Entry information : MpFSD01 (Mapoly0009s0094)
Entry ID 15114
Creation 2018-04-12 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-04-12 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2018-04-24 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: MpFSD01 (Mapoly0009s0094)
Name (synonym) MpFSD01 (Mapoly0009s0094)
Class FeSOD    [Orthogroup: FSD001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Marchantiaceae Marchantia
Organism Marchantia polymorpha    [TaxId: 3197 ]
Cellular localisation N/D
Tissue types Reproductive organs
Thallus
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value MpFSD01
start..stop
S start..stop
PpaFSD01 308 5e-106 30..286 26..279
LeFSD03 306 2e-105 74..275 46..249
CbraFSD01 306 4e-105 70..279 59..293
PpaFSD02 295 2e-101 36..286 1..251
Literature and cross-references MpFSD01 (Mapoly0009s0094)
Protein sequence: MpFSD01 (Mapoly0009s0094)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   287
PWM (Da):   %s   31649.04  
PI (pH):   %s   6.97
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MPRAHLIPTP HPFSQSRESI PPSATVLSSE RAAMAMAAVT GTRCLLPVPS LRSSKARPSN ATSLKVKLPL GAPVAKFDLA DPPYPLDALE PHMSKETLEF HWGKHHRAYV NNLNGQIENS  DLERNTLEEI VQSSYNNGNP TPAFNNAGQI WNHDFFWQSM KPGGGGPPTG EVAELINRDF GSYDNFVKEF KAGGATQFGS GWAWLVLKNG KLAIEKTPNA VTPILWGSIP LLVVDVWEHA 
YYLDFQNRRP DYLSTFVNEL ISWDAVNERL ARAKASVNLG TPSIPEQ* 

Retrieve as FASTA  
Remarks 13 ESTs
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCCTCGAG CTCACCTCAT TCCGACACCC CATCCCTTTT CCCAGAGTCG AGAATCCATC CCGCCCTCCG CAACCGTGCT ATCGAGCGAG CGAGCAGCCA TGGCAATGGC AGCAGTTACC  GGGACTCGGT GCCTTCTGCC TGTTCCTTCG CTTCGGTCGT CCAAGGCTCG ACCCTCAAAT GCCACCTCTC TGGTGAGAAT TTCGTCGTCA CTTGCCTTAG TTTGTTTGTT GGGTTCGTCG  ATGTGTTCTT GGGTTTGGTT GGTTGTGGAC TGCGTTTGAA GCATCTTCTG GAGTGACTGC GTGTTTCTGG GGTCGTGGAT TTGATTTCGT TTTGGTCGAG GATAGTGTCT ACTCGAAAGA  ATTCAGGGTA GTGATCCACT TGTTCATGCG GACGAGGAAT TGGCCGGGAG CCTGTGAGCC GATGGCGAAT GCTGAACGGC GTGTAGGGTT ATTGGGAAAT TAGCCAAGCG GGAGTCGTGA  ATGTGCCTCT GTGTCGAATA TAGTGTTACA CGCTGGGGTG TTAATAGTCC TCAGCTCATT CACCACCCAC TCAATTTCTT GCCAAGTATG CTTTTCCTGT TTTGCTCTTC ATTTTCAGCT  GCGTACATTC CATACAACCA AAGGTCCGCC GATGTATTCA TGCCACTCCG AGGGATGTCG GTGAAAGTCT CCGCTGCACA AATGTGATTC AATTGTGCTT GCTTGTGTAT TGTAACCGTA  ATTAGTCGTG GTTACCTTGT GTATCGCATC TCTTGATTGA ATCTGTTCGA GCTGGCCCAT AGGAAAATTT CCTTATCGGG TTTATCACTT GGGACCTATG CAATAAGCTT GGAGTTGCTC  TGATTAAACT TCTCCTGATG GATTTGATGT GGTGTGTTCC AGAAAGTTAA GCTTCCGCTT GGTGCTCCCG TTGCCAAGTT CGACTTGGCG GACCCTCCTT ACCCTCTGGT AAGCTTCTTG  CATTTTTATT TCTAATCTCC GAATGCTAGA TGGCTGAAAT GCAGTCATAG ATCATCATAG ATCTGAGAAT CATTTTTCAT CTCGACGTCA TATTTGTCGT AGGATTTCAA CGTATAAGAC  ATTTAAAAAT TGTGCAGGAT GCCTTGGAGC CACACATGAG CAAGGAGACC CTTGAATTTC ACTGGGGAAA GCACCACCGA GCTTACGTCA ACAACTTGAA CGGGCAGATC GAGAACTCTG  ACTTGGAGAG AAACACTCTT GAAGAGATTG TCCAGAGCTC TTACAACAAT GGCAACCCTA CCCCAGCTTT TAACAACGCC GGCCAGGTGT GTGGTCTGAA CTATGCCCAT GTCGTCGATT  GGGTCCCGTA AGTATTGAAG AAGTTGCAGT CAGTTGTGGC AATGAAATTG ACTATAGCTC AATTTACCCT ATGCAGATTT GGAATCACGA CTTCTTCTGG CAGTCAATGA AGCCAGGAGG  TGGTGGCCCG CCCACCGGTG AGGTCGCAGA GCTCATCAAC AGAGACTTCG GAAGCTACGA CAACTTCGTG AAGGAATTCA AGGCTGGAGG AGCCACCCAA TTCGGTTCTG GATGGGCCTG  GCTTGTGTGT AAGTTCCACT CTTATTATCA GGTTCTCCCG TAGGTATCTT CTCATGAAAA TATTTTGTAG AGTTTATAGT AGATCGAAAA TGCATGGGTC CTCCGGATAT CATCTTTATC  GGCTTGTCAG TGGAAAATGA CCACAAATGC GTCAAATATA ATATGCATAT ATTTCCACTA TTCTAATCTA CGGATCGTAC ATAGTATACA AAATAAGACT CCAAATTATT TCTAAGATGA  GCTCCAGCTC ATTTTATGAT GCTTGACTTC TCATTGCAGT GAAGAATGGC AAGCTCGCCA TTGAAAAGAC TCCGAATGCA GTTACCCCTA TCCTCTGGGG CAGCATTGTA AGTTTCTCTC  AAGCCATTGT GGATATTTAC ATGTGTTGCA GAAATGATGA CTTCTGAAAT TAGTCCTTGG CTTGTTTTTC CTCCGTGCAA GATATAGTCT CCTAACACAC TGTTATGTTT TTTGCAGCCT  CTTCTTGTTG TGGACGTCTG GGAGGTAAAT ATACATATGA ACACCTATCT GAGGGAAGAA ATCTTTTATG CAGATTTTTC ATTTTGTAAT ATTTCTGCCT AGCTGTTGTC GACTGTGTTT  AGCCAGACCA ATATGTCGGA TCTTGAATTT CACAGACTCG TCAATCCAAG ACCTCTACTT CATTTGTCTT AGATCATAAT TTTCTCAAGC TTGAAGGTGA TACACACTTT GCTCTCGTTT  TCTACCATAC TAACGCCGGT GAATCTACTT TGACAACGCA GCACGCATAT TACCTCGACT TTCAGGTAAC TGAAATTTCC TGAACGACTT ACTAACAATT GTCTTCGCTA CATTGATCTC  TCAGTTTGGT CTTCTAATGT TGACATTCTT TGCTGCATGA GTACTACTAG TATACTTTTG CCACAGGTTG CAAAGTACCT TTTGATTGGG TATAACAGAT GTTTTGAGTT ATTATAGATA  TAACTTCTAT GCAGATCGCT CATTTTGATT TTGGTTAATG CAGAACCGAA GGCCAGATTA CTTGAGCACC TTTGTGAACG AGCTGATCAG CTGGGACGCA GTGAACGAGC GTCTCGCCCG 
AGCCAAGGCT AGCGTAAATC TCGGCACCCC TTCCATCCCT GAGCAGTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCCTCGAG CTCACCTCAT TCCGACACCC CATCCCTTTT CCCAGAGTCG AGAATCCATC CCGCCCTCCG CAACCGTGCT ATCGAGCGAG CGAGCAGCCA TGGCAATGGC AGCAGTTACC  GGGACTCGGT GCCTTCTGCC TGTTCCTTCG CTTCGGTCGT CCAAGGCTCG ACCCTCAAAT GCCACCTCTC TGAAAGTTAA GCTTCCGCTT GGTGCTCCCG TTGCCAAGTT CGACTTGGCG  GACCCTCCTT ACCCTCTGGA TGCCTTGGAG CCACACATGA GCAAGGAGAC CCTTGAATTT CACTGGGGAA AGCACCACCG AGCTTACGTC AACAACTTGA ACGGGCAGAT CGAGAACTCT  GACTTGGAGA GAAACACTCT TGAAGAGATT GTCCAGAGCT CTTACAACAA TGGCAACCCT ACCCCAGCTT TTAACAACGC CGGCCAGATT TGGAATCACG ACTTCTTCTG GCAGTCAATG  AAGCCAGGAG GTGGTGGCCC GCCCACCGGT GAGGTCGCAG AGCTCATCAA CAGAGACTTC GGAAGCTACG ACAACTTCGT GAAGGAATTC AAGGCTGGAG GAGCCACCCA ATTCGGTTCT  GGATGGGCCT GGCTTGTGTT GAAGAATGGC AAGCTCGCCA TTGAAAAGAC TCCGAATGCA GTTACCCCTA TCCTCTGGGG CAGCATTCCT CTTCTTGTTG TGGACGTCTG GGAGCACGCA  TATTACCTCG ACTTTCAGAA CCGAAGGCCA GATTACTTGA GCACCTTTGT GAACGAGCTG ATCAGCTGGG ACGCAGTGAA CGAGCGTCTC GCCCGAGCCA AGGCTAGCGT AAATCTCGGC 
ACCCCTTCCA TCCCTGAGCA GTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GATCTGATCT GCCGGGGCCT GGCCAATCTT CGACTACGGA AGCAGGCGCT GGCTGTACTT GAGGCGTGTG CATGCCTCGA GCTCACCTCA TTCCGACACC CCATCCCTTT TCCCAGAGTC  GAGAATCCAT CCCGCCCTCC GCAACCGTGC TATCGAGCGA GCGAGCAGCC ATGGCAATGG CAGCAGTTAC CGGGACTCGG TGCCTTCTGC CTGTTCCTTC GCTTCGGTCG TCCAAGGCTC  GACCCTCAAA TGCCACCTCT CTGAAAGTTA AGCTTCCGCT TGGTGCTCCC GTTGCCAAGT TCGACTTGGC GGACCCTCCT TACCCTCTGG ATGCCTTGGA GCCACACATG AGCAAGGAGA  CCCTTGAATT TCACTGGGGA AAGCACCACC GAGCTTACGT CAACAACTTG AACGGGCAGA TCGAGAACTC TGACTTGGAG AGAAACACTC TTGAAGAGAT TGTCCAGAGC TCTTACAACA  ATGGCAACCC TACCCCAGCT TTTAACAACG CCGGCCAGAT TTGGAATCAC GACTTCTTCT GGCAGTCAAT GAAGCCAGGA GGTGGTGGCC CGCCCACCGG TGAGGTCGCA GAGCTCATCA  ACAGAGACTT CGGAAGCTAC GACAACTTCG TGAAGGAATT CAAGGCTGGA GGAGCCACCC AATTCGGTTC TGGATGGGCC TGGCTTGTGT TGAAGAATGG CAAGCTCGCC ATTGAAAAGA  CTCCGAATGC AGTTACCCCT ATCCTCTGGG GCAGCATTCC TCTTCTTGTT GTGGACGTCT GGGAGCACGC ATATTACCTC GACTTTCAGA ACCGAAGGCC AGATTACTTG AGCACCTTTG  TGAACGAGCT GATCAGCTGG GACGCAGTGA ACGAGCGTCT CGCCCGAGCC AAGGCTAGCG TAAATCTCGG CACCCCTTCC ATCCCTGAGC AGTAAGAAAA ATCCGTACTG CGTGAGGGAG  AAATTATAGC AGCAGAGTGT CATGTACAAC CTACAAAAAT ACGAGTGTAA ATCAAACTTT TGAGGCTTTC TATATGTAAC GAAATTGAGA ATGCACGTAT GCAAGATCGT ATTTCGCCAT  GGTGTGTTTC CACCAAATCT CATGTTTTTG TGTTCAACAC TCGAAACTTG GGCAGAAAAA TTGATATCAG TGTGAGCATG GGCACAAGTC GATCATATGG AGAACTTTAA AAGTTTCAAC 
ACGTCACAAT GCGGTACATA TTC 

Retrieve as FASTA