Entry information : MpFSD01 (Mapoly0009s0094)
Entry ID 15114
Creation 2018-04-12 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-04-12 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2018-04-24 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: MpFSD01 (Mapoly0009s0094)
Name (synonym) MpFSD01 (Mapoly0009s0094)
Class FeSOD    [Orthogroup: FSD001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Marchantiaceae Marchantia
Organism Marchantia polymorpha    [TaxId: 3197 ]
Cellular localisation N/D
Tissue types Reproductive organs
Thallus
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value MpFSD01
start..stop
S start..stop
PpaFSD01 308 5e-106 30..286 26..279
CbraFSD01 306 4e-105 70..279 59..293
PpaFSD02 295 2e-101 36..286 1..251
HaFSD03 282 3e-96 34..277 1..252
Literature and cross-references MpFSD01 (Mapoly0009s0094)
Protein sequence: MpFSD01 (Mapoly0009s0094)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   287
PWM (Da):   %s   31649.04  
PI (pH):   %s   6.97
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MPRAHLIPTP HPFSQSRESI PPSATVLSSE RAAMAMAAVT GTRCLLPVPS LRSSKARPSN ATSLKVKLPL GAPVAKFDLA DPPYPLDALE PHMSKETLEF HWGKHHRAYV NNLNGQIENS  DLERNTLEEI VQSSYNNGNP TPAFNNAGQI WNHDFFWQSM KPGGGGPPTG EVAELINRDF GSYDNFVKEF KAGGATQFGS GWAWLVLKNG KLAIEKTPNA VTPILWGSIP LLVVDVWEHA 
YYLDFQNRRP DYLSTFVNEL ISWDAVNERL ARAKASVNLG TPSIPEQ* 

Retrieve as FASTA  
Remarks 13 ESTs
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GATCTGATCT GCCGGGGCCT GGCCAATCTT CGACTACGGA AGCAGGCGCT GGCTGTACTT GAGGCGTGTG CATGCCTCGA GCTCACCTCA TTCCGACACC CCATCCCTTT TCCCAGAGTC  GAGAATCCAT CCCGCCCTCC GCAACCGTGC TATCGAGCGA GCGAGCAGCC ATGGCAATGG CAGCAGTTAC CGGGACTCGG TGCCTTCTGC CTGTTCCTTC GCTTCGGTCG TCCAAGGCTC  GACCCTCAAA TGCCACCTCT CTGGTGAGAA TTTCGTCGTC ACTTGCCTTA GTTTGTTTGT TGGGTTCGTC GATGTGTTCT TGGGTTTGGT TGGTTGTGGA CTGCGTTTGA AGCATCTTCT  GGAGTGACTG CGTGTTTCTG GGGTCGTGGA TTTGATTTCG TTTTGGTCGA GGATAGTGTC TACTCGAAAG AATTCAGGGT AGTGATCCAC TTGTTCATGC GGACGAGGAA TTGGCCGGGA  GCCTGTGAGC CGATGGCGAA TGCTGAACGG CGTGTAGGGT TATTGGGAAA TTAGCCAAGC GGGAGTCGTG AATGTGCCTC TGTGTCGAAT ATAGTGTTAC ACGCTGGGGT GTTAATAGTC  CTCAGCTCAT TCACCACCCA CTCAATTTCT TGCCAAGTAT GCTTTTCCTG TTTTGCTCTT CATTTTCAGC TGCGTACATT CCATACAACC AAAGGTCCGC CGATGTATTC ATGCCACTCC  GAGGGATGTC GGTGAAAGTC TCCGCTGCAC AAATGTGATT CAATTGTGCT TGCTTGTGTA TTGTAACCGT AATTAGTCGT GGTTACCTTG TGTATCGCAT CTCTTGATTG AATCTGTTCG  AGCTGGCCCA TAGGAAAATT TCCTTATCGG GTTTATCACT TGGGACCTAT GCAATAAGCT TGGAGTTGCT CTGATTAAAC TTCTCCTGAT GGATTTGATG TGGTGTGTTC CAGAAAGTTA  AGCTTCCGCT TGGTGCTCCC GTTGCCAAGT TCGACTTGGC GGACCCTCCT TACCCTCTGG TAAGCTTCTT GCATTTTTAT TTCTAATCTC CGAATGCTAG ATGGCTGAAA TGCAGTCATA  GATCATCATA GATCTGAGAA TCATTTTTCA TCTCGACGTC ATATTTGTCG TAGGATTTCA ACGTATAAGA CATTTAAAAA TTGTGCAGGA TGCCTTGGAG CCACACATGA GCAAGGAGAC  CCTTGAATTT CACTGGGGAA AGCACCACCG AGCTTACGTC AACAACTTGA ACGGGCAGAT CGAGAACTCT GACTTGGAGA GAAACACTCT TGAAGAGATT GTCCAGAGCT CTTACAACAA  TGGCAACCCT ACCCCAGCTT TTAACAACGC CGGCCAGGTG TGTGGTCTGA ACTATGCCCA TGTCGTCGAT TGGGTCCCGT AAGTATTGAA GAAGTTGCAG TCAGTTGTGG CAATGAAATT  GACTATAGCT CAATTTACCC TATGCAGATT TGGAATCACG ACTTCTTCTG GCAGTCAATG AAGCCAGGAG GTGGTGGCCC GCCCACCGGT GAGGTCGCAG AGCTCATCAA CAGAGACTTC  GGAAGCTACG ACAACTTCGT GAAGGAATTC AAGGCTGGAG GAGCCACCCA ATTCGGTTCT GGATGGGCCT GGCTTGTGTG TAAGTTCCAC TCTTATTATC AGGTTCTCCC GTAGGTATCT  TCTCATGAAA ATATTTTGTA GAGTTTATAG TAGATCGAAA ATGCATGGGT CCTCCGGATA TCATCTTTAT CGGCTTGTCA GTGGAAAATG ACCACAAATG CGTCAAATAT AATATGCATA  TATTTCCACT ATTCTAATCT ACGGATCGTA CATAGTATAC AAAATAAGAC TCCAAATTAT TTCTAAGATG AGCTCCAGCT CATTTTATGA TGCTTGACTT CTCATTGCAG TGAAGAATGG  CAAGCTCGCC ATTGAAAAGA CTCCGAATGC AGTTACCCCT ATCCTCTGGG GCAGCATTGT AAGTTTCTCT CAAGCCATTG TGGATATTTA CATGTGTTGC AGAAATGATG ACTTCTGAAA  TTAGTCCTTG GCTTGTTTTT CCTCCGTGCA AGATATAGTC TCCTAACACA CTGTTATGTT TTTTGCAGCC TCTTCTTGTT GTGGACGTCT GGGAGGTAAA TATACATATG AACACCTATC  TGAGGGAAGA AATCTTTTAT GCAGATTTTT CATTTTGTAA TATTTCTGCC TAGCTGTTGT CGACTGTGTT TAGCCAGACC AATATGTCGG ATCTTGAATT TCACAGACTC GTCAATCCAA  GACCTCTACT TCATTTGTCT TAGATCATAA TTTTCTCAAG CTTGAAGGTG ATACACACTT TGCTCTCGTT TTCTACCATA CTAACGCCGG TGAATCTACT TTGACAACGC AGCACGCATA  TTACCTCGAC TTTCAGGTAA CTGAAATTTC CTGAACGACT TACTAACAAT TGTCTTCGCT ACATTGATCT CTCAGTTTGG TCTTCTAATG TTGACATTCT TTGCTGCATG AGTACTACTA  GTATACTTTT GCCACAGGTT GCAAAGTACC TTTTGATTGG GTATAACAGA TGTTTTGAGT TATTATAGAT ATAACTTCTA TGCAGATCGC TCATTTTGAT TTTGGTTAAT GCAGAACCGA  AGGCCAGATT ACTTGAGCAC CTTTGTGAAC GAGCTGATCA GCTGGGACGC AGTGAACGAG CGTCTCGCCC GAGCCAAGGC TAGCGTAAAT CTCGGCACCC CTTCCATCCC TGAGCAGTAA  GAAAAATCCG TACTGCGTGA GGGAGAAATT ATAGCAGCAG AGTGTCATGT ACAACCTACA AAAATACGAG TGTAAATCAA ACTTTTGAGG CTTTCTATAT GTAACGAAAT TGAGAATGCA  CGTATGCAAG ATCGTATTTC GCCATGGTGT GTTTCCACCA AATCTCATGT TTTTGTGTTC AACACTCGAA ACTTGGGCAG AAAAATTGAT ATCAGTGTGA GCATGGGCAC AAGTCGATCA 
TATGGAGAAC TTTAAAAGTT TCAACACGTC ACAATGCGGT ACATATTC 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCCTCGAG CTCACCTCAT TCCGACACCC CATCCCTTTT CCCAGAGTCG AGAATCCATC CCGCCCTCCG CAACCGTGCT ATCGAGCGAG CGAGCAGCCA TGGCAATGGC AGCAGTTACC  GGGACTCGGT GCCTTCTGCC TGTTCCTTCG CTTCGGTCGT CCAAGGCTCG ACCCTCAAAT GCCACCTCTC TGAAAGTTAA GCTTCCGCTT GGTGCTCCCG TTGCCAAGTT CGACTTGGCG  GACCCTCCTT ACCCTCTGGA TGCCTTGGAG CCACACATGA GCAAGGAGAC CCTTGAATTT CACTGGGGAA AGCACCACCG AGCTTACGTC AACAACTTGA ACGGGCAGAT CGAGAACTCT  GACTTGGAGA GAAACACTCT TGAAGAGATT GTCCAGAGCT CTTACAACAA TGGCAACCCT ACCCCAGCTT TTAACAACGC CGGCCAGATT TGGAATCACG ACTTCTTCTG GCAGTCAATG  AAGCCAGGAG GTGGTGGCCC GCCCACCGGT GAGGTCGCAG AGCTCATCAA CAGAGACTTC GGAAGCTACG ACAACTTCGT GAAGGAATTC AAGGCTGGAG GAGCCACCCA ATTCGGTTCT  GGATGGGCCT GGCTTGTGTT GAAGAATGGC AAGCTCGCCA TTGAAAAGAC TCCGAATGCA GTTACCCCTA TCCTCTGGGG CAGCATTCCT CTTCTTGTTG TGGACGTCTG GGAGCACGCA  TATTACCTCG ACTTTCAGAA CCGAAGGCCA GATTACTTGA GCACCTTTGT GAACGAGCTG ATCAGCTGGG ACGCAGTGAA CGAGCGTCTC GCCCGAGCCA AGGCTAGCGT AAATCTCGGC 
ACCCCTTCCA TCCCTGAGCA GTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GATCTGATCT GCCGGGGCCT GGCCAATCTT CGACTACGGA AGCAGGCGCT GGCTGTACTT GAGGCGTGTG CATGCCTCGA GCTCACCTCA TTCCGACACC CCATCCCTTT TCCCAGAGTC  GAGAATCCAT CCCGCCCTCC GCAACCGTGC TATCGAGCGA GCGAGCAGCC ATGGCAATGG CAGCAGTTAC CGGGACTCGG TGCCTTCTGC CTGTTCCTTC GCTTCGGTCG TCCAAGGCTC  GACCCTCAAA TGCCACCTCT CTGAAAGTTA AGCTTCCGCT TGGTGCTCCC GTTGCCAAGT TCGACTTGGC GGACCCTCCT TACCCTCTGG ATGCCTTGGA GCCACACATG AGCAAGGAGA  CCCTTGAATT TCACTGGGGA AAGCACCACC GAGCTTACGT CAACAACTTG AACGGGCAGA TCGAGAACTC TGACTTGGAG AGAAACACTC TTGAAGAGAT TGTCCAGAGC TCTTACAACA  ATGGCAACCC TACCCCAGCT TTTAACAACG CCGGCCAGAT TTGGAATCAC GACTTCTTCT GGCAGTCAAT GAAGCCAGGA GGTGGTGGCC CGCCCACCGG TGAGGTCGCA GAGCTCATCA  ACAGAGACTT CGGAAGCTAC GACAACTTCG TGAAGGAATT CAAGGCTGGA GGAGCCACCC AATTCGGTTC TGGATGGGCC TGGCTTGTGT TGAAGAATGG CAAGCTCGCC ATTGAAAAGA  CTCCGAATGC AGTTACCCCT ATCCTCTGGG GCAGCATTCC TCTTCTTGTT GTGGACGTCT GGGAGCACGC ATATTACCTC GACTTTCAGA ACCGAAGGCC AGATTACTTG AGCACCTTTG  TGAACGAGCT GATCAGCTGG GACGCAGTGA ACGAGCGTCT CGCCCGAGCC AAGGCTAGCG TAAATCTCGG CACCCCTTCC ATCCCTGAGC AGTAAGAAAA ATCCGTACTG CGTGAGGGAG  AAATTATAGC AGCAGAGTGT CATGTACAAC CTACAAAAAT ACGAGTGTAA ATCAAACTTT TGAGGCTTTC TATATGTAAC GAAATTGAGA ATGCACGTAT GCAAGATCGT ATTTCGCCAT  GGTGTGTTTC CACCAAATCT CATGTTTTTG TGTTCAACAC TCGAAACTTG GGCAGAAAAA TTGATATCAG TGTGAGCATG GGCACAAGTC GATCATATGG AGAACTTTAA AAGTTTCAAC 
ACGTCACAAT GCGGTACATA TTC 

Retrieve as FASTA