Entry information : CrubPrx90Carubv10017550m.g
Entry ID 15088
Creation 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CrubPrx90Carubv10017550m.g
Name CrubPrx90Carubv10017550m.g
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx035]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella rubella    [TaxId: 81985 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CrubPrx90
start..stop
S start..stop
CagraPrx30 718 0 1..351 1..351
CrubPrx107 610 0 9..351 12..353
BstrPrx03 607 0 3..351 6..353
AlyPrx33 605 0 1..351 1..349
Literature and cross-references CrubPrx90Carubv10017550m.g
Protein sequence: CrubPrx90Carubv10017550m.g
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   351 (324)
PWM (Da):   %s   38781.52 (35654.0)  
PI (pH):   %s   6.03 (5.72) Peptide Signal:   %s   cut: 28 range:28-351
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MKFSASFTWT TLITLVCLML HVSLSDAQLT PTFYDTSCPR VTTIVRDTIV EELRSDPRIA ASILRLHFHD CFVNGCDASI LLDNTTTFRT EKDALGNANS ARGFPVIDRM KAAIERACPR  TVSCADMLTI AAQQSVTLAG GPSWRVPLGR RDSLQAFLQL ANDNLPSPFE SLQEIKDKFS NVGLTLPSDL VALSGGHTFG KNQCQFITNR LYNFNNTGLP DPTLDATYLQ TLRGQCPQNG 
NPRALVDFDL RTPTVFDNKY YVNLKERKGL LQTDQVLFSS PDATDTSPLV REYADGTQKF FDAFVVAMNR MGNITPLTGT QGQIRLNCSV VNSNSLLHDV VEILDNFVSS M* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GAAATGCCTT CATACGAGAA CCAAATAAAG AAATGAATAG GATTCTTTTT TTTTTTACGA ATTAAAAGAA AGAAAAAAAA AATTGTACAT GCCTCCAGGT TTGACCCACA TTTTGGCTAT  AAAAGGATTC TATAAGATAA GGACCTTACT CATCTTCCCC ATTAAAACCT AATCACATAG TTTTCTTTTT CCTTGCCAAA AGATGAAGTT CTCTGCTTCG TTCACTTGGA CAACCTTAAT  CACATTGGTA TGTCTTATGC TTCATGTTTC TTTGTCCGAT GCTCAACTTA CCCCTACATT CTACGACACT TCATGTCCTA GAGTTACTAC CATCGTAAGA GATACCATTG TCGAAGAGTT  AAGGTCAGAC CCTCGTATCG CCGCGAGCAT CCTTCGTCTT CACTTCCACG ACTGCTTTGT TAATGTAAGA AATTAACTTT ACATATATCT ATAGCGATAC GAATCACTGT GGTTCATCTT  ATAAATATTA ATATGTTAGT GTAAAAAGTA GATAAAAAAC AAAAGTAGAT AACAAGTATA CTTAGTCATC GGCACACGCA ATCTTAGTTG ATACTCTTTT TGCTCTAAAT ACTAAATCTC  AAGTATGTTA GATGCCATAT GTTTGCTTTT CCTATTGAAT AATTTAATAC TTATCTCTCG TCGACACTCG ATCGACAATG ATGTTTCTGG TTATTATTTA TTTCTTGCAC AATAATGATG  CCAAAACGTT TATGAAGTCG GATTCACAAA GATGAATTAT GCATGCTACA GTAGGTAGCA AGAGCATGGT GCCGTACCAT ACACGTCAGA AATTTAACAT CCATCAATCA TTTTTTTTTG  TTTTTGTTTT TTTTTGAGAG AGATATATAA CAAATAGACT TTTCAAACAT CATTCTACTG ATAGATATAC ATATAATCAA TCTTCATTGA CTACTTAGCT TGCTTTAGAG GAACAAATAG  CTTTAACGGT TGACAAAAGA AAAAAAAAAG TTTTCTGTTA AATTGTTACA TTTGGTAAAA ATTTAGTTAT GGATGGACGT AATACATTGA CTAACCATTT GTTATACATA ATATTTTGGA  CTTATGAAAG GGTTGTGACG CATCGATCTT GTTGGATAAC ACAACAACAT TCCGAACAGA GAAAGATGCG CTTGGAAACG CAAATTCGGC TAGGGGATTC CCAGTGATTG ATAGAATGAA  AGCCGCAATA GAGAGGGCTT GCCCGAGAAC TGTTTCATGC GCAGATATGC TCACCATTGC AGCTCAACAA TCTGTTACTT TGGTATGCTT ATGCTCTACT GCTCCATCTT CATTTACAAA  CATTGTTTTC AACTTTATAT TTCAAGTTGT ACCTTTGCAT ATATCAAACA TGACGGCCTC AAGTTCTTAA AGAAAACAAT TGAGATATTT TTAGTCGTTT AAAAACGTCA CAATCTTTAT  TTAGTATCGA CTTTTGAATA TATATTTTGA AAAGTATTGA AATTTATTTG AGAAATATTC GAAACGCGTG GTCCCGTTAA GAAAATTTGA TAACACTATA TCTCTCATTA CTTGGATTTT  ACCTGGTTAG GCAAGACTTG AACCTTTTTC GTGAAAGAAT AATTTTCATT TATTTCAAAG AAAAAGTAGA AAAGCTTACT CTTGAGTATA TAATTATGAT TTTGTGATAC ATGTTTGTCT  TTTTCTCTTT GCATATTCGA GTGATAAAAA TAATCTAAGA AGATAGTTAA TTTGAATGTA ATGGTTATTA TACTATATTA GGCAGGAGGT CCTTCTTGGA GAGTTCCTTT GGGGAGAAGA  GACAGCTTAC AAGCATTTTT GCAACTCGCT AATGATAATC TTCCTAGTCC ATTCGAATCA CTTCAAGAAA TTAAAGATAA GTTTAGCAAT GTTGGCCTCA CCCTTCCTTC TGATCTCGTT  GCTCTCTCCG GTAATTAATA CAAGTGTATT AAACATGTTT TTCATATATA TAGTTGTAAT CAGCTGAGTT TTGTTACTAA TTGATCTTAT GGTTTCTCTA TTTGTTAGGT GGCCATACAT  TTGGTAAAAA CCAGTGCCAG TTTATTACGA ACAGACTATA CAACTTTAAC AATACTGGTT TACCCGATCC TACTCTCGAC GCTACTTACC TCCAAACTCT TCGTGGACAA TGTCCCCAAA  ATGGTAATCC AAGAGCCTTG GTGGATTTTG ATCTCCGCAC GCCTACGGTT TTCGACAACA AATACTACGT GAATCTGAAA GAAAGAAAAG GTCTTCTCCA AACCGATCAA GTGTTGTTCT  CTAGCCCCGA TGCCACAGAC ACGAGCCCCT TGGTGAGAGA ATATGCTGAT GGCACACAAA AGTTCTTTGA TGCCTTCGTG GTGGCTATGA ACAGGATGGG AAACATTACA CCTCTTACAG  GAACTCAAGG ACAAATCAGG TTGAACTGTA GCGTGGTGAA CTCCAACTCT CTACTCCATG ATGTGGTGGA GATTCTTGAC AACTTTGTTA GCTCTATGTG AGAATTGTGT ACTAAATATA  ATATATGTCG CTACAAGAAT ACGTATCAAT AAATAAAACT CTCAAAGCTG TTATTACTTG AGAATATTAT ATTTAAATTT CTCTTTTTCT AGATTTTTGT AAAACATACT CCATGTGTTC 
TTTATTAATT AA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGTTCT CTGCTTCGTT CACTTGGACA ACCTTAATCA CATTGGTATG TCTTATGCTT CATGTTTCTT TGTCCGATGC TCAACTTACC CCTACATTCT ACGACACTTC ATGTCCTAGA  GTTACTACCA TCGTAAGAGA TACCATTGTC GAAGAGTTAA GGTCAGACCC TCGTATCGCC GCGAGCATCC TTCGTCTTCA CTTCCACGAC TGCTTTGTTA ATGGTTGTGA CGCATCGATC  TTGTTGGATA ACACAACAAC ATTCCGAACA GAGAAAGATG CGCTTGGAAA CGCAAATTCG GCTAGGGGAT TCCCAGTGAT TGATAGAATG AAAGCCGCAA TAGAGAGGGC TTGCCCGAGA  ACTGTTTCAT GCGCAGATAT GCTCACCATT GCAGCTCAAC AATCTGTTAC TTTGGCAGGA GGTCCTTCTT GGAGAGTTCC TTTGGGGAGA AGAGACAGCT TACAAGCATT TTTGCAACTC  GCTAATGATA ATCTTCCTAG TCCATTCGAA TCACTTCAAG AAATTAAAGA TAAGTTTAGC AATGTTGGCC TCACCCTTCC TTCTGATCTC GTTGCTCTCT CCGGTGGCCA TACATTTGGT  AAAAACCAGT GCCAGTTTAT TACGAACAGA CTATACAACT TTAACAATAC TGGTTTACCC GATCCTACTC TCGACGCTAC TTACCTCCAA ACTCTTCGTG GACAATGTCC CCAAAATGGT  AATCCAAGAG CCTTGGTGGA TTTTGATCTC CGCACGCCTA CGGTTTTCGA CAACAAATAC TACGTGAATC TGAAAGAAAG AAAAGGTCTT CTCCAAACCG ATCAAGTGTT GTTCTCTAGC  CCCGATGCCA CAGACACGAG CCCCTTGGTG AGAGAATATG CTGATGGCAC ACAAAAGTTC TTTGATGCCT TCGTGGTGGC TATGAACAGG ATGGGAAACA TTACACCTCT TACAGGAACT 
CAAGGACAAA TCAGGTTGAA CTGTAGCGTG GTGAACTCCA ACTCTCTACT CCATGATGTG GTGGAGATTC TTGACAACTT TGTTAGCTCT ATGTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GAAATGCCTT CATACGAGAA CCAAATAAAG AAATGAATAG GATTCTTTTT TTTTTTACGA ATTAAAAGAA AGAAAAAAAA AATTGTACAT GCCTCCAGGT TTGACCCACA TTTTGGCTAT  AAAAGGATTC TATAAGATAA GGACCTTACT CATCTTCCCC ATTAAAACCT AATCACATAG TTTTCTTTTT CCTTGCCAAA AGATGAAGTT CTCTGCTTCG TTCACTTGGA CAACCTTAAT  CACATTGGTA TGTCTTATGC TTCATGTTTC TTTGTCCGAT GCTCAACTTA CCCCTACATT CTACGACACT TCATGTCCTA GAGTTACTAC CATCGTAAGA GATACCATTG TCGAAGAGTT  AAGGTCAGAC CCTCGTATCG CCGCGAGCAT CCTTCGTCTT CACTTCCACG ACTGCTTTGT TAATGGTTGT GACGCATCGA TCTTGTTGGA TAACACAACA ACATTCCGAA CAGAGAAAGA  TGCGCTTGGA AACGCAAATT CGGCTAGGGG ATTCCCAGTG ATTGATAGAA TGAAAGCCGC AATAGAGAGG GCTTGCCCGA GAACTGTTTC ATGCGCAGAT ATGCTCACCA TTGCAGCTCA  ACAATCTGTT ACTTTGGCAG GAGGTCCTTC TTGGAGAGTT CCTTTGGGGA GAAGAGACAG CTTACAAGCA TTTTTGCAAC TCGCTAATGA TAATCTTCCT AGTCCATTCG AATCACTTCA  AGAAATTAAA GATAAGTTTA GCAATGTTGG CCTCACCCTT CCTTCTGATC TCGTTGCTCT CTCCGGTGGC CATACATTTG GTAAAAACCA GTGCCAGTTT ATTACGAACA GACTATACAA  CTTTAACAAT ACTGGTTTAC CCGATCCTAC TCTCGACGCT ACTTACCTCC AAACTCTTCG TGGACAATGT CCCCAAAATG GTAATCCAAG AGCCTTGGTG GATTTTGATC TCCGCACGCC  TACGGTTTTC GACAACAAAT ACTACGTGAA TCTGAAAGAA AGAAAAGGTC TTCTCCAAAC CGATCAAGTG TTGTTCTCTA GCCCCGATGC CACAGACACG AGCCCCTTGG TGAGAGAATA  TGCTGATGGC ACACAAAAGT TCTTTGATGC CTTCGTGGTG GCTATGAACA GGATGGGAAA CATTACACCT CTTACAGGAA CTCAAGGACA AATCAGGTTG AACTGTAGCG TGGTGAACTC  CAACTCTCTA CTCCATGATG TGGTGGAGAT TCTTGACAAC TTTGTTAGCT CTATGTGAGA ATTGTGTACT AAATATAATA TATGTCGCTA CAAGAATACG TATCAATAAA TAAAACTCTC 
AAAGCTGTTA TTACTTGAGA ATATTATATT TAAATTTCTC TTTTTCTAGA TTTTTGTAAA ACATACTCCA TGTGTTCTTT ATTAATTAA 

Retrieve as FASTA