Entry information : BstrGOX04
Entry ID 15106
Creation 2018-03-22 (Bruno Savelli)
Last sequence changes 2018-03-22 (Bruno Savelli)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: BstrGOX04
Name BstrGOX04
Class Glycolate Oxidase    [Orthogroup: GOX001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Boechera
Organism Boechera stricta    [TaxId: 72658 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value BstrGOX04
start..stop
S start..stop
AtGOX05 743 0 1..368 1..368
BstrGOX03 650 0 1..362 1..362
HaGOX09 648 0 1..365 1..365
AtGOX04 644 0 1..362 1..362
Literature and cross-references BstrGOX04
Protein sequence: BstrGOX04
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   368
PWM (Da):   %s   40552.24  
PI (pH):   %s   8.94
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MEITNVMEYE KIAKEKLPKM VYDYYASGAE DQWTLQENRN AFSRILFRPR ILIDVSKIDV STTVLGFNIS MPIMIAPTAM QKMAHPDGEL ATARATSAAG TIMTLSSWAT CSVEEVASTG  PGIRFFQLYV YKDRNVVRQL VKRAEEVGFK AIALTVDTPR LGRRESDIKN RFALPRGLTL KNFEGLDLGK IDKTNDSGLA SYVAGQVDQS LSWKDIKWLQ SITSLPILVK GVITAEDARI  AVEYGAAGII VSNHGARQLD FVPATIVALE EVVKAVEGRI PVFLDGGVRR GTDVFKALAL GASGVFVGRP SLFSLAADGE AGVRKMMQML RDEFELTMAL SGCRSLREIS RNHIKTDWDT 
PHYLPAKL* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GGAATATTCA ATTAACATTT TTTTCTGTTC TTATTCTTTC TTAGCCACCT TCCCGAGAAG ACCAAGTCGC TCTAGGCCTC TAAGGTAAGC TCTGCGTTGC ATTTCTCGTT TATGATCGTT  CATTTGATTG TTAGATTTTA ATCGAAAATC CAACGAGTGA AGATCCTGTG ATCATAAAAT CTGGGTCAGA TTTTATGATT CTTTGATTAC TTTTTGTACT GTTGATTGAC CTTTTAAGTG  TCAGTCTCGT TTCTTTTTTG TTTCTGATTC TTGAATTCAG GAATTTAAAA AAGTGGTTTT GATGATGAAA AGCTGTAATC ATAATATAAC TTTTCATGAC AGGATTTTTT TTTTGAGGTT  TGAAAAAAAT AAAAATGGAG ATAACAAACG TGATGGAATA TGAGAAGATA GCAAAGGAGA AATTACCAAA GATGGTTTAT GATTACTATG CGTCTGGTGC AGAGGATCAA TGGACTCTTC  AAGAGAATCG AAACGCTTTC TCCAGGATTC TGTAAGGGAA AACAACACAA CAAAATAATC TTTCTTTTTA GTTGATTGTT TTGGGGAATT TAATTGTTTG TGTTATGAGT TGGAAACAGA  TTTAGGCCTC GGATTCTTAT CGATGTAAGC AAGATTGATG TGAGCACAAC GGTTTTAGGG TTTAACATTT CTATGCCAAT CATGATTGCT CCTACAGCAA TGCAGAAAAT GGCTCATCCT  GATGGTAAGT CTTTAGAGTT GTGTAATGAG TGTAACCAAA AAACAATCTT GAGGTCTCTT GTCAAGAAGA AGTCTTTTAG GTTAGAGTAA CTTTTTTCTG ATAATATTAA CAATAAGATC  ATAGCTTAGA CTGTCATATT GTTAAAGATC TTAAGTTCAC TATGGGGATA TGGTTTTATT ATCGTTGTAG GCGAGCTTGC AACCGCGAGA GCTACTTCTG CTGCTGGAAC AATCATGGTT  TTGGTTCTTT GTCTCTGTCT CTTTCACCTG ATTGGATATC TCTTTTATGT ATTCATTTTC TGTATTCTTT GATGTTTTCA GACTTTATCT TCATGGGCTA CTTGTAGTGT TGAGGAAGTT  GCTTCCACAG GACCCGGGAT TCGGTTTTTC CAACTCTATG TAAGTTTCAG AAGATCCACT TGTTCTTTTG AATTTTTGGC TTTGAATCGA CTGTTTGGTC TCTTGATTCA GGTTTATAAG  GATAGAAATG TGGTTAGACA GCTTGTGAAA CGAGCTGAAG AAGTTGGATT TAAAGCGATT GCTCTTACCG TAGATACTCC AAGGCTTGGA CGCAGAGAAT CTGACATCAA AAACAGGTGA  TGAAACTTCA CACCATCACA TAAAACCATT TTGTTTGTTA GATCTTTTGG TTTTCTTGAT GGTTTTTATC TTGCAGATTC GCGCTTCCTC GAGGTCTTAC GTTGAAGAAC TTCGAAGGGT  TGGATCTTGG GAAAATAGAC AAGGTCATAA GACATATAAC AAACTTGAAT TGATCTAATA GATTAATACT AAAAAAATTG TTGTTTTGCT CTGTTGAAAA TTGCAGACCA ATGACTCAGG  GCTAGCTTCA TATGTTGCTG GTCAAGTTGA TCAGTCACTA AGCTGGAAGG TTAGAAAATG TAACAAGATC AACTCTGTGT TTTTGCCCAC CAAGATTCAT AAACATAATA ATCTCGCTTC  TGCTCGCTGT CTGTTCTCTT CTTACAGGAT ATAAAATGGC TCCAATCTAT CACAAGCTTA CCAATTCTTG TCAAGGGTGT CATTACAGCT GAGGATGGTA AGAAAACAGT ACTAAGAATG  AAAAATTTGC ATTAACCTTT TACATAAAGT TTCATGATAA TTAGAAAATT TCCTCTGATC ATTCGAAATT TTGGCAGCAA GAATAGCTGT TGAATATGGA GCTGCAGGGA TTATAGTCTC  TAACCACGGA GCACGTCAGC TCGATTTTGT CCCTGCAACT ATAGTGGCCC TGGAAGAGGT AGTCCTTTTA AGTGGATCTA GATTGAAAAC TGTTTTAATA AAGGTTTCAG CTTTCTTCAT  TGATAAATCG AGCAAAATCG CAGGTAGTTA AAGCCGTGGA GGGTCGGATA CCTGTGTTTC TTGACGGTGG GGTTCGCCGT GGAACCGATG TCTTTAAGGC ATTGGCTCTT GGCGCTTCAG  GTGTCTTTGT AAGTTCATTC ATCACATACT CTTTAGCTCT TGTAATATCC CCTGTTTTTC TCTCATTCTT TTCAAATTGA TCCCTTCGTT TTTAATTTTC ACATTTTGCC CCAACATTTT  AAAATATTCA AACAAACCCA AACATAACCT CTGTTTTCTT TTGTTATTTT TTTTTCTTCA ATATATCTTT GCTGCATTTC AATACTCTCA CCAATCATCT GATAATCCAC ACGACACGTT  TGTTTTTCTC TCTTTTGTTC CAAATAATTC CCTTACTTTC CAATTCTACA TGAATAACCT CTGATTGCTT ACCACTTTTT CATATTGTGC TCCAAACTTT TTAATTTGTC AAAAAATGAA  CCCAAAAAAT GCATGATTAT ATCACATTGC TGCATATGAG TACTCTCACC GACCATATGA TATTCCAGAC GACATGTAAT CAATTACTCT TGTTTGATTA GGTCGGGAGG CCGAGCTTGT  TCTCGCTTGC AGCGGATGGA GAAGCGGGAG TGAGGAAGAT GATGCAAATG CTAAGAGACG AGTTTGAGCT GACAATGGCA CTAAGTGGCT GCCGTTCCCT GAGAGAGATC AGCCGAAACC  ACATCAAGAC CGATTGGGAC ACTCCTCATT ACCTCCCGGC CAAGCTGTAG GGAATCTTAT TCACTTCTTT TAATAGTCAT CAAAGATATG AAAGGAGAGA TGGATGTTTG AAGTTGTGAT  CCAATAATGT ATTCTCATCC AACTTTATAA TCGAATATTT CCATTAAGTA AAAGGATTTG ATATGAGATT TGTAACTTTA GTACAATAAA TCAATTCATG AGGGTAAAAG TACTATGTAA 
GTTGAGGGAC TAGTGTTTGA CAATTGAGTC TTCG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGATAA CAAACGTGAT GGAATATGAG AAGATAGCAA AGGAGAAATT ACCAAAGATG GTTTATGATT ACTATGCGTC TGGTGCAGAG GATCAATGGA CTCTTCAAGA GAATCGAAAC  GCTTTCTCCA GGATTCTATT TAGGCCTCGG ATTCTTATCG ATGTAAGCAA GATTGATGTG AGCACAACGG TTTTAGGGTT TAACATTTCT ATGCCAATCA TGATTGCTCC TACAGCAATG  CAGAAAATGG CTCATCCTGA TGGCGAGCTT GCAACCGCGA GAGCTACTTC TGCTGCTGGA ACAATCATGA CTTTATCTTC ATGGGCTACT TGTAGTGTTG AGGAAGTTGC TTCCACAGGA  CCCGGGATTC GGTTTTTCCA ACTCTATGTT TATAAGGATA GAAATGTGGT TAGACAGCTT GTGAAACGAG CTGAAGAAGT TGGATTTAAA GCGATTGCTC TTACCGTAGA TACTCCAAGG  CTTGGACGCA GAGAATCTGA CATCAAAAAC AGATTCGCGC TTCCTCGAGG TCTTACGTTG AAGAACTTCG AAGGGTTGGA TCTTGGGAAA ATAGACAAGA CCAATGACTC AGGGCTAGCT  TCATATGTTG CTGGTCAAGT TGATCAGTCA CTAAGCTGGA AGGATATAAA ATGGCTCCAA TCTATCACAA GCTTACCAAT TCTTGTCAAG GGTGTCATTA CAGCTGAGGA TGCAAGAATA  GCTGTTGAAT ATGGAGCTGC AGGGATTATA GTCTCTAACC ACGGAGCACG TCAGCTCGAT TTTGTCCCTG CAACTATAGT GGCCCTGGAA GAGGTAGTTA AAGCCGTGGA GGGTCGGATA  CCTGTGTTTC TTGACGGTGG GGTTCGCCGT GGAACCGATG TCTTTAAGGC ATTGGCTCTT GGCGCTTCAG GTGTCTTTGT CGGGAGGCCG AGCTTGTTCT CGCTTGCAGC GGATGGAGAA  GCGGGAGTGA GGAAGATGAT GCAAATGCTA AGAGACGAGT TTGAGCTGAC AATGGCACTA AGTGGCTGCC GTTCCCTGAG AGAGATCAGC CGAAACCACA TCAAGACCGA TTGGGACACT 
CCTCATTACC TCCCGGCCAA GCTGTAG 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GGAATATTCA ATTAACATTT TTTTCTGTTC TTATTCTTTC TTAGCCACCT TCCCGAGAAG ACCAAGTCGC TCTAGGCCTC TAAGGATTTT TTTTTTGAGG TTTGAAAAAA ATAAAAATGG  AGATAACAAA CGTGATGGAA TATGAGAAGA TAGCAAAGGA GAAATTACCA AAGATGGTTT ATGATTACTA TGCGTCTGGT GCAGAGGATC AATGGACTCT TCAAGAGAAT CGAAACGCTT  TCTCCAGGAT TCTATTTAGG CCTCGGATTC TTATCGATGT AAGCAAGATT GATGTGAGCA CAACGGTTTT AGGGTTTAAC ATTTCTATGC CAATCATGAT TGCTCCTACA GCAATGCAGA  AAATGGCTCA TCCTGATGGC GAGCTTGCAA CCGCGAGAGC TACTTCTGCT GCTGGAACAA TCATGACTTT ATCTTCATGG GCTACTTGTA GTGTTGAGGA AGTTGCTTCC ACAGGACCCG  GGATTCGGTT TTTCCAACTC TATGTTTATA AGGATAGAAA TGTGGTTAGA CAGCTTGTGA AACGAGCTGA AGAAGTTGGA TTTAAAGCGA TTGCTCTTAC CGTAGATACT CCAAGGCTTG  GACGCAGAGA ATCTGACATC AAAAACAGAT TCGCGCTTCC TCGAGGTCTT ACGTTGAAGA ACTTCGAAGG GTTGGATCTT GGGAAAATAG ACAAGACCAA TGACTCAGGG CTAGCTTCAT  ATGTTGCTGG TCAAGTTGAT CAGTCACTAA GCTGGAAGGA TATAAAATGG CTCCAATCTA TCACAAGCTT ACCAATTCTT GTCAAGGGTG TCATTACAGC TGAGGATGCA AGAATAGCTG  TTGAATATGG AGCTGCAGGG ATTATAGTCT CTAACCACGG AGCACGTCAG CTCGATTTTG TCCCTGCAAC TATAGTGGCC CTGGAAGAGG TAGTTAAAGC CGTGGAGGGT CGGATACCTG  TGTTTCTTGA CGGTGGGGTT CGCCGTGGAA CCGATGTCTT TAAGGCATTG GCTCTTGGCG CTTCAGGTGT CTTTGTCGGG AGGCCGAGCT TGTTCTCGCT TGCAGCGGAT GGAGAAGCGG  GAGTGAGGAA GATGATGCAA ATGCTAAGAG ACGAGTTTGA GCTGACAATG GCACTAAGTG GCTGCCGTTC CCTGAGAGAG ATCAGCCGAA ACCACATCAA GACCGATTGG GACACTCCTC  ATTACCTCCC GGCCAAGCTG TAGGGAATCT TATTCACTTC TTTTAATAGT CATCAAAGAT ATGAAAGGAG AGATGGATGT TTGAAGTTGT GATCCAATAA TGTATTCTCA TCCAACTTTA  TAATCGAATA TTTCCATTAA GTAAAAGGAT TTGATATGAG ATTTGTAACT TTAGTACAAT AAATCAATTC ATGAGGGTAA AAGTACTATG TAAGTTGAGG GACTAGTGTT TGACAATTGA 
GTCTTCG 

Retrieve as FASTA