Entry information : CrubPrx96Carubv10001325m.g
Entry ID 15093
Creation 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CrubPrx96Carubv10001325m.g
Name CrubPrx96Carubv10001325m.g
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx035]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella rubella    [TaxId: 81985 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CrubPrx96
start..stop
S start..stop
CrubPrx47 652 0 1..345 1..345
BstrPrx36 650 0 1..345 1..344
AtPrx37 624 0 1..345 1..346
AhalPrx37 622 0 1..345 1..346
Literature and cross-references CrubPrx96Carubv10001325m.g
Protein sequence: CrubPrx96Carubv10001325m.g
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   345 (323)
PWM (Da):   %s   37969.37 (35513.0)  
PI (pH):   %s   8.56 (8.38) Peptide Signal:   %s   cut: 23 range:23-345
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MSSSLTKLGF VLILLQVSLS HAQLSPSFYD KTCPQVFDIA TKTIVKALRS DPRIAASILR LHFHDCFVNG CDASILLDNT TSFRTEKDAF GNAKSARGFD VIDEMKAAVE KACPRTVSCA  DLLAIAAQES VVLAGGPSWM VPSGRRDSLR GFMDLANDNL PAPFFTLKQL KDSFKKVGLD LPSDLVALSG GHTFGKNQCQ FIMDRLYNFS STGKPDPSLD KSYLSTLRKQ CPRNGNQSVL 
VDFDLRTPTL FDNKYYVNLK ENKGLIQSDQ ELFSSPDAKD TIPLVRAYAD GQGKFFDAFV KAMIRMGNLS PLTGKQGEIR SNCRVVNSKP RIMDVVDVVD FVSSM* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CCATAACCAA AACATTCTCT TAGAGTCAGA GCAAAAGATC AAAATGAGTT CCTCTTTGAC AAAATTAGGA TTTGTTCTTA TTCTTCTTCA AGTCTCATTG TCTCATGCTC AACTAAGTCC  TTCCTTTTAC GATAAAACTT GTCCTCAAGT CTTCGACATT GCTACCAAAA CCATTGTCAA AGCTCTGAGA TCAGACCCTC GCATCGCTGC GAGCATCCTT CGTCTTCATT TCCATGACTG  CTTCGTTAAT GTAAGATATC ACTAGACTCA ATATATTTCA CGTATATTAT AAAGTTTTTA GTTCTTTGTT AGAGTTTATA AACTTGAAGA TACTCAAAAC TGTAAAATTC GTTTTGTTAT  TTTGGTTATT GATATTTTTT AGTTTAATTA AAAAATACAA ATAACATAAA AACGTTATTT ATACGTACCA AAATATAGTT AAATTATACT TTTGGAACTT TGATTCTTTA TACTTTATGT  TTTGTATATT AATGGACCAA CCACTTCGAT CTCAAAGATA TCAATATAGT ATTATTAGCA ACTACTCTAC ATAGATTGCA GTGCATTCTT ATCTCAAGTT TCAGATTCTG TCGTCAAAGA  TGATTAGTTA AGATATTTCT ACAATATTAT TTTGGATTTT TATTACTACA TTATTAGGTA GATTAGTGAT GGATCCGCAT GTATGTGCGG GATTATTTTT ACAAAATTAC GATTTTTTTT  ATGTAGATGC TATTTTGGTA AAATTTTGTT ATATGAATTT ATTTGATAAA CTATATATAG ACATACAGTT GTAAAATATA TATATTGTAT TACATAATAA ATTTTTTAAA TAATTTAAAT  GAAAATGATA AGTGATATTA CGTGTTTATT TTTTAAACTA ATCAAAACAT TTCTAACAGT TTGCTTAGAG ATGTTAAATC GGATTTAGAT TTGGGTTTAG TTTGAATTGT TTTATGTGTA  GTTTAGAATG GAAAATATAT CAATATAGTA TTATTAGCAA CTACTCTACA TAGATCGCAG TGTATTCTTA TCTCAAGTTT CGGATTAGTT AAGATATTTC CACAATATTA TTTTGGATTT  TTATTGCTAC ATTATTAGGT AGATTTCATG GCCCATTCAT TTATGTGTTT GGCGTATTAG GTGTCGCATT AATGTTCTAT TCGAATTCAC GTGAATAAGT GTATGTATGC TAGTGATAGT  GTGATACTAG AATTTACTAT TTACTTACGG TAGAAAGGTT AAAAGAAGAT GTGATGTATA TTTACTATTT ACTATTGAAC AATGTGGTTG GTTTGACTAA CTATGAAGAT GTATACTTAT  GTTTTGGAAA TAGGGATGTG ATGCGTCTAT ATTGTTAGAC AACACAACAT CGTTTAGGAC GGAGAAGGAC GCGTTTGGGA ACGCTAAGTC GGCTCGAGGT TTCGATGTTA TCGATGAAAT  GAAAGCTGCC GTGGAGAAAG CATGTCCGAG AACAGTTTCA TGTGCTGATT TGCTCGCAAT CGCGGCTCAA GAATCTGTCG TTTTGGTATG AATCTTTTAG TACTATGTTA TGCATATTTG  GTTTCTAGAC CATTTTGTTG ATGTTTTACT TTGATACAAT AGGCGGGAGG TCCTTCATGG ATGGTTCCAA GTGGAAGAAG AGATAGCTTA AGAGGTTTTA TGGATCTTGC TAATGATAAC  CTTCCAGCTC CATTCTTTAC CCTTAAACAA CTTAAGGATA GCTTCAAAAA AGTCGGACTC GATCTTCCTT CGGATCTCGT TGCTCTTTCC GGTATGTTAT CAATAGAGTT TGAGACGTTT  TCATATCTAT ATATAGTTGT AATTACTAAT AACTCTATAT GGTACTTCCC TTTGTTTAGG TGGTCACACC TTTGGCAAAA ACCAATGTCA GTTTATAATG GATCGGCTTT ACAACTTCAG  TAGCACCGGT AAACCCGACC CAAGCCTTGA TAAATCTTAC CTCAGTACAC TAAGAAAGCA ATGTCCGCGT AATGGAAACC AAAGTGTCTT GGTAGATTTT GATCTACGTA CGCCAACACT  CTTTGACAAC AAATACTATG TGAATCTCAA AGAGAACAAA GGTCTTATCC AAAGCGACCA AGAGTTATTC TCAAGCCCTG ATGCTAAAGA CACTATCCCA TTAGTCCGGG CATACGCTGA  TGGTCAAGGG AAATTTTTCG ACGCGTTCGT TAAGGCAATG ATAAGGATGG GAAACCTTTC ACCATTAACA GGGAAGCAAG GTGAAATTAG ATCGAACTGT AGAGTGGTGA ATTCGAAACC 
GAGAATCATG GATGTGGTTG ATGTTGTTGA TTTTGTCAGC TCAATGTGAT GAAGTGAGTT TCTTGTAATA ATAAAGATCT TCAAATACTA TGTGGTATCA ATGAAATCAA G 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGTTCCT CTTTGACAAA ATTAGGATTT GTTCTTATTC TTCTTCAAGT CTCATTGTCT CATGCTCAAC TAAGTCCTTC CTTTTACGAT AAAACTTGTC CTCAAGTCTT CGACATTGCT  ACCAAAACCA TTGTCAAAGC TCTGAGATCA GACCCTCGCA TCGCTGCGAG CATCCTTCGT CTTCATTTCC ATGACTGCTT CGTTAATGGA TGTGATGCGT CTATATTGTT AGACAACACA  ACATCGTTTA GGACGGAGAA GGACGCGTTT GGGAACGCTA AGTCGGCTCG AGGTTTCGAT GTTATCGATG AAATGAAAGC TGCCGTGGAG AAAGCATGTC CGAGAACAGT TTCATGTGCT  GATTTGCTCG CAATCGCGGC TCAAGAATCT GTCGTTTTGG CGGGAGGTCC TTCATGGATG GTTCCAAGTG GAAGAAGAGA TAGCTTAAGA GGTTTTATGG ATCTTGCTAA TGATAACCTT  CCAGCTCCAT TCTTTACCCT TAAACAACTT AAGGATAGCT TCAAAAAAGT CGGACTCGAT CTTCCTTCGG ATCTCGTTGC TCTTTCCGGT GGTCACACCT TTGGCAAAAA CCAATGTCAG  TTTATAATGG ATCGGCTTTA CAACTTCAGT AGCACCGGTA AACCCGACCC AAGCCTTGAT AAATCTTACC TCAGTACACT AAGAAAGCAA TGTCCGCGTA ATGGAAACCA AAGTGTCTTG  GTAGATTTTG ATCTACGTAC GCCAACACTC TTTGACAACA AATACTATGT GAATCTCAAA GAGAACAAAG GTCTTATCCA AAGCGACCAA GAGTTATTCT CAAGCCCTGA TGCTAAAGAC  ACTATCCCAT TAGTCCGGGC ATACGCTGAT GGTCAAGGGA AATTTTTCGA CGCGTTCGTT AAGGCAATGA TAAGGATGGG AAACCTTTCA CCATTAACAG GGAAGCAAGG TGAAATTAGA 
TCGAACTGTA GAGTGGTGAA TTCGAAACCG AGAATCATGG ATGTGGTTGA TGTTGTTGAT TTTGTCAGCT CAATGTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CCATAACCAA AACATTCTCT TAGAGTCAGA GCAAAAGATC AAAATGAGTT CCTCTTTGAC AAAATTAGGA TTTGTTCTTA TTCTTCTTCA AGTCTCATTG TCTCATGCTC AACTAAGTCC  TTCCTTTTAC GATAAAACTT GTCCTCAAGT CTTCGACATT GCTACCAAAA CCATTGTCAA AGCTCTGAGA TCAGACCCTC GCATCGCTGC GAGCATCCTT CGTCTTCATT TCCATGACTG  CTTCGTTAAT GGATGTGATG CGTCTATATT GTTAGACAAC ACAACATCGT TTAGGACGGA GAAGGACGCG TTTGGGAACG CTAAGTCGGC TCGAGGTTTC GATGTTATCG ATGAAATGAA  AGCTGCCGTG GAGAAAGCAT GTCCGAGAAC AGTTTCATGT GCTGATTTGC TCGCAATCGC GGCTCAAGAA TCTGTCGTTT TGGCGGGAGG TCCTTCATGG ATGGTTCCAA GTGGAAGAAG  AGATAGCTTA AGAGGTTTTA TGGATCTTGC TAATGATAAC CTTCCAGCTC CATTCTTTAC CCTTAAACAA CTTAAGGATA GCTTCAAAAA AGTCGGACTC GATCTTCCTT CGGATCTCGT  TGCTCTTTCC GGTGGTCACA CCTTTGGCAA AAACCAATGT CAGTTTATAA TGGATCGGCT TTACAACTTC AGTAGCACCG GTAAACCCGA CCCAAGCCTT GATAAATCTT ACCTCAGTAC  ACTAAGAAAG CAATGTCCGC GTAATGGAAA CCAAAGTGTC TTGGTAGATT TTGATCTACG TACGCCAACA CTCTTTGACA ACAAATACTA TGTGAATCTC AAAGAGAACA AAGGTCTTAT  CCAAAGCGAC CAAGAGTTAT TCTCAAGCCC TGATGCTAAA GACACTATCC CATTAGTCCG GGCATACGCT GATGGTCAAG GGAAATTTTT CGACGCGTTC GTTAAGGCAA TGATAAGGAT  GGGAAACCTT TCACCATTAA CAGGGAAGCA AGGTGAAATT AGATCGAACT GTAGAGTGGT GAATTCGAAA CCGAGAATCA TGGATGTGGT TGATGTTGTT GATTTTGTCA GCTCAATGTG 
ATGAAGTGAG TTTCTTGTAA TAATAAAGAT CTTCAAATAC TATGTGGTAT CAATGAAATC AAG 

Retrieve as FASTA