTGG TGGTCCTGAT ATCCCGATGA AATATGGGAG AGTTGATGTC GTAGCACCTG AGCAGTGTCC AGAAGAAGGA AGACTCCCTG  GTTAACTAAT CTTCCCATTG TCTGTTTCAC GGCTTCCATG AGTTTGTTTC AGATTTTCAT TTGGACTATT GAACTAATGA GATGAAATAT GTTTACGTTT AGATGCTGGA CCTCCTTCAC  CAGCTGATCA TTTGAGAGAT GTATTTTACA GGATGGGACT GAATGACAAG GTGACTTCTG AATTTTTTCC ATTTTCTGTA TTCTTGTCAA CGTGAATATT CTCATTGGTT GTTTTATCAA  GCAGGAAATA GTTGCCTTGT CTGGTGCACA TACTTTAGGA AGAGCCAGAC CAGACCGTAG CGGTTGGGGA AAACCTGAGA CAAAGTACAC GGTATAATAA ATGACAAAAT GAAACTTCAT  TATATTGTTC TTGCAATTAT AGCGTAGAGA TGTTATGGAA ACGTTCAACA TGGCAGAAAA CTGGACCAGG AGAACCAGGA GGACAGTCAT GGACAGTGAA ATGGCTTAAG TTTGACAACT  CTTACTTCAA GGTCTACCTC TCTATCTGTC TTAGTAACTT TGGATTGGGA CTTAAGAAGA CTTTTCTAAG GAGATGAGAT ATGTGAATAC GATCCCCAGT TTCTTAATCA ATGACTTCTA  TGAATAGCAG GATATCAAAG AAAAGAGGGA CGAAGATCTT CTGGTGTTAC CCACTGATGC TGCACTTTTT GAAGATCCTT CTTTCAAGGT TTGCAAACAA TGATGAGTAA TAAGATGCCG  CAGAAATAGT AGTAGTTCGT TGTTACTTAA GGTTTTAAAA CAACTTCTAT TTACAGAACT ATGCAGAGAA GTATGCTGAA GATCCGGCTG CATTTTTCAA GGATTACGCT GAAGCTCACG  CCAAGCTCAG CAATATTGGG GCAAAATTTG ACCCTCCTGA GGTACATAAA CAAAGAGAGA GAAATTCTAA TCTTATGTTA GCGAACATGA ACCATGCATT TACATCCAGT TCAGTGACTT  AACTATATAG TCTTAAATCT GTCCCTACGA TACTAATCAG GGCATCATCA TTGACAACGC TCCGGAGAAG TTTGTAGCTG CTAAGTATTC CAATGAAAAG GTTTGTTCTT ACTACTTAAC  CCAAATGTGT TTGTAGCTTA TTGTAATATA TACGCTTTAC TTGTTTTTAA CTTTTCCGGG GAATATATAT GCAGAAGGAG CTTTCGGACT CAATGAAGAA GAAGATAAGA GCAGAGTATG  AAGCAATAGG AGGAAGCCCA GATAAGCCAC TACCAACGAA TTACTTCCTC AACATCATAA TTGCCATTGG CGTTTTGGTC CTTTTGTCCA CTCTCTTTGG TGGTGGTAAT AACAACTCCG  ATTTCTCTGG TTTCTAATTG AAAGATGGAT ATATTTTGAT TACTTGGTGT TCATATACTC TTTGCAACAA ACATCATTGG CATAGTTATG CTTTGATAAA GTCACCTTTA ATAAGTGGTT  TTAGATTTGA GATCAGTGTG AGCTTTTGAT CAAATACTAT ATACTAGTAT AAAGTGTGTA CCGAATCACT ACGGCTATGC CTTTGCACGA ATATTTTTCG AACATTAAAA TAAGGCTTGC 
ATAGTTGC 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTGTTT CTCTCTCCGC CGCATCTCAC TTACTCTGTT CATCCACCAG AGTCTCTCTT TCCCCCGCCG TCGCCTCCTC CTCTTCGTCC ACCTCAGCTC CTCTCGTTTC CTCTACGTCG  TCGCCACATT CTCTCTCTTC TCTTCGAAGC GTCGCATCTA CTTCTCTGTT TCCTCATTCC TCCCTCGTTC AGAAAAAGTA TCCGAATTAT GGGAGGAGCA AGGGGATGGT CTCACCAAAA  TGTGCCGCTT CTGATGCAGC TCAATTGAAA AGCGCTAAAG AAGACATCAA AGTTCTCCTC CGGACTAATT TTTGCCATCC CATTTTGGTT AGACTGGGGT GGCACGATGC TGGTACATAC  AACAAAAACA TTGAGGAGTG GCCACAGAGA GGTGGAGCTA ATGGAAGTCT TAGATTTGAG CCTGAGCTTA AACATGCTGC AAATGCTGGT CTCATTAGTG CGTTAAAGCT CATTCAACCT  ATCAAAGACA AGTATCCTAA CATCTCTTAC GCCGACTTAT TCCAGTTAGC TAGTGCCACT GCAGTAGAGG AGGCTGGTGG TCCTGATATC CCGATGAAAT ATGGGAGAGT TGATGTCGTA  GCACCTGAGC AGTGTCCAGA AGAAGGAAGA CTCCCTGATG CTGGACCTCC TTCACCAGCT GATCATTTGA GAGATGTATT TTACAGGATG GGACTGAATG ACAAGGAAAT AGTTGCCTTG  TCTGGTGCAC ATACTTTAGG AAGAGCCAGA CCAGACCGTA GCGGTTGGGG AAAACCTGAG ACAAAGTACA CGAAAACTGG ACCAGGAGAA CCAGGAGGAC AGTCATGGAC AGTGAAATGG  CTTAAGTTTG ACAACTCTTA CTTCAAGGAT ATCAAAGAAA AGAGGGACGA AGATCTTCTG GTGTTACCCA CTGATGCTGC ACTTTTTGAA GATCCTTCTT TCAAGAACTA TGCAGAGAAG  TATGCTGAAG ATCCGGCTGC ATTTTTCAAG GATTACGCTG AAGCTCACGC CAAGCTCAGC AATATTGGGG CAAAATTTGA CCCTCCTGAG GGCATCATCA TTGACAACGC TCCGGAGAAG  TTTGTAGCTG CTAAGTATTC CAATGAAAAG AAGGAGCTTT CGGACTCAAT GAAGAAGAAG ATAAGAGCAG AGTATGAAGC AATAGGAGGA AGCCCAGATA AGCCACTACC AACGAATTAC 
TTCCTCAACA TCATAATTGC CATTGGCGTT TTGGTCCTTT TGTCCACTCT CTTTGGTGGT GGTAATAACA ACTCCGATTT CTCTGGTTTC TAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTGTTT CTCTCTCCGC CGCATCTCAC TTACTCTGTT CATCCACCAG AGTCTCTCTT TCCCCCGCCG TCGCCTCCTC CTCTTCGTCC ACCTCAGCTC CTCTCGTTTC CTCTACGTCG  TCGCCACATT CTCTCTCTTC TCTTCGAAGC GTCGCATCTA CTTCTCTGTT TCCTCATTCC TCCCTCGTTC AGAAAAAGTA TCCGAATTAT GGGAGGAGCA AGGGGATGGT CTCACCAAAA  TGTGCCGCTT CTGATGCAGC TCAATTGAAA AGCGCTAAAG AAGACATCAA AGTTCTCCTC CGGACTAATT TTTGCCATCC CATTTTGGTT AGACTGGGGT GGCACGATGC TGGTACATAC  AACAAAAACA TTGAGGAGTG GCCACAGAGA GGTGGAGCTA ATGGAAGTCT TAGATTTGAG CCTGAGCTTA AACATGCTGC AAATGCTGGT CTCATTAGTG CGTTAAAGCT CATTCAACCT  ATCAAAGACA AGTATCCTAA CATCTCTTAC GCCGACTTAT TCCAGTTAGC TAGTGCCACT GCAGTAGAGG AGGCTGGTGG TCCTGATATC CCGATGAAAT ATGGGAGAGT TGATGTCGTA  GCACCTGAGC AGTGTCCAGA AGAAGGAAGA CTCCCTGATG CTGGACCTCC TTCACCAGCT GATCATTTGA GAGATGTATT TTACAGGATG GGACTGAATG ACAAGGAAAT AGTTGCCTTG  TCTGGTGCAC ATACTTTAGG AAGAGCCAGA CCAGACCGTA GCGGTTGGGG AAAACCTGAG ACAAAGTACA CGAAAACTGG ACCAGGAGAA CCAGGAGGAC AGTCATGGAC AGTGAAATGG  CTTAAGTTTG ACAACTCTTA CTTCAAGGAT ATCAAAGAAA AGAGGGACGA AGATCTTCTG GTGTTACCCA CTGATGCTGC ACTTTTTGAA GATCCTTCTT TCAAGAACTA TGCAGAGAAG  TATGCTGAAG ATCCGGCTGC ATTTTTCAAG GATTACGCTG AAGCTCACGC CAAGCTCAGC AATATTGGGG CAAAATTTGA CCCTCCTGAG GGCATCATCA TTGACAACGC TCCGGAGAAG  TTTGTAGCTG CTAAGTATTC CAATGAAAAG AAGGAGCTTT CGGACTCAAT GAAGAAGAAG ATAAGAGCAG AGTATGAAGC AATAGGAGGA AGCCCAGATA AGCCACTACC AACGAATTAC  TTCCTCAACA TCATAATTGC CATTGGCGTT TTGGTCCTTT TGTCCACTCT CTTTGGTGGT GGTAATAACA ACTCCGATTT CTCTGGTTTC TAATTGAAAG ATGGATATAT TTTGATTACT  TGGTGTTCAT ATACTCTTTG CAACAAACAT CATTGGCATA GTTATGCTTT GATAAAGTCA CCTTTAATAA GTGGTTTTAG ATTTGAGATC AGTGTGAGCT TTTGATCAAA TACTATATAC 
TAGTATAAAG TGTGTACCGA ATCACTACGG CTATGCCTTT GCACGAATAT TTTTCGAACA TTAAAATAAG GCTTGCATAG TTGC 

Retrieve as FASTA