Entry information : MpMSD01 (Mapoly0005s0177)
Entry ID 15112
Creation 2018-04-12 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-04-12 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2018-04-24 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: MpMSD01 (Mapoly0005s0177)
Name (synonym) MpMSD01 (Mapoly0005s0177)
Class Mn SOD    [Orthogroup: MSD001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Marchantiaceae Marchantia
Organism Marchantia polymorpha    [TaxId: 3197 ]
Cellular localisation N/D
Tissue types Reproductive organs
Thallus
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value MpMSD01
start..stop
S start..stop
PpaMSD01 324 5e-114 6..235 2..226
ThasMSD01 313 1e-109 1..237 3..232
AtMSD01 313 1e-109 17..235 3..228
HaMSD02 305 2e-106 7..237 5..227
Literature and cross-references MpMSD01 (Mapoly0005s0177)
Protein sequence: MpMSD01 (Mapoly0005s0177)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   237
PWM (Da):   %s   25997.4  
PI (pH):   %s   8.41
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAAMQASMAI KRGTSTVACT ARNLLGLQRG FSTSYKEHGY TLPDLPYGYG ELEPAISGDI MQLHHSKHHQ AYITGFNQAL EKLDAAHSSR DPQTIVQLQA ALKFNGGGHV NHSIFWKNLA 
PIKEGGGVPP EGSLASAIEA EFGSLEILKA KMVAGGVGVQ GSGWVWLGLN KDLKKLVVET TANQDPLVTK GLIPLLGIDV WEHAYYLQYK NVRPDYLKNI WKVVNWKDVS SRYEENV* 

Retrieve as FASTA  
Remarks 2 ESTs
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCCGCAA TGCAGGCGTC GATGGCTATC AAAAGAGGCA CCTCGACCGT CGCCTGCACA GCGAGGAACT TGTTGGGTTT GCAGAGAGGG TTTAGCACCT CGTACAAGGA GCACGGTTAC  ACTCTACCAG ATCTGCCTTA TGGTTATGGG GAGTTAGAAC CTGCCATCAG TGGAGACATC ATGCAATTGC ACCACTCGAA GCATCATCAG GCTTACATCA CCGGCTTCAA TCAGGCGCTC  GAAAAGCTTG ACGCAGCTCA TTCTAGTCGC GATCCACAAA CTATTGTCCA GCTCCAGGCT GCTCTCAAGT TCAACGGTGG AGGTTGGTTT CTATCCCTAT TTTCTTGGAG TTCTAATCTC  CCCACTGATA AGGGCTAAAT CTAGTACTGT TGATCTTCAC TGCAAATTTC CCTCTCTTTC TTTGCGGTAA AGTTTTTTTT GTCTACTCGC ATGGAGCCGA ATATGTGGTG GACTTCTTTG  GACCTGTCAG AGGGATTGAT ACCGACTGAC ACATTTGTGT GTAACCTGTT GAGACCCTCT AGAAATAGAC GGTACGGTAT GCATGAAGAG ATTCTTCATA TACTCGTAAC TAGATCTAGT  TCCAGAAACT TACCATGTTA AGTACACCAC CACCACCTTG TGGCTGTGGC TTGAGGGAAG CATAGAGGAA GTAGTTTTCT TGTCACCGAT GCTCTAAACT GGCACTTTCC TATAGTGAAA  CAGTTTTGCA ACTTCAACGG ACGTTTGGAG TTTTAGTGTG CTCGCTACTT GGAATCCACT GCCCGATCTA GGCTTCTCCC GTTTGCACTC TGGTTCACTT CCTGGAAACT TCGTCTCTGC  TCGTGAATTT TTCTGGCCAA TCTGATACAG GTTCGAGTAA ATATTACGAT CTAGCAGAGT AAGAATGAGA TTTTTGATGA GATAATTCCT CATATTCTCT CGTTTTCATT TGGTGTTTCT  TCCAGGCCAT GTTAACCACA GCATCTTTTG GAAGAATCTA GCACCCATAA AGGTTAGTAA AATCACGGTC CGAGGTTCGT GTACATCATA TAATGCACGA GTTAATTTTT GAGCTATTTT  CTTTATTGTT GATACGCAAA ATAGTCTAAT TCCCACCGTT GAATTGACCT CTCGATTATA TGAGAACACT GGTTACCAGC ACAACTGTAA ACCCTATGTG GCTAAAGGCC AAATGCATCT  GAGCGGGTTC CCAAAGGCGT ATATATGCAT TCTTTTGATG ATTATCGGGA CTAGGCTGGC CACGTTGGAA GTTTTACACC CGATCATTTC CGAAGAAAAC TTTGCAATGA GTCTTATGGG  TTCAGTGTTT GGCCTTACAG GAAGGAGGAG GTGTTCCTCC TGAAGGGTCG TTGGCATCTG CTATTGAGGC TGAGTTTGGT TCTCTCGAAA TTCTAAAAGC GAAGATGGTT GCTGGAGGTG  TAGGAGTTCA AGGATCAGGC TGGGTGGTAT GCATCAACTA AATAAGCTGG GTTCATTTTG GCTGTAATGT GAAATTTGTG TCTAAAGGTT TATGTTGGAC ATAAGAAACT GAGCTTCTAG  TTATGATCCG TGTCAAATGG CAGTTGCAAT GGGGAAGCTT ATGTCTGTAT GTATGTATAC CTCTCTATAT ATATGGAGAT GCTCCTGAAG ATATTCGAAA TACTAATTAG ATTAATGGTT  TGGTCTGCAG TGGCTAGGTT TAAACAAAGA CCTAAAAAAG CTCGTTGTGG AGACCACAGC AAATCAGGCA AGAATATATT CAGGTCTTCA CTTTTTTGCA GTTCAGGATA TTGTGGGATA  TTGACGTTCT TGCGAGATTT AGTGGTGACG CTGACTCCCT TGTTGACTTC GATTTTTTGT ATGTTTCCGC AGGATCCTTT GGTTACCAAA GGACTGATTC CATTGTTGGG GATCGATGTT  TGGGAACATG CTTACTACCT ACAGGTAGGC AACTGGATGT CTGCAATTTG TACATGGTTT GCTTTGAGCA TGGTCGGTCG GTGTGTTACT CAAGAAATGA TTCTCTTATG TCATCAAGAT  AAGAGGGGTT AGAGCATCAG GTCGGTTTTA GCCCTGACTA GCAGGATCCG CATGGCATTA AGAAGAATGG AGATTTGAAG TGTTGTGTGA TTATGTATCT TCCTCTTTTC AGCGTTTCCG  GTAGTGCTTG ACTGATGGAA GCCATGGTAA GAAAATTTGG GTAAAAAATT GAGTCAAAAT TTTAAAACCT TGGGTGTCTT CTGGTGGCTT ACATTCTTGA CCGTCATTGA GTTTCACTGC  ATACGAATAG GACATTTTCT GAGAGCTGGA TCCGACTTGG TTCCTTAATG GGTGGTCGAT GTCAAAGCCT TGTGTTTGTG GTTTTTGGGT TGAACTCACC ACAGGAACCA GTCTTATCGA  ACGGATTTTT TCTTACCGAT ATTCCTGGAA CTGTTTGTGT GCAGTACAAA AATGTTCGCC CTGACTACTT GAAAAACATC TGGAAAGTGG TGAACTGGAA GGATGTCTCA TCTCGATACG 
AGGAAAATGT TTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCCGCAA TGCAGGCGTC GATGGCTATC AAAAGAGGCA CCTCGACCGT CGCCTGCACA GCGAGGAACT TGTTGGGTTT GCAGAGAGGG TTTAGCACCT CGTACAAGGA GCACGGTTAC  ACTCTACCAG ATCTGCCTTA TGGTTATGGG GAGTTAGAAC CTGCCATCAG TGGAGACATC ATGCAATTGC ACCACTCGAA GCATCATCAG GCTTACATCA CCGGCTTCAA TCAGGCGCTC  GAAAAGCTTG ACGCAGCTCA TTCTAGTCGC GATCCACAAA CTATTGTCCA GCTCCAGGCT GCTCTCAAGT TCAACGGTGG AGGCCATGTT AACCACAGCA TCTTTTGGAA GAATCTAGCA  CCCATAAAGG AAGGAGGAGG TGTTCCTCCT GAAGGGTCGT TGGCATCTGC TATTGAGGCT GAGTTTGGTT CTCTCGAAAT TCTAAAAGCG AAGATGGTTG CTGGAGGTGT AGGAGTTCAA  GGATCAGGCT GGGTGTGGCT AGGTTTAAAC AAAGACCTAA AAAAGCTCGT TGTGGAGACC ACAGCAAATC AGGATCCTTT GGTTACCAAA GGACTGATTC CATTGTTGGG GATCGATGTT 
TGGGAACATG CTTACTACCT ACAGTACAAA AATGTTCGCC CTGACTACTT GAAAAACATC TGGAAAGTGG TGAACTGGAA GGATGTCTCA TCTCGATACG AGGAAAATGT TTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TTGGCCGCGC TCTCCAAGAA GCTAGATTGT CTCTGAGCTC GCGGATCTGG ATCAGTCGAG AGCTGCAGGG GAGTTTTGGA GACCTTAGGG ACGAAGGTCG AGTGGTTCAC TAGAGAGCGA  GCGAGAGTCG AGCAGCAACG CGATCGAAAG GAAGCGAGAA GCTATGGCCG CAATGCAGGC GTCGATGGCT ATCAAAAGAG GCACCTCGAC CGTCGCCTGC ACAGCGAGGA ACTTGTTGGG  TTTGCAGAGA GGGTTTAGCA CCTCGTACAA GGAGCACGGT TACACTCTAC CAGATCTGCC TTATGGTTAT GGGGAGTTAG AACCTGCCAT CAGTGGAGAC ATCATGCAAT TGCACCACTC  GAAGCATCAT CAGGCTTACA TCACCGGCTT CAATCAGGCG CTCGAAAAGC TTGACGCAGC TCATTCTAGT CGCGATCCAC AAACTATTGT CCAGCTCCAG GCTGCTCTCA AGTTCAACGG  TGGAGGCCAT GTTAACCACA GCATCTTTTG GAAGAATCTA GCACCCATAA AGGAAGGAGG AGGTGTTCCT CCTGAAGGGT CGTTGGCATC TGCTATTGAG GCTGAGTTTG GTTCTCTCGA  AATTCTAAAA GCGAAGATGG TTGCTGGAGG TGTAGGAGTT CAAGGATCAG GCTGGGTGTG GCTAGGTTTA AACAAAGACC TAAAAAAGCT CGTTGTGGAG ACCACAGCAA ATCAGGATCC  TTTGGTTACC AAAGGACTGA TTCCATTGTT GGGGATCGAT GTTTGGGAAC ATGCTTACTA CCTACAGTAC AAAAATGTTC GCCCTGACTA CTTGAAAAAC ATCTGGAAAG TGGTGAACTG  GAAGGATGTC TCATCTCGAT ACGAGGAAAA TGTTTGATAT AGATCGTTGA GGGTAAGTCA CCATGTCAAA TATGTCCACC CTTGTCCGTT CATGACTTTT CAGTGAGACA TGGAGGGCAA  TGCTGGTGAA ACTTAAGGTG AGGAAGAGGT TTCAGGAGAG GTCTTGGATG GCCTAGTCCA TTCATCTTAA CATGTATATA TGCGGGAGTA TGCTTCAAAA TTATTCTGGC AGAAGATCCT  TGCATTGTGT TAATTTATCG AGTGCAATAG AGTTTTTTTC TCACATCTGT ATGAGAAGCA TAAGACTTGA GATCGAAAGT ACATTGCAGA ACATGTCCTT TCGTCCAATT GAATTGCTGT  TGGAGTTCTA CTGTTCCGTC CAAATGCATG TGGATGGATG GTTATTCCCT TTGATCAGAG TGGCATTCCA GGTAAAATTG TGAGGAGAGC AGTCTTCGCT GAGCGCTGTT TTCTCTGATT  TGGTGGTTGT TGTGTATGCC TGCGTTTGAT ATACTTATAG ATGATATGTA AATCAGCGTG TGAAAGTGAT GCATATGGAT CAATTTTAGA TAACCTGTGG TTTCTCTTGC ACTTGCCATA  ACCTTCTCTT GCACTTGCCA TACCCTTCTC TTGCACTTGC CATACGTACA GTCTAATTCA AGTTAATACT CAGATAAATT CTAGGCAATG TTCTTCAGGT CAAAACTCTG AATGTGACAC  TCCTTGCCTT GATCCAAGTT CAAGTTCCAT CTCAAACTCA GCTGGACTGC TGTAACCATC TTCACATCCC TGTAATCCAA CAGTTGTGAT CAGTACGTGA AGGAATGATC ATTGGCAAGG  TGTGATCTGA TTGTTTTACT ATTTTAACAA GAGTTTTTCT ATTTTCAGCT TTGAGCTTGG ATACACAAAA TCGAAACCCC AAATCTTGGT AGCTGGTGTG TTATTGGTCA CAAAAGTAGC  CTTGAAGTAA ATCACCACTA CCTTATAACT CAGCCAAGCC AAATTACAGT CTCTAGTCAA TGAGTACTCG TATGGTCTGA CTCCGAGATT AATCAACAAT ATTATAAGTG AAGTAATTTA  AATTCCAGTC CTAAACCAAA TTGAAGCTGA GTATCTGGTA GAAAGGAACT TCCAGTCAAC CAGGTGAAAC AGCCGAGCAT GAACTAATAA AGTATTATTT ACAGGCGCAG TTCTCCCCCC  GCTCTTTTAT GTGTTACTTG TATTGATCTT GCTGAGTATA CATAGTGCGT GGCGTAACTA CATAAATAGC ACCGGTTTCA TAGTCACCTG TTTCACCTGC TTGATTGGCA GATTCGTGAT  GTTGCTTCGA GCTAAAATAC TACTGCAGCT CAAATACTAC ATCCAACCGT ATGCTGTCTC TTTGCTTATA TTTGTAGATT CTCTACATAC GAACAAGAGA AGTTTGTCAT GTGCAACAGC  GATGTACACA AAATGGTCTA TGGGAGTTTC ATCATCTACC ACAGTTGTAA TTCAACAGTG GTCTGGCGTC CATGACTTAA GCGCGGTGAC AGCGATTCCC GAGATAACGT GTTTTCACAT  AGCACCTGTG AAACTGACAC CTTGTAATTC GCATGAGCTT TTGTTCACGG TGTAAATTCT ACCTCTTCTT TCAATGAATT CTGCCGTCGC AAGTGGTGAT TTTTGAAAAC TTCTGAATTA  ACCATATATC TGTAGTTGCC TCATACCAAA GCAGCCGTAT TCTGGGACAC ACTTACCTCT TATGGCTCCT TCTAACTGAG GTTTAGTGTG GCCTCTTTCT AGAGTGTGTC GCCAGGAAGC  GGTGAATAAA CAATCTTTCA ACGCGATGGC CATGAATCTG AAATGTGCCA CCGTGTGCTT CACAATCTGT GCTTCTCTGC AAGAGATGAG TAGTGGGGAG CACGAAAAGA GTTGCAAACC  TTGAGGGTGC AAATGGATGG ATTCATGGAT GCTGGACAGC ACTTCCTCGT CCACGATCTT CAGACCGGTG GACTCACAAG GTGCCTTGCC CACCGGAAGG ACGGGCGATA CAAACGTTTG  CCAAACTAGG GTATATTGTA TCCACCGGCC ATAAAATGAA AACAATTTGC TCGAAGGTCA TGGAAGGTTT TTGCTTATGG TACAGAAGAG AGGCTTTTTT GTGTAACCAA AACTGCACAC  TACGGTAAAG CTGTGAGAGC ATTGTCGTGA TGGAGACAAA GTGTGCTTGC TGACAGTTGA CCGAGGATAT TTACAACTGT AAGTACCTCG TTTGAATAGA CCTGAAGATA AGTTAGCTAG  AAATCTAGAA GTAAAGTCCG TGAAGCTGAA AGTGCTTCTA CCTTTCTGAG TAATGTACCA AACTTAACCA CGTTAGTTTC GGGTGGCATC AAAGGACACA GTGGCTATGA TTATGTGAAG 
AGATCAGCAT TCGAGAACTT CATTTTTCCT TAACAGTTGT TCAATAATTT GA 

Retrieve as FASTA