Entry information : CrubPrx95Carubv10026787m.g
Entry ID 15092
Creation 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CrubPrx95Carubv10026787m.g
Name CrubPrx95Carubv10026787m.g
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx036]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella rubella    [TaxId: 81985 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CrubPrx95
start..stop
S start..stop
CagraPrx80 660 0 1..322 1..322
AtPrx66 640 0 1..322 1..322
BstrPrx29 630 0 1..322 1..322
AlyPrx66 625 0 1..322 1..322
Literature and cross-references CrubPrx95Carubv10026787m.g
Protein sequence: CrubPrx95Carubv10026787m.g
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   322 (298)
PWM (Da):   %s   35471.2 (32849.8)  
PI (pH):   %s   9.89 (9.82) Peptide Signal:   %s   cut: 25 range:25-322
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAFSKGLVFA MVIAIFAIVK PSEGALNAHY YDRSCPAAEK IILETVRNAT LYDPKVPARL LRMFFHDCFI RGCDASILLD STRSNQAEKD GPPNISVRSF YVIEDAKRKL EKACPRTVSC  ADVIAIAARD VVTLSGGPYW SVLKGRKDGT VSRANETRNL PPPTFNVSQL IQSFAARGLS VKDMVTLSGG HTIGFSHCSS FESRLQNFSK FQDIDPSMNY AFAQTLKKKC PRSSNRGKNA 
GTVLDSTASV FDNVYYKLIL SGKGVFGSDQ ALLGDSRTKW IVETYAQDQK AFFREFAASM VKLGNVGVKE TGQVRIYTRF AN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TAAAGAGTGC TTTTTGAGGC TTAAACACAC AAAACCATAA AATGGCATTC TCGAAAGGAC TCGTTTTCGC TATGGTAATT GCGATTTTTG CGATAGTTAA GCCCTCGGAA GGTGCTCTTA  ATGCTCACTA CTATGACCGG TCGTGCCCCG CTGCTGAGAA AATCATACTT GAAACTGTTA GGAATGCTAC TTTGTATGAT CCCAAAGTGC CTGCTCGTCT CCTAAGAATG TTCTTTCACG  ACTGTTTCAT CAGGGTATGC ATCTTGATCT TCCTTCTTCG ATCATTGATC CATATGAAGT TGTGTTTTGA GTAAATAATT TGGATGGGTT TTTGTAGGGA TGTGATGCTT CCATTCTACT  TGATTCGACT CGGTCAAACC AAGCTGAGAA GGATGGTCCT CCTAACATCT CCGTACGTTC GTTTTATGTG ATCGAAGATG CTAAGAGAAA GCTCGAGAAG GCTTGTCCTC GTACTGTTTC  TTGTGCCGAT GTAATCGCCA TTGCAGCCAG AGATGTGGTT ACCCTGGTTA GTGCCTTTAT GGTCTATATA TTCAATTCTG AATATCACAT GAATATCAGT TTGATTTTAT TTAAAAACAA  TAACTATCTA GGAAAAAATC ATAACTATTT ATCGATATTA TATTAGTGTA TAAGATAATT TGTTGACAGT TTAAACATTC TGGTTGACAT TTCGTTCGAT TTGATTTACT TGTAATATAT  CTCATTTATT AGTCCGGTGG TCCTTACTGG AGCGTACTAA AAGGGCGAAA AGACGGGACA GTTTCGCGAG CCAACGAGAC TAGAAATCTC CCACCACCAA CGTTCAACGT GTCACAACTG  ATCCAAAGCT TTGCAGCAAG AGGCTTGTCG GTGAAAGACA TGGTTACGCT CTCAGGTGGC CACACCATAG GGTTCTCTCA CTGTTCTTCT TTCGAGTCCC GTCTTCAAAA CTTCAGCAAA  TTCCAGGACA TTGATCCTTC GATGAACTAT GCATTTGCAC AAACCCTGAA AAAGAAATGC CCAAGATCAT CTAACCGAGG CAAGAACGCA GGGACAGTCT TGGACTCTAC AGCCTCTGTT  TTCGATAATG TTTACTACAA GCTGATTTTG TCAGGGAAAG GAGTGTTTGG GTCTGATCAG GCGCTTCTTG GGGATTCCAG GACTAAGTGG ATCGTTGAGA CGTATGCTCA AGACCAAAAA  GCATTCTTTA GAGAGTTTGC AGCTTCTATG GTGAAACTTG GAAACGTTGG AGTCAAGGAG ACCGGACAAG TGAGAATTTA CACGCGTTTC GCCAACTAAA AGCATAACAC TAACAAGCAA  CCAAATGAGA GTTTTCTTTT CTTCAAATTT GATTTCATTT ATACACATAT ACTAATAATG TAGACTGGCC AGTTTATTGA TCAGTTTTCA AACCTTCTGA TTCTCTATTG AGTTTGCAGA  GATGCTTTAA AAGTAAATTT GTTCTGATTC AATGACTTAC CTTTACATTC ATCAGCAGAT TCACTTACTG GTCACCAAAT TTGAATCATT TACCATCAAA CAGACATGGA AAAATGAGTC  ATAAACTACT CATCATGGCT TCTTATAAAT AGTGATCTAC ACAAGTTTAA TATGTGGTTT GTATGAAAGT AAATAATGGG AGAAATACAA AATACAGAGA AGTTGAAAGC AGAGTTCCTT  CATGCAAAAA CAACATCAGA ACGGAACACA TACTTGACAC CTTTGGAGAC ATTTCTTCCT TCGTGCAACA TGCACTTGTC GCCATGGATG TGAAAGAGAG CCATACCTTC AACTGGAGCT  ACCTGCGATA ATAAGCAATT TTAGTTGACG GTATATCAAT ATAACATGAA ATTAAGACCA AAAATACTAT TTGAGAGTTG ATTACCTCAG CCACGATACT GTTCCTGGAA CCATAAAAGA  CGGTTTCTCC ACCTACTAAT GGCTCTGCTG AAGAAGAATC ATTTGTCTTG CTTGAACCGC TCTTTGATTT TGATTTTGAG CTGTTCCCGC TTAGATATAT CAACAATGTG TAATAAGTCC  GCTTTCCATC TTCAAGATCA GCACTTTCAT CAATGTGACG ACCAAAATGC TGGCCAGGAC TATACCTGAA AATTAAAAAT CACATTGTGC CAAAAATTTC AGAAATTTCC CCCCTTAACA  ACTCTGCAAC GTTGTAAAAA AACACATCCA TAGACTGCAA GCAAAGAATG AAGAACATAT TCTTTGCACA ACTCTCCACA ATTTAACCAT TACGAGTGAG CAAAGAATGA AACTTCAAAA  AAAGTTGGGA CTGCAAACCT GTAAAATCTA ATATTTGGAT TCAAGCCAAC AGCAACCTTC CTCCTAATCT TTATATCAGT AAATAAACTG GAAATCCCTG ATTGCCATAA CGTATCAGCA  AGGACGGGAT CATTCACTGA GATTCGATGG TTATCCCTAT AAGCTTCACC ATAAGCTGGG CCACGACTTC CTTGGTGAGT GAAACCGAGA GACTCCGCGA TTTTAACGAA AGCCTTTGAT 
TCATCAGAAG TGAGACAGTT TTCCACCT 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCATTCT CGAAAGGACT CGTTTTCGCT ATGGTAATTG CGATTTTTGC GATAGTTAAG CCCTCGGAAG GTGCTCTTAA TGCTCACTAC TATGACCGGT CGTGCCCCGC TGCTGAGAAA  ATCATACTTG AAACTGTTAG GAATGCTACT TTGTATGATC CCAAAGTGCC TGCTCGTCTC CTAAGAATGT TCTTTCACGA CTGTTTCATC AGGGGATGTG ATGCTTCCAT TCTACTTGAT  TCGACTCGGT CAAACCAAGC TGAGAAGGAT GGTCCTCCTA ACATCTCCGT ACGTTCGTTT TATGTGATCG AAGATGCTAA GAGAAAGCTC GAGAAGGCTT GTCCTCGTAC TGTTTCTTGT  GCCGATGTAA TCGCCATTGC AGCCAGAGAT GTGGTTACCC TGTCCGGTGG TCCTTACTGG AGCGTACTAA AAGGGCGAAA AGACGGGACA GTTTCGCGAG CCAACGAGAC TAGAAATCTC  CCACCACCAA CGTTCAACGT GTCACAACTG ATCCAAAGCT TTGCAGCAAG AGGCTTGTCG GTGAAAGACA TGGTTACGCT CTCAGGTGGC CACACCATAG GGTTCTCTCA CTGTTCTTCT  TTCGAGTCCC GTCTTCAAAA CTTCAGCAAA TTCCAGGACA TTGATCCTTC GATGAACTAT GCATTTGCAC AAACCCTGAA AAAGAAATGC CCAAGATCAT CTAACCGAGG CAAGAACGCA  GGGACAGTCT TGGACTCTAC AGCCTCTGTT TTCGATAATG TTTACTACAA GCTGATTTTG TCAGGGAAAG GAGTGTTTGG GTCTGATCAG GCGCTTCTTG GGGATTCCAG GACTAAGTGG  ATCGTTGAGA CGTATGCTCA AGACCAAAAA GCATTCTTTA GAGAGTTTGC AGCTTCTATG GTGAAACTTG GAAACGTTGG AGTCAAGGAG ACCGGACAAG TGAGAATTTA CACGCGTTTC 
GCCAACTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TAAAGAGTGC TTTTTGAGGC TTAAACACAC AAAACCATAA AATGGCATTC TCGAAAGGAC TCGTTTTCGC TATGGTAATT GCGATTTTTG CGATAGTTAA GCCCTCGGAA GGTGCTCTTA  ATGCTCACTA CTATGACCGG TCGTGCCCCG CTGCTGAGAA AATCATACTT GAAACTGTTA GGAATGCTAC TTTGTATGAT CCCAAAGTGC CTGCTCGTCT CCTAAGAATG TTCTTTCACG  ACTGTTTCAT CAGGGGATGT GATGCTTCCA TTCTACTTGA TTCGACTCGG TCAAACCAAG CTGAGAAGGA TGGTCCTCCT AACATCTCCG TACGTTCGTT TTATGTGATC GAAGATGCTA  AGAGAAAGCT CGAGAAGGCT TGTCCTCGTA CTGTTTCTTG TGCCGATGTA ATCGCCATTG CAGCCAGAGA TGTGGTTACC CTGTCCGGTG GTCCTTACTG GAGCGTACTA AAAGGGCGAA  AAGACGGGAC AGTTTCGCGA GCCAACGAGA CTAGAAATCT CCCACCACCA ACGTTCAACG TGTCACAACT GATCCAAAGC TTTGCAGCAA GAGGCTTGTC GGTGAAAGAC ATGGTTACGC  TCTCAGGTGG CCACACCATA GGGTTCTCTC ACTGTTCTTC TTTCGAGTCC CGTCTTCAAA ACTTCAGCAA ATTCCAGGAC ATTGATCCTT CGATGAACTA TGCATTTGCA CAAACCCTGA  AAAAGAAATG CCCAAGATCA TCTAACCGAG GCAAGAACGC AGGGACAGTC TTGGACTCTA CAGCCTCTGT TTTCGATAAT GTTTACTACA AGCTGATTTT GTCAGGGAAA GGAGTGTTTG  GGTCTGATCA GGCGCTTCTT GGGGATTCCA GGACTAAGTG GATCGTTGAG ACGTATGCTC AAGACCAAAA AGCATTCTTT AGAGAGTTTG CAGCTTCTAT GGTGAAACTT GGAAACGTTG  GAGTCAAGGA GACCGGACAA GTGAGAATTT ACACGCGTTT CGCCAACTAA AAGCATAACA CTAACAAGCA ACCAAATGAG AGTTTTCTTT TCTTCAAATT TGATTTCATT TATACACATA  TACTAATAAT GTAGACTGGC CAGTTTATTG ATCAGTTTTC AAACCTTCTG ATTCTCTATT GAGTTTGCAG AGATGCTTTA AAAGTAAATT TGTTCTGATT CAATGACTTA CCTTTACATT  CATCAGCAGA TTCACTTACT GGTCACCAAA TTTGAATCAT TTACCATCAA ACAGACATGG AAAAATGAGT CATAAACTAC TCATCATGGC TTCTTATAAA TAGTGATCTA CACAAGTTTA  ATATGTGGTT TGTATGAAAG TAAATAATGG GAGAAATACA AAATACAGAG AAGTTGAAAG CAGAGTTCCT TCATGCAAAA ACAACATCAG AACGGAACAC ATACTTGACA CCTTTGGAGA  CATTTCTTCC TTCGTGCAAC ATGCACTTGT CGCCATGGAT GTGAAAGAGA GCCATACCTT CAACTGGAGC TACCTGCGAT AATAAGCAAT TTTAGTTGAC GGTATATCAA TATAACATGA  AATTAAGACC AAAAATACTA TTTGAGAGTT GATTACCTCA GCCACGATAC TGTTCCTGGA ACCATAAAAG ACGGTTTCTC CACCTACTAA TGGCTCTGCT GAAGAAGAAT CATTTGTCTT  GCTTGAACCG CTCTTTGATT TTGATTTTGA GCTGTTCCCG CTTAGATATA TCAACAATGT GTAATAAGTC CGCTTTCCAT CTTCAAGATC AGCACTTTCA TCAATGTGAC GACCAAAATG  CTGGCCAGGA CTATACCTGA AAATTAAAAA TCACATTGTG CCAAAAATTT CAGAAATTTC CCCCCTTAAC AACTCTGCAA CGTTGTAAAA AAACACATCC ATAGACTGCA AGCAAAGAAT  GAAGAACATA TTCTTTGCAC AACTCTCCAC AATTTAACCA TTACGAGTGA GCAAAGAATG AAACTTCAAA AAAAGTTGGG ACTGCAAACC TGTAAAATCT AATATTTGGA TTCAAGCCAA  CAGCAACCTT CCTCCTAATC TTTATATCAG TAAATAAACT GGAAATCCCT GATTGCCATA ACGTATCAGC AAGGACGGGA TCATTCACTG AGATTCGATG GTTATCCCTA TAAGCTTCAC 
CATAAGCTGG GCCACGACTT CCTTGGTGAG TGAAACCGAG AGACTCCGCG ATTTTAACGA AAGCCTTTGA TTCATCAGAA GTGAGACAGT TTTCCACCT 

Retrieve as FASTA