Entry information : CrubPrx81Carubv10027924m.g
Entry ID 15079
Creation 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CrubPrx81Carubv10027924m.g
Name CrubPrx81Carubv10027924m.g
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx087]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella rubella    [TaxId: 81985 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CrubPrx81
start..stop
S start..stop
CagraPrx77 640 0 1..332 1..316
BstrPrx73 624 0 1..331 1..331
AlyPrx70 593 0 1..331 1..332
AtPrx70 584 0 1..331 1..330
Literature and cross-references CrubPrx81Carubv10027924m.g
Protein sequence: CrubPrx81Carubv10027924m.g
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   332 (308)
PWM (Da):   %s   36270.42 (33635.0)  
PI (pH):   %s   8.32 (8.21) Peptide Signal:   %s   cut: 25 range:25-332
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGSVTNYNPR CVILLLFTVL AATATKHRNN FLPRPRLGYY GSSCWNVESI VRSVVQSNYF ANPANAPGVL RMHFHDCFVQ GCDASILLAG PNSERTAIPN LSLRGFNVIE EAKTQLEIAC  PRTVSCADIL SLAARDFVVL AGGPWWPVPL GRLDGKVSLA SNVNLPGPTD SVALQRQMFS AKNLNTQDLV VLVAGHTIGT AGCGVFRNRF FNYKNTGSPD PTISPSFVPQ IQSQCPLNGD 
PATRVVLDTG SGDQFDTSYL NNLRNGRGVL ESDQVLWTDP QTRPIVEQLL GLRFPFLWFG QEFGRSMTKM SQIEIKTGLD GEIRRVCSAV NS* 

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Remarks
DNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGAAGTG TTACAAATTA TAATCCTCGC TGCGTTATCT TACTTTTATT CACTGTCCTA GCCGCGACTG CAACCAAACA CAGGAACAAT TTCCTCCCAA GGCCTCGGCT CGGGTATTAC  GGTAGTTCAT GCTGGAATGT AGAATCGATA GTGCGGTCTG TGGTGCAGTC TAACTATTTT GCTAATCCAG CCAATGCTCC GGGGGTTTTG CGTATGCACT TTCACGATTG TTTCGTCCAA  GGCTGTGACG CCTCCATTCT CCTTGCCGGA CCTAACTCTG AGAGAACGGC GATACCAAAT CTATCGTTGA GAGGCTTTAA TGTCATCGAA GAAGCTAAAA CTCAGCTTGA GATCGCTTGT  CCTCGAACAG TCTCTTGTGC TGATATTCTC TCACTCGCTG CACGTGACTT CGTCGTTTTG GTATAACTAT AACCCACTTT TATTATATAT AATTAAGTCC ATAGTTTATA ATCGTTTTTT  TTAATATATT TTAAATGGAA ATAAATTTGA TACGTATGTG TAGGCTGGTG GACCATGGTG GCCAGTTCCA TTGGGACGAC TCGATGGTAA GGTTTCGCTA GCCTCGAATG TCAATTTGCC  CGGACCAACC GACTCCGTTG CCCTGCAGAG GCAAATGTTC TCGGCTAAAA ATCTTAATAC GCAAGACCTC GTTGTCCTTG TTGGTACGTA AACCAAGTTG GGTTTAGGCC TCGCGCACTG  GTTTTAAACA TTTTTTCCCC CGATTCTAGT TTATATGTTT GTGAAATATT TCTGCCACTA TACACGTTAA CCACATGCAT GGCGTTGGCG TCACATATTA AATGTATACT ACTACAAAAT  ATAGACTCGT AGCATGTGTA TGGTATATGG AGTATATTTT AACATTATCT AACAATATCT AACAATTTCT TGCATCTTAA GGCTTAAGTT AACTTAGCAT TATTCAAATG ATATAATGAA  TAAGTGATTA TATTTTATAA CAGTCATACG TTTTTGAAAT TCCGTCGAGA TACCTTCTAA TCCACATAGA GCGTTTGGTA CATATAACAG CTGGACACAC GATAGGAACG GCCGGGTGTG  GTGTGTTTAG GAACAGGTTC TTCAACTACA AGAACACAGG AAGTCCGGAC CCAACCATCT CCCCCAGTTT CGTCCCTCAA ATCCAATCTC AATGTCCTCT CAACGGCGAC CCTGCCACTC  GTGTCGTACT AGACACAGGA AGTGGAGACC AGTTCGATAC GTCGTATCTT AACAACTTGA GGAATGGTCG AGGAGTCCTC GAGTCCGATC AGGTCCTATG GACTGATCCC CAGACCCGAC  CCATCGTGGA ACAGCTTTTA GGACTAAGGT TTCCATTTCT GTGGTTCGGA CAGGAGTTCG GGAGGTCAAT GACCAAAATG AGTCAGATTG AGATCAAGAC GGGTTTGGAT GGGGAGATTC 
GTAGGGTTTG TTCTGCCGTT AACTCATAA 

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CDS
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGAAGTG TTACAAATTA TAATCCTCGC TGCGTTATCT TACTTTTATT CACTGTCCTA GCCGCGACTG CAACCAAACA CAGGAACAAT TTCCTCCCAA GGCCTCGGCT CGGGTATTAC  GGTAGTTCAT GCTGGAATGT AGAATCGATA GTGCGGTCTG TGGTGCAGTC TAACTATTTT GCTAATCCAG CCAATGCTCC GGGGGTTTTG CGTATGCACT TTCACGATTG TTTCGTCCAA  GGCTGTGACG CCTCCATTCT CCTTGCCGGA CCTAACTCTG AGAGAACGGC GATACCAAAT CTATCGTTGA GAGGCTTTAA TGTCATCGAA GAAGCTAAAA CTCAGCTTGA GATCGCTTGT  CCTCGAACAG TCTCTTGTGC TGATATTCTC TCACTCGCTG CACGTGACTT CGTCGTTTTG GCTGGTGGAC CATGGTGGCC AGTTCCATTG GGACGACTCG ATGGTAAGGT TTCGCTAGCC  TCGAATGTCA ATTTGCCCGG ACCAACCGAC TCCGTTGCCC TGCAGAGGCA AATGTTCTCG GCTAAAAATC TTAATACGCA AGACCTCGTT GTCCTTGTTG CTGGACACAC GATAGGAACG  GCCGGGTGTG GTGTGTTTAG GAACAGGTTC TTCAACTACA AGAACACAGG AAGTCCGGAC CCAACCATCT CCCCCAGTTT CGTCCCTCAA ATCCAATCTC AATGTCCTCT CAACGGCGAC  CCTGCCACTC GTGTCGTACT AGACACAGGA AGTGGAGACC AGTTCGATAC GTCGTATCTT AACAACTTGA GGAATGGTCG AGGAGTCCTC GAGTCCGATC AGGTCCTATG GACTGATCCC  CAGACCCGAC CCATCGTGGA ACAGCTTTTA GGACTAAGGT TTCCATTTCT GTGGTTCGGA CAGGAGTTCG GGAGGTCAAT GACCAAAATG AGTCAGATTG AGATCAAGAC GGGTTTGGAT 
GGGGAGATTC GTAGGGTTTG TTCTGCCGTT AACTCATAA 

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cDNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGAAGTG TTACAAATTA TAATCCTCGC TGCGTTATCT TACTTTTATT CACTGTCCTA GCCGCGACTG CAACCAAACA CAGGAACAAT TTCCTCCCAA GGCCTCGGCT CGGGTATTAC  GGTAGTTCAT GCTGGAATGT AGAATCGATA GTGCGGTCTG TGGTGCAGTC TAACTATTTT GCTAATCCAG CCAATGCTCC GGGGGTTTTG CGTATGCACT TTCACGATTG TTTCGTCCAA  GGCTGTGACG CCTCCATTCT CCTTGCCGGA CCTAACTCTG AGAGAACGGC GATACCAAAT CTATCGTTGA GAGGCTTTAA TGTCATCGAA GAAGCTAAAA CTCAGCTTGA GATCGCTTGT  CCTCGAACAG TCTCTTGTGC TGATATTCTC TCACTCGCTG CACGTGACTT CGTCGTTTTG GCTGGTGGAC CATGGTGGCC AGTTCCATTG GGACGACTCG ATGGTAAGGT TTCGCTAGCC  TCGAATGTCA ATTTGCCCGG ACCAACCGAC TCCGTTGCCC TGCAGAGGCA AATGTTCTCG GCTAAAAATC TTAATACGCA AGACCTCGTT GTCCTTGTTG CTGGACACAC GATAGGAACG  GCCGGGTGTG GTGTGTTTAG GAACAGGTTC TTCAACTACA AGAACACAGG AAGTCCGGAC CCAACCATCT CCCCCAGTTT CGTCCCTCAA ATCCAATCTC AATGTCCTCT CAACGGCGAC  CCTGCCACTC GTGTCGTACT AGACACAGGA AGTGGAGACC AGTTCGATAC GTCGTATCTT AACAACTTGA GGAATGGTCG AGGAGTCCTC GAGTCCGATC AGGTCCTATG GACTGATCCC  CAGACCCGAC CCATCGTGGA ACAGCTTTTA GGACTAAGGT TTCCATTTCT GTGGTTCGGA CAGGAGTTCG GGAGGTCAAT GACCAAAATG AGTCAGATTG AGATCAAGAC GGGTTTGGAT 
GGGGAGATTC GTAGGGTTTG TTCTGCCGTT AACTCATAA 

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