Entry information : CrubPrx71Carubv10015891m.g
Entry ID 15071
Creation 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CrubPrx71Carubv10015891m.g
Name CrubPrx71Carubv10015891m.g
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella rubella    [TaxId: 81985 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CrubPrx71
start..stop
S start..stop
AtPrx15 662 0 1..338 1..338
AhalPrx05 658 0 1..338 1..339
BstrPrx49 658 0 1..338 1..337
AlyPrx15 655 0 1..338 1..339
Literature and cross-references CrubPrx71Carubv10015891m.g
Protein sequence: CrubPrx71Carubv10015891m.g
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   338 (322)
PWM (Da):   %s   36948.93 (35049.9)  
PI (pH):   %s   5.09 (4.96) Peptide Signal:   %s   cut: 17 range:17-338
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MARIGSFLVL LYLTYALTLC ICDDETNYGG SERGNLFPGF YRSSCPRAEE IVRSVVAKAV SRETRMAASL MRLHFHDCFV QGCDGSLLLD TSGNIVTEKN SNPNSRSARG YEVVDEIKAA  LESECPNTVS CADALTLAAR DSSVLTGGPS WTVPLGRRDS TSASLSGSNN NIPAPNNTFN TIVSRFNNQG LDLTDVVALS GSHTIGFSRC TSFRQRLYNQ SGNGSPDTTL EQSYAANLRQ 
RCPKSGGDQN LSELDINSAG RFDNSYFKNL IENMGLLNSD EVLFSSNEQS RELVKKYAED QEEFFEQFAE SMVKMGNISP LTGSSGEIRK NCRKINNS* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCAAGAA TCGGAAGCTT TCTCGTTCTT CTTTATCTCA CTTACGCTCT TACTCTCTGC ATCTGCGACG ACGAGACTAA CTATGGCGGC AGTGAGAGAG GGAATCTCTT TCCAGGTTTC  TACCGCAGCT CATGTCCTAG AGCCGAGGAG ATCGTAAGGT CAGTTGTAGC CAAAGCTGTT TCAAGGGAGA CTCGTATGGC TGCTTCTCTC ATGAGGCTCC ATTTCCACGA TTGTTTCGTT  CAGGTACTGC ATGAGTCTTT TTTTTTTGAA GTAACTTTCT TAACAAGTTA GCTACTAATG TTGAGAATCA TCTTTATACT TAAACTGTTT GATTGAAACT GTGTAGGGTT GTGATGGATC  GTTGCTTTTA GACACCAGTG GGAATATTGT TACTGAGAAG AACTCAAACC CTAACAGTAG ATCAGCTCGC GGCTATGAAG TTGTTGACGA GATCAAAGCT GCATTGGAGA GTGAATGCCC  TAACACTGTT TCTTGTGCTG ACGCCTTAAC TCTAGCTGCT AGAGACTCCT CTGTTCTTGT AAGTCATTTT CTTTTTAAGC CTCTGTCTCT ATTGCTTATT CAAAATTTTC AAGATCTGAT  TTGGTATGGT TTGGTTTGTG TTTAGACTGG TGGACCAAGC TGGACGGTTC CTTTGGGAAG AAGAGATTCC ACAAGTGCAA GTTTGAGTGG ATCAAACAAC AACATCCCTG CACCTAACAA  CACTTTCAAC ACAATTGTAT CGAGATTTAA CAATCAAGGT CTTGACCTCA CTGACGTTGT TGCTCTCTCC GGTAAGCTTA CTTCACACAC AAGCCATAAT ATTACTTTAC TTGCATTTGA  AGCTAACGTT AAACCTTCAA AGACAGTTTT ATCATAACCT TACCCAAATT TTATTCAGGG AGCCACACCA TTGGATTCTC AAGATGCACA AGTTTCAGAC AAAGACTTTA CAACCAATCT  GGAAACGGAA GTCCCGACAC AACCTTAGAG CAATCCTACG CTGCTAACTT GCGCCAAAGG TGCCCTAAGT CCGGTGGGGA TCAGAACCTG TCGGAGCTTG ACATCAACAG TGCCGGGAGG  TTTGATAACA GCTACTTCAA GAACTTGATC GAGAACATGG GACTGTTAAA TTCCGACGAA GTCTTGTTCT CTAGCAATGA ACAATCGAGA GAGCTTGTTA AGAAGTATGC AGAGGATCAA 
GAAGAGTTCT TTGAGCAGTT CGCAGAATCG ATGGTCAAGA TGGGAAACAT CTCTCCCTTG ACAGGCTCGA GTGGTGAGAT CAGGAAGAAT TGCAGGAAGA TTAATAACTC TTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCAAGAA TCGGAAGCTT TCTCGTTCTT CTTTATCTCA CTTACGCTCT TACTCTCTGC ATCTGCGACG ACGAGACTAA CTATGGCGGC AGTGAGAGAG GGAATCTCTT TCCAGGTTTC  TACCGCAGCT CATGTCCTAG AGCCGAGGAG ATCGTAAGGT CAGTTGTAGC CAAAGCTGTT TCAAGGGAGA CTCGTATGGC TGCTTCTCTC ATGAGGCTCC ATTTCCACGA TTGTTTCGTT  CAGGGTTGTG ATGGATCGTT GCTTTTAGAC ACCAGTGGGA ATATTGTTAC TGAGAAGAAC TCAAACCCTA ACAGTAGATC AGCTCGCGGC TATGAAGTTG TTGACGAGAT CAAAGCTGCA  TTGGAGAGTG AATGCCCTAA CACTGTTTCT TGTGCTGACG CCTTAACTCT AGCTGCTAGA GACTCCTCTG TTCTTACTGG TGGACCAAGC TGGACGGTTC CTTTGGGAAG AAGAGATTCC  ACAAGTGCAA GTTTGAGTGG ATCAAACAAC AACATCCCTG CACCTAACAA CACTTTCAAC ACAATTGTAT CGAGATTTAA CAATCAAGGT CTTGACCTCA CTGACGTTGT TGCTCTCTCC  GGGAGCCACA CCATTGGATT CTCAAGATGC ACAAGTTTCA GACAAAGACT TTACAACCAA TCTGGAAACG GAAGTCCCGA CACAACCTTA GAGCAATCCT ACGCTGCTAA CTTGCGCCAA  AGGTGCCCTA AGTCCGGTGG GGATCAGAAC CTGTCGGAGC TTGACATCAA CAGTGCCGGG AGGTTTGATA ACAGCTACTT CAAGAACTTG ATCGAGAACA TGGGACTGTT AAATTCCGAC  GAAGTCTTGT TCTCTAGCAA TGAACAATCG AGAGAGCTTG TTAAGAAGTA TGCAGAGGAT CAAGAAGAGT TCTTTGAGCA GTTCGCAGAA TCGATGGTCA AGATGGGAAA CATCTCTCCC 
TTGACAGGCT CGAGTGGTGA GATCAGGAAG AATTGCAGGA AGATTAATAA CTCTTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCAAGAA TCGGAAGCTT TCTCGTTCTT CTTTATCTCA CTTACGCTCT TACTCTCTGC ATCTGCGACG ACGAGACTAA CTATGGCGGC AGTGAGAGAG GGAATCTCTT TCCAGGTTTC  TACCGCAGCT CATGTCCTAG AGCCGAGGAG ATCGTAAGGT CAGTTGTAGC CAAAGCTGTT TCAAGGGAGA CTCGTATGGC TGCTTCTCTC ATGAGGCTCC ATTTCCACGA TTGTTTCGTT  CAGGGTTGTG ATGGATCGTT GCTTTTAGAC ACCAGTGGGA ATATTGTTAC TGAGAAGAAC TCAAACCCTA ACAGTAGATC AGCTCGCGGC TATGAAGTTG TTGACGAGAT CAAAGCTGCA  TTGGAGAGTG AATGCCCTAA CACTGTTTCT TGTGCTGACG CCTTAACTCT AGCTGCTAGA GACTCCTCTG TTCTTACTGG TGGACCAAGC TGGACGGTTC CTTTGGGAAG AAGAGATTCC  ACAAGTGCAA GTTTGAGTGG ATCAAACAAC AACATCCCTG CACCTAACAA CACTTTCAAC ACAATTGTAT CGAGATTTAA CAATCAAGGT CTTGACCTCA CTGACGTTGT TGCTCTCTCC  GGGAGCCACA CCATTGGATT CTCAAGATGC ACAAGTTTCA GACAAAGACT TTACAACCAA TCTGGAAACG GAAGTCCCGA CACAACCTTA GAGCAATCCT ACGCTGCTAA CTTGCGCCAA  AGGTGCCCTA AGTCCGGTGG GGATCAGAAC CTGTCGGAGC TTGACATCAA CAGTGCCGGG AGGTTTGATA ACAGCTACTT CAAGAACTTG ATCGAGAACA TGGGACTGTT AAATTCCGAC  GAAGTCTTGT TCTCTAGCAA TGAACAATCG AGAGAGCTTG TTAAGAAGTA TGCAGAGGAT CAAGAAGAGT TCTTTGAGCA GTTCGCAGAA TCGATGGTCA AGATGGGAAA CATCTCTCCC 
TTGACAGGCT CGAGTGGTGA GATCAGGAAG AATTGCAGGA AGATTAATAA CTCTTGA 

Retrieve as FASTA