Entry information : CrubPrx73Carubv10005222m.g
Entry ID 15073
Creation 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CrubPrx73Carubv10005222m.g
Name CrubPrx73Carubv10005222m.g
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx011]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella rubella    [TaxId: 81985 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CrubPrx73
start..stop
S start..stop
AhalPrx33 622 0 6..330 3..327
AtPrx50 619 0 3..330 2..329
AlyPrx50 617 0 26..330 23..327
BstrPrx06 617 0 24..330 23..329
Literature and cross-references CrubPrx73Carubv10005222m.g
Protein sequence: CrubPrx73Carubv10005222m.g
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   330 (304)
PWM (Da):   %s   36113.37 (33218.7)  
PI (pH):   %s   8.56 (8.39) Peptide Signal:   %s   cut: 27 range:27-330
Sequence
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Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MALVNNKTNL LLLLLSLFLT LNLGSAQLRR DFYAGSCPNV EQIVRNAVQK KVQQTFTTIP ATLRLYFHDC FVNGCDASVM IASTDNNKAE KDHEENLSLA GDGFDTVIKA KEALDAVPNC  RNKVSCADII TMATRDVVNL AGGPKYDVEL GRLDGLSSTA ASVGGKLPHP TDDVNQLTSL FAKNGLSLND MVALSGAHTL GFAHCTKVFN RIYSFNKTTK VDPTVNKDYV TELKASCPQN 
IDPRVAINMD PTTPRQFDNV YYKNLQQGKG LFTSDQVLFT DRRSKPTVDL WASNAQLFNQ AFVNSMIKLG RVGVKTGSNG NIRRDCGVFN * 

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Remarks
DNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TTTTAAAACA TGGCTTTGGT GAATAATAAA ACGAATCTCT TGTTGCTTCT TCTCTCTCTT TTTCTAACAC TCAACCTCGG CTCCGCTCAA CTCCGTCGCG ATTTCTACGC CGGAAGTTGC  CCTAACGTCG AGCAGATCGT CAGAAACGCC GTTCAGAAAA AAGTCCAACA AACTTTCACC ACCATCCCCG CCACTCTCCG CCTCTATTTC CACGACTGCT TCGTCAATGT AAAACATATT  ATTTTCTTGA TAATTTTTTT TGTTTCTTCT TGATCTTTTT CTTCTCTAGC ATAAATTTTA TTTTATTATT TTGTCTAATT TATGGGTTGA CTGGTTAATA TGATAGGGGT GTGATGCATC  AGTGATGATA GCGTCAACTG ATAACAATAA GGCGGAGAAA GATCACGAGG AAAATTTATC GTTGGCCGGA GATGGATTCG ACACCGTCAT TAAAGCTAAA GAAGCTCTCG ATGCCGTCCC  AAATTGTCGT AACAAAGTTT CTTGCGCCGA TATTATCACG ATGGCCACTC GTGACGTCGT TAATCTTGTT AGTAACTCAT TCTTAATTAA TTTTATGTAA TAAGCGTGTT TTATTAAATT  AAAAACATTT TATTTTGTAA GTTAGTAAAT ATTAAATTCA ATATAGGCGG GTGGACCAAA ATATGACGTG GAATTGGGAA GGCTAGATGG TCTATCGTCA ACGGCTGCTA GCGTCGGAGG  GAAGTTGCCG CATCCGACGG ACGATGTCAA CCAACTCACT TCACTTTTCG CCAAAAATGG TCTTAGCCTT AACGACATGG TCGCTCTCTC CGGTAAGTGT TGAACTACGT ACTTCTCTAT  CAAAAATAGT ATCATTCAGA CCGAACCTAG CTACGCAGTA GTGACTCAAA ATTGGTAATA TATCGGTTTA GCTTGATAAG GTTATGTATT TTGTTAAATC TCGGTTAAAC TCGTTTAATT  TTTCTGGTTG TAATTTGGTT TGGTTTGATC TTAAAAGGGG CGCACACACT AGGATTCGCG CATTGCACAA AAGTGTTCAA TCGGATATAC AGTTTCAACA AGACAACGAA AGTGGATCCC  ACGGTTAACA AAGATTACGT GACAGAGCTA AAAGCATCTT GTCCTCAAAA CATAGATCCA AGAGTGGCTA TAAACATGGA CCCAACAACT CCAAGACAAT TCGACAACGT TTACTACAAG  AACTTGCAGC AAGGAAAAGG ATTGTTCACG TCTGATCAAG TCTTATTCAC GGATCGTCGG TCAAAGCCAA CCGTTGACTT ATGGGCTAGT AATGCACAGC TGTTTAACCA AGCTTTTGTT  AACTCCATGA TCAAGCTTGG TCGTGTTGGT GTTAAAACCG GTAGTAATGG TAATATCCGT CGTGATTGTG GAGTTTTCAA TTGATTTAAA TATTGATCTG TTTTAAGATT TTGTTTATTT  CGGTTCAGTT GTATTAATTG GGCATATATG ATGGGTCGTC TCACGAAGCT TGTTCAGCTA AATTGTAATA AATCTTGGTT TTGGGTTTCA GTTTATCGCA AAACCTAAAT TGTAATATTA 
AAGTTAAGAA TAATTTTGAA GGTAATAAAA GTATTA 

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CDS
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTTGG TGAATAATAA AACGAATCTC TTGTTGCTTC TTCTCTCTCT TTTTCTAACA CTCAACCTCG GCTCCGCTCA ACTCCGTCGC GATTTCTACG CCGGAAGTTG CCCTAACGTC  GAGCAGATCG TCAGAAACGC CGTTCAGAAA AAAGTCCAAC AAACTTTCAC CACCATCCCC GCCACTCTCC GCCTCTATTT CCACGACTGC TTCGTCAATG GGTGTGATGC ATCAGTGATG  ATAGCGTCAA CTGATAACAA TAAGGCGGAG AAAGATCACG AGGAAAATTT ATCGTTGGCC GGAGATGGAT TCGACACCGT CATTAAAGCT AAAGAAGCTC TCGATGCCGT CCCAAATTGT  CGTAACAAAG TTTCTTGCGC CGATATTATC ACGATGGCCA CTCGTGACGT CGTTAATCTT GCGGGTGGAC CAAAATATGA CGTGGAATTG GGAAGGCTAG ATGGTCTATC GTCAACGGCT  GCTAGCGTCG GAGGGAAGTT GCCGCATCCG ACGGACGATG TCAACCAACT CACTTCACTT TTCGCCAAAA ATGGTCTTAG CCTTAACGAC ATGGTCGCTC TCTCCGGGGC GCACACACTA  GGATTCGCGC ATTGCACAAA AGTGTTCAAT CGGATATACA GTTTCAACAA GACAACGAAA GTGGATCCCA CGGTTAACAA AGATTACGTG ACAGAGCTAA AAGCATCTTG TCCTCAAAAC  ATAGATCCAA GAGTGGCTAT AAACATGGAC CCAACAACTC CAAGACAATT CGACAACGTT TACTACAAGA ACTTGCAGCA AGGAAAAGGA TTGTTCACGT CTGATCAAGT CTTATTCACG  GATCGTCGGT CAAAGCCAAC CGTTGACTTA TGGGCTAGTA ATGCACAGCT GTTTAACCAA GCTTTTGTTA ACTCCATGAT CAAGCTTGGT CGTGTTGGTG TTAAAACCGG TAGTAATGGT 
AATATCCGTC GTGATTGTGG AGTTTTCAAT TGA 

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cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TTTTAAAACA TGGCTTTGGT GAATAATAAA ACGAATCTCT TGTTGCTTCT TCTCTCTCTT TTTCTAACAC TCAACCTCGG CTCCGCTCAA CTCCGTCGCG ATTTCTACGC CGGAAGTTGC  CCTAACGTCG AGCAGATCGT CAGAAACGCC GTTCAGAAAA AAGTCCAACA AACTTTCACC ACCATCCCCG CCACTCTCCG CCTCTATTTC CACGACTGCT TCGTCAATGG GTGTGATGCA  TCAGTGATGA TAGCGTCAAC TGATAACAAT AAGGCGGAGA AAGATCACGA GGAAAATTTA TCGTTGGCCG GAGATGGATT CGACACCGTC ATTAAAGCTA AAGAAGCTCT CGATGCCGTC  CCAAATTGTC GTAACAAAGT TTCTTGCGCC GATATTATCA CGATGGCCAC TCGTGACGTC GTTAATCTTG CGGGTGGACC AAAATATGAC GTGGAATTGG GAAGGCTAGA TGGTCTATCG  TCAACGGCTG CTAGCGTCGG AGGGAAGTTG CCGCATCCGA CGGACGATGT CAACCAACTC ACTTCACTTT TCGCCAAAAA TGGTCTTAGC CTTAACGACA TGGTCGCTCT CTCCGGGGCG  CACACACTAG GATTCGCGCA TTGCACAAAA GTGTTCAATC GGATATACAG TTTCAACAAG ACAACGAAAG TGGATCCCAC GGTTAACAAA GATTACGTGA CAGAGCTAAA AGCATCTTGT  CCTCAAAACA TAGATCCAAG AGTGGCTATA AACATGGACC CAACAACTCC AAGACAATTC GACAACGTTT ACTACAAGAA CTTGCAGCAA GGAAAAGGAT TGTTCACGTC TGATCAAGTC  TTATTCACGG ATCGTCGGTC AAAGCCAACC GTTGACTTAT GGGCTAGTAA TGCACAGCTG TTTAACCAAG CTTTTGTTAA CTCCATGATC AAGCTTGGTC GTGTTGGTGT TAAAACCGGT  AGTAATGGTA ATATCCGTCG TGATTGTGGA GTTTTCAATT GATTTAAATA TTGATCTGTT TTAAGATTTT GTTTATTTCG GTTCAGTTGT ATTAATTGGG CATATATGAT GGGTCGTCTC 
ACGAAGCTTG TTCAGCTAAA TTGTAATAAA TCTTGGTTTT GGGTTTCAGT TTATCGCAAA ACCTAAATTG TAATATTAAA GTTAAGAATA ATTTTGAAGG TAATAAAAGT ATTA 

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