Entry information : CrubAPx-R01 (Carubv10007089m.g)
Entry ID 15083
Creation 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CrubAPx-R01 (Carubv10007089m.g)
Name (synonym) CrubAPx-R01 (Carubv10007089m.g)
Class Ascorbate peroxidase related    [Orthogroup: APx-R001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella rubella    [TaxId: 81985 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CrubAPx-R01
start..stop
S start..stop
CagraAPx-R01 669 0 1..327 1..327
BstrAPx-R01 609 0 1..327 1..331
AlyAPx-R 592 0 3..327 2..329
AtAPx-R 583 0 3..327 2..329
Literature and cross-references CrubAPx-R01 (Carubv10007089m.g)
Protein sequence: CrubAPx-R01 (Carubv10007089m.g)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   327
PWM (Da):   %s   35928.74  
PI (pH):   %s   9.47
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MTTATTASLL ETSLFRCDSS SSSFKFKLPA KTRLLPPVTG KHVVRTLRAW RIRCVSDDPG WRPDLVSSRR KMVVMLSTVQ LLSHLVPPYG KAADIYPVMQ NEIRKVVTKG KAAGVLRLVF  HDAGTFELED NSGGINGSIA YELERPENTG LKKSLKVLAK AKIKVDEIQP VSWADMISVA GSEAVSICGG PIIPVLLGRL DSTQPDPEGK LPPETLSASG LKECFKRKGF STQELVALSG 
AHTIGSKGFG DPTVFDNAYY KILLEKPWTS ASKMTSMVGL PSDHALVDDD ECLRWVKRYA EDQDKFFEDF TNAYKKLVNS GAKWNKL* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACGACGG CGACGACTGC GTCACTGTTG GAGACTTCTC TTTTCCGGTG CGACTCGTCT TCTTCTTCTT TCAAATTCAA ACTTCCAGCG AAAACGCGAC TGCTCCCTCC GGTGACCGGG  AAACATGTTG TGAGAACGTT AAGAGCTTGG CGTATTCGTT GCGTCTCCGA TGATCCTGGT AAGACCGGAT TCTAGTATCC TTAAACATTT CTGTTCTAAG GTTCCTCTTT CCGTCGATCT  CGGAACAGAA TAGCTTCGTT TTATAATTTG AAATGAAATG CTTGGTCCGA TTGGAAAACT TCAAATGCTT GGAGTCCGAT TCGTGCTGAG GTTGTTCTGT TTCTGCATAA TTTCTAGGTT  GGCGTCCTGA TTTGGTTTCC AGTAGAAGAA AAATGGTTGT AATGTTGTCC ACAGTGCAGC TTCTGTCTCA TTTGGTTCCG CCATATGGCA AGGCAGCTGA GTGAGTCTTA AAAATTGAAG  CTGGATTTTG GTTTGGTTAT TTGGATCAGT GTTCTTCAAG CTATTGTATT CCAAGGTCTT GTGCTAATTT TGCAAATCGC ACTGTTGGAT TACAGCATTT ATCCAGTGAT GCAAAACGAA  ATAAGGAAAG TCGTGACAAA GGGTAAGGCT GCTGGTGTGC TTCGTCTAGT GTTTCATGAT GCTGGAACCT TTGAGCTGGA AGATAATTCA GGTAAACAGA TAAGTTTTAA AGTGTAAACA  TTTGGTTGTT AGATCACTTC TATTGGTTAT CTTTTCTTGC TTTCTCAGTA AAAGATACTG CAATCCACTA GCTAAGATCA ATTGTGTTTT TGGTTATGAA TTTAATTGCA GGTGGCATCA  ACGGGTCTAT TGCATATGAA CTTGAGAGAC CTGAAAACAC TGGTTTGAAG AAATCCTTAA AGGCACTAAA TCCCTCTCTT TAATCTGTTA GCGTGAGCAT ATAAAGATGT AATTTTCGCA  TCTACGTAAC TGCCTTTTTT GTATATATTT GCTCTTGTAT CTCAAATATG TTACATTCGA AAATTGCATC TACTAATCTT CTTGGTAGAT GTATTCTTTG CTAGGTTCTA GCAAAAGCAA  AGATTAAGGT TGATGAGATA CAACCAGGTA CTTACTTTTT GAACTATGTG TCCTGTCATG AGCGTTGTTG CTAATGTTCT CAATCTGCGT GATCTCAGTG TCTTGGGCAG ATATGATCTC  TGTCGCTGGA TCAGAAGCAG TTTCAATATG TGGCGGCCCA ATAATTCCAG TACTTTTGGG AAGACTTGAT TCAACGTAAG CAATATATGG TTGTAGTCCT CATTCGATTG ATTTCTGGTT  ACTGTTTCTA TATTTCCAGC AGGGTGATTT TCTCATGTTT ACAGGCAACC TGATCCAGAA GGCAAGCTAC CTCCAGAAAC CCTGAGTGCC TCTGGTTTAA AAGAATGCTT CAAAAGAAAA  GGATTTTCGT AAGTCGTTAC ACAAAGATAG CTATGAATTG TTTTAACATG TTTTTGTATC AGCATTTTGT AACTCGACAT CAATGGGTTT GTGTACCATT GCAGGACTCA GGAGCTTGTT  GCTTTATCTG GGGCACATAC GATAGGGAGT AAAGGCTTTG GGGATCCGAC AGTTTTTGAC AATGCATACT ACAAAATCCT TCTTGAAAAA CCATGGACAT CAGCTTGTAA GTCTGATGAC  AAAGTTCTTA AGTTCCTTAA CTCGTACAAT TTAAGTTTCC ACCCATTCCT CCCTATGTTC TGAAGATTGT TTGTAAAACT GAGATTATAC ATTTACATAG TTAAGTTCTT ATGATGCAGC  CAAAATGACG AGCATGGTCG GCCTCCCTTC GGATCATGCC TTAGTGGACG ATGATGAGTG TTTAAGGTTT CTCAGTTTCT GAACGTTCTT ACCTTATCAT TTATTTATCT AATTTTCTCT  TTAGTACTAA TTTTAGTAGA GTGGAGTAAT GTGCTGAACA CTTGGACTAT AGGCTCATAG ATAAAACTGG AATATGTTGC ACATTGTTCA TGTCATATGA GCGATCTGGA AAACTATTAA  TTGATATAGA TTTGTGGTTT GATGATGCAC AGATGGGTGA AACGATATGC GGAAGACCAA GACAAGTTCT TCGAAGACTT CACCAATGCT TATAAAAAAC TAGTGAATTC TGGGGCTAAA 
TGGAATAAGT TATGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACGACGG CGACGACTGC GTCACTGTTG GAGACTTCTC TTTTCCGGTG CGACTCGTCT TCTTCTTCTT TCAAATTCAA ACTTCCAGCG AAAACGCGAC TGCTCCCTCC GGTGACCGGG  AAACATGTTG TGAGAACGTT AAGAGCTTGG CGTATTCGTT GCGTCTCCGA TGATCCTGGT TGGCGTCCTG ATTTGGTTTC CAGTAGAAGA AAAATGGTTG TAATGTTGTC CACAGTGCAG  CTTCTGTCTC ATTTGGTTCC GCCATATGGC AAGGCAGCTG ACATTTATCC AGTGATGCAA AACGAAATAA GGAAAGTCGT GACAAAGGGT AAGGCTGCTG GTGTGCTTCG TCTAGTGTTT  CATGATGCTG GAACCTTTGA GCTGGAAGAT AATTCAGGTG GCATCAACGG GTCTATTGCA TATGAACTTG AGAGACCTGA AAACACTGGT TTGAAGAAAT CCTTAAAGGT TCTAGCAAAA  GCAAAGATTA AGGTTGATGA GATACAACCA GTGTCTTGGG CAGATATGAT CTCTGTCGCT GGATCAGAAG CAGTTTCAAT ATGTGGCGGC CCAATAATTC CAGTACTTTT GGGAAGACTT  GATTCAACGC AACCTGATCC AGAAGGCAAG CTACCTCCAG AAACCCTGAG TGCCTCTGGT TTAAAAGAAT GCTTCAAAAG AAAAGGATTT TCGACTCAGG AGCTTGTTGC TTTATCTGGG  GCACATACGA TAGGGAGTAA AGGCTTTGGG GATCCGACAG TTTTTGACAA TGCATACTAC AAAATCCTTC TTGAAAAACC ATGGACATCA GCTTCCAAAA TGACGAGCAT GGTCGGCCTC  CCTTCGGATC ATGCCTTAGT GGACGATGAT GAGTGTTTAA GATGGGTGAA ACGATATGCG GAAGACCAAG ACAAGTTCTT CGAAGACTTC ACCAATGCTT ATAAAAAACT AGTGAATTCT 
GGGGCTAAAT GGAATAAGTT ATGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACGACGG CGACGACTGC GTCACTGTTG GAGACTTCTC TTTTCCGGTG CGACTCGTCT TCTTCTTCTT TCAAATTCAA ACTTCCAGCG AAAACGCGAC TGCTCCCTCC GGTGACCGGG  AAACATGTTG TGAGAACGTT AAGAGCTTGG CGTATTCGTT GCGTCTCCGA TGATCCTGGT TGGCGTCCTG ATTTGGTTTC CAGTAGAAGA AAAATGGTTG TAATGTTGTC CACAGTGCAG  CTTCTGTCTC ATTTGGTTCC GCCATATGGC AAGGCAGCTG ACATTTATCC AGTGATGCAA AACGAAATAA GGAAAGTCGT GACAAAGGGT AAGGCTGCTG GTGTGCTTCG TCTAGTGTTT  CATGATGCTG GAACCTTTGA GCTGGAAGAT AATTCAGGTG GCATCAACGG GTCTATTGCA TATGAACTTG AGAGACCTGA AAACACTGGT TTGAAGAAAT CCTTAAAGGT TCTAGCAAAA  GCAAAGATTA AGGTTGATGA GATACAACCA GTGTCTTGGG CAGATATGAT CTCTGTCGCT GGATCAGAAG CAGTTTCAAT ATGTGGCGGC CCAATAATTC CAGTACTTTT GGGAAGACTT  GATTCAACGC AACCTGATCC AGAAGGCAAG CTACCTCCAG AAACCCTGAG TGCCTCTGGT TTAAAAGAAT GCTTCAAAAG AAAAGGATTT TCGACTCAGG AGCTTGTTGC TTTATCTGGG  GCACATACGA TAGGGAGTAA AGGCTTTGGG GATCCGACAG TTTTTGACAA TGCATACTAC AAAATCCTTC TTGAAAAACC ATGGACATCA GCTTCCAAAA TGACGAGCAT GGTCGGCCTC  CCTTCGGATC ATGCCTTAGT GGACGATGAT GAGTGTTTAA GATGGGTGAA ACGATATGCG GAAGACCAAG ACAAGTTCTT CGAAGACTTC ACCAATGCTT ATAAAAAACT AGTGAATTCT 
GGGGCTAAAT GGAATAAGTT ATGA 

Retrieve as FASTA