Entry information : CrubAPx04 (Carubv10007422m.g)
Entry ID 15081
Creation 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CrubAPx04 (Carubv10007422m.g)
Name (synonym) CrubAPx04 (Carubv10007422m.g)
Class Ascorbate peroxidase     [Orthogroup: APx006]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella rubella    [TaxId: 81985 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CrubAPx04
start..stop
S start..stop
CagraAPx04 577 0 1..279 44..322
AhalAPx03 553 0 1..279 1..279
AtAPx04 549 0 1..279 1..279
AlyAPx04 543 0 1..279 1..279
Literature and cross-references CrubAPx04 (Carubv10007422m.g)
Protein sequence: CrubAPx04 (Carubv10007422m.g)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   279
PWM (Da):   %s   30952.97 Transmb domain:   %s   o250-272i
PI (pH):   %s   8.75
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAVNVDSDYL KEIEKARRDL RALISSRNCA PIMLRLAWHD AGTYDAKKKT GGANGSIRFK EELNRPHNKG LEKAVAFCEE VKAKHPRVTY ADLYQLAGVV AVEVTGGPAI PFTPGRKDAD  SPDDGELPNP NEDASHLRNL FSRMGLSDRD IVALSGGHTL GRAHKERSDF EGPWTQEPLK FDNSYFVELQ KGETPGLLQL KTDRALLNDP KFHAFVKLYA KDEDMFFKAY AISHKKLSEL 
GFNPPRRISS AVTQQTLGIA VAAAVVIFTI CYEASRRGK* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGGTGA ACGTTGATTC AGATTACCTC AAAGAAATAG AAAAGGCTCG TAGAGACCTT CGAGCTCTCA TCTCTTCCAG AAACTGTGCT CCCATTATGC TCCGTCTTGC GTAAGCTCTT  TCTTTCTGTA CCATTCTCCG TTTCTCATTT TTTGTCGAGA TGTTTCTAAC TGCATATTCT TGTATCCATA TATAGATGGC ATGATGCAGG AACCTATGAT GCCAAAAAGA AAACCGGAGG  TGCCAATGGA TCAATCAGGT TCAAGGAAGA GCTAAACCGT CCACACAACA AAGGTTTGGA GAAAGCAGTC GCCTTCTGCG GTGAGTTTAT GCTAAAACCT TTAATCCATC ACTACTCCAC  TCTTAAGGAC CTGACAATAA AACGGTAGCT GATTCCTTTG ATTTTTGTTG ATTTCAGAGG AAGTCAAGGC TAAGCATCCA CGAGTCACTT ACGCAGACCT TTATCAGGTA AACATTGCCA  TATAGCATCT CTAAGCCATT AAACCCATAA AAACTTCCTG CCCCCTTGAT GGTTAGCTTG ACAGATTATT TGATTTCATT TCAGCTCGCT GGAGTTGTTG CAGTGGAGGT TACTGGTGGC  CCTGCAATCC CATTTACTCC AGGCCGTAAG GTAGTTACAC TTACTGCTAA AGGGTATGCG CTAAATCATA ATTGCCAAGT GAGTTTACTG ATTTTGAGAC ATATGATATC AGGATGCTGA  TTCCCCAGAC GACGGGGAGC TTCCAAATCC AAACGAAGGT TACCCTCGCA GCTTGTAGGT CTTGCAACGG GATTCTATTT TACAAACTGA CTTTTGGATT ATTGCAGATG CCTCACATTT  AAGAAATCTC TTCTCTCGTA TGGGGCTATC GGATAGAGAC ATCGTTGCTC TCTCTGGAGG CCACACTTTG GTTTTAATTG CTAACTCTCC TTCAATATAT CCGCTACTAA AAATACTCCA  ATGAACCAAC TTGGTTGCTA CTTTTGTATA TAGGGCCGTG CACATAAGGA GAGATCCGAT TTTGAAGGTC CTTGGACACA AGAACCTCTC AAGTTTGATA ATTCATATTT CGTGTAAGCC  AATAACAAAA TCACACAGAG TTAAAGTAAG AGAGAGTAAA AGTTCTGAAA CTTACGCTTG TCTGCTGATT GGTTTTTCAG AGAACTTCAA AAAGGAGAGA CTCCAGGGTT GCTACAACTG  AAAACCGACA GGGCTCTACT TAATGATCCC AAGTTCCACG CTTTTGTTAA GCTGTATGCA AAGGTAATTA GATTTTCCTA CGATTATAAG AAACTTTTAG TTTGGATGAT TCGCTGGTGT  TATCAACATT AAAAAAAGTA TTATGATGTG TAGGACGAGG ATATGTTCTT CAAAGCATAT GCAATTTCTC ACAAGAAACT CTCAGAACTA GGATTTAATC CGCCAAGAAG AATTTCTTCA 
GCAGTGACAC AGCAGACGCT TGGAATCGCT GTTGCTGCAG CTGTGGTGAT CTTTACCATA TGCTACGAAG CAAGCAGAAG AGGCAAGTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGGTGA ACGTTGATTC AGATTACCTC AAAGAAATAG AAAAGGCTCG TAGAGACCTT CGAGCTCTCA TCTCTTCCAG AAACTGTGCT CCCATTATGC TCCGTCTTGC ATGGCATGAT  GCAGGAACCT ATGATGCCAA AAAGAAAACC GGAGGTGCCA ATGGATCAAT CAGGTTCAAG GAAGAGCTAA ACCGTCCACA CAACAAAGGT TTGGAGAAAG CAGTCGCCTT CTGCGAGGAA  GTCAAGGCTA AGCATCCACG AGTCACTTAC GCAGACCTTT ATCAGCTCGC TGGAGTTGTT GCAGTGGAGG TTACTGGTGG CCCTGCAATC CCATTTACTC CAGGCCGTAA GGATGCTGAT  TCCCCAGACG ACGGGGAGCT TCCAAATCCA AACGAAGATG CCTCACATTT AAGAAATCTC TTCTCTCGTA TGGGGCTATC GGATAGAGAC ATCGTTGCTC TCTCTGGAGG CCACACTTTG  GGCCGTGCAC ATAAGGAGAG ATCCGATTTT GAAGGTCCTT GGACACAAGA ACCTCTCAAG TTTGATAATT CATATTTCGT AGAACTTCAA AAAGGAGAGA CTCCAGGGTT GCTACAACTG  AAAACCGACA GGGCTCTACT TAATGATCCC AAGTTCCACG CTTTTGTTAA GCTGTATGCA AAGGACGAGG ATATGTTCTT CAAAGCATAT GCAATTTCTC ACAAGAAACT CTCAGAACTA  GGATTTAATC CGCCAAGAAG AATTTCTTCA GCAGTGACAC AGCAGACGCT TGGAATCGCT GTTGCTGCAG CTGTGGTGAT CTTTACCATA TGCTACGAAG CAAGCAGAAG AGGCAAGTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGGTGA ACGTTGATTC AGATTACCTC AAAGAAATAG AAAAGGCTCG TAGAGACCTT CGAGCTCTCA TCTCTTCCAG AAACTGTGCT CCCATTATGC TCCGTCTTGC ATGGCATGAT  GCAGGAACCT ATGATGCCAA AAAGAAAACC GGAGGTGCCA ATGGATCAAT CAGGTTCAAG GAAGAGCTAA ACCGTCCACA CAACAAAGGT TTGGAGAAAG CAGTCGCCTT CTGCGAGGAA  GTCAAGGCTA AGCATCCACG AGTCACTTAC GCAGACCTTT ATCAGCTCGC TGGAGTTGTT GCAGTGGAGG TTACTGGTGG CCCTGCAATC CCATTTACTC CAGGCCGTAA GGATGCTGAT  TCCCCAGACG ACGGGGAGCT TCCAAATCCA AACGAAGATG CCTCACATTT AAGAAATCTC TTCTCTCGTA TGGGGCTATC GGATAGAGAC ATCGTTGCTC TCTCTGGAGG CCACACTTTG  GGCCGTGCAC ATAAGGAGAG ATCCGATTTT GAAGGTCCTT GGACACAAGA ACCTCTCAAG TTTGATAATT CATATTTCGT AGAACTTCAA AAAGGAGAGA CTCCAGGGTT GCTACAACTG  AAAACCGACA GGGCTCTACT TAATGATCCC AAGTTCCACG CTTTTGTTAA GCTGTATGCA AAGGACGAGG ATATGTTCTT CAAAGCATAT GCAATTTCTC ACAAGAAACT CTCAGAACTA  GGATTTAATC CGCCAAGAAG AATTTCTTCA GCAGTGACAC AGCAGACGCT TGGAATCGCT GTTGCTGCAG CTGTGGTGAT CTTTACCATA TGCTACGAAG CAAGCAGAAG AGGCAAGTGA 

Retrieve as FASTA