Entry information : CrubPrx78Carubv10003258m.g
Entry ID 15076
Creation 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CrubPrx78Carubv10003258m.g
Name CrubPrx78Carubv10003258m.g
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx019]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella rubella    [TaxId: 81985 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CrubPrx78
start..stop
S start..stop
CagraPrx04 608 0 8..310 8..310
AtPrx57 586 0 8..310 11..313
BrPrx57-1Aa_other 580 0 8..310 8..310
AlyPrx57 578 0 8..310 11..313
Literature and cross-references CrubPrx78Carubv10003258m.g
Protein sequence: CrubPrx78Carubv10003258m.g
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   310 (291)
PWM (Da):   %s   33778.31 (31560.1) Transmb domain:   %s   i7-26o
PI (pH):   %s   10.85 (10.71) Peptide Signal:   %s   cut: 20 range:20-310
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
FKSSGKALVF FFIFPIAFGQ LRVGFYSQSC PQAETIVRNL VRQRFGVDPT VTAALLRMHF HDCFVRGCDA SLLIDGTNSE KAAGPNGSVR EFDLIDRIKA QLEAACPSTV SCADIVTLAT  RDSVALAGGP SYSIPTGRRD GRVSNNVDVA LPGPTISVSG AVSFFTVKGM NTFDAVALLG AHTVGRGNCG LFSDRITNFQ GSGRPDPSMD PALVTSLRNT CRNSASAALD QSTPLRFDNQ 
FFKQIRKRRG VLQVDQRLAS DRQTRGIVAR YANNNAFFKR QFVRAMVKMG AVDVLTGRNG EIRRNCRRFN * 

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Remarks
DNA
Send to BLAST
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TTTAAATCTT CAGGGAAGGC TCTAGGTATA CACAACCTTT AAAGAATGAC AGTGACTCTA AAACCAGAGC CATATAATAT TCATGTATTT GTTACGTTTG TTCTAGACTA ACAAATACAA  TTAACAAGAT GGAGTTCTTT TCTAGAGCAC TCAGCAAAAT TTTTTTTAAA AAGAACATGA ATATGTTTTG ACTTCTTGTT ATATCTCCTG TTCATTATAG GTAAGCTATG CATAAAAGGA  TCAAGTACCC TAAAGATGAA CTAATTAAGA AATAAAATAT CATATTAATA ACTATTAATT TTGAAACATA AATATTTATA CCATAGTTTT CCTATATATA TATGCTATGC GTATTTAAAA  TTTTATTAGT AAAAAACCAA AATATTAAAA TACGTGATAC AATCGCGATA CAACATAAAT TATTATGTTA TATGTCCCAC AAATAAAAAA TACAGTATTA TGATATAATC AATGCAAGTA  TAATGAAAGG GACGAGAATG TCACATTATT ACAAGCAAAT AATCATTTGT GCTGTGCCAG CTTCTTTACA CAACTCGCCA CGAAACCGAC TTTGAAGTTC ATTTTTAAAA AATCTTATAA  CGAAACCGTC AGTCAAACTA TAATATTCCC AAACCTCAAT AGTCGATTTC CTCAAGTAAC AAACTTTACT TTTTTTTTTT TTTTTTTGAA CTTTTCACTT CTATATATAT ACATAACATT  CCCAAATTTT GTTCCAAACA TCTCTCTTAT CAACTCATCA GAAATTTTCG ATTTTTTTCT TTTCATGTAC TATACTACTA TAGTATTGTG GTATATAGTA TCGTAACAGC TTCTTTTAGT  TTTTTCTTGT TGATCATCAT TAGGCATGAC GGATTAACAA CAAATCACTT GTTTTAACTA TTAATTGATA TATAATTTGA CGACTAAACT AATCAGCAGA TACCGAACCT CCGGATAGAT  GATGACTACA TGGAGCAATT GTCGTGATGT CCATGTATTG GGGTATACAT AATTAGTTAT TTGTCTTATT GGAATACGAA TTCATAAGTA TAGTTTATGA CAAATATTGC AACAACTGAT  AAGTTTTTAT GGTTGCAATT ATATGGTTGT TGTACATGTG ACATTAACTA AAATTAAAGA GAATGTCCAA AACTTAAATC CATTATTTTT TTCCTAAGTC CTTTAAAACA TTCTCAATCA  TATGAAAGTC TTGTTAATAA TATAAAAGTC CAAAATATAT ATATTAGGGA TAGAGCCAAG TGGGTTTTTA AAAGAAAACC CGTTTTTTTT ATTCTTTCAT AGCATAATTT ATAATGAACT  ATTTCATGAA ATTGACTTTT GCATTTCTTT CAAAATCAAA ATCGGCAAGA AAATGTAATC GAACTAGATT AGGATAGAAT TACACACCTA ATCCACCATG TAAATTGATT ACAATTCTAC  TATTATCGAC TTAGCTGGAT CAAATTTTCA GCATATCTCA TACACATCGT ATATGACATT ATAAAATTCA CAACATGGCA AAGGAATGTT TACAAAGTCG CTCGCACGCC TTTGCAAACG  TTTCAAAGCT TTATTATATA AATAATAACA TAAACCTTTG ACTTTCTAAT TTATTCGGCA TATTCATGGA TGTATTAATT TTATAGTCTC TAAATTATTT TTCTACGGTT GATGTTCGTG  TATGTATATA TACACCTTAT GGTTGATCTC AAAGACTCAC AATCATTTGC ACAAGAAGTT ATATAAGCCA ATACAAAGAA GAAAACTCCT AATCCCAAAT AGAATGATGA AGTTTTCTTC  TCTTCTAGTG TTTTTCTTTA TTTTCCCGAT CGCATTTGGT CAACTTAGAG TTGGGTTCTA TAGCCAGTCA TGCCCACAAG CCGAGACTAT TGTACGCAAC CTGGTGCGCC AACGGTTTGG  TGTTGACCCA ACCGTCACCG CCGCTTTGCT CCGTATGCAT TTCCACGACT GTTTCGTTAG GGTAAGAATC TAATATAGCA ATTTTGATAT AGCTCAACAT GCCCAGGGAA CGGTTTAACA  AATCTGTGGC TCAAAGTGGC TTAAACTTGT ATAGCTTTTA ACTTTAAGTT CTTAAGTTAA ACTTGTATAG CTTAAATTTG AGACAAGAAC ATAAGCGGAA AAAAGACCAA AAATATTATC  ATTCAAATTT GAGACTCAAG ATAAACTGTA TTGCATACTT GTATATTAAA TGCATATGTT AAGAAATACT CATAAATTTA AGCAAATTTC ATATCATTTT GTCTGGGTAA TCTTATTCTA  ATATTTTTTG TTTTGTAGGG TTGTGACGCA TCTCTCCTCA TTGATGGAAC CAATTCCGAG AAAGCCGCTG GACCAAACGG AAGCGTGAGA GAATTTGACC TTATCGACAG GATCAAGGCT  CAGCTAGAGG CTGCATGCCC CTCCACAGTC TCATGTGCCG ACATCGTCAC ATTAGCCACA CGTGACTCCG TGGCCTTAGC CGGAGGCCCG AGCTACAGCA TCCCCACGGG AAGGCGCGAC  GGTAGGGTCT CAAACAATGT GGACGTGGCA TTACCGGGTC CAACAATCTC GGTCTCCGGA GCCGTGAGTT TCTTCACCGT CAAAGGGATG AACACGTTCG ATGCTGTGGC TCTTTTGGGT  GCACACACCG TTGGTCGGGG AAACTGTGGT CTCTTCAGCG ACCGAATCAC TAATTTCCAA GGAAGCGGAC GACCCGATCC ATCCATGGAC CCTGCTTTAG TTACAAGGTA ATTTGAGGAT  GATAAAACAA AAAAAAACAG TTTCACATTC AATAAGAAAT ATTTTATTTA ACTCATAAAA ATAATATTCT GATGTTTTCT TGTTTTTTAA ATATAGCCTA AGGAACACAT GCAGAAACAG  TGCGTCAGCA GCCCTAGACC AGTCGACTCC ATTGAGATTC GACAACCAAT TCTTCAAGCA AATCCGTAAA AGAAGAGGAG TGTTGCAGGT TGACCAACGG CTCGCAAGTG ACCGACAGAC  TCGTGGCATC GTGGCCAGGT ACGCTAACAA CAACGCCTTC TTCAAGCGTC AGTTCGTTAG AGCGATGGTG AAGATGGGAG CCGTTGATGT GCTTACCGGT CGTAACGGTG AGATCAGGAG 
GAACTGCAGG AGATTCAACT GA 

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CDS
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TTTAAATCTT CAGGGAAGGC TCTAGTGTTT TTCTTTATTT TCCCGATCGC ATTTGGTCAA CTTAGAGTTG GGTTCTATAG CCAGTCATGC CCACAAGCCG AGACTATTGT ACGCAACCTG  GTGCGCCAAC GGTTTGGTGT TGACCCAACC GTCACCGCCG CTTTGCTCCG TATGCATTTC CACGACTGTT TCGTTAGGGG TTGTGACGCA TCTCTCCTCA TTGATGGAAC CAATTCCGAG  AAAGCCGCTG GACCAAACGG AAGCGTGAGA GAATTTGACC TTATCGACAG GATCAAGGCT CAGCTAGAGG CTGCATGCCC CTCCACAGTC TCATGTGCCG ACATCGTCAC ATTAGCCACA  CGTGACTCCG TGGCCTTAGC CGGAGGCCCG AGCTACAGCA TCCCCACGGG AAGGCGCGAC GGTAGGGTCT CAAACAATGT GGACGTGGCA TTACCGGGTC CAACAATCTC GGTCTCCGGA  GCCGTGAGTT TCTTCACCGT CAAAGGGATG AACACGTTCG ATGCTGTGGC TCTTTTGGGT GCACACACCG TTGGTCGGGG AAACTGTGGT CTCTTCAGCG ACCGAATCAC TAATTTCCAA  GGAAGCGGAC GACCCGATCC ATCCATGGAC CCTGCTTTAG TTACAAGCCT AAGGAACACA TGCAGAAACA GTGCGTCAGC AGCCCTAGAC CAGTCGACTC CATTGAGATT CGACAACCAA  TTCTTCAAGC AAATCCGTAA AAGAAGAGGA GTGTTGCAGG TTGACCAACG GCTCGCAAGT GACCGACAGA CTCGTGGCAT CGTGGCCAGG TACGCTAACA ACAACGCCTT CTTCAAGCGT 
CAGTTCGTTA GAGCGATGGT GAAGATGGGA GCCGTTGATG TGCTTACCGG TCGTAACGGT GAGATCAGGA GGAACTGCAG GAGATTCAAC TGA 

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cDNA
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TTTAAATCTT CAGGGAAGGC TCTAGTGTTT TTCTTTATTT TCCCGATCGC ATTTGGTCAA CTTAGAGTTG GGTTCTATAG CCAGTCATGC CCACAAGCCG AGACTATTGT ACGCAACCTG  GTGCGCCAAC GGTTTGGTGT TGACCCAACC GTCACCGCCG CTTTGCTCCG TATGCATTTC CACGACTGTT TCGTTAGGGG TTGTGACGCA TCTCTCCTCA TTGATGGAAC CAATTCCGAG  AAAGCCGCTG GACCAAACGG AAGCGTGAGA GAATTTGACC TTATCGACAG GATCAAGGCT CAGCTAGAGG CTGCATGCCC CTCCACAGTC TCATGTGCCG ACATCGTCAC ATTAGCCACA  CGTGACTCCG TGGCCTTAGC CGGAGGCCCG AGCTACAGCA TCCCCACGGG AAGGCGCGAC GGTAGGGTCT CAAACAATGT GGACGTGGCA TTACCGGGTC CAACAATCTC GGTCTCCGGA  GCCGTGAGTT TCTTCACCGT CAAAGGGATG AACACGTTCG ATGCTGTGGC TCTTTTGGGT GCACACACCG TTGGTCGGGG AAACTGTGGT CTCTTCAGCG ACCGAATCAC TAATTTCCAA  GGAAGCGGAC GACCCGATCC ATCCATGGAC CCTGCTTTAG TTACAAGCCT AAGGAACACA TGCAGAAACA GTGCGTCAGC AGCCCTAGAC CAGTCGACTC CATTGAGATT CGACAACCAA  TTCTTCAAGC AAATCCGTAA AAGAAGAGGA GTGTTGCAGG TTGACCAACG GCTCGCAAGT GACCGACAGA CTCGTGGCAT CGTGGCCAGG TACGCTAACA ACAACGCCTT CTTCAAGCGT 
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