Entry information : CrubPrx94(Carubv10005223m.g)
Entry ID 15091
Creation 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2019-02-26 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CrubPrx94(Carubv10005223m.g)
Name CrubPrx94(Carubv10005223m.g)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx002]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella rubella    [TaxId: 81985 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CrubPrx94
start..stop
S start..stop
CagraPrx65 686 0 1..330 1..330
AlyPrx42 678 0 1..330 1..330
AtPrx42 676 0 1..330 1..330
BstrPrx72 676 0 1..330 1..330
Literature and cross-references CrubPrx94(Carubv10005223m.g)
Protein sequence: CrubPrx94(Carubv10005223m.g)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   330 (307)
PWM (Da):   %s   37289.08 (34835.8)  
PI (pH):   %s   7.56 (7.59) Peptide Signal:   %s   cut: 24 range:24-330
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGGKGVMLVA ILCLWALSAT TEAVTEEESG LMMNFYKDTC PQAEDIIREQ VKLLYKRHKN TAFSWLRNIF HDCAVESCDA SLLLDSTRRE LGEKEHDRSF GLRNFRYIEE IKEALERECP  GVVSCSDILV LSAREGIEAV GGPHIPLKTG RRDGLKSRTD MLESYLPDHN ESISVVLDKF KSIGIDTPGL VALLGSHSVG RTHCVKLVHR LYPEVDPSLN PDHVPHMLHK CPDSIPDPKA 
VQYVRNDRGT PMVLDNNYYR NILDNKGLLL VDHQLAHDKR TRPIVKKMAK DQAYFFKEFT RAIQILSENN PLTGSKGEIR KQCNLANKNH * 

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Remarks
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TTCTGATAAT GCTTAAATCC TTTAACGAGC TCTCTCATAT GGAATTATTT GCTTTTCTTT TGAACTTATA TATATGTTCT TGTAACCTTT TTTTGTTTTT TGTTGCTATT TGCTATATAT  AGCAAATCGT CGTCACTTTG AAATGAGGGA ACTCAAAAGA CATGGCAACT AAATTCAGAG TCTATATTCT TCACTATTTA AGGAAACTTA GAAAATGATC CCAAATTGCT TTTTTAAAAA  AGTCTGGTGT GGTGGGAGAA AAATAGTAAC GTCTTTTGTC TCTTGGTATT AAAACTTTGC ATGGCCCCAT GGTGAATGCA ACGTTAAGGA CACGGATGAG TACAGTCTCC ACGTGTCAAG  ATCAAGATCC ATGACGATTA ACTCGTATGA GATTCGATTT CAACATTTTT TACATCTTAC ACAGAGTTGC ACATAAATTA TATGTTGGTT AGGACATGTT AATCTGTGTT TATAGGACAC  ATGTGATGTG AAGCCCACTG AGCTGAGCTA GAGAGTGACA TTACCGAATG GGATTGTTAC TCACAAAGCC ATTTGTCGAC GACACTTGGA TAAGGGAACA AACTGTCGGT GGTCACAGTT  CTTTCATTTT TTTATTTTTT TCATATTTTG TTGTTTTTAA TCAAAATATC CAAATTTTGA GGTGAACTTC GAATCTACGG ATTCAATGCG ATATCGGTTA AAGCTACCGA TACTCACCGA  TTATACTATT TAAATCTTTT TCCTTTTCAA TGTAAATGTC GTTTTATCTA GTCTGCCTCT ATTAAAATTA GTTTCATAAA ATACAAGAGA TAACAAATTT GAAGAACTAC TCTTTTTTTT  TTTAAGGGTA TGATAGTATA ACTTGTTTAG TCAAATCTGA AGCATAAAAA GTTCTACAAT GTTTATAAAT ATAAATTAAC CCACAAAAAT AGGGAACACT AGAGAGTGAA GAGTGGTGAA  CGTGTTTTAA TACCATATCA CGTGGATCAA GATTCATTCA AGATTCATTC AATATTTTAT AACTCTTTAC TGACCATTTC TACGTTAAGT AAATACTAGT AGAAGTTTTT TGCTAATATT  TATTTTTCTT GAATTATATA CAAAAATTTC AGCAGAAAAA TAAAGTAATT GAATATGTAC AAATGTACTA TTTATATTTG TTAAAAATAA TAAGAATCCA CCATGAGTTC ATCGAAAATC  AAGATTCTGT TTATCTGCTA TAGTAACAAT TTAACAAAAA CAAATTTTTA GGAAATTTGC AAATCGACCC CGTGAGTGTT TTTTTACTTT TAACTATTAC ACCCCATATA TTATACTTGT  TTCAGCCGCC CCCCTTTGTT TGTATTGTTA ACAAAAGAAG CTGATTTTTT TTTTTGGAAG AATCTTTCAC AGGGTCCATT GATGTGTACT CAATGAGACC AAAATCCAAA ACTTGGTGAT  TGGTTTAGCT AACCATAACA AAACACCCCT TGTATATGAG ATAAATTATT CAAAATGCCA TCGACATTAA AATCTCCAAC GAACTTTATT TATTATCACA TAACACTGTC AATGACTTTA  GCTATAGCAT GATCACTCAC ACCGTCACAC GTCTTTCGAA TTAGTACCAG ATTGTGGTTT TAGATTTGTT TACCCAAAAT TAAACTTTCA GTACAATGTC AAGCATATAT TTTGATTGAA  CTATATTAAT AAAATGAATA ATTGTAACTT TATGTTATTT CATTTTTGAA AATTCAAATT ACACTAATTC TGCTGTCGGG TCAATTTATA AGACTTCCTA TTTCCTTTTT CTATATTTTT  TTTGTTTAAA ATATATTCAA TTCTTTATTT TGTTTAGTGT GTATGATCTA AATTATCTTA TCATAATAGG TATAGGCGCC CTTTTATTGA ATATAGATAT TCTTAATCAC GACTGACGGA  ACATACAATT ATTGTAGTCT TATAATAATA TTTTTGGTTG CTCAAAGTGA AAAAAATGAA TAATGTTTCA TGATAAATGA TCTGTCACGT AAAATGTATT AATTCACCAA CTTGTCTTAA  TTTACTATAA CCTTCAAATT AAGCTTCTCT TTTATTATTT TGAAAAAAAT AAAGAAAGAA AACTCCATTT CCCTTTATTT AAGGAAGCTG CATTGCTTGC TCACTGACTC AACTCAAGAG 
TGGTGTTGTA GTGAGAGAAA AGAAGATAGA GAAAGAAAAA 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGAGGCA AAGGTGTGAT GTTGGTGGCG ATACTCTGCC TTTGGGCACT CTCTGCAACA ACTGAAGCAG TGACAGAGGA GGAGTCAGGT TTGATGATGA ACTTCTACAA GGACACGTGT  CCTCAGGCCG AAGACATCAT CCGTGAACAA GTCAAACTTC TCTACAAACG CCACAAGAAC ACTGCTTTCT CTTGGCTCCG TAACATCTTC CACGACTGCG CTGTCGAGGT CCGATCTCTC  TCCCTCTCTC TCAATGATCT TTCATATGTT TTGCATGGTG GGTTTTGTCT GAAAATCATG TTTTGTTGGA TGGTTTAAGT GGGAAAAGTA CCGATCTTTG TGTTAAAACA TAGCTAAAAG  GTTTGATATT TCACTTGAAA CAGAGCTAAC GGTTTACTCT GTTTTTGCTT TGTTTTTTGG GGGTTGATAA CAGTCATGTG ATGCGTCGCT TTTGCTGGAT TCGACAAGAA GAGAGCTAGG  AGAGAAAGAA CACGACAGGA GCTTCGGTCT CAGAAACTTT AGGTACATCG AGGAGATCAA GGAAGCTCTC GAGAGGGAGT GCCCTGGTGT TGTCTCATGT TCCGACATTC TCGTCTTGTC  TGCAAGAGAA GGCATCGAAG CAGTAAGTTT TAAAGGACAA GAATTTTTCT GTCTTGTGAC AAAACTGCGT GTTCTTTGTT TCCCTTTTTT TGACAAAACA GTGTGTGGGG TTTTTGTGTA  GGTGGGAGGA CCGCATATTC CTTTGAAGAC AGGAAGGAGA GATGGTCTGA AGAGCAGGAC AGATATGCTT GAGTCATATC TTCCTGACCA CAACGAGAGT ATCTCCGTCG TTCTTGACAA  ATTCAAATCC ATCGGAATCG ACACTCCCGG CCTCGTAGCT CTCTTAGGTA CCGTTATCTT TCTCCTCCTT TGATTATCTC TCACTAGTCA CTGGTCTCCG GCAAAAACGT AACGCTCGAA  AGTCGATAAC TATTTGACCA TCCAAAAAGT GCTCTTTCTA CCATATCCTA ATCAAGGGTA TTTTCGTCTG TTTGATTTAT GCATGTAAAA ATCTTAGGTA GATTAATGAA ACCATTTAAT  TTGAGGTAAT CTTGCCGGTT CACATCGGAA TATGCGATCT GAGTTGGAAA GTTGAATGTA ACCCTTATCC GATCTCTCGG TAGTCCTTGT TTAATGGATT AGCTAGCACA AGGTTATTTT  GGTCCATTAA CTCATGTATG ATTAATTTTA GGCTAGCAAA GTTTAAGTTT CTTGTTAGAT TTTTTGAGTT TGGATAGTGT TAGATTTTGA CTTTTTGTTA TGATGACACG TGCAGGGTCA  CACAGCGTGG GAAGAACTCA CTGTGTTAAG CTGGTCCATC GTTTGTACCC TGAGGTGGAC CCGTCCTTGA ACCCGGACCA CGTCCCTCAC ATGCTACACA AGTGTCCTGA CTCGATCCCT  GACCCAAAGG CTGTTCAGTA CGTGCGTAAC GACCGTGGCA CTCCCATGGT GCTAGACAAC AATTACTACC GTAACATCCT AGACAACAAG GGTTTGCTCC TTGTGGACCA TCAGCTCGCA  CACGACAAAA GGACCAGACC AATTGTTAAG AAGATGGCTA AGGACCAGGC CTACTTCTTC AAGGAGTTCA CTAGAGCGAT TCAGATCTTA TCCGAGAACA ACCCTTTGAC CGGTTCTAAG 
GGTGAGATTA GGAAGCAATG TAATCTCGCA AACAAGAACC ACTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGAGGCA AAGGTGTGAT GTTGGTGGCG ATACTCTGCC TTTGGGCACT CTCTGCAACA ACTGAAGCAG TGACAGAGGA GGAGTCAGGT TTGATGATGA ACTTCTACAA GGACACGTGT  CCTCAGGCCG AAGACATCAT CCGTGAACAA GTCAAACTTC TCTACAAACG CCACAAGAAC ACTGCTTTCT CTTGGCTCCG TAACATCTTC CACGACTGCG CTGTCGAGTC ATGTGATGCG  TCGCTTTTGC TGGATTCGAC AAGAAGAGAG CTAGGAGAGA AAGAACACGA CAGGAGCTTC GGTCTCAGAA ACTTTAGGTA CATCGAGGAG ATCAAGGAAG CTCTCGAGAG GGAGTGCCCT  GGTGTTGTCT CATGTTCCGA CATTCTCGTC TTGTCTGCAA GAGAAGGCAT CGAAGCAGTG GGAGGACCGC ATATTCCTTT GAAGACAGGA AGGAGAGATG GTCTGAAGAG CAGGACAGAT  ATGCTTGAGT CATATCTTCC TGACCACAAC GAGAGTATCT CCGTCGTTCT TGACAAATTC AAATCCATCG GAATCGACAC TCCCGGCCTC GTAGCTCTCT TAGGGTCACA CAGCGTGGGA  AGAACTCACT GTGTTAAGCT GGTCCATCGT TTGTACCCTG AGGTGGACCC GTCCTTGAAC CCGGACCACG TCCCTCACAT GCTACACAAG TGTCCTGACT CGATCCCTGA CCCAAAGGCT  GTTCAGTACG TGCGTAACGA CCGTGGCACT CCCATGGTGC TAGACAACAA TTACTACCGT AACATCCTAG ACAACAAGGG TTTGCTCCTT GTGGACCATC AGCTCGCACA CGACAAAAGG  ACCAGACCAA TTGTTAAGAA GATGGCTAAG GACCAGGCCT ACTTCTTCAA GGAGTTCACT AGAGCGATTC AGATCTTATC CGAGAACAAC CCTTTGACCG GTTCTAAGGG TGAGATTAGG 
AAGCAATGTA ATCTCGCAAA CAAGAACCAC TAA 

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cDNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TTATTGTAGT CTTATAATAA TATTTTTGGT TGCTCAAAGT GAAAAAAATG AATAATGTTT CATGATAAAT GATCTGTCAC GTAAAATGTA TTAATTCACC AACTTGTCTT AATTTACTAT  AACCTTCAAA TTAAGCTTCT CTTTTATTAT TTTGAAAAAA ATAAAGAAAG AAAACTCCAT TTCCCTTTAT TTAAGGAAGC TGCATTGCTT GCTCACTGAC TCAACTCAAG AGTGGTGTTG  TAGTGAGAGA AAAGAAGATA GAGAAAGAAA AAATGGGAGG CAAAGGTGTG ATGTTGGTGG CGATACTCTG CCTTTGGGCA CTCTCTGCAA CAACTGAAGC AGTGACAGAG GAGGAGTCAG  GTTTGATGAT GAACTTCTAC AAGGACACGT GTCCTCAGGC CGAAGACATC ATCCGTGAAC AAGTCAAACT TCTCTACAAA CGCCACAAGA ACACTGCTTT CTCTTGGCTC CGTAACATCT  TCCACGACTG CGCTGTCGAG TCATGTGATG CGTCGCTTTT GCTGGATTCG ACAAGAAGAG AGCTAGGAGA GAAAGAACAC GACAGGAGCT TCGGTCTCAG AAACTTTAGG TACATCGAGG  AGATCAAGGA AGCTCTCGAG AGGGAGTGCC CTGGTGTTGT CTCATGTTCC GACATTCTCG TCTTGTCTGC AAGAGAAGGC ATCGAAGCAG TGGGAGGACC GCATATTCCT TTGAAGACAG  GAAGGAGAGA TGGTCTGAAG AGCAGGACAG ATATGCTTGA GTCATATCTT CCTGACCACA ACGAGAGTAT CTCCGTCGTT CTTGACAAAT TCAAATCCAT CGGAATCGAC ACTCCCGGCC  TCGTAGCTCT CTTAGGGTCA CACAGCGTGG GAAGAACTCA CTGTGTTAAG CTGGTCCATC GTTTGTACCC TGAGGTGGAC CCGTCCTTGA ACCCGGACCA CGTCCCTCAC ATGCTACACA  AGTGTCCTGA CTCGATCCCT GACCCAAAGG CTGTTCAGTA CGTGCGTAAC GACCGTGGCA CTCCCATGGT GCTAGACAAC AATTACTACC GTAACATCCT AGACAACAAG GGTTTGCTCC  TTGTGGACCA TCAGCTCGCA CACGACAAAA GGACCAGACC AATTGTTAAG AAGATGGCTA AGGACCAGGC CTACTTCTTC AAGGAGTTCA CTAGAGCGAT TCAGATCTTA TCCGAGAACA  ACCCTTTGAC CGGTTCTAAG GGTGAGATTA GGAAGCAATG TAATCTCGCA AACAAGAACC ACTAAAGTTG GAAAAAGTGA GAAAAGACAG AGGCTCTGGT GTGTTGGGGT TCTCTGCTTG  GTACGTATCG AAACCAAGAT GAATAAAGGA ATCTTTTAAA GTTAAAATCA AAGAAAGGGT GATGATGAAT GCATCATTGT GGTGACCACT CCCTTCTTTT GTGTGTTCTT GTTGTAGCCT  TAATGCTTTA ATTATGATGT TAGTGGTCTT TGAGTTATTT AAATCTAAAA TGTTGGCTCT TTGTTGATTT TGGGTTTGTG GTGGGGATGA TATAAAGATA ATGGAAAGGA TGTATGATAT  GATGGATGGT GTTGGGTATC ATGTATGACT ATGTAATGAT AAGTAAACAG TCCGAATCTT TTGATATACT TTCATGTTGA ATATCATACG TAGAAACAAT GACATACATC AATGAACTTG 
TTCGACGTGC ATGATATATA CACAGCACTG TCTATGTATG ATATCGATCT ATATTACTGA TCTCACCAA 

Retrieve as FASTA