Entry information : CrubPrx84Carubv10023623m.g
Entry ID 15082
Creation 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CrubPrx84Carubv10023623m.g
Name CrubPrx84Carubv10023623m.g
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx031]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella rubella    [TaxId: 81985 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CrubPrx84
start..stop
S start..stop
CagraPrx35 681 0 1..327 1..327
BstrPrx19 667 0 1..327 1..327
AlyPrx21 656 0 1..327 1..327
BrPrx21-1Ab_other 635 0 1..327 1..328
Literature and cross-references CrubPrx84Carubv10023623m.g
Protein sequence: CrubPrx84Carubv10023623m.g
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   327 (299)
PWM (Da):   %s   36693.47 (33452.8) Transmb domain:   %s   i7-26o
PI (pH):   %s   6.77 (6.51) Peptide Signal:   %s   cut: 29 range:29-327
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MASVKPFCLL SFFCLLLQLF SIFHIGNGEL EMNYYRESCP KAEEIIRQQV ETLYYKHGNT AVSWLRNLFH DCVVKSCDAS LLLETARGVE SEQKSTRSFG MRNFKYVKII KDALEKECPS  TVSCADIVAL SARDGIVMLK GPKIEMIKTG RRDSRGSYLA DVETLIPNHN DSLSSVLSTF DSLGIDVEAT VALLGAHSVG RVHCVNLVHR LYPTVDPTLD PSYALYLKNR CPTPTPDPNA 
VLYSRNDRET PMVVDNMYYK NIMAHKGLLV IDDELATDPR TAPFVAKMAA DNGYFHEQFS RGVRLLSETN PLTGDQGEIR KDCRYVN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GGACACACAA ACAATTATTT TAGTAGAAAA AAAAAAGAGA GAAAGAGAGA GCAATGGCCA GTGTGAAGCC CTTCTGCCTC CTCAGCTTCT TTTGTCTGTT ATTACAGTTG TTCTCCATCT  TCCATATCGG TAAATACATT CTTCCCTTAT CCAATCACGT TATGCCATGT ATCTTCTTGC TTCACAAGTT TAATTTTCCA CCGTTCAATA TTTCTATAAA CTGATAAAAT AAATTAAAAT  ATATGAAAAT TTGTAGGAAA TGGGGAGTTG GAGATGAACT ATTACAGAGA GAGTTGTCCA AAAGCGGAAG AGATTATTAG ACAACAAGTG GAGACGCTTT ACTACAAACA CGGCAACACT  GCCGTCTCTT GGCTCCGTAA TCTCTTCCAT GACTGTGTCG TCAAGGTATA TATTAATCAA CTCTTTTTAC ATATAATTCA CCAATTACTA ATATATAATA TTACGACATA GTATATATTA  ATGTTCTCGT GTGTGTATTT TTCTATATTT TGTAGTCGTG TGATGCGTCG CTGCTGCTAG AGACAGCGAG AGGTGTGGAG TCTGAGCAGA AATCGACGAG GAGCTTCGGT ATGAGAAACT  TTAAGTACGT TAAGATTATC AAAGACGCAC TTGAGAAAGA GTGTCCTTCC ACTGTCTCTT GCGCTGATAT CGTCGCTCTC TCTGCTAGAG ACGGTATTGT CATGGTGCGT TTAGACATAT  ATTTACATGC ATTTTTACAG TTAGTTTGTA ATTTCTTTGG TTAATTTTTG TTTTTTTGGA TGAAATTTAA TAGTTGAAAG GGCCAAAAAT AGAGATGATA AAGACAGGAA GGAGAGATAG  CAGAGGAAGC TACTTGGCAG ACGTTGAGAC TCTAATCCCT AACCACAATG ACTCTCTCTC CTCTGTTCTC TCCACCTTTG ACTCCCTTGG CATTGATGTA GAAGCTACTG TCGCTCTCTT  AGGTACCATC TTTTAACTAC ATAGATCATC TAATCTAAAC GTGCATGATC AGTAACACTT AACTAGGATC GAGTCTGGTC CAAAACCAAA AACAAAAACC GAAAGATAAG AGTTTTGGTT  CGATCTAAAA CAAATTTTTG TCTTTTAATC TTGACTCAAC CATAAAAATT TGATTCTTAT CAATCATATA TCTAGTAATA CAATAATTTT TTATATGGAA AGCTACGTCA ATAGTAAATT  TACTTTTTTT TGGGTTATGA ATAAAACCAG ATCTTTATAA CATAATCTTG TTTTGTTATA TAAATTTGGT ATTGATTTTT ATTAAAAAAA TATTAAAAAA TTGGTATTGA TAGAGATGGA  AGTAAAATGA TATATAAAAT CATGGAATTT TTCTTAGAGA TATATGAATG ATGAAATCTT GAATAAGAAT GACATTGTTA TTGATTAGTC AATTTATATT ACCGTAGGTG CTCACTCAGT  GGGCAGGGTC CACTGCGTTA ACCTAGTGCA CCGGCTATAT CCAACGGTCG ACCCGACTCT CGACCCAAGT TACGCCCTTT ACTTGAAGAA TCGTTGCCCA ACTCCAACAC CGGACCCGAA  CGCCGTCTTG TACTCCCGCA ACGATCGCGA GACCCCTATG GTTGTGGACA ACATGTACTA CAAGAACATC ATGGCACACA AGGGGCTTCT TGTTATCGAT GATGAGCTAG CCACCGATCC  AAGGACCGCA CCGTTTGTGG CCAAGATGGC TGCGGACAAT GGTTACTTCC ACGAGCAGTT CTCACGCGGC GTCAGGCTCT TGTCGGAGAC AAACCCGCTT ACCGGAGACC AAGGGGAGAT  CAGGAAGGAT TGTCGTTATG TGAACTAATA TTTGGTTATA ATGTTGTGAA AGATAATAAT CATATATATG AATGTATGTA TTTGAATGTT TTGGATTCAA TAAGAAGAAA TACCAAAACC 
TTTGTGGATT GAGATATGTT TGGATCGTCC TACGTTTTCG ATGGG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCCAGTG TGAAGCCCTT CTGCCTCCTC AGCTTCTTTT GTCTGTTATT ACAGTTGTTC TCCATCTTCC ATATCGGAAA TGGGGAGTTG GAGATGAACT ATTACAGAGA GAGTTGTCCA  AAAGCGGAAG AGATTATTAG ACAACAAGTG GAGACGCTTT ACTACAAACA CGGCAACACT GCCGTCTCTT GGCTCCGTAA TCTCTTCCAT GACTGTGTCG TCAAGTCGTG TGATGCGTCG  CTGCTGCTAG AGACAGCGAG AGGTGTGGAG TCTGAGCAGA AATCGACGAG GAGCTTCGGT ATGAGAAACT TTAAGTACGT TAAGATTATC AAAGACGCAC TTGAGAAAGA GTGTCCTTCC  ACTGTCTCTT GCGCTGATAT CGTCGCTCTC TCTGCTAGAG ACGGTATTGT CATGTTGAAA GGGCCAAAAA TAGAGATGAT AAAGACAGGA AGGAGAGATA GCAGAGGAAG CTACTTGGCA  GACGTTGAGA CTCTAATCCC TAACCACAAT GACTCTCTCT CCTCTGTTCT CTCCACCTTT GACTCCCTTG GCATTGATGT AGAAGCTACT GTCGCTCTCT TAGGTGCTCA CTCAGTGGGC  AGGGTCCACT GCGTTAACCT AGTGCACCGG CTATATCCAA CGGTCGACCC GACTCTCGAC CCAAGTTACG CCCTTTACTT GAAGAATCGT TGCCCAACTC CAACACCGGA CCCGAACGCC  GTCTTGTACT CCCGCAACGA TCGCGAGACC CCTATGGTTG TGGACAACAT GTACTACAAG AACATCATGG CACACAAGGG GCTTCTTGTT ATCGATGATG AGCTAGCCAC CGATCCAAGG  ACCGCACCGT TTGTGGCCAA GATGGCTGCG GACAATGGTT ACTTCCACGA GCAGTTCTCA CGCGGCGTCA GGCTCTTGTC GGAGACAAAC CCGCTTACCG GAGACCAAGG GGAGATCAGG 
AAGGATTGTC GTTATGTGAA CTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GGACACACAA ACAATTATTT TAGTAGAAAA AAAAAAGAGA GAAAGAGAGA GCAATGGCCA GTGTGAAGCC CTTCTGCCTC CTCAGCTTCT TTTGTCTGTT ATTACAGTTG TTCTCCATCT  TCCATATCGG AAATGGGGAG TTGGAGATGA ACTATTACAG AGAGAGTTGT CCAAAAGCGG AAGAGATTAT TAGACAACAA GTGGAGACGC TTTACTACAA ACACGGCAAC ACTGCCGTCT  CTTGGCTCCG TAATCTCTTC CATGACTGTG TCGTCAAGTC GTGTGATGCG TCGCTGCTGC TAGAGACAGC GAGAGGTGTG GAGTCTGAGC AGAAATCGAC GAGGAGCTTC GGTATGAGAA  ACTTTAAGTA CGTTAAGATT ATCAAAGACG CACTTGAGAA AGAGTGTCCT TCCACTGTCT CTTGCGCTGA TATCGTCGCT CTCTCTGCTA GAGACGGTAT TGTCATGTTG AAAGGGCCAA  AAATAGAGAT GATAAAGACA GGAAGGAGAG ATAGCAGAGG AAGCTACTTG GCAGACGTTG AGACTCTAAT CCCTAACCAC AATGACTCTC TCTCCTCTGT TCTCTCCACC TTTGACTCCC  TTGGCATTGA TGTAGAAGCT ACTGTCGCTC TCTTAGGTGC TCACTCAGTG GGCAGGGTCC ACTGCGTTAA CCTAGTGCAC CGGCTATATC CAACGGTCGA CCCGACTCTC GACCCAAGTT  ACGCCCTTTA CTTGAAGAAT CGTTGCCCAA CTCCAACACC GGACCCGAAC GCCGTCTTGT ACTCCCGCAA CGATCGCGAG ACCCCTATGG TTGTGGACAA CATGTACTAC AAGAACATCA  TGGCACACAA GGGGCTTCTT GTTATCGATG ATGAGCTAGC CACCGATCCA AGGACCGCAC CGTTTGTGGC CAAGATGGCT GCGGACAATG GTTACTTCCA CGAGCAGTTC TCACGCGGCG  TCAGGCTCTT GTCGGAGACA AACCCGCTTA CCGGAGACCA AGGGGAGATC AGGAAGGATT GTCGTTATGT GAACTAATAT TTGGTTATAA TGTTGTGAAA GATAATAATC ATATATATGA 
ATGTATGTAT TTGAATGTTT TGGATTCAAT AAGAAGAAAT ACCAAAACCT TTGTGGATTG AGATATGTTT GGATCGTCCT ACGTTTTCGA TGGG 

Retrieve as FASTA