Entry information : CrubPrx94(Carubv10005223m.g)
Entry ID 15091
Creation 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2019-02-26 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CrubPrx94(Carubv10005223m.g)
Name CrubPrx94(Carubv10005223m.g)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx010]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella rubella    [TaxId: 81985 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CrubPrx94
start..stop
S start..stop
CagraPrx65 686 0 1..330 1..330
AlyPrx42 678 0 1..330 1..330
AtPrx42 676 0 1..330 1..330
BstrPrx72 676 0 1..330 1..330
Literature and cross-references CrubPrx94(Carubv10005223m.g)
Protein sequence: CrubPrx94(Carubv10005223m.g)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   330 (307)
PWM (Da):   %s   37289.08 (34835.8)  
PI (pH):   %s   7.56 (7.59) Peptide Signal:   %s   cut: 24 range:24-330
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGGKGVMLVA ILCLWALSAT TEAVTEEESG LMMNFYKDTC PQAEDIIREQ VKLLYKRHKN TAFSWLRNIF HDCAVESCDA SLLLDSTRRE LGEKEHDRSF GLRNFRYIEE IKEALERECP  GVVSCSDILV LSAREGIEAV GGPHIPLKTG RRDGLKSRTD MLESYLPDHN ESISVVLDKF KSIGIDTPGL VALLGSHSVG RTHCVKLVHR LYPEVDPSLN PDHVPHMLHK CPDSIPDPKA 
VQYVRNDRGT PMVLDNNYYR NILDNKGLLL VDHQLAHDKR TRPIVKKMAK DQAYFFKEFT RAIQILSENN PLTGSKGEIR KQCNLANKNH * 

Retrieve as FASTA  
Remarks
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TTCTGATAAT GCTTAAATCC TTTAACGAGC TCTCTCATAT GGAATTATTT GCTTTTCTTT TGAACTTATA TATATGTTCT TGTAACCTTT TTTTGTTTTT TGTTGCTATT TGCTATATAT  AGCAAATCGT CGTCACTTTG AAATGAGGGA ACTCAAAAGA CATGGCAACT AAATTCAGAG TCTATATTCT TCACTATTTA AGGAAACTTA GAAAATGATC CCAAATTGCT TTTTTAAAAA  AGTCTGGTGT GGTGGGAGAA AAATAGTAAC GTCTTTTGTC TCTTGGTATT AAAACTTTGC ATGGCCCCAT GGTGAATGCA ACGTTAAGGA CACGGATGAG TACAGTCTCC ACGTGTCAAG  ATCAAGATCC ATGACGATTA ACTCGTATGA GATTCGATTT CAACATTTTT TACATCTTAC ACAGAGTTGC ACATAAATTA TATGTTGGTT AGGACATGTT AATCTGTGTT TATAGGACAC  ATGTGATGTG AAGCCCACTG AGCTGAGCTA GAGAGTGACA TTACCGAATG GGATTGTTAC TCACAAAGCC ATTTGTCGAC GACACTTGGA TAAGGGAACA AACTGTCGGT GGTCACAGTT  CTTTCATTTT TTTATTTTTT TCATATTTTG TTGTTTTTAA TCAAAATATC CAAATTTTGA GGTGAACTTC GAATCTACGG ATTCAATGCG ATATCGGTTA AAGCTACCGA TACTCACCGA  TTATACTATT TAAATCTTTT TCCTTTTCAA TGTAAATGTC GTTTTATCTA GTCTGCCTCT ATTAAAATTA GTTTCATAAA ATACAAGAGA TAACAAATTT GAAGAACTAC TCTTTTTTTT  TTTAAGGGTA TGATAGTATA ACTTGTTTAG TCAAATCTGA AGCATAAAAA GTTCTACAAT GTTTATAAAT ATAAATTAAC CCACAAAAAT AGGGAACACT AGAGAGTGAA GAGTGGTGAA  CGTGTTTTAA TACCATATCA CGTGGATCAA GATTCATTCA AGATTCATTC AATATTTTAT AACTCTTTAC TGACCATTTC TACGTTAAGT AAATACTAGT AGAAGTTTTT TGCTAATATT  TATTTTTCTT GAATTATATA CAAAAATTTC AGCAGAAAAA TAAAGTAATT GAATATGTAC AAATGTACTA TTTATATTTG TTAAAAATAA TAAGAATCCA CCATGAGTTC ATCGAAAATC  AAGATTCTGT TTATCTGCTA TAGTAACAAT TTAACAAAAA CAAATTTTTA GGAAATTTGC AAATCGACCC CGTGAGTGTT TTTTTACTTT TAACTATTAC ACCCCATATA TTATACTTGT  TTCAGCCGCC CCCCTTTGTT TGTATTGTTA ACAAAAGAAG CTGATTTTTT TTTTTGGAAG AATCTTTCAC AGGGTCCATT GATGTGTACT CAATGAGACC AAAATCCAAA ACTTGGTGAT  TGGTTTAGCT AACCATAACA AAACACCCCT TGTATATGAG ATAAATTATT CAAAATGCCA TCGACATTAA AATCTCCAAC GAACTTTATT TATTATCACA TAACACTGTC AATGACTTTA  GCTATAGCAT GATCACTCAC ACCGTCACAC GTCTTTCGAA TTAGTACCAG ATTGTGGTTT TAGATTTGTT TACCCAAAAT TAAACTTTCA GTACAATGTC AAGCATATAT TTTGATTGAA  CTATATTAAT AAAATGAATA ATTGTAACTT TATGTTATTT CATTTTTGAA AATTCAAATT ACACTAATTC TGCTGTCGGG TCAATTTATA AGACTTCCTA TTTCCTTTTT CTATATTTTT  TTTGTTTAAA ATATATTCAA TTCTTTATTT TGTTTAGTGT GTATGATCTA AATTATCTTA TCATAATAGG TATAGGCGCC CTTTTATTGA ATATAGATAT TCTTAATCAC GACTGACGGA  ACATACAATT ATTGTAGTCT TATAATAATA TTTTTGGTTG CTCAAAGTGA AAAAAATGAA TAATGTTTCA TGATAAATGA TCTGTCACGT AAAATGTATT AATTCACCAA CTTGTCTTAA  TTTACTATAA CCTTCAAATT AAGCTTCTCT TTTATTATTT TGAAAAAAAT AAAGAAAGAA AACTCCATTT CCCTTTATTT AAGGAAGCTG CATTGCTTGC TCACTGACTC AACTCAAGAG 
TGGTGTTGTA GTGAGAGAAA AGAAGATAGA GAAAGAAAAA 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TTATTGTAGT CTTATAATAA TATTTTTGGT TGCTCAAAGT GAAAAAAATG AATAATGTTT CATGATAAAT GATCTGTCAC GTAAAATGTA TTAATTCACC AACTTGTCTT AATTTACTAT  AACCTTCAAA TTAAGCTTCT CTTTTATTAT TTTGAAAAAA ATAAAGAAAG AAAACTCCAT TTCCCTTTAT TTAAGGAAGC TGCATTGCTT GCTCACTGAC TCAACTCAAG AGTGGTGTTG  TAGTGAGAGA AAAGAAGATA GAGAAAGAAA AAATGGGAGG CAAAGGTGTG ATGTTGGTGG CGATACTCTG CCTTTGGGCA CTCTCTGCAA CAACTGAAGC AGTGACAGAG GAGGAGTCAG  GTTTGATGAT GAACTTCTAC AAGGACACGT GTCCTCAGGC CGAAGACATC ATCCGTGAAC AAGTCAAACT TCTCTACAAA CGCCACAAGA ACACTGCTTT CTCTTGGCTC CGTAACATCT  TCCACGACTG CGCTGTCGAG GTCCGATCTC TCTCCCTCTC TCTCAATGAT CTTTCATATG TTTTGCATGG TGGGTTTTGT CTGAAAATCA TGTTTTGTTG GATGGTTTAA GTGGGAAAAG  TACCGATCTT TGTGTTAAAA CATAGCTAAA AGGTTTGATA TTTCACTTGA AACAGAGCTA ACGGTTTACT CTGTTTTTGC TTTGTTTTTT GGGGGTTGAT AACAGTCATG TGATGCGTCG  CTTTTGCTGG ATTCGACAAG AAGAGAGCTA GGAGAGAAAG AACACGACAG GAGCTTCGGT CTCAGAAACT TTAGGTACAT CGAGGAGATC AAGGAAGCTC TCGAGAGGGA GTGCCCTGGT  GTTGTCTCAT GTTCCGACAT TCTCGTCTTG TCTGCAAGAG AAGGCATCGA AGCAGTAAGT TTTAAAGGAC AAGAATTTTT CTGTCTTGTG ACAAAACTGC GTGTTCTTTG TTTCCCTTTT  TTTGACAAAA CAGTGTGTGG GGTTTTTGTG TAGGTGGGAG GACCGCATAT TCCTTTGAAG ACAGGAAGGA GAGATGGTCT GAAGAGCAGG ACAGATATGC TTGAGTCATA TCTTCCTGAC  CACAACGAGA GTATCTCCGT CGTTCTTGAC AAATTCAAAT CCATCGGAAT CGACACTCCC GGCCTCGTAG CTCTCTTAGG TACCGTTATC TTTCTCCTCC TTTGATTATC TCTCACTAGT  CACTGGTCTC CGGCAAAAAC GTAACGCTCG AAAGTCGATA ACTATTTGAC CATCCAAAAA GTGCTCTTTC TACCATATCC TAATCAAGGG TATTTTCGTC TGTTTGATTT ATGCATGTAA  AAATCTTAGG TAGATTAATG AAACCATTTA ATTTGAGGTA ATCTTGCCGG TTCACATCGG AATATGCGAT CTGAGTTGGA AAGTTGAATG TAACCCTTAT CCGATCTCTC GGTAGTCCTT  GTTTAATGGA TTAGCTAGCA CAAGGTTATT TTGGTCCATT AACTCATGTA TGATTAATTT TAGGCTAGCA AAGTTTAAGT TTCTTGTTAG ATTTTTTGAG TTTGGATAGT GTTAGATTTT  GACTTTTTGT TATGATGACA CGTGCAGGGT CACACAGCGT GGGAAGAACT CACTGTGTTA AGCTGGTCCA TCGTTTGTAC CCTGAGGTGG ACCCGTCCTT GAACCCGGAC CACGTCCCTC  ACATGCTACA CAAGTGTCCT GACTCGATCC CTGACCCAAA GGCTGTTCAG TACGTGCGTA ACGACCGTGG CACTCCCATG GTGCTAGACA ACAATTACTA CCGTAACATC CTAGACAACA  AGGGTTTGCT CCTTGTGGAC CATCAGCTCG CACACGACAA AAGGACCAGA CCAATTGTTA AGAAGATGGC TAAGGACCAG GCCTACTTCT TCAAGGAGTT CACTAGAGCG ATTCAGATCT  TATCCGAGAA CAACCCTTTG ACCGGTTCTA AGGGTGAGAT TAGGAAGCAA TGTAATCTCG CAAACAAGAA CCACTAAAGT TGGAAAAAGT GAGAAAAGAC AGAGGCTCTG GTGTGTTGGG  GTTCTCTGCT TGGTACGTAT CGAAACCAAG ATGAATAAAG GAATCTTTTA AAGTTAAAAT CAAAGAAAGG GTGATGATGA ATGCATCATT GTGGTGACCA CTCCCTTCTT TTGTGTGTTC  TTGTTGTAGC CTTAATGCTT TAATTATGAT GTTAGTGGTC TTTGAGTTAT TTAAATCTAA AATGTTGGCT CTTTGTTGAT TTTGGGTTTG TGGTGGGGAT GATATAAAGA TAATGGAAAG  GATGTATGAT ATGATGGATG GTGTTGGGTA TCATGTATGA CTATGTAATG ATAAGTAAAC AGTCCGAATC TTTTGATATA CTTTCATGTT GAATATCATA CGTAGAAACA ATGACATACA 
TCAATGAACT TGTTCGACGT GCATGATATA TACACAGCAC TGTCTATGTA TGATATCGAT CTATATTACT GATCTCACCA A 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGAGGCA AAGGTGTGAT GTTGGTGGCG ATACTCTGCC TTTGGGCACT CTCTGCAACA ACTGAAGCAG TGACAGAGGA GGAGTCAGGT TTGATGATGA ACTTCTACAA GGACACGTGT  CCTCAGGCCG AAGACATCAT CCGTGAACAA GTCAAACTTC TCTACAAACG CCACAAGAAC ACTGCTTTCT CTTGGCTCCG TAACATCTTC CACGACTGCG CTGTCGAGTC ATGTGATGCG  TCGCTTTTGC TGGATTCGAC AAGAAGAGAG CTAGGAGAGA AAGAACACGA CAGGAGCTTC GGTCTCAGAA ACTTTAGGTA CATCGAGGAG ATCAAGGAAG CTCTCGAGAG GGAGTGCCCT  GGTGTTGTCT CATGTTCCGA CATTCTCGTC TTGTCTGCAA GAGAAGGCAT CGAAGCAGTG GGAGGACCGC ATATTCCTTT GAAGACAGGA AGGAGAGATG GTCTGAAGAG CAGGACAGAT  ATGCTTGAGT CATATCTTCC TGACCACAAC GAGAGTATCT CCGTCGTTCT TGACAAATTC AAATCCATCG GAATCGACAC TCCCGGCCTC GTAGCTCTCT TAGGGTCACA CAGCGTGGGA  AGAACTCACT GTGTTAAGCT GGTCCATCGT TTGTACCCTG AGGTGGACCC GTCCTTGAAC CCGGACCACG TCCCTCACAT GCTACACAAG TGTCCTGACT CGATCCCTGA CCCAAAGGCT  GTTCAGTACG TGCGTAACGA CCGTGGCACT CCCATGGTGC TAGACAACAA TTACTACCGT AACATCCTAG ACAACAAGGG TTTGCTCCTT GTGGACCATC AGCTCGCACA CGACAAAAGG  ACCAGACCAA TTGTTAAGAA GATGGCTAAG GACCAGGCCT ACTTCTTCAA GGAGTTCACT AGAGCGATTC AGATCTTATC CGAGAACAAC CCTTTGACCG GTTCTAAGGG TGAGATTAGG 
AAGCAATGTA ATCTCGCAAA CAAGAACCAC TAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TTATTGTAGT CTTATAATAA TATTTTTGGT TGCTCAAAGT GAAAAAAATG AATAATGTTT CATGATAAAT GATCTGTCAC GTAAAATGTA TTAATTCACC AACTTGTCTT AATTTACTAT  AACCTTCAAA TTAAGCTTCT CTTTTATTAT TTTGAAAAAA ATAAAGAAAG AAAACTCCAT TTCCCTTTAT TTAAGGAAGC TGCATTGCTT GCTCACTGAC TCAACTCAAG AGTGGTGTTG  TAGTGAGAGA AAAGAAGATA GAGAAAGAAA AAATGGGAGG CAAAGGTGTG ATGTTGGTGG CGATACTCTG CCTTTGGGCA CTCTCTGCAA CAACTGAAGC AGTGACAGAG GAGGAGTCAG  GTTTGATGAT GAACTTCTAC AAGGACACGT GTCCTCAGGC CGAAGACATC ATCCGTGAAC AAGTCAAACT TCTCTACAAA CGCCACAAGA ACACTGCTTT CTCTTGGCTC CGTAACATCT  TCCACGACTG CGCTGTCGAG TCATGTGATG CGTCGCTTTT GCTGGATTCG ACAAGAAGAG AGCTAGGAGA GAAAGAACAC GACAGGAGCT TCGGTCTCAG AAACTTTAGG TACATCGAGG  AGATCAAGGA AGCTCTCGAG AGGGAGTGCC CTGGTGTTGT CTCATGTTCC GACATTCTCG TCTTGTCTGC AAGAGAAGGC ATCGAAGCAG TGGGAGGACC GCATATTCCT TTGAAGACAG  GAAGGAGAGA TGGTCTGAAG AGCAGGACAG ATATGCTTGA GTCATATCTT CCTGACCACA ACGAGAGTAT CTCCGTCGTT CTTGACAAAT TCAAATCCAT CGGAATCGAC ACTCCCGGCC  TCGTAGCTCT CTTAGGGTCA CACAGCGTGG GAAGAACTCA CTGTGTTAAG CTGGTCCATC GTTTGTACCC TGAGGTGGAC CCGTCCTTGA ACCCGGACCA CGTCCCTCAC ATGCTACACA  AGTGTCCTGA CTCGATCCCT GACCCAAAGG CTGTTCAGTA CGTGCGTAAC GACCGTGGCA CTCCCATGGT GCTAGACAAC AATTACTACC GTAACATCCT AGACAACAAG GGTTTGCTCC  TTGTGGACCA TCAGCTCGCA CACGACAAAA GGACCAGACC AATTGTTAAG AAGATGGCTA AGGACCAGGC CTACTTCTTC AAGGAGTTCA CTAGAGCGAT TCAGATCTTA TCCGAGAACA  ACCCTTTGAC CGGTTCTAAG GGTGAGATTA GGAAGCAATG TAATCTCGCA AACAAGAACC ACTAAAGTTG GAAAAAGTGA GAAAAGACAG AGGCTCTGGT GTGTTGGGGT TCTCTGCTTG  GTACGTATCG AAACCAAGAT GAATAAAGGA ATCTTTTAAA GTTAAAATCA AAGAAAGGGT GATGATGAAT GCATCATTGT GGTGACCACT CCCTTCTTTT GTGTGTTCTT GTTGTAGCCT  TAATGCTTTA ATTATGATGT TAGTGGTCTT TGAGTTATTT AAATCTAAAA TGTTGGCTCT TTGTTGATTT TGGGTTTGTG GTGGGGATGA TATAAAGATA ATGGAAAGGA TGTATGATAT  GATGGATGGT GTTGGGTATC ATGTATGACT ATGTAATGAT AAGTAAACAG TCCGAATCTT TTGATATACT TTCATGTTGA ATATCATACG TAGAAACAAT GACATACATC AATGAACTTG 
TTCGACGTGC ATGATATATA CACAGCACTG TCTATGTATG ATATCGATCT ATATTACTGA TCTCACCAA 

Retrieve as FASTA