Entry information : CrubPrx89Carubv10001445m.g
Entry ID 15087
Creation 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CrubPrx89Carubv10001445m.g
Name CrubPrx89Carubv10001445m.g
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx009]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella rubella    [TaxId: 81985 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CrubPrx89
start..stop
S start..stop
CagraPrx22 649 0 10..326 1..317
BstrPrx83 649 0 1..326 1..326
AtPrx39 638 0 1..326 1..326
AlyPrx39 634 0 1..326 1..327
Literature and cross-references CrubPrx89Carubv10001445m.g
Protein sequence: CrubPrx89Carubv10001445m.g
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   326 (303)
PWM (Da):   %s   35575.12 (33083.8)  
PI (pH):   %s   8.4 (8.40) Peptide Signal:   %s   cut: 24 range:24-326
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MARFGLALVM ILAILGSVSF SEAQLKMGFY DKTCPYAEKI VQDVVNQHIH NAPSLAAGLI RMHFHDCFVR GCDGSILINA TSRNQQVEKL APPNLTVRGF DFIDKVKSAL ESKCPGIVSC  ADIITLATRD SIVAIGGPTW NVPTGRRDGR ISNFIEARNN IPPPFGNFTT LITLFGNQGL DVKDLVLLSG AHTIGVSHCS SFSKRLFNFT GVGDQDPSLD SEYAANLKSR RCLSIADNTT 
KVEMDPGSRN TFDLSYFRLV LKRRGLFESD AALTMDPAAL AQVRRFAGGS EQEFFAEFAK AMEKMGRIGV KTGSDGEIRR TCAFVN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATCAAATTTT TCTAAGTGTG ACATCTAAAA CAAAATGGCG AGATTCGGGT TAGCTCTTGT AATGATTCTT GCGATTCTAG GATCTGTGAG CTTTTCAGAA GCTCAGTTGA AGATGGGATT  CTACGACAAA ACTTGCCCTT ACGCAGAGAA GATTGTACAA GATGTTGTCA ACCAACATAT CCACAATGCA CCTTCTTTGG CCGCTGGCCT TATCAGGATG CATTTTCATG ATTGCTTCGT  TCGGGTATAT ATGATCACTA TCTTTCTAGT TATACAATTC ATAAACTATA TATATTAGTT TATCTGCGAA TTATATCATA AGTATACTCA ATATACATAC TATTGCTCGA AACTGTTATT  AACAATCTCC AAGATAAGTA AATTAAAGAA AACGTCTAAG TTCTAATCAT ATAATTACTT TTTTAGGCAT TTGTTTATCA TATATTATAT GCAAAAACGT ATATTTTTTC ATATGAATAC  GTACGTATTG GTGTTGACAG GGTTGTGATG GTTCGATCTT GATCAACGCG ACATCGAGGA ACCAACAAGT CGAGAAGCTT GCTCCTCCGA ATCTAACTGT TAGAGGTTTC GACTTCATCG  ATAAAGTAAA GTCTGCTCTA GAATCAAAAT GCCCTGGAAT CGTCTCCTGC GCCGATATCA TCACCCTCGC TACTAGAGAC TCTATTGTTG CTATTGTGAG TATGCTAATA CTTTAAGTTA  CCTCGATAAG TCTAAACTCT AAACTTGATC GACACTAAAA CTAACGGGGT TCGATTATTT TGGCTTAGGG TGGACCAACA TGGAATGTTC CAACAGGACG TAGAGACGGA CGTATCTCTA  ACTTTATCGA GGCTCGGAAC AATATCCCTC CTCCTTTTGG GAACTTCACG ACTCTTATAA CCTTATTTGG AAACCAAGGA CTTGATGTTA AAGACCTCGT CTTATTGTCC GGTAAAATCC  TACTCCAAAT TGTCTTTTTT TGGGTTTGGT TTTGTAACGT GGGTTATTAC AAACGTCGTC GTTTTCGTAA CACTGTCAAA TTTAAACGTT TTAGGTGCAC ACACTATTGG AGTGTCTCAT  TGCTCATCCT TCTCAAAACG TCTCTTCAAT TTCACCGGTG TTGGAGACCA AGACCCGTCC CTCGACAGCG AATACGCTGC CAATCTCAAG TCGCGGAGAT GCTTGTCTAT CGCCGACAAT  ACAACAAAGG TCGAAATGGA TCCCGGCAGT AGAAACACCT TTGATCTTAG CTACTTCCGT CTTGTCCTGA AACGTCGTGG ACTTTTCGAG TCTGACGCTG CATTAACTAT GGATCCTGCG  GCGTTGGCTC AGGTCAGACG TTTCGCGGGA GGATCGGAAC AAGAGTTTTT TGCTGAGTTC GCAAAGGCAA TGGAGAAAAT GGGAAGGATT GGTGTCAAAA CCGGGTCAGA TGGTGAAATC  CGAAGAACAT GTGCATTTGT TAATTGAAAA GGTTTCTCAC TTTTGTCTTT TTGAATGGTT TTTAATATCG TTAATTTTGG ATGTTTTTTG TGTGACTTTT TTGGGTATTT AATTTACAAT 
TTCGTGATAT GTATTTATGT GGTGGAAATG TGATTTTCCG AATAAATTTC ACGTATGTGA AATCGTTGTA CTATAAATCT TCCATTCATT TATCTATCAA TAAAAAAATT GC 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGAGAT TCGGGTTAGC TCTTGTAATG ATTCTTGCGA TTCTAGGATC TGTGAGCTTT TCAGAAGCTC AGTTGAAGAT GGGATTCTAC GACAAAACTT GCCCTTACGC AGAGAAGATT  GTACAAGATG TTGTCAACCA ACATATCCAC AATGCACCTT CTTTGGCCGC TGGCCTTATC AGGATGCATT TTCATGATTG CTTCGTTCGG GGTTGTGATG GTTCGATCTT GATCAACGCG  ACATCGAGGA ACCAACAAGT CGAGAAGCTT GCTCCTCCGA ATCTAACTGT TAGAGGTTTC GACTTCATCG ATAAAGTAAA GTCTGCTCTA GAATCAAAAT GCCCTGGAAT CGTCTCCTGC  GCCGATATCA TCACCCTCGC TACTAGAGAC TCTATTGTTG CTATTGGTGG ACCAACATGG AATGTTCCAA CAGGACGTAG AGACGGACGT ATCTCTAACT TTATCGAGGC TCGGAACAAT  ATCCCTCCTC CTTTTGGGAA CTTCACGACT CTTATAACCT TATTTGGAAA CCAAGGACTT GATGTTAAAG ACCTCGTCTT ATTGTCCGGT GCACACACTA TTGGAGTGTC TCATTGCTCA  TCCTTCTCAA AACGTCTCTT CAATTTCACC GGTGTTGGAG ACCAAGACCC GTCCCTCGAC AGCGAATACG CTGCCAATCT CAAGTCGCGG AGATGCTTGT CTATCGCCGA CAATACAACA  AAGGTCGAAA TGGATCCCGG CAGTAGAAAC ACCTTTGATC TTAGCTACTT CCGTCTTGTC CTGAAACGTC GTGGACTTTT CGAGTCTGAC GCTGCATTAA CTATGGATCC TGCGGCGTTG  GCTCAGGTCA GACGTTTCGC GGGAGGATCG GAACAAGAGT TTTTTGCTGA GTTCGCAAAG GCAATGGAGA AAATGGGAAG GATTGGTGTC AAAACCGGGT CAGATGGTGA AATCCGAAGA 
ACATGTGCAT TTGTTAATTG A 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATCAAATTTT TCTAAGTGTG ACATCTAAAA CAAAATGGCG AGATTCGGGT TAGCTCTTGT AATGATTCTT GCGATTCTAG GATCTGTGAG CTTTTCAGAA GCTCAGTTGA AGATGGGATT  CTACGACAAA ACTTGCCCTT ACGCAGAGAA GATTGTACAA GATGTTGTCA ACCAACATAT CCACAATGCA CCTTCTTTGG CCGCTGGCCT TATCAGGATG CATTTTCATG ATTGCTTCGT  TCGGGGTTGT GATGGTTCGA TCTTGATCAA CGCGACATCG AGGAACCAAC AAGTCGAGAA GCTTGCTCCT CCGAATCTAA CTGTTAGAGG TTTCGACTTC ATCGATAAAG TAAAGTCTGC  TCTAGAATCA AAATGCCCTG GAATCGTCTC CTGCGCCGAT ATCATCACCC TCGCTACTAG AGACTCTATT GTTGCTATTG GTGGACCAAC ATGGAATGTT CCAACAGGAC GTAGAGACGG  ACGTATCTCT AACTTTATCG AGGCTCGGAA CAATATCCCT CCTCCTTTTG GGAACTTCAC GACTCTTATA ACCTTATTTG GAAACCAAGG ACTTGATGTT AAAGACCTCG TCTTATTGTC  CGGTGCACAC ACTATTGGAG TGTCTCATTG CTCATCCTTC TCAAAACGTC TCTTCAATTT CACCGGTGTT GGAGACCAAG ACCCGTCCCT CGACAGCGAA TACGCTGCCA ATCTCAAGTC  GCGGAGATGC TTGTCTATCG CCGACAATAC AACAAAGGTC GAAATGGATC CCGGCAGTAG AAACACCTTT GATCTTAGCT ACTTCCGTCT TGTCCTGAAA CGTCGTGGAC TTTTCGAGTC  TGACGCTGCA TTAACTATGG ATCCTGCGGC GTTGGCTCAG GTCAGACGTT TCGCGGGAGG ATCGGAACAA GAGTTTTTTG CTGAGTTCGC AAAGGCAATG GAGAAAATGG GAAGGATTGG  TGTCAAAACC GGGTCAGATG GTGAAATCCG AAGAACATGT GCATTTGTTA ATTGAAAAGG TTTCTCACTT TTGTCTTTTT GAATGGTTTT TAATATCGTT AATTTTGGAT GTTTTTTGTG  TGACTTTTTT GGGTATTTAA TTTACAATTT CGTGATATGT ATTTATGTGG TGGAAATGTG ATTTTCCGAA TAAATTTCAC GTATGTGAAA TCGTTGTACT ATAAATCTTC CATTCATTTA 
TCTATCAATA AAAAAATTGC 

Retrieve as FASTA