Entry information : CrubPrx66Carubv10014176m.g
Entry ID 15066
Creation 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CrubPrx66Carubv10014176m.g
Name CrubPrx66Carubv10014176m.g
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx009]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella rubella    [TaxId: 81985 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CrubPrx66
start..stop
S start..stop
CagraPrx41 669 0 1..326 1..326
BstrPrx02 630 0 1..326 4..329
AlyPrx30 620 0 1..326 4..329
BrPrx30-1Ab_other 616 0 1..326 1..326
Literature and cross-references CrubPrx66Carubv10014176m.g
Protein sequence: CrubPrx66Carubv10014176m.g
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   326 (302)
PWM (Da):   %s   35416.08 (32945.7)  
PI (pH):   %s   9.75 (9.76) Peptide Signal:   %s   cut: 25 range:25-326
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MKPLNIAVAL AVTVLIGTFG SSEAQLQMNF YGKSCPNAEK IISDHIQKHI HHGPSLAAPL IRMHFHDCFV RGCDGSVLIN STSGNAEKDS APNLTLRGFG FVERIKTLLE AECPKTVSCA  DIIALTARDA VVATGGPSWR VPTGRRDGRI SNSTEAFNNI PPPTSNFTTL QRLFANQGLN LKDLVLLSGA HTIGVSHCSS MNTRLYNFST TVKQDPSLDT EYAANLKANK CKSLNDNTTI 
LEMDPGSRRS FDLSYYRLVL KRRGLFQSDA ALTTNSATLK MINDLVNGSE EKFYKAFAKS MEKMGRVKVK TGSSGVIRTR CSVAGS* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GATGAAGCCA TTGAATATTG CGGTTGCGCT TGCAGTGACG GTTCTTATTG GAACCTTTGG ATCATCGGAG GCTCAACTTC AAATGAACTT CTACGGGAAG AGCTGTCCAA ACGCAGAGAA  AATCATTTCA GATCATATTC AAAAGCATAT CCATCATGGT CCTTCTCTTG CAGCTCCTCT CATCAGAATG CACTTCCATG ATTGCTTCGT TAGGGTATGT ATTTATAATC TCTAAGACTT  TAACGCCCAC ATATATATAC TATACTTACT TGCATGTTGC AAGTGTTATG AATTATGAAC ATACTTACAT CTATATTCAT ATCCAAGTTA AATAGCTTAC TAAAAATGGT AAGCTACTCC  AGAAGATGTA TCATCATATT AAAATATATT TTCTCATATT AAGTAAATAG AAATGTAAAT TTGATAGTAA CTTTGAGCTA TAGCTTAATT GTTTTAGACT AATTGCATTA TTTTCTTCTA  TATATTGTTA CTGAGTCTGG AAAAAAAATA TAATGAAGGG ATGTGATGGA TCGGTGTTGA TAAATTCAAC ATCTGGGAAC GCAGAGAAAG ATTCAGCACC GAACCTAACA CTTAGAGGAT  TTGGTTTCGT AGAGAGGATC AAGACTCTTC TTGAAGCAGA GTGTCCTAAG ACTGTTTCTT GCGCTGATAT TATCGCTTTA ACCGCTAGAG ATGCAGTTGT CGCCACCGTA AGTGTCACAA  AAAATAAATA AGCAACACAA TTTGTTAATT AAGAAAAAAA TGTTAATATA ATCTTTTTTT TTTCTTAAAC AGGGAGGTCC TTCATGGAGA GTCCCAACGG GAAGAAGAGA CGGTAGGATC  TCAAACTCTA CGGAAGCTTT TAACAACATT CCACCGCCAA CAAGTAACTT CACGACGTTA CAGCGACTTT TCGCTAACCA AGGCCTTAAT CTCAAAGACC TTGTTCTGCT CTCCGGTAAC  TCAACATAGC AAGGATTAGT CAAGTCACGG CTCATGTAGT TTCTTTAACG AGTTTGACAT TTGTTTTGTG TTTTTTCAGG GGCTCATACG ATTGGTGTCT CGCATTGTTC TTCCATGAAC  ACTCGTCTCT ACAACTTCTC GACGACAGTG AAACAAGATC CATCTCTAGA TACCGAGTAC GCAGCTAACC TTAAGGCTAA CAAATGCAAG AGCCTTAACG ACAACACCAC CATCCTAGAG  ATGGATCCGG GGAGTAGGAG AAGCTTCGAT CTCAGTTATT ACAGGCTTGT CCTAAAGAGG AGAGGTTTGT TTCAATCTGA TGCTGCCTTG ACGACGAACT CAGCCACGTT GAAGATGATC  AACGACTTGG TCAACGGTTC TGAAGAGAAG TTTTACAAAG CCTTCGCTAA GTCGATGGAG AAGATGGGGA GAGTTAAAGT GAAGACTGGC TCATCAGGCG TGATCAGGAC ACGCTGTTCT  GTCGCCGGAA GCTAGTTTTA CATATACCAC ATCGGAAGAG TGGTGTGTGT TCTATTATTC ATTGTTGTTA ATTATCTTTA ACTTTTGGGG GATGTGTTAA CGTTGTTACT TTTATTTTGA 
TGTTGCGTTG AAATGTGTTT TATGCACCCA AGAATCATTC TAAATTTACA ATAATCCTCT CATTACTTTG TTTTCACAAT GAATAAAAC 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGCCAT TGAATATTGC GGTTGCGCTT GCAGTGACGG TTCTTATTGG AACCTTTGGA TCATCGGAGG CTCAACTTCA AATGAACTTC TACGGGAAGA GCTGTCCAAA CGCAGAGAAA  ATCATTTCAG ATCATATTCA AAAGCATATC CATCATGGTC CTTCTCTTGC AGCTCCTCTC ATCAGAATGC ACTTCCATGA TTGCTTCGTT AGGGGATGTG ATGGATCGGT GTTGATAAAT  TCAACATCTG GGAACGCAGA GAAAGATTCA GCACCGAACC TAACACTTAG AGGATTTGGT TTCGTAGAGA GGATCAAGAC TCTTCTTGAA GCAGAGTGTC CTAAGACTGT TTCTTGCGCT  GATATTATCG CTTTAACCGC TAGAGATGCA GTTGTCGCCA CCGGAGGTCC TTCATGGAGA GTCCCAACGG GAAGAAGAGA CGGTAGGATC TCAAACTCTA CGGAAGCTTT TAACAACATT  CCACCGCCAA CAAGTAACTT CACGACGTTA CAGCGACTTT TCGCTAACCA AGGCCTTAAT CTCAAAGACC TTGTTCTGCT CTCCGGGGCT CATACGATTG GTGTCTCGCA TTGTTCTTCC  ATGAACACTC GTCTCTACAA CTTCTCGACG ACAGTGAAAC AAGATCCATC TCTAGATACC GAGTACGCAG CTAACCTTAA GGCTAACAAA TGCAAGAGCC TTAACGACAA CACCACCATC  CTAGAGATGG ATCCGGGGAG TAGGAGAAGC TTCGATCTCA GTTATTACAG GCTTGTCCTA AAGAGGAGAG GTTTGTTTCA ATCTGATGCT GCCTTGACGA CGAACTCAGC CACGTTGAAG  ATGATCAACG ACTTGGTCAA CGGTTCTGAA GAGAAGTTTT ACAAAGCCTT CGCTAAGTCG ATGGAGAAGA TGGGGAGAGT TAAAGTGAAG ACTGGCTCAT CAGGCGTGAT CAGGACACGC 
TGTTCTGTCG CCGGAAGCTA G 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GATGAAGCCA TTGAATATTG CGGTTGCGCT TGCAGTGACG GTTCTTATTG GAACCTTTGG ATCATCGGAG GCTCAACTTC AAATGAACTT CTACGGGAAG AGCTGTCCAA ACGCAGAGAA  AATCATTTCA GATCATATTC AAAAGCATAT CCATCATGGT CCTTCTCTTG CAGCTCCTCT CATCAGAATG CACTTCCATG ATTGCTTCGT TAGGGGATGT GATGGATCGG TGTTGATAAA  TTCAACATCT GGGAACGCAG AGAAAGATTC AGCACCGAAC CTAACACTTA GAGGATTTGG TTTCGTAGAG AGGATCAAGA CTCTTCTTGA AGCAGAGTGT CCTAAGACTG TTTCTTGCGC  TGATATTATC GCTTTAACCG CTAGAGATGC AGTTGTCGCC ACCGGAGGTC CTTCATGGAG AGTCCCAACG GGAAGAAGAG ACGGTAGGAT CTCAAACTCT ACGGAAGCTT TTAACAACAT  TCCACCGCCA ACAAGTAACT TCACGACGTT ACAGCGACTT TTCGCTAACC AAGGCCTTAA TCTCAAAGAC CTTGTTCTGC TCTCCGGGGC TCATACGATT GGTGTCTCGC ATTGTTCTTC  CATGAACACT CGTCTCTACA ACTTCTCGAC GACAGTGAAA CAAGATCCAT CTCTAGATAC CGAGTACGCA GCTAACCTTA AGGCTAACAA ATGCAAGAGC CTTAACGACA ACACCACCAT  CCTAGAGATG GATCCGGGGA GTAGGAGAAG CTTCGATCTC AGTTATTACA GGCTTGTCCT AAAGAGGAGA GGTTTGTTTC AATCTGATGC TGCCTTGACG ACGAACTCAG CCACGTTGAA  GATGATCAAC GACTTGGTCA ACGGTTCTGA AGAGAAGTTT TACAAAGCCT TCGCTAAGTC GATGGAGAAG ATGGGGAGAG TTAAAGTGAA GACTGGCTCA TCAGGCGTGA TCAGGACACG  CTGTTCTGTC GCCGGAAGCT AGTTTTACAT ATACCACATC GGAAGAGTGG TGTGTGTTCT ATTATTCATT GTTGTTAATT ATCTTTAACT TTTGGGGGAT GTGTTAACGT TGTTACTTTT 
ATTTTGATGT TGCGTTGAAA TGTGTTTTAT GCACCCAAGA ATCATTCTAA ATTTACAATA ATCCTCTCAT TACTTTGTTT TCACAATGAA TAAAAC 

Retrieve as FASTA